본 연구는 유용 냉수성 어류 등의 종묘생산 시 초기의 성장과 생존률을 향상시키기 위하여, 저온에서 증식할 수 있는 저온 내성을 가진 로티퍼(Brachionus plicatilis)를 배양하여, 수온 및 시간에 따른 영양강화 실험을 실시하였다. 로티퍼의 저온 배양은 $20^{\circ}C$에서 배양하던 로티퍼의 수온을 점차적으로 낮추면서 활력이 있는 개체의 선별 배양을 반복하여 최종적으로 $10^{\circ}C$에서 사육하였다. 영양강화는 상업적으로 이용되는 영양강화제인 A, S, SCV 및 SCP의 4종류를 사용하여 10, 15 및 $20^{\circ}C$의 수온에서 6, 12 및 24시간 실시하였다. 수온 $10^{\circ}C$에서 50일간 로티퍼의 증식률 실험을 한 결과 접종 밀도 $350{\pm}7.9$개체/ml에서 최종 배양 밀도는 $1,064{\pm}5.7$개체/ml로 약 3배 개체수가 증가하였다. 영양강화제에 포함된 지방산을 분석한 결과, n3계 고도불포화 지방산인 eicosapentaenoic acid (EPA, C20:5n-3) 및 docosahexaenoic acid(DHA, C22:6n-3)는 SCP에서 각각 15.49%, 35.03 %로 높게 나타났다. 영양강화한 로티퍼의 지방산 조성은 영양강화제에 따라 영향을 받았다. EPA는 SCP가 영양강화 수온 및 시간에 관계없이 2 % 이상을 차지하여 다른 영양강화제보다 높은 비율을 나타냈다. DHA는 S가 $15^{\circ}C$, 24시간 실험구에서 12.40 %로 높게 나타났다. 영양강화 로티퍼의 EPA와 DHA의 비율을 고려하면 S를 $20^{\circ}C$에서 12시간 영양강화한 실험구가 각각 3.09, 11.65 %로 높게 나타났다.
A chitinase-producing bacterium was isolated from seashore mud around Beobseongpo in Chunmam province through the use of a selective enrichment culture. The best chitinase producing strain was isolated and identified as Serratia marcescens KY from its characteristics. For effective production of chitinase, optimum pH, temperature, and agitation speed were investigated in flask cultures. The optimum pH using Serratia marcescens KY was between pH 6 and 7 and the chitinase produced was 37.9 unit/mL. On the other hand, the optimal pH of the Serratia marcescens ATCC 27117 was 7.5, and the produced amount of chitinase was 35.2 unit/mL. The optimal temperature for chitinase production for Serratia marcescens KY and Serratia marcescens ATCC 27117 was $30^{\circ}$. The cell growth pattern at different temperature was almost identical to the chitinase production. To investigate the optimal shaking speed under optimal culture, speeds were varied in the range of 0∼300 rpm. The maximum production of chitinase was carried at 200 rpm although the cell growth was the highest at 150 rpm. It indicates that oxygen adjustment is required for the maximum chitinase production. Using optimal conditions, batch cultures for comparing Serratia marcescens KY and Serratia marcescens ATCC 27117 were carried out in a 5 L fermentor. The oxygen consumption was increased with the increase of culture. Especially, at 120 h of culture Serratia marcescens KY and Serratia marcescens ATCC 27117 produced 38.3 unit/mL, and 33.5 unit/mL, respectively.
본 실험에서 얻은 성과를 요약하면 다음과 같다. \circled1 Furfuryl alcohol를 단일탄소원으로 이용하여 ADH를 생산하는 세균을 토양중에서 분리하고, 균학적 성질에 따라 Pseudomonas sp.라 동정하였다. \circled2 본 효소는 disc 전기영동적, SDS 전기영동적, 초원침강적, 분석에서 완전히 균일하였다. \circled3 본 효소의 침강계수는 7.6S, 반응최적활성 pH는8.5~9.0에 위치하였으며, 최적활성온도는 45$^{\circ}C$ 이었다. \circled4 4개의 동일 subunit (M.W 30,000)가 회합하여 본 활성효소를 형성하는 tetramer이며, 분자량은 개략 120,000이다. \circled5 본 효소의 subunit 1분자는 266개의 amino 산 residues로 구성되고 있다.
Alkaline bacterium producing a high pro-tease activity at low temperature was isolated by using enrichment culture from soil samples and identified as Bacil-lus sp. WRD-1 Cell growth was maximal at 10 hours and the optimal initial pH and culture time of culture condition for enzyme production was pH 7 and 10 hours, respectively. Temperature range of high enzyme activity were $10~40^{\circ}C$. The optimal pH and temperature for the enzyme activity were pH9 and $30^{\circ}C$.
For the biological treatment of industrial wastewater containing high concentration of phenol, isolation and characterization of phenol - degrading bacterium were carried out. A bacterial strain P2 capable of degrading phenol was isolated from contaminated soils by enrichment culture technique and identified as the genus Rhodococcus by morphological, cultural, biochemical characteristics, and Biolog system. The optimal medium composition and cultural conditions for the growth and degradation of phenol by Rhodococcus sp. P2 were 0.1% of (NH$_4$)$_2$SO$_4$, 0.2% of KH$_2$PO$_4$, 0.25% of Na$_2$HPO$_4$ㆍ12$H_2O$, 0.2% of MgSO$_4$ㆍ7$H_2O$, and 0.008% of CaC1$_2$ㆍ2$H_2O$ along with initial pH 8.5 at 3$0^{\circ}C$. Rhodococcus sp. P2 could grow with phenol as the sole carbon source up to 1,800 ppm in batch cultures, but did not grow in medium containing above 2,000 ppm of phenol. When 800 ppm phenol was given in the optimal media, Rhodococcus sp. P2 completely degraded it within 24 h. Meanwhile, 1,800 ppm of phenol was degraded within 9 days. Rhodococcus sp. P2 could utilize toluene, n-hexane, xylene and benzene as sole carbon source .
A biosurfactant-producing microorganism was isolated from activated sludge by enrichment culture when grown on a minimal salt medium containing n-hexadecane as a sole carbon source. This microorganism was identified as Pseudomonas sp. and it was named Pseudomonas sp. EL-G527. It's optimal culture condition is 2% n-hexadecane, 0.2% NH$_4$NO$_3$, 0.3% KH$_2$PO$_4$, 0.3% $K_2$HPO$_4$, 0.02% MgSO$_4$ㆍ7$H_2O$, 0.0025% CaCk$_2$ㆍ6$H_2O$, 0.0015% FeSO$_4$ㆍ7$H_2O$ in 1$\ell$ distilled water and initial pH 7.0. Cultivation was initiated with a 2% inoculum obtained from starter cultures grown in 30 $m\ell$ of the same medium in 250 $m\ell$ flask. They were cultivated at 3$0^{\circ}C$ in reciprocal shaking incubator and the highest biosurfactant production was observed after 4 days.
In recent years, there has been a growing recognition of the important role that long non-coding RNAs (lncRNAs) play in the immunological process of hepatocellular carcinoma (LIHC). An increasing number of studies have shown that certain lncRNAs hold great potential as viable options for diagnosis and treatment in clinical practice. The primary objective of our investigation was to devise an immune lncRNA profile to explore the significance of immune-associated lncRNAs in the accurate diagnosis and prognosis of LIHC. Gene expression profiles of LIHC samples obtained from TCGA database were screened for immune-related genes. The optimal immune-related lncRNA signature was built via correlational analysis, univariate and multivariate Cox analysis. Then, the Kaplan-Meier plot, ROC curve, clinical analysis, gene set enrichment analysis, and principal component analysis were performed to evaluate the capability of the immune lncRNA signature as a prognostic indicator. Six long non-coding RNAs were identified via correlation analysis and Cox regression analysis considering their interactions with immune genes. Subsequently, tumor samples were categorized into two distinct risk groups based on different clinical outcomes. Stratification analysis indicated that the prognostic ability of this signature acted as an independent factor. The Kaplan-Meier method was employed to conduct survival analysis, results showed a significant difference between the two risk groups. The predictive performance of this signature was validated by principal component analysis (PCA). Additionally, data obtained from gene set enrichment analysis (GSEA) revealed several potential biological processes in which these biomarkers may be involved. To summarize, this study demonstrated that this six-lncRNA signature could be identified as a potential factor that can independently predict the prognosis of LIHC patients.
A new strain of acidophilic, acetogenic bacterium, Acetobacter sp. strain HA was isolated by selective enrichment from the traditionally fermented rice wine vinegar in Korea. It was a gram-negative, non-motile short rod and oxidized acetate and lactate. The optimal temperature and pH for growth were $28^{\circ}C$ and 4.0, respectively. The strain HA differed from other Acetobacter species by growing well on methanol, xylitol, inositol, dulcitol, D-xylose, L-arabinose, and D-mannose as sole sources of carbon and energy. The isolated strain HA did not produce $\gamma$-pyrones from glucose and did not produce ketone bodies from glycerol. The quinone system used in this study was an ubiquinone-9 isoprene unit. The guanine-plus-cytosine content of the DNA was 50.7 mol%, and the major cellular fatty acids were $C_{18:1} and C_{16:0}$.
20 bacterial strains capable of growing on phenol minimal medium were isolated from soil and wastewater by the enrichment culture technique, and among them, one isolate which was the best in the cell growth was selected and identified as Bacillus sp. SH3 by its characteristics. Strain SH3 could grow with phenol as the sole carbon source up to 15 mM, but did not grow in minimal medium containing above 20 mM of phenol. The optimal conditions of temperature and initial pH for growth and phenol degradation were 30$^{\circ}$C and 7.5, respectively. This strain could grow on various aromatic compounds such as catechol, protocatechuic acid, gentisic acid, o-, m-, p-cresol, benzoic acid, p-hydroxybenzoic acid, anthranilic acid, phenyl acetate and pentachlorophenol, and the growth-limiting log P value of strain SH3 on organic solvents was 3.1. In batch culture, strain SH3 degraded 97% of 10 mM phenol in 48 hours. In continuous culture under the conditions of 20 mM of influent phenol concentration and 0.050 hr$^{-1}$ of dilution rate, the treatment rate of phenol was 94%.
In the screening of phenol-degrading bacteria, a strain showing good growth in media containing phenol was isolated by using enrichment culture from various sample and identified as genus Klebsiella pneumoniae. The optimal temperature and pH for cell growth of Klebsiella pneumoniae was $35^{\circ}C$ and 8.0, respectively. When phenol was added to the minimal media as a sole source of carbon and energy, the concentration of maximum and optimum for cell growth was 1,200ppm and 1,000ppm, respectively. It was observed that Klebsiella pneumoniae was able to degrade 98% of phenol (1,000ppm) after 40hr in culture. The isolated could utilize various kinds of aromatic compounds and showed good growth in presence of phenol, m-cresol and 3-methyl catechol.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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