Facing the counterfeiting acts towards various products, many manufacturers implement ePedigree system to secure their supply chain. Using ePedigree, a distribution history including a valid product identifier from the manufacturer until the final retailer is recorded. And this ePedigree is signed by each involved supply chain party using digital signature. With this digital signature, any unauthorized alteration to the ePedigree document would generate a failed verification process. If there is a counterfeit product using a fake ePedigree document, it wouldn't be able to pass the verification process either. Hence, there wouldn't be any counterfeit product that could enter the legal supply chain and bought by the consumer. We are proposing to use ECDSA instead of RSA since it has faster performance and shorter key size. At a certain same security level, ECDSA only needs 163 bits, while RSA needs 1024 bits.
경주지방에서 사육 중인 경주개(동경이) 51두를 대상으로 8개의 microsatellite marker을 이용하여 DNA형을 분석한 결과 대립 유전자 수는 $4{\sim}12$개(평균 8.5개)로 검출되었으며 Expected heterozygosit와 PIC는 각각 $0.6162{\sim}0.8746$(평균 0.7587)와 $0.5461{\sim}0.8512$(평균 0.7167)으로 나타났고, PEZ3, PEZ6, PEZ12, FHC2054 marker는 PIC가 0.7이상으로 나타났다. 이들 marker는 향후 동경이의 개체식별 및 친자확인에 유용하게 쓰일 수 있다. 공시재료 51두 중 사육가에 의해 혈통이 알려진 5두를 대상으로 microsatellite marker를 이용하여 혈통을 분석한 결과 3두에서 현재 가계도와 일치하지 않았다. 따라서 앞으로 더 많은 연구를 통해서 동경이에 대한 체계적인 혈통 정립이 이루어져야 할 것이다.
Kim, Eun Ho;Kim, Hyeon Kwon;Sun, Du Won;Kang, Ho Chan;Lee, Doo Ho;Lee, Seung Hwan;Lee, Jae Bong;Lim, Hyun Tae
Journal of Animal Science and Technology
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제62권4호
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pp.429-437
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2020
This study was conducted to construct basic data for the selection of elite cows by analyzing the estimated breeding value (EBV) and accuracy using the pedigree of Hanwoo cows in Gyeongnam. The phenotype trait used in the analysis are the carcass weight (CWT), eye muscle area (EMA), backfat thickness (BFT) and marbling score (MS). The pedigree of the test group and reference group was collected to build a pedigree structure and a numeric relationship matrix (NRM). The EBV, genetic parameters and accuracy were estimated by applying NRM to the best linear unbiased prediction (BLUP) multiple-trait animal model of the BLUPF90 program. Looking at the pedigree structure of the test group, there were a total of 2,371 cows born between 2003 to 2009, of these 603 cows had basic registration (25%), 562 cows had pedigree registration (24%) and 1,206 cows had advanced registration (51%). The proportion of pedigree registered cows was relatively low but it gradually increased and reached a point of 20,847 cows (68%) between 2010 to 2017. Looking at the change in the EBV, the CWT improved from 4.992 kg to 9.885 kg, the EMA from 0.970 ㎠ to 2.466 ㎠, the BFT from -0.186 mm to -0.357 mm, and the MS from 0.328 to 0.559 points. As a result of genetic parameter estimation, the heritability of CWT, EMA, BFT, and MS were 0.587, 0.416, 0.476, and 0.571, respectively, and the accuracy of those were estimated to be 0.559, 0.551, 0.554, and 0.558, respectively. Selection of superior genetic breed and efficient improvement could be possible if cow ability verification is implemented by using the accurate pedigree of each individual in the farms.
말에서 개체식별 및 친자확인을 위한 ISAG microsatellite marker의 적용을 위한 유용성 및 표준화를 위해 더러브렛종 6두를 포함한 다양한 품종의 20두를 대상으로 22개의 ISAG microsatellite marker를 분석한 결과 대립유전자의 수는 4개에서 8개로 분포하였고 더러브렛종에서 출현하는 대립유전자의 대부분이 비더러브렛종에서도 출현하였다. 본 연구결과를 통해서 ISAG microsatellte marker를 제주말의 혈통등록에 적용할 수 있음을 알 수 있었다.
To develop an efficient DNA typing system for Chinese Holstein cattle, 17 microsatellites, which were amplified in four fluorescent multiplex reactions and genotyped by two capillary electrophoresis injections, were evaluated for parentage verification and identity test. These markers were highly polymorphic with a mean of 8.35 alleles per locus and an average expected heterozygosity of 0.711 in 371 individuals. Parentage exclusion probability with only one sampled parent was approximately 0.999. Parentage exclusion probability when another parent' genotype was known was over 0.99999. Overall probability of identity, i.e. the probability that two animals share a common genotype by chance, was $1.52{\times}10^{-16}$. In a test case of parentage assignment, the 17 loci assigned 31 out of 33 cows to the pedigree sires with 95% confidence, while 2 cows were excluded from the paternity relationship with candidate sires. The results demonstrated the high efficacy of the 17 markers in parentage analysis and individual identification for Chinese Holstein cattle.
서울대공원에서 사육중인 Miniature horse 10두의 혈통정립을 목적으로 PCR에 의한 성별 판정 및 16개 microsatellite marker를 사용하여 친자감정을 실시하였다. 성별 판정에서 430 bp의 SRY band가 관찰된 7두는 숫말로 판정되었고, 친자감정에서는 멘델의 유전양식에 부합된 3두가 친자관계가 확인되었다. 향후 Miniature horse의 혈통보존 및 관리에 유용한 자료가 될 것으로 사료된다.
Rahimi, G.;Nejati-Javaremi, A.;Saneei, D.;Olek, K.
Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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제19권4호
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pp.463-467
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2006
Genetic profiles of Iranian Holstein young bulls at the national artificial insemination station were determined on the basis of individual genotypes at 13 ISAG's recommended microsatellites, the most useful markers of choice for parentage identification. In the present study a total of 119 individuals were genotyped at 13 microsatellite loci and for possible parent-offspring combinations. A high level of genetic variation was evident within the investigated individuals as assessed from various genetic diversity measures. The mean number of observed alleles per microsatellite marker was 9.15 and the number of effective alleles as usual was less than the observed values (4.03). The average observed and expected heterozygosity values were 0.612 and 0.898, respectively. The mean polymorphic information content (PIC) value (0.694) further reflected a high level of genetic variability. The average exclusion of probability (PE) of the 13 markers was 0.520, ranging from 0.389 to 0.788. The combined exclusion of probability was 0.999, when 13 microsatellite loci were used for analysis in the individual identification system. Inbreeding was calculated as the difference between observed and expected heterozygosity. Observed homozygosity was less than expected which reflects inbreeding of -3.7% indicating that there are genetic differences between bull-sires and bull-dams used to produce young bulls. The results obtained from this study demonstrate that the microsatellite DNA markers used in the present DNA typing are useful and sufficient for individual identification and parentage verification without accurate pedigree information.
본 연구는 국내 국가단위 평가결과의 문제점을 해결하면서 유전 능력평가시스템을 고도화하고 우리나라가 국제유전평가에 참여하기 위하여 국제평가기구에서 요구하는 검증작업을 통과하기 위하여 수행하였다. 본 연구에 이용된 자료는 농협중앙회 젖소개량부에서 수집한 분만일이 2001년부터 2009년까지의 검정성적으로 총 1,416,589개이며 산차는 5산으로 제한하였으며, 누적착유일은 75~305일로 제한하였고, 전체 혈통자료는 2,279,741개이며 부모를 갖는 개체는 535,409개이고 아비소는 2,467두로 구성되어 있는 기록들을 이용하였다. 유량, 유지방, 유단백에 대한 육종가는 신규로 개발한 다형질모형(Multiple traits model)을 이용하여 육종가를 구하였으며 기초작업은 SAS version 9.2와 R프로그램을 이용하였으며 유전모수를 추정하기 위하여 VCE 6.0을 이용하였다. 전반적으로 유전적 추세는 꾸준히 지속되어 오고 있으며 산차별 차이가 두드러지게 나타나지는 않았다. 유지방을 제외하고 유량과 유단백 형질의 추세가 잘 추정되었음을 알 수 있다. 유전평가분석결과 상위 1000두의 랭킹안에 최근의 생년을 갖는 딸소가 기존에 사용한 모수로 분석한 결과보다 딸소가 증가했음을 알 수 있다. 국제유전평가모형을 통해 새로 평가한 결과 씨수소상위 100두를 기존 평가모형에 의한 평가결과와 비교했을 때, 2006년생은 23두에서 28두로 2007년생은 12두에서 20두로 2008년생은 2두에서 8두로 증가하였다. 이는 최근의 딸소나 씨수소의 유전능력이 우수함에도 불구하고 상위에 랭크되지 못했던 결과가 새 모형의 적용으로 보완하여 새로운 평가분석에 적용할 수 있을 것으로 판단된다. 따라서 기존의 단형질 모형 대신 다형질 모형을 이용한 분석방법으로 평가를 실시하고 국제유전평가에도 다형질 모형을 이용한 육종가를 제시함으로써 다형질 선발의 정확도가 향상될 수 있을 것이다.
본 연구에서는 Landrace, Large White와 Duroc 3품종의 3원 교잡 시스템으로 비육돈을 생산하는 9개 농가를 대상으로 Landrace와 Large White 교배를 통해 생산된 $F_1$ 모돈과 Duroc 웅돈 그리고 비육돈을 이용하여 기 보고한 바 있는 돼지 이력추적 및 브랜드육 식별을 위한 13종의 MS marker의 개체판별능과 혈연관계 추정 효율을 실증하였다. 우선 $F_1$ 모돈과 웅돈 즉 부모 집단을 대상으로 API-CALC version 1.0 프로그램을 이용하여 무작위 교배집단, 반형매 교배집단 그리고 전형매 교배집단으로 가정시 개체 판별능이 각 각 $4.94{\times}10^{-34}$, $8.16{\times}10^{-23}$ 그리고 $2.01{\times}10^{-08}$으로 추정되었으며, 비육돈을 포함한 추정치는 $3.74{\times}10^{-35}$, $5.48{\times}10^{-25}$ 그리고 $2.96{\times}10^{-11}$으로 추정되었다. 또한 Cervus version 2.0을 이용하여 친자감별률을 추정한 결과 100% 인 것으로 추정되었다. 이론적으로 산출된 상기의 수치들을 검증하기 위해 PAPA version 2.0 프로그램을 이용하여 비육돈 전체 452두에 대한 친자감별을 실시한 결과 100% 친부모를 확인 할 수 있었으며, Cervus 프로그램을 이용하여 전체 축군에서 동일한 대립유전자형을 가진 개체의 출현을 조사한 결과 동일개체는 존재하지 않는 것을 확인하였다. 비록 개체 판별능에 대한 실증은 제시한 이론적 판별능에 상응하는 두수를 검증하지는 못하였으나, 친자확인의 경우는 제시한 이론적 효율성 100%는 실증적으로 검증되었다. 따라서 현재 국내에서 행해지는 3 품종 교잡에 의한 비육돈 생산 시스템의 경우 본 연구의 결과로 비추어 볼 때 13 MS marker를 이용하여 체계화된 전산정보와 병행하여 계열화된 생산체계하의 브랜드 단위 또는 지역별 권역으로 구분하는 이력추적이 충분히 가능하다고 사료된다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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