• 제목/요약/키워드: pairs set

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도메인 조합 기반 단백질-단백질 상호작용 확률 예측기법 (A Domain Combination Based Probabilistic Framework for Protein-Protein Interaction Prediction)

  • Han, Dong-Soo;Seo, Jung-Min;Kim, Hong-Soog;Jang, Woo-Hyuk
    • 한국생물정보학회:학술대회논문집
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    • 한국생물정보시스템생물학회 2003년도 제2차 연례학술대회 발표논문집
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    • pp.7-16
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    • 2003
  • In this paper, we propose a probabilistic framework to predict the interaction probability of proteins. The notion of domain combination and domain combination pair is newly introduced and the prediction model in the framework takes domain combination pair as a basic unit of protein interactions to overcome the limitations of the conventional domain pair based prediction systems. The framework largely consists of prediction preparation and service stages. In the prediction preparation stage, two appearance pro-bability matrices, which hold information on appearance frequencies of domain combination pairs in the interacting and non-interacting sets of protein pairs, are constructed. Based on the appearance probability matrix, a probability equation is devised. The equation maps a protein pair to a real number in the range of 0 to 1. Two distributions of interacting and non-interacting set of protein pairs are obtained using the equation. In the prediction service stage, the interaction probability of a protein pair is predicted using the distributions and the equation. The validity of the prediction model is evaluated fur the interacting set of protein pairs in Yeast organism and artificially generated non-interacting set of protein pairs. When 80% of the set of interacting protein pairs in DIP database are used as foaming set of interacting protein pairs, very high sensitivity(86%) and specificity(56%) are achieved within our framework.

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주가지수 선물의 가격 비율에 기반한 차익거래 투자전략을 위한 페어트레이딩 규칙 개발 (Developing Pairs Trading Rules for Arbitrage Investment Strategy based on the Price Ratios of Stock Index Futures)

  • 김영민;김정수;이석준
    • 산업경영시스템학회지
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    • 제37권4호
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    • pp.202-211
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    • 2014
  • Pairs trading is a type of arbitrage investment strategy that buys an underpriced security and simultaneously sells an overpriced security. Since the 1980s, investors have recognized pairs trading as a promising arbitrage strategy that pursues absolute returns rather than relative profits. Thus, individual and institutional traders, as well as hedge fund traders in the financial markets, have an interest in developing a pairs trading strategy. This study proposes pairs trading rules (PTRs) created from a price ratio between securities (i.e., stock index futures) using rough set analysis. The price ratio involves calculating the closing price of one security and dividing it by the closing price of another security and generating Buy or Sell signals according to whether the ratio is increasing or decreasing. In this empirical study, we generate PTRs through rough set analysis applied to various technical indicators derived from the price ratio between KOSPI 200 and S&P 500 index futures. The proposed trading rules for pairs trading indicate high profits in the futures market.

LINEAR MAPS THAT PRESERVE COMMUTING PAIRS OF MATRICES OVER GENERAL BOOLEAN ALGEBRA

  • SONG SEOK-ZUN;KANG KYUNG-TAE
    • 대한수학회지
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    • 제43권1호
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    • pp.77-86
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    • 2006
  • We consider the set of commuting pairs of matrices and their preservers over binary Boolean algebra, chain semiring and general Boolean algebra. We characterize those linear operators that preserve the set of commuting pairs of matrices over a general Boolean algebra and a chain semiring.

Linear Operators which Preserve Pairs on which the Rank is Additive

  • Beasley, LeRoy B.
    • Journal of the Korean Society for Industrial and Applied Mathematics
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    • 제2권2호
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    • pp.27-30
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    • 1998
  • Let A and B be $m{\times}n$ matrices. A linear operator T preserves the set of matrices on which the rank is additive if rank(A+B) = rank(A)+rank(B) implies that rank(T(A) + T(B)) = rankT(A) + rankT(B). We characterize the set of all linear operators which preserve the set of pairs of $n{\times}n$ matrices on which the rank is additive.

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도메인 조합 기반 단백질-단백질 상호작용 확률 예측 틀 (A Domain Combination-based Probabilistic Framework for Protein-Protein Interaction Prediction)

  • 한동수;서정민;김홍숙;장우혁
    • 한국정보과학회논문지:컴퓨팅의 실제 및 레터
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    • 제10권4호
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    • pp.299-308
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    • 2004
  • 최근 단백질 및 도메인과 관련된 방대한 양의 데이타들이 인터넷상에 공표되고 축적됨에 따라, 단백질간의 상호작용에 대한 예측 시스템의 필요성이 제기되고 있다. 본 논문에서는 이러한 데이타를 이용하여 계산적으로 도메인 조합 쌍에 기반하여 단백질의 상호작용 확률을 예측하는 새로운 단백질 상호작용 예측 시스템을 제안한다. 제안된 예측 시스템에서는 기존의 도메인 쌍(domain pair)의 제약성을 극복하기 위하여 도메인 조합(domain combination)과 도메인 조합 쌍(domain combination pair)의 개념이 새롭게 도입하였다. 그리고 도메인 조합 쌍(domain combination pair 또는 dc-pair)을 단백질 상호작용의 기본 단위로 간주하고 예측을 시도한다. 예측 시스템은 크게 예측 준비 과정과 서비스 과정으로 구성되어 있다. 예측 준비 과정에서는 상호작용이 있는 것으로 알려진 단백질 쌍 집합과 상호작용이 없는 것으로 추정되는 단백질 도메인 쌍 집합으로부터 각각 도메인 조합 정보와 그 출현 빈도를 추출한다. 추출된 정보들은 출현 확률 배열(Appearance Probability Matrix 또는 AP matrix)로 불리는 배열 구조에 저장된다. 논문에서는 출현 확률 배열에 기반을 두어, 단백질-단백질 상호작용을 예측하는 확률식 PIP(Primary Interaction Probability)를 고안하고, 고안된 확률식을 이용하여, 상호작용이 있는 것으로 알려진 단백질 쌍 집합과 상호작용이 없는 것으로 추정되는 단백질 도메인 쌍 집합의 확률 값 분포를 생성시킨다. 예측서비스 과정에서는 예측 준비 과정에서 얻어진 분포와 확률식을 이용하여 임의의 단백질 쌍의 상호작용 확률을 계산한다. 예측 모델의 유효성은 효모(yeast)에서 상호작용이 있는 것으로 보고된 단백질 쌍 집합과 상호작용이 없는 것으로 추정되는 단백질 쌍 집합을 이용하여 검증하였다. DIP(Database of Inter-acting Proteins)의 상호작용이 있는 것으로 알려진 효모 단백질 쌍 집합의 80%를 학습 집단으로 사용했을 때, 86%의 sensitivity와 56%의 specificity를 나타내어, 도메인을 기반으로 한 기존의 예측 시스템에 비해서 우월한 예측 정확도를 보여주었다. 이와 같은 예측 정확도의 개선은 본 예측 시스템이 상호작용의 기본 단위로 dc-pair를 채택한 점과 분류를 위하여 새롭게 고안하여 사용한 PIP식이 유효했던 것으로 판단된다.

BD PAIRS OF POLYNOMIAL ZEROS

  • Kim, Seon-Hong
    • 대한수학회논문집
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    • 제15권4호
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    • pp.697-706
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    • 2000
  • If an arithmetic progression F of length 2n and the number k with 2k$\leq$n are give, can we find two monic polynomials with the same degrees whose set of all zeros form F such that both the number of bad pairs and the number of nonreal zeros are 2k? We will consider the case that both the number of bad pairs and the number of nonreal zeros are two. Moreover, we will see the fundamental relation between the number of bad pairs and the number of nonreal zeros, and we will show that the polynomial in x where the coefficient of x(sup)k is the number of sequences having 2k bad pairs has all zeros real and negative.

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이중 곡률을 갖는 판재 성형을 위한 롤셋(Roll Set) 성형 공정 개발 (Development of a Forming Process using the Roll Set for the Manufacture of a Doubly Curved Sheet Metal)

  • 윤석준;양동열
    • 한국소성가공학회:학술대회논문집
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    • 한국소성가공학회 2002년도 춘계학술대회 논문집
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    • pp.44-47
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    • 2002
  • In order to make a doubly curved sheet metal effectively, a sheet metal forming process has been developed by adopting the flexibility of the incremental forming process and the principle of bending deformation which causes slight deformation to thickness. The developed process is an unconstrained forcing process with no holder. For this study, the experimental equipment is set up with the roll set which consists of two pairs of support rolls and one center roll. In the experiments using aluminum sheets and FEM simulation, it is found that the curvature of the formed sheet metal is determined by controlling the distance between supporting rolls in pairs and the forming depth of the center roll. The FEM simulation of the forming process using the roll set along the one path shows the distributions of the curvatures in two directions along the path, and gives information about the characteristics of the proposed forming process.

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이중 곡률을 갖는 판재의 성형 공정의 개발에 대한 실험적 연구 (Experimental Study on the Development of a Forming Process for Manufacturing Doubly-curved Sheet Metal)

  • 양동열
    • 한국소성가공학회:학술대회논문집
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    • 한국소성가공학회 1999년도 춘계학술대회논문집
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    • pp.18-21
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    • 1999
  • In this study in order to make doubly-curved sheet metal effectively a sheet metal forming process has been developed by adopting the flexibility of the incremental forming process and the principle of bending deformation which causes slight deformation to thickness The developed process is an unconstrained forming process with no holder. For this study the experimental equipment is set up with the punch-set which consists of two pairs of lower support-punches and one upper center-punch. In the experiments using aluminum sheet it is found that the curvature of the formed sheet metal is determined by controlling the distance between supporting punches in pairs and the forming depth of the center-punch. and the edge-forming method is proposed for forming the sheet metal into the balanced shape. The equation using process variables such as the distance between supporting punches in pairs and the forming depth of the center-punch is proposed for the prediction of the radii of curvatures of the formed shape and it is corrected by the experimental results and the FEM simulation results about whether springback takes place. It is found that according o the simulation there is a certain set of the distance between a pair of supporting punches and the forming depth of the center-punch which causes a little springback. It is thus shown that the radii of curvatures of the formed sheet metal can be predicated by the corrected equation unless significant springback occurs.

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효율적인 의미 검색을 위한 동영상 데이터 모델링 (Modeling of Video Data for Sffective Content-based Retrival)

  • 정미영;이원석
    • 한국정보처리학회논문지
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    • 제4권4호
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    • pp.908-922
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    • 1997
  • 본 논문에서는 많은 양의 정보를 복합적으로 포함하는 비디오 데이터의 의미적인 접근 효율을 높이고 저장 장소를 절약하기 위한 관리 방안을 제안한다. 비디오 데이터를 단순히 화일 단위의 비드열로 간주하여 처리하는 것이 아니라 원하는 부분을 속성을 통해 의미를 기술함으로써 접근할 수 있도록 한다. 비디오 데이터는 복잡한 의미를 내포하며 의미기술에 필요한 속성이 변할 수 있으므로 데이타베스 시스템의 고정된 스키마 를 통한 의미기술 방법과 유동적인 속성 집할을 통한 의미기술 방법을 병합하여 의미 기술하도록 지원하며 사용자마다 의미 표현 방법에 차이가 있을 수 있으므로 일관된 속성값을 선택 할 수 있도록 속성과 속성값을 체계적으로 관리하는 방안을 제안한다. 또한 비디오 데이타베이스에 저장된 비디오 데이터간에 의미상속을 통해 접근 효율을 높이는 한편 비디오 데이터를 물리적으로 분리하거나 공유하여 새로운 프린젠테이션을 구 성할 수 있도록 함으로써 저장공간을 효율적으로 사용할 수 있도록 지원한다.

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공간 네트워크 데이터베이스에서 POI 기반 실체화 기법을 이용한 Closest Pairs 및 e-distance 조인 질의처리 알고리즘 (Closest Pairs and e-distance Join Query Processing Algorithms using a POI-based Materialization Technique in Spatial Network Databases)

  • 김용기;장재우
    • 한국공간정보시스템학회 논문지
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    • 제9권3호
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    • pp.67-80
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    • 2007
  • 최근 LBS(location-based service) 및 텔레매틱스(telematics) 응용의 효율적인 지원을 위해, 기존 유클리디언(Euclidean) 공간 대신, 실제 도로나 철도와 같은 공간 네트워크(network)를 고려한 다수의 연구가 수행되었다. 그러나 Closest Pairs 질의 및 e-distance 조인 질의는, 하나의 POI(Point Of Interest)를 다루는 대신 POI 집합에 대하여 질의처리를 수행하기 때문에 매우 비용이 많이 든다. 아울러, k 값 및 범위의 증가에 따라 질의처리에 필요한 노드 검색 및 거리 계산의 비용이 매우 크게 증가한다. 따라서 본 논문에서는 공간 네트워크를 위한 효율적인 Closest Pairs 질의 및 e-distance 조인 질의 처리를 위해, POI 기반의 실체화 기법을 이용한 효율적인 질의처리 알고리즘을 제안한다. 아울러 기존 질의처리 알고리즘과의 성능 비교를 통하여 제안하는 알고리즘이 검색 성능이 우수함을 보인다.

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