• 제목/요약/키워드: regulation by cAMP-CRP

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sfs1 유전자의 cAMP-cAMP receptor protein에 의한 발현 조절 (Regulation of sfs1 gene expression by the cAMP-cAMP receptor protein)

  • 유주순;이승진;이희영;정수열;최용락
    • Applied Biological Chemistry
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    • 제39권3호
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    • pp.195-199
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    • 1996
  • $crp^{\ast}$ 유전자가 도입된 대장균 MK2001($crp^{{\ast}1}$}, cya::km)을 숙주로 사용하여 mal 유전자 발현을 촉진시키는 유전자의 하나인 sfs1(sugar fermentation stimulation)의 구조해석 결과에 의하면, 잠정적인 sfs1의 promoter 영역에는 CRP 단백질과의 결합영역으로 보이는 염기배열이 존재하였다. 본 실험에서는 sfs1 유전자의 cAMP-CRP에 의한 발현 조절을 확인하고자, lacZ 와의 융합 유전자를 작성하였다. 작성된 융합 유전자는 cya 결손주인 Tp2010에서 cAMP의 첨가에 의해 ${\beta}-galactosidase$ 활성이 크게 증가하였으며, Western blotting의 실험에서도 같은 결과를 나타냈다. in vivo에서 발현이 확인된 전사산물은 cAMP에 의해 전사 촉진이 일어났으며, CRP의 결합부위로 예상되는 DNA 영역은 cAMP가 존재하면 CRP 단백질과 결합하는 특성을 나타내었다. 이상의 결과로 보아, sfs1 유전자의 발현은 UMP-CRP에 의한 전사촉진 현상을 받는 것으로 나타났다.

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glpD와 glpE 유전자의 조절영역 결손변이주가 전사조절에 미치는 영향 (Effect of deletion mutants in the regulatory region of transcriptional regulation of glpD and glpE genes)

  • 정희태;최용악;정수열
    • 생명과학회지
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    • 제5권4호
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    • pp.162-169
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    • 1995
  • The glpD genes encoding gly-3-p dehydrogenase is essential for the aerobic growth of E. coli on glycerol or gly-3-p. The glpE gene, the function of which is unknownm is transcribed divergently with respect to glpD gene. Expression of the adjacent but divergently transcribed glpD the glpE genes is positively regulated by the cAMP-CRP complex. In this study, for a precise investigation of the functional elements in the regulatory region for transcription activation by cAMP-CRP, deletion mutation have been introducted into the regulatory region. The effect of the deletion mutant on transcriptional regulation was tested in vivo by $\beta$-galctosidase activity. Deletion mutants in the regulatory region of glpD demonstrated that the presence of the CRP-binding site resulted in an sixfold increase in promoter activity. And also deletion mutants of glpE gene demonstrated that the presence of the CRP-binding site resulted in an eightfold increase in promoter activity. Insertion of 22 bp oligomer in the deletion mutants has shown that the CRP binding site is need for maximal expression of glpD and glpE genes. glpD and glpE gene, cAMP-CRP complex, deletion mutant, transcriptional regulation.

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Serratia marcescens에서 cAMP receptor protein(CRP) 유전자의 클로닝 해석 (Analysis and cloning of cAMP receptor protein(CRp) gene in Serratia marcescens)

  • 유주순;김혜선;문종환;정수열;최용락
    • 생명과학회지
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    • 제8권3호
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    • pp.263-271
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    • 1998
  • 전사조절인자로서 잘 알려져 있는 cAMP receptor protein(CRP)은 cAMP와 DNA에 결합하는 특별한 활성을 가지고 있으며, cAMP-CRP complex를 형성하여 수많은 유전자의 발현조절에 관여한다. 이러한 측면에서 cAMP-CRP의 조절은 어떤 면에서 총체적 조절체계라고까지 한다.본 연구는 Serratia 균주에서 crp 유전자의 분자적 특성 및 cAMP에 의한 발현조절을 받는 분자기구를 해석하고자 유전자를 클로닝하고 발현을 확인하였다. MacConkey 배지에서 maltose를 탄소원으로 충분히 이용하지 못하는 대장균 TP2139(${\Delta}crp$,${\Delta}lac$를 숙주로 이용하고, 염색체 DNA를 library로 작성하여 얻은 형질전환체 약 일만개의 콜로니에서 red colony를 나타내는 5종류의 양성 클론을 얻었다. 이들 클론을 Southern 방법으로 확인한 결과 3kh의 단편을 가진 pCKB12클론이 crp유전자를 coding하고 있음을 확인하였다. glpD-lacZ 융합 plasmid인 pLDC6의 BamHI부위에 pCKB12의 3kb 단편을 삽입시킨 재조합 plasmid pLDC6-Scrp를 작성하여, 클로닝된 Serratia의 crp유전자가 대장균에서 유전자 전사조절에 미치는 영향을 확인한 결과 cAMP-CRP 복합체 형성에 의한 전사조절 기능이 확인되어졌다.

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Effects of Mutations in the Regulatory Region on Transcriptional Regulation of glpD Gene

  • Jeong, Hee-Tae;Choi, Yong-Lark;Chung, Soo-Yeol;Chung, Chung-Han
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제5권5호
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    • pp.245-249
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    • 1995
  • Expression of the adjacent but divergently transcribed glpD and glpE gene is positively regulated by cAMP-CRP. In this study, we constructed several mutants in which a CRP-binding site is placed at different distances upstream of the glpD promoter. The effect of the spacer length on transcription activation by cAMP-CRP was tested in vivo by $\beta$-galactosidase. The cAMP-CRP complex activated transcription from glpD when bound at a number of positions, all of which lay on the same face of the DNA helix, although the degree of activation varied with the length of the spacer. By contrast, the insertion of spacer length with non-integral turns of the DNA helix extremely inhibited the activation of transcription. The observed transcription activation by cAMP of the glpD promoter was influenced by the distance between the CRP binding site and the transcription start point.

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CRP 의존성 maltose 대사 촉진 유전자 sfs4의 클로닝 및 염기배열 결정 (Nucleotide Sequence and Cloning of sfs4, One of the Genes Involved in the CRP-Dependent Expression of E. coli mal Genes.)

  • 정수열;조무제;정희태;최용락
    • Applied Biological Chemistry
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    • 제38권2호
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    • pp.111-117
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    • 1995
  • CRP (cAMP receptor protein)은 cAMP와 결합하여 cAMP-CRP 복합체를 형성하여 전사조절의 조절인자로서 작용한다. crp 유전자에 변이를 도입하여 cAMP의 비존재 상태에서 cAMP-CRP와 비슷한 기능을 가진 crp 유전자가 도입된 대장균 MK2001 (crp, cya::km)을 숙주로 사용하여 cAMP 혹은 cGMP의 비존재하에서도 mal 유전자의 발현을 촉진시키는 유전자 sfs (sugar fermentation stimulation) 수 종을 클로닝 하였다. 본 실험에서는 이미 밝혀진 nlp (Ner like protein) 유전자와 같이, sfs의 새로운 유전자를 탐색하여, 그 중 sfs4의 2126 bp 전 염기배열을 결정하고, 잠정적인 sfs4의 promoter 영역에는 CRP 단백질과의 결합 DNA 공통 염기배열(5' AAT TGTGA ACACCA TCACC CGT 3')이 존재함을 확인했다. lacZ 융합 유전자를 작성하여 TP2010R1 MK2001의 균주에서 cAMP를 첨가할 경우 각각 2.3배, 1.8배의 ${\beta}-galactosidase$ 활성이 증가하는 것으로 보아 sfs4는 cAMP-CRP에 의해 발현 조절을 받는 것으로 나타났다.

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온도 기울기 전기영동장치의 CAMP 수용성 단백질에 응용 (Application of Temperature Gradient Gel Electrophoresis To cAMP Receptor Protein)

  • Gang, Jong-Back;Cho, Hyun-Young
    • 생명과학회지
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    • 제14권2호
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    • pp.309-314
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    • 2004
  • cAMP수용성 단백질(CRP)은 E. coli의 100가지 이상의 유전자 전자조절에 관계된다. CRP는 dimer로 존재하며 cAMP의 결합으로 활성인 형태로 전환된다. 이중체인 CRP 단백질의 열 안정성과 구조 전이의 연구에 효과적인 온도 기울기 전기영동장치를 이용하여 확인하였다. 본 연구에서 야생형과 S83C CRP 단백질의 melting temperature (Tm)는 산성인 완충용액[89.8 mM Glycine, 24mM Boric acid (pH 5.8)]에서 57$\pm$1(야생형 CRP)과 55$\pm$1$^{\circ}C$ (S83G CRP)였다. 그리고 온도에 따른 CRP 단백질의 구조변화도 protease digestion과 CD spectropolarimeter을 이용하여 확인하였다.

Expression of Escherichia coli DcuS-R Two-Component Regulatory System is Regulated by the Secondary Internal Promoter Which is Activated by CRP-cAMP

  • Oyamada, Tomoya;Yokoyama, Katsushi;Morinaga, Michiko;Suzuki, Masashi;Makino, Kozo
    • Journal of Microbiology
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    • 제45권3호
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    • pp.234-240
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    • 2007
  • The DcuS-R two-component system of Escherichia coli senses $C_{4}-dicarboxylates$ of the medium and regulates expression of the genes related to utilization of them. It is known that phospho-DcuR induces expression of genes such as the dcuB-fumB operon, the frdABCD operon, and the dctA gene. We analyzed promoters of the dcuS-R operon to elucidate the transcriptional regulation system. We found a novel internal promoter within the dcuS gene that is regulated by the transcriptional regulator, CRP-cAMP, in both aerobic and anaerobic conditions.

한국에서 분리된 병원성 Salmonella 균주의 장독소 유전자(stn) 분포와 발현조절 기작 (Prevalence of Salmonella Enterotoxin Gene(stn) among Clinical Strains Isolated in Korea and Regulation of stn Expression)

  • 임상용;유상렬
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제28권6호
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    • pp.316-321
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    • 2000
  • Role of enterotoxin from Salmonella in pathogenesis is not know. Enterotoxin gene from Salmonella typhimurium(stn) encodes a 29kDa toxin that has no homology to any other known enterotoxins. Expression of stn is enthanced upon contact with epithelial cell but not all strains having the stn gene express Stn, Based on PCR analysis, we found that all 36 clinical strains of Salmonella isolated in Korea tested carried the stn gene. To understand the trgulation of the stn transcription, the expression of stn was studies in vitro. RNA polymerase was purified by polymin P fraction-ation, DNA-agarose affinity chromatography, and Mono-Q ion exchange chromatography from Salmonella. The expression of stn was inhibited by cAMP·CRP complex by about 50%.

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Identification of a Novel Genetic Locus Affecting ptsG Expression in Escherichia coli

  • Shin Dong-Woo;Lee Sang-Mi;Shin Yu-Rae;Ryu Sang-Ryeol
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제16권5호
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    • pp.795-798
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    • 2006
  • The phosphoenolpyruvate-dependent carbohydrate phosphotransferase system (PTS) is responsible for the simultaneous transfer and phosphorylation of various carbon sources in Escherichia coli. The ptsG gene encoding the enzyme $IICB^{Glc}$, the membrane component of the glucose-specific PTS, is repressed by Mlc and activated by the CRP cAMP complex; various other factors, such as Fis, FruR, and ArcA, are also known to be involved in ptsG regulation. Thus, in an attempt to discover a novel gene affecting the regulation of ptsG, a mutant with a decreased ptsG transcription in the presence of glucose compared with the wild-type strain was screened using transposon random mutagenesis. The mutant was found to have a transposon insertion in yhjV, a putative gene encoding a transporter protein whose function is yet unknown.