• 미생물학회지
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• 제41권4호
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• pp.255-261
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• 2005

Streptomyces griseus trypsin(SGT)을 코드하는 sprT 유전자를 포함하여 약 6.7 kb의 DNA 단편을 Streptomyces griseus ATCC 10137의 염색체 DNA로부터 클로닝 하여 염기서열을 결정하였다. 염기서열 분석 결과, 염색체 DNA를 EcoRI-HindIII 제한효소로 완전 분해하여 클로닝한 약6.7 kb의 단편에는 sprT유전자를 포함하여 총6개의 완전한 ORF (open reading frame)와 1개의 불완전한 ORF가 존재하는 것으로 밝혀졌으며, 순서대로 ORF1, SGT, ORF2, ORF3, ORF4, ORF5, ORF6로 명명하였다. 예상 단백질의 아미노산 서열 분석 결과, ORF1은 oxidoreductase, ORF3는 ArsR family의 transcription regulator, ORF4는 Listeria monocytogenes의 LPXTG motif를 갖는 peptidoglycan bound protein, ORF5는 transmembrane helix를 갖는 막단백질, ORF6는 Streptomyces avermitilis에서 보고된 lipoprotein과 높은 상동성을 보였으며, ORF2는 기능을 예측 할 수 없었다. 이와 같은 분석결과, sprT 유전자 주위에는 세포막이나 세포벽 구성성분을 코드하는 유전자가 존재하고 있으며, 따라서 SGT Pretense는 이러한 세포막 또는 세포벽 합성이나 분해과정에서 어떤 기능을 담당할 가능성 이 있는 것으로 추측되었다.

• 생명과학회지
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• 제29권11호
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• pp.1251-1257
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• 2019

본 연구에서는 펩티도글리칸이 단핵세포의 $TNF-{\alpha}$ 발현에 미치는 영향을 조사하였고, 또한 펩티도글리칸에 의한 $TNF-{\alpha}$ 발현에 관련된 세포의 요소들을 연구하였다. 사람의 단핵세포주인 THP-1 세포를 펩티도글리칸에 노출시키는 경우 $TNF-{\alpha}$ 분비 증가뿐만 아니라 $TNF-{\alpha}$ 유전자 전사를 유도하는 결과를 가져왔다. TLR-2/4의 억제제인 OxPAPC은 펩티도글리칸에 의한 $TNF-{\alpha}$의 발현을 저해하였다. 그리고 U0126, SB202190, SP6001250, LY294002, Akti IV, rapamycin, NAC, DPI 같은 약리학적 저해제 또한 $TNF-{\alpha}$ 발현을 유전자/단백질 수준에서 상당히 약화시켰다. 그러나 polymyxin B는 $TNF-{\alpha}$ 발현에 영향을 주지않았다. 따라서 펩티도글리칸이 TLR-2, PI3K, Akt, mTOR, MAPKs, ROS 등을 통하여 단핵세포의 $TNF-{\alpha}$ 발현을 증가시킴을 확인하였다.

• 생명과학회지
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• 제32권6호
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• pp.421-429
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• 2022

본 연구에서는 죽상경화 플락에서 발견되는 펩티도글리칸이 혈관염증에서 어떠한 역할을 하는지 알아보기 위하여 염증성 사이토카인의 한 종류인 인터루킨-1 알파의 발현에 대한 영향을 조사하였다. 실험방법으로는 혈관염증을 주도하는 단핵구/대식세포인 THP-1 세포주에 펩티도글리칸을 처리하고 인터루킨-1 알파의 발현을 RT-PCR, real-time PCR, ELISA 방법으로 분석하였다. 펩티도글리칸의 처리 시간과 농도에 비례하여 단핵구/대식세포에서 인터루킨-1 알파의 전사체와 단백질 분비가 증가함을 관찰하였다. 또한 펩티도글리칸의 작용기전을 규명하기 위하여 신호전달을 차단하는 억제제를 세포에 처리하고 인터루킨-1 알파의 발현을 조사하였다. TLR2/4의 억제제인 OxPAPC 그리고 세포 kinase의 작용을 억제하는 LY294002(PI3 kinase 억제), Akti IV (Akt 억제), rapamycin (mTOR 억제), U0126 (MEK 억제), SB202190 (p38 MAPK 억제), SP6001250 (JNK 억제), DPI (NOX 억제)를 처리하는 경우 인터루킨-1 알파 전사체의 발현 그리고 단백질의 분비가 감소되었다. 반면에 LPS의 작용을 억제하는 polymyxin B는 인터루킨-1 알파의 발현에 영향을 주지 않았다. 이상의 결과는, 펩티도글리칸이 TLR2, PI3K, Akt, mTOR, MAPKs를 통하여 단핵구/대식세포의 인터루킨-1 알파 발현을 증가시키고 혈관염증에 기여한다는 것을 나타낸다.

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제24권3호
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• pp.311-315
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• 1996

A cytotoxic material was produced by strain No. 5-99 which was isolated from soil. Analyzing the cell wall components, LL-diaminopimelic acid was identified. From the existance of glycine in the cell wall, this strain was identified to Streptomyces sp. which has cell wall chemotype I and peptidoglycan type A3 connected by glycine. So, we named this strain to Streptomyces sp. YJB-599. The Active material was purified through solvent extraction, silica gel column chromatography and crystallized to needle-shaped white -crystal. Analyzing the structure of this crytal by instrumental analysis and database, it was determined to genistein.

• 한국잠사학회:학술대회논문집
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• 한국잠사학회 2001년도 제44회 추계 학술연구 발표회
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• pp.43-43
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• 2001

no Abstract, See Full Text

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제21권5호
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• pp.453-460
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• 1993

The extracellular bacteriolytic enzyme from alkalophilic Bacillus sp. YJ-451 was endopeptidase which hydrolyzes the peptide bond at the amino group of D-glutamic acid in the peptidoglycan. Protoplast transfomation system of B. subtilis by the lytic enzyme that differs, in mechanisms, from lysozyme which was used to transformation of B. subtilis was investigated. High protoplast yield was obtained from cells cultured in PAB at the late logarithmic growth phase.

• 한국축산식품학회:학술대회논문집
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• 한국축산식품학회 2000년도 정기총회 및 제25차 춘계학술발표회
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• pp.95-95
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• 2000

• 대한약학회:학술대회논문집
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• 대한약학회 2002년도 Proceedings of the Convention of the Pharmaceutical Society of Korea Vol.1
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• pp.169.3-170
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• 2002

• Molecules and Cells
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• 제26권2호
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• pp.206-211
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• 2008

HI0381 of Haemophilus influenzae was investigated by circular dichroism (CD) and nuclear magnetic resonance (NMR) spectroscopy. HI0381 is a 153-residue peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein, and a part of the larger Tol/Pal network. Here, we report its backbone $^1H$, $^{15}N$, and $^{13}C$ resonance assignments, and secondary structure predictions. About 97% of all of the $^1HN$, $^{15}N$, $^{13}CO$, $^{13}C{\alpha}$, and $^{13}C{\beta}$ resonances covering 131 non-proline residues of the 134 residue, mature protein, were clarified by sequential and specific assignments. CSI and TALOS analyses revealed that HI0381 contains five ${\alpha}$-helices and five ${\beta}$-strands. To characterize the structure of HI0381, the effects of pH and salt concentration were investigated by CD. In addition, the structural changes occurring when HI0381 was in a membranous environment were investigated by comparing its HSQC spectra and CD data in buffer and in DPC micelles; the results showed that helix ${\alpha}4$ and strand ${\beta}4$ became aligned with the membrane. We conclude that the conformation of HI0381 is affected by the membrane environment, implying that its folded state is directly related to its function.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제27권4호
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• pp.838-843
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• 2017

Sepsis is a major health problem worldwide, with an extremely high rate of morbidity and mortality, partly due to delayed diagnosis during early disease. Currently, sepsis diagnosis requires bacterial culturing of blood samples over several days, whereas PCR-based molecular diagnosis methods are faster but lack sensitivity. The use of biosensors containing nucleic acid aptamers that bind targets with high affinity and specificity could accelerate sepsis diagnosis. Previously, we used the systematic evolution of ligands by exponential enrichment technique to develop the aptamers Antibac1 and Antibac2, targeting the ubiquitous bacterial peptidoglycan. Here, we show that these aptamers bind to four gram-positive and seven gram-negative bacterial sepsis agents with high binding efficiency. Thus, these aptamers could be used in combination as biological recognition elements in the development of biosensors that are an alternative to rapid bacteria detection, since they could provide culture and amplification-free tests for rapid clinical sepsis diagnosis.