Ling, Jessmi M.L.;Nathan, Sheila;Hin, Lee Kok;Mohamed, Rahmah
BMB Reports
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v.34
no.6
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pp.509-516
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2001
A genomic DNA fragment that contains the gene, which codes for a novel extracellular serine protease in Burkholderia pseudomallei, was cloned by using pQE40 as a vector. It was maintained in Escherichia coli JM109. The expression of the gene(s) resulted in the production of a 52 kDa protease. The recombinant protease was purified from the culture filtrate via ammonium sulfate fractionation, gel filtration, and anion-exchange chromatography. The purified protease had an optimum pH and temperature of pH 8.9 and $38^{\circ}C$, respectively. The protease activity was inhibited by EGTA, EDTA, and PMSF, but not 1,10-phenanthroline. The first 11 amino acid residues from the N-terminus of the purified protease were identified as LAPNDPYYYGY. PNDPYY was found to show homology to the Bacillus cereus microbial serine protease and B. subtilis PD498 serine protease. These results indicate that the protease that was purified in this study is an extracellular calcium-dependent serine protease. The purified protease was able to digest the human serum 19A, IgG, albumin, and transferrin, as well as bovine muscle actin and myosin. Furthermore, it was able to promote or cause dermonecrosis in experimental rabbits. These results propose the possible role of a novel B. pseudomallei extracellular calcium-dependent serine protease in the virulence of the pathogen.
This study was conducted for the isolation, purification, and characterization of a protease from Korean pear, to see its proteolytic activity on chicken actomyosin and to find the optimum pH and temperature of activity on chicken actomyosin. The protease was isolated from crude extract of Korean pear by ammonium sulfate precipitation. Further purification was done by DEAE-Sepharose ion-exchange chromatography, Mono-Q and Mini-Q column chromatography. The purified enzyme gave a single protein band on SDS polyacrylamide gel electrophoresis and the molecular weight was found to be 38 kDa. The specific activity of purified enzyme was 34,907 unit/mg with 25 fold purification and the yield was 2%. The purified enzyme incubated with chicken actomyosin showed high activity. The optimum pH and temperature for enzyme activity on chicken actomyosin were 6.5 and $70^{\circ}C$, respectively. A protease was purified from Korean pear for the first time and characterized. It was found to be promising for meat tenderization.
Pseudomonas sp. BK7, an alkalophile, displayed the highest growth and protease activity when grown in a fermenter which was controlled at a pH level of 9.0, and the enzyme production was significantly enhanced by the increase of agitation speed. Two forms of alkaline proteases (BK7-1 and BK7-2) were fractionated and purified to near homogeneity. Protease BK7-1 was purified through CM-Sepharose CL-6B and Sephadex G-75 column chromatographies, and Protease BK7-2 was purified through CM-Sepharose CL-6B, DEAE-Sepharose, and Sephadex G-75 column chromatographies. The molecular weights of proteases BK7-1 and BK7-2 determined by gel filtration chromatography were 20,700 and 40,800, respectively. The $K_m$ value, isoelectric point, and optimum pH of protease BK7-1 were 2.55 mg/ml, 11.0, and 11.0, respectively, whereas those of protease BK7-2 were 1.57 mg/ml, 7.2, and 10.0, respectively. Both proteases were practically stable in the pH range of 5-11. The optimum temperatures for the activities of both protease BK7-1 and BK7-2 were $50^{\circ}C$ and $45^{\circ}C$, respectively. About 56% of the original protease BK7-2 activity remained after being treated at $50^{\circ}C$ for 30 min but protease BK7-1 was rapidly inactivated at above $25^{\circ}C$. Both proteases were completely inhibited by phenylmethane sulfonyl fluoride, a serine protease inhibitor. Protease BK7-2 was stable against EDTA, EGTA, STP, and detergents such as SDS and LAS, whereas protease BK7-1 was found to be unstable.
Human tissue-type plasminogen activator (tPA) is a valuable thrombolytic agent used to successfully treat acute myocardial infarction, thromboembolic stroke, peripheral arterial occlusion, and venous thromboembolism. Recombinant tPA is accumulated as an inactive form in inclusion bodies of E. coli and is refolded in vitro, which is accompanied by extensive aggregation. In the present study, a tPA protease domain was expressed in an active soluble form in the cytosol of E. coli Rosetta-gami cells, which allowed disulfide bond formation and supplied the tRNA molecules required for six rarely used codons in E. coli. This strategy increased the amount of soluble protease domain protein and avoided the cumbersome refolding process. The purified protease domain not only degraded tPA substrate peptides but also formed a covalently bound complex with plasminogen activator inhibitor-1, as does full-length tPA. Soluble expression and purification of tPA domains may aid in functional analyses of this multi-domain protein, which has been implicated in many physiological and pathological processes.
A psychrotrophic bacterium was isolated from Antarctic marine sediment and identified as Shewanella sp. species based on the biochemical properties and 16S rRNA sequence, and designated as Shewanella sp. L93. Extracellular protease produced by this strain was purified through ammonium sulfate precipitation, High-Q column chromatography, first gel permeation chromatography, BioScale Q2 ion exchange chromatography and second gel permeation chromatography, and basic properties of this enzyme were investigated.
Journal of the Korean Society of Food Science and Nutrition
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v.20
no.4
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pp.388-394
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1991
Alkaline protease producing bacteria were isolated from soil and identified as Bacillus sp. CW-1121. It was found that the production of alkaline protease reached to maximum in 5 day of fermentation at 4$0^{\circ}C$. The enzyme was purified by ammonium sulfate precipitation, gel filtration on Sephadex G-150 and DEAE-cellulose ion-exchange chromatography. The homogeneity of the purified enzyme was verified by polyacrylamide gel electrophoresis. The enzyme was purified 5.72 fold and yield of the enzyme purification was 16.71%. When the purified enzyme was applied to sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis, the molecular weight was estimated to be 55, 000.
An alkalophilic bacterium producing alkaline protease was isolated from waste water and solar saltern sample and identified as Bacillus pseudofirmus HS-54 based on morphological, biochemical characteristics as well as 16S-rRNA gene sequencing. The HS-54 protease was purified to homogeneity using ammonium sulfate precipitation, DEAE cellulose column chromatography, and sephadex G-100 gel filtration with a 4.0 purification fold. The molecular mass of the purified enzyme was estimated by SDS-PAGE to be 27 kDa. The optimal pH and temperature for the purified protease activity were 10.0 and $50^{\circ}C$, respectively. The purified enzyme was relatively stable at the pH range of 6.0-11.0 and at the temperature below $50^{\circ}C$. This enzyme was activated by $Ca^{2+}$ and $Mg^{2+}$ and inhibited by $Hg^{2+}$, $Cu^{2+}$, $Zn^{2+}$, $Al^{3+}$, $Ag^{2+}$. And this enzyme was strongly inhibited by PMSF, suggesting that it belongs to the serine protease superfamily.
Mantis egg fibrolase (MEF-3) was purified from the egg cases of Tenodera sinensis using ammonium sulfate fractionation, gel filtration on Bio-Gel P-60, DEAE Affi-Gel blue gel affinity chromatogragphy, and MONO-Q anion-exchange chromatography. This protease had a molecular weight of 35,600 Da as determined by SDS-polyacrylamide gel electrophoresis under reducing conditions and its isoelectric point was 6.0. The N-terminal amino acids sequence was Ala-Thr-Gln-Asp-Asp-Ala-Pro-Pro-Gly-Leu-Ala-Arg-Arg. This sequence was 80% homologous to the serine protease from Tritirachium album. MEF-3 readily digested the ${\alpha}$-and ${\beta}$-chains of fibrinogen and more slowly the ${\gamma}$-chains. It showed strong proteolytic and fibrinolytic activities. Phenylmethanesulfonyl fluoride and chymostatin inhibited its proteolytic activity, while EDTA, EGTA, cysteine, ${\beta}$-mercaptoethanol, elastinal, tosyl-lysine chloromethylketone, and tosyl-amido-2-phenylethyl chloromethyl ketone did not affect its proteolytic activity. Among the chromogenic protease substrates, the most sensitive one to the hydrolysis of MEF-3 was benzoyl-Phe-Val-Arg-p-nitroanilide. Based on these experimental results, we speculated that MEF-3 is a serine protease with a strong fibrin(ogen)olytic activity.
Neutral protease which was obtained from a genus of Aspergilli as the crystal form were investigated for their purification and properties. The results of biochemical and enzymatic studies for their purification and properties in this enzyme were as follows. 1) On the wheat media containing 70%-water and $CaCo_{3}$, Aspergilus oryzae S.H.W. 131 is satisfactorily grown under the basic optimum conditions temperature $27^{\circ}C$- $30^{\circ}C$at relative humidity 100% for three days. 2) The enzyme solution extracted with water is successively purified through the passing on column of Asmti-177N for decolorization of it. And ion exchanger such as DEAAE Sphadex A-50 or Shepadex G-100 and fraction collector is necessary for the sepearte treatments of this enzyme. After washing it with organic solvents as aceton-EtOH, etc., it should be dried on the vacuum dryer at $40^{\circ}C$) The protease activity is determined by the amounts of amino acids, tyrosine. 4) The optimum pH of neutral protease is 6.0-8.0. 5) In effectively decomposing with this neutral protease, the optimum temperature is $35^{\circ}C$. 6) It is interesting that the amounts of metal ion affects the activity of neutral protease. For examples, if it were treated with manganic ion, its activity would be more effective than any other that.
An attractive target for anti-herpes chemotherapy is the herpes simplex virus 1 (HSV-1) protease encoded by the UL26 gene. HSV-1 protease is essential for DNA packaging and virus maturation. To perform high throughput for potent inhibitors, the efficient production of larger amounts of highly purified enzyme and protease activity assay method must be established. In this report, expression in E. coli and purification of the protease gene of HSV-1 strain F was investigated. The protease gene was cloned pET28, and the nucleotide sequence of protease catalytic domain of HSV-1 compared strain F with other strains (KOS and CL101). In these results the F strain was different in base sequence. However, the amino acid sequence was identifical. The HSV-1 protease was purified with His-tagged affinity column. The analysis of HSV-1 protease activity was performed by high performance liquid chromatography.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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