Mycobacterium tuberculosis (MTB) remains a major worldwide public health problem. In recent years, the incidence of MTB has been rising. Rapid and reliable diagnosis of Mycobacterium tuberculosis is essential to initiate correct treatment, avoid severe complications, and prevent transmission. LAMP was used to develop a rapid and sensitive laboratory diagnostic system for the MTB. In this research, the loop-mediated isothermal amplification method (LAMP) that amplifies DNA with high specificity and rapidity at an isothermal condition was evaluated for rapid detection of MTB. Undiluted DNA (2.10 × 106 copy/mL), 10-1, 10-2, 10-3, 10-4, 10-5 and 10-6 (copy/mL) of MTB DNA were amplified by PCR and LAMP to determine the sensitivity of the assay. At results, the LAMP assay reported here has the advantages of rapid amplification, high sensitivity, and high specificity and will be useful for rapid and reliable clinical diagnosis of MTB in hospital clinical laboratory.
Background: To identify the optimal cost effective strategy for the management of women having ASC-US who attended at King Chulalongkorn Memorial Hospital (KMCH). Design: An Economical Analysis based on a retrospective study. Subject: The women who were referred to the gynecological department due to screening result of ASC-US at King Chulalongkorn Memorial Hospital, a general and tertiary referral center in Bangkok Thailand, from Jan 2008 - Dec 2012. Materials and Methods: A decision tree-based was constructed to evaluate the cost effectiveness of three follow up strategies in the management of ASC-US results: repeat cytology, triage with HPV testing and immediate colposcopy. Each ASC-US woman made the decision of each strategy after receiving all details about this algorithm, advantages and disadvantages of each strategy from a doctor. The model compared the incremental costs per case of high-grade cervical intraepithelial neoplasia (CIN2+) detected as measured by incremental cost-effectiveness ratio (ICER). Results: From the provider's perspective, immediate colposcopy is the least costly strategy and also the most effective option among the three follow up strategies. Compared with HPV triage, repeat cytology triage is less costly than HPV triage, whereas the latter provides a more effective option at an incremental cost-effectiveness ratio (ICER) of 56,048 Baht per additional case of CIN 2+ detected. From the patient's perspective, the least costly and least effective is repeat cytology triage. Repeat colposcopy has an incremental cost-effectiveness (ICER) of 2,500 Baht per additional case of CIN2+ detected when compared to colposcopy. From the sensitivity analysis, immediate colposcopy triage is no longer cost effective when the cost exceeds 2,250 Baht or the cost of cytology is less than 50 Baht (1USD = 31.58 THB). Conclusions: In women with ASC-US cytology, colposcopy is more cost-effective than repeat cytology or triage with HPV testing for both provider and patient perspectives.
Lim, Hyungryul;Kwon, Ho-Jang;Lim, Ji-Ae;Choi, Jong Hyuk;Ha, Mina;Hwang, Seung-sik;Choi, Won-Jun
Journal of Preventive Medicine and Public Health
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v.49
no.4
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pp.205-219
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2016
Objectives: No children-specified review and meta-analysis paper about the short-term effect of fine particulate matter ($PM_{2.5}$) on hospital admissions and emergency department visits for asthma has been published. We calculated more precise pooled effect estimates on this topic and evaluated the variation in effect size according to the differences in study characteristics not considered in previous studies. Methods: Two authors each independently searched PubMed and EMBASE for relevant studies in March, 2016. We conducted random effect meta-analyses and mixed-effect meta-regression analyses using retrieved summary effect estimates and 95% confidence intervals (CIs) and some characteristics of selected studies. The Egger's test and funnel plot were used to check publication bias. All analyses were done using R version 3.1.3. Results: We ultimately retrieved 26 time-series and case-crossover design studies about the short-term effect of $PM_{2.5}$ on children's hospital admissions and emergency department visits for asthma. In the primary meta-analysis, children's hospital admissions and emergency department visits for asthma were positively associated with a short-term $10{\mu}g/m^3$ increase in $PM_{2.5}$ (relative risk, 1.048; 95% CI, 1.028 to 1.067; $I^2=95.7%$). We also found different effect coefficients by region; the value in Asia was estimated to be lower than in North America or Europe. Conclusions: We strengthened the evidence on the short-term effect of $PM_{2.5}$ on children's hospital admissions and emergency department visits for asthma. Further studies from other regions outside North America and Europe regions are needed for more generalizable evidence.
Objectives : Peripheral blood-buffy coat fractions (N=14,956) have been stored at $-70^{\circ}C$ in the headquarter of the Korean Multicenter Cancer Cohort (KMCC), since 1993. To study the future molecular etiology of cancers using specimens of the cohort, properly stored specimens are necessary, Therefore, the DNA-viability of the bully coat samples was investigated. Methods : Buffy coat fraction samples were randomly selected from various collection areas and years (N=100). The DNA viability was evaluate from the UV-absorbent ratios at 260/280nm and the PCH for $\beta$-globin was performed with genomic DNA isolated from the buffy coat. Results : PCR products were obtained from 85 and 98% of the C and H area-samples, respectively, using 50 or $100{\mu}l$ of the buffy coat. There were significant differences in the yields of the PCR-amplifications from the C and H areas (p<0.05), which was due to differences in the homogenization of the buffy coat fractions available as aliquots. The PCR-products were obtained from all of the samples (N=7) stored at the C area-local confer, but the other aliquots stored at the headquarter were not PCR-amplified, Therefore, the PCR products in almost all the samples, even including the DNA-degraded samples, were obtained. In addition, an improvement in the DNA isolation, i,e. approx. 1.6 fold, was found after using extra RBC lysis buffer. Conclusions : PCR products for $\beta$-globin were obtained from nearly all of the samples. The regional differences in the PCR amplifications were thought to have originated from the different sample-preparation and homogenization performance. Therefore, the long term-stored buffy coat species at the KMCC can be used for future molecular studies.
Journal of the korean academy of Pediatric Dentistry
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v.37
no.4
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pp.461-466
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2010
We examined the pattern of brand naming for dental clinics depending on various factors in 551 members of The Korean Academy of Pediatric Dentistry. The results follows: 1. Brand naming depending on the sex showed that the clinical subspeciality was 33.4% and the name of people or regional location was 31.7% in male members. In female members, the clinical subspeciality was 49% and a feeling of affinity was 29.9% (p<0.05). 2. Brand naming using the name of people and regional location in association with the year of graduation, the period before the 1960s was 66.7% the 1960s was 62.5% the 1970s was 68.8% and the 1980s was 46.5%. That is, these periods accounted for the most part. During the 1990s, however, brand naming based on the clinical subspeciality accounted for 52.2%. After the 2000s, it accounted for 59.8% (p<0.05). 3. In Seoul, Pusan and Kyounggi Province, brand naming based on the clinical speciality accounted for the most part. In other areas, the name of people and regional location, as well as a feeling of affinity, was the most prevalant (p<0.05). To summarize, there was a variability in the pattern of brand naming for dental clinics in association with the sex, schools and year of graduation and the regional location.
Park, Sooyeun;Yeom, Yeon Soo;Kim, Jae Hyeon;Lee, Hyun Su;Han, Min Cheol;Jeong, Jong Hwi;Kim, Chan Hyeong
Journal of Radiation Protection and Research
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v.39
no.1
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pp.30-37
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2014
Recently High-Definition Reference Korean-Man (HDRK-Man) and High-Definition Reference Korean-Woman (HDRK-Woman) were constructed in Korea. The HDRK phantoms were designed to represent respectively reference Korean male and female to calculate effective doses for Korean by performing Monte Carlo dose calculation. However, the Monte Carlo dose calculation requires detailed knowledge on computational human phantoms and Monte Carlo simulation technique which regular researchers in radiation protection dosimetry and practicing health physicists do not have. Recently the UFPE (Federal University of Pernambuco) research group has developed, and opened to public, an online Monte Carlo dose calculation system called CALDOSE_X(www.caldose.org). By using the CALDOSE_X, one can easily perform Monte Carlo dose calculations. However, the CALDOSE_X used caucasian phantoms to calculate organ doses or effective doses which are limited for Korean. The present study developed an online reference Korean dose calculation system which can be used to calculate effective doses for Korean.
In the study, we introduce the trend in domestic and foreign web accessibility, as well as the legal system that ensures web accessibility. Based on Korean Web Content Accessibility Guidelines (KWCAG)1.0, we investigated the web content accessibility of 80 tertiary health-care hospitals and general hospitals in Korea. We evaluated accessibility by combining accessibility-based criteria (ABC) with usability-based criteria (UBC). ABC was limited to an alternative text for Guideline 1, using a small number of frames and keyboard accessibility for Guideline 2. UBC checked the voice service (TTS), resizing text, providing multi-lingual websites, and disclosing web accessibility policy. KADO-WAH2.0 was used for representing the compliance rate. The evaluation result was a considerable improvement from previous results, even though the rate of compliance with web accessibility was generally insufficient. There was a significant difference between those medical centers which did and did not comply with web accessibility. Incidentally, many hospitals were found to have attempted to confront and come to terms with web accessibility. In future, the following factors are advisable for medical centers with publicity or public interest: they must employ active and aggressive promotion of establishment of independent accessibility guidelines to secure web accessibility, they should effect an improvement of the realization of web accessibility, there can be constant education and promotion, and there can be an institutional supplementation, as well as others.
Monitoring of Listeria monocytogenes, the causative agent of listeriosis, in food is inportant for public health. The Korean Food Standards Codex has adopted a 'zero-tolerance' policy for L. monocytogenes. The standard detection method of L. monocytogenes is based on enrichment. Thus, proper enrichment methods need to be instituted to ensure quality control of the detection procedures. In this study, the growth of L. monocytogenes and Listeria innocua as a mixed culture in Listeria enrichment broth (LEB) was monitored during artificial contamination of enrichment culture. We confirmed competitive growth or interspecies inhibitory activity of L. monocytogenes and L. innocua. Interspecies growth differences and the inhibitory activity of different inoculation and mixtures L. innocua against L. monocytogenes were examined. The concentration of L. monocytogenes must be 2.0 log CFU/mL or more than L. innocua to grow better than L. innocua. It is known that Listeria spp. and L. monocytogenes show growth difference during LEB, resulting in the risk of false-negative results. The inhibition of L. monocytogenes by L. innocua was always observed when present at lower concentrations. However, it was confirmed that L. innocua suppressed when L. monocytogenes was present at a higher concentration. Therefore if a mixture of Listeria spp. is present, detecting L. monocytogenes is difficult. Thus, a new enrichment broth to improve the detection rate of L. monocytogenes is needed.
Objectives: The microRNA (miRNA) miR-196a2 may play an important role in lung cancer development and survival by altering binding activity of target mRNA. In this study, we evaluated their associations with the susceptibility of non-small cell lung cancers (NSCLC) by case-control study in a Korean population. Methods: We performed genotyping analyses for miR-196a2 rs11614913 T/C at miRNA regions in a case-control study using blood samples of 406 NSCLC patient and 428 cancer-free control groups. Results: The total C allele frequencies for miR-196a2 were 48.8% for the patients and 45.6% for the controls; and the genotype frequencies of TT, TC, and CC were 23.7%, 55.2%, and 21.1% for the patients and 31.1%, 46.35%, and 22.4% for the controls (p<0.05). Participants who possesses TC/CC genotypes showed high risk for NSCLC compared to those possessed TT genotypes (OR, 1.42; 95% CI, 1.03 to 1.96). The association was persisted in 60 and older age group, male, smokers, those without family history for cancer. However, no significant association of CC genotypes in recessive genetic model was observed. Conclusions: In conclusion, this case-control study provides evidence that miR-196a2 rs11614913 C/T polymorphisms are associated with a significantly increased risk of NSCLC in a dominant model, indicating that common genetic polymorphisms in miR-196a2 rs11614913 are associated with NSCLC. The association of miR196a2 rs11614913 polymorphisms and NSCLC risk require confirmation through additional larger studies.
Despite the existence of effective anthelmintics, parasitic infections remain a major public health problem in Southeast Asia, including Thailand. In rural communities, continuing infection is often reinforced by dietary habits that have a strong cultural basis and by poor personal hygiene and sanitation. This study presents a survey of the prevalence of intestinal parasitic infections among the people in rural Thailand. The community-based cross-sectional study was conducted in villages in Khon Kaen Province, northeastern Thailand, from July to August 2013. A total of 253 stool samples from 102 males and 140 females, aged 2-80 years, were prepared using formalin-ethyl acetate concentration methods and examined using light microscopy. Ninety-four individuals (37.2%) were infected with 1 or more parasite species. Presence of parasitic infection was significantly correlated with gender (P=0.001); nearly half of males in this survey (49.0%) were infected. Older people had a higher prevalence than younger members of the population. The most common parasite found was Opisthorchis viverrini (26.9%), followed by Strongyloides stercoralis (9.5%), Taenia spp. (1.6%), echinostomes (0.4%), and hookworms (0.4%). The prevalence of intestinal protozoa was Blastocystis hominis 1.6%, Entamoeba histolytica 0.8%, Entamoeba coli 0.8%, Balantidium coli 0.4%, Iodamoeba b$\ddot{u}$tschlii 0.4%, and Sarcocystis hominis 0.4%. Co-infections of various helminths and protozoa were present in 15.9% of the people. The present results show that the prevalence of parasitic infections in this region is still high. Proactive education about dietary habits, personal hygiene, and sanitation should be provided to the people in this community to reduce the prevalence of intestinal parasite infections. Moreover, development of policies and programs to control parasites is needed.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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