• 제목/요약/키워드: mutation rate

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황기 발아 및 생장에 미치는 감마선 조사 효과 (Effect of Gamma Irradiation on the Germination and Growth of Astragalus membranaceus)

  • 김동휘;박희운;박춘근;성정숙;성낙술
    • 한국약용작물학회지
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    • 제16권4호
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    • pp.238-241
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    • 2008
  • 황기는 한국의 중요 약용작물로 한약재 및 식품의 용도로 이용되고 있으며. 재배시 가장 중요한 조건은 병해 및 각종 재해 등에 대한 안정성의 확보이다. 본 연구에서는 황기의 돌연변이 육종체계 확립 및 유용변이체를 육성하기 위한 목적으로, Y-선 처리에 의한 발아, 출현 및 생존율 등에 대한 감수성을 구명하여 각종 병해 및 재해에 안정성을 지닌 돌연변이체를 육성하기 위한 기초자료를 얻고자 하였다. 시험재료로는 포천 재래종을 이용하였고 파종 후 4일째부터의 발아율은 무처리에 비하여 고선량 (300 Gy 이상)에서 유의하게 낮아지는 것으로 나타났으며, 감마선량별 생존율은 무처리 대비 100 Gy 32%, 200Gy 43%, 300 Gy 63%, 400 Gy 이상에서는 72${\sim}$89%로 현저히 감소하였다. 감마선에 민감한 형질은 초장과 분지수였고, 둔감한 형질은 엽폭, 엽장, 엽수의 순으로 나타났으며, 초장, 분지수 및 생존율을 대상으로 한 황기의 생육 및 생존 반감 ($LD_{50}$)에 해당하는 선량은 $200{\sim}300$ Gy로 나타났다. 종합적으로 감마선 처리구의 발아, 생존율 및 생육차이를 감안해 보았을 때 황기 돌연변이 유기를 위한 적정 감마선량은 $200{\sim}300$ Gy로 판단되었다.

최단 경로 라우팅을 위한 새로운 유전자 알고리즘 (A New Genetic Algorithm for Shortest Path Routing Problem)

  • 안창욱;;강충구
    • 한국통신학회논문지
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    • 제27권12C호
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    • pp.1215-1227
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    • 2002
  • 본 논문은 최단 경로 라우팅 문제의 해결을 위한 새로운 방식의 유전자 알고리즘(Genetic Algorithm)을 제안한다. 이를 위해 가변길이(variable-length) 염색체(chromosome) 구조와 그에 따른 유전자 부호화(genes coding) 기법을 설계하고, 부분 염색체(partial-chromosome)를 교환하는데 있어서 교차점(crossing-site)에 의존성이 없는 교배(crossover) 기법과 개체군(population)의 다양성(diversity)을 유지하는 돌연변이(mutation) 기법을 개발한다. 또한, 모든 부적합(infeasible) 염색체를 간단하게 치료할 수 있는 복구 함수(repair function)를 제안한다. 제안 교배 기법과 돌연변이 기법의 상호 동작은 제안 알고리즘이 개체군의 다양성을 유지하면서 해-표면(solution-surface)을 효과적으로 탐색할 수 있도록 하여 해의 최적성(optimality) 및 수렴(convergence) 속도의 향상을 도모한다. 제안 알고리즘에 의해 계산된 경로의 최적성은 유전자 알고리즘을 이용하는 기존의 알고리즘보다 우수하고, 수렴 속도도 빠르다는 것을 컴퓨터 시뮬레이션을 통해 확인한다. 이 결과는 대부분의 출발지와 도착지 쌍에 대해 기존의 유전자 알고리즘 기반의 최단 경로 라우팅 알고리즘에 비해 네트워크 토폴로지에 비교적 덜 민감한 것으로 나타난다.

A Design of Controller for 4-Wheel 2-D.O.F. Mobile Robot Using Fuzzy-Genetic algorithms

  • Kim, Sangwon;Kim, Sunghoe;Sunho Cho;chongkug
    • 한국지능시스템학회:학술대회논문집
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    • 한국퍼지및지능시스템학회 1998년도 The Third Asian Fuzzy Systems Symposium
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    • pp.607-612
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    • 1998
  • In this paper, a controller using fuzzy-genetic algorithms is proposed for pat-tracking of WMR. A fuzzy controller is implemented so as to adjust appropriate crossover rate and mutation rate. A genetic algorithms is also implemented to have adaptive adjustment of control gain during optimizing process. To check effectiveness of this algorithms, computer simulation is applied.

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두경부 종양에서 DHPLC를 이용한 p53체세포 돌연변이 검출 연구 (Analysis of p53 Somatic Mutation in Head and Neck Cancer Using Denaturing High Performance Liquid Chromatography(DHPLC))

  • 김광열;박상범;한상만;남윤형;장원철
    • 대한화학회지
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    • 제48권1호
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    • pp.33-38
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    • 2004
  • 두경부 편평 세포암종(HNSCC: head and neck squamous cell carcinoma) 의 발생과 관련하여 p53 종양 억제 유전자 (tumor suppressor gene) 의 돌연변이는 높은 비율로 나타나는 것으로 보고 되고 있다. 단국대학교 병원에서 두경부 종양으로 진단 받고 수술 받은 환자의 조직 50개를 대상으로 p53 종양 억제 유전자의 exon 5-8 까지의 영역에서 DNA를 추출하여 PCR-SSCP(polymerase chain reaction single strand conformational polymorphism) 방법과 DHPLC(denaturing high performance liquid chromatography) 방법으로 p53체세포 돌연변이(somatic mutation)를 비교 분석하였다. 그 결과 SSCP 분석 방법은 16개(32%), DHPLC 분석 방법은 17개(34%) 를 검출하였고 그 중 SSCP와 DHPLC 분석 방법 모두 exon 8번에서 결실(deletion) 형태의 돌연변이를 확인하였으며 최종적으로 자동 염기 서열 분석기(automatic DNA sequencer) 를 통하여 모든 돌연변이를 확인하였다. DHPLC 분석방법이 SSCP 방법보다 분석 시간이나 노력이 덜 소모되며 보다 더 정확한 돌연변이 검출 방법임을 확인하였다.

Comparison of Epidermal Growth Factor Receptor Mutations between Primary Tumors and Lymph Nodes in Non-small Cell Lung Cancer: a Review and Meta-analysis of Published Data

  • Wang, Feng;Fang, Ping;Hou, Dan-Yang;Leng, Zai-Jun;Cao, Le-Jie
    • Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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    • 제15권11호
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    • pp.4493-4497
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    • 2014
  • Background: Epidermal growth factor receptor (EGFR) mutations in non-small cell lung cancer (NSCLC) can predict the clinical response to tyrosine kinase inhibitor (TKI) therapy. However, EGFR mutations may be different in primary tumors (PT) and metastatic lymph nodes (MLN). The aim of this study was to compare EGFR mutations between PT and the corresponding MLN in NSCLC patients, and provide some guidelines for clinical treatment using TKI therapy. Materials and Methods: A systematic review and meta-analysis was performed with several research databases. Relative risk (RR) with the 95% confidence interval (CI) were used to investigate the EGFR mutation status between PT and the corresponding MLN. A random-effects model was used. Results: 9 publications involving 707 patients were included in the analysis. It was found that activation of EGFR mutations identified in PT and the corresponding MLN was 26.4% (187/707) and 19.9% (141/707), respectively. The overall discordance rate in our meta-analysis was 12.2% (86/707). The relative risk (RR) for EGFR mutation in PT relative to MLN was 1.33 (95%CI: 1.10-1.60; random-effects model). There was no significant heterogeneity between the studies ($I^2$=5%, p=0.003). Conclusions: There exists a considerable degree of EGFR mutation discrepancy in NSCLC between PT and corresponding MLN, suggesting that tumor heterogeneity might arise at the molecular level during the process of metastasis.

$aroP^{-}$변이가 E.coli에서 트립토판 방출에 미치는 영향 (Effects of $aroP^{-}$ mutation on the tryptophan excretion in escherichia coli)

  • 지연태;안병우;이세영
    • 미생물학회지
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    • 제23권1호
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    • pp.9-12
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    • 1985
  • 증폭된 재조합 trp operon의 발현을 위한 숙주박테리아 개발의 일환으로 숙수 E. coli에 $aroP^{-}$ 변이를 도입하였다. $aroP^{-}$ 변이의 유도에는 trans po son Tn10을 사용하였으며 P1Kc파아지를 이용하여 숙주박테리아에 형질도입하였다. General aromatic amino acid transport system이 결여된 $aroP^{-}$ 변이주는 $\beta$-thienylalanine ($(2{\times}10^{-4}M)$). p-fluor-phenylalanine ($(2{\times}10^{-4}M)$) 그리고 5-methyltryptophan에 저항성을 가졌다. $aroP^{-}$ 변이주는 $aroP^{-}$ 야생주에 비해서 〔$[^3H]$-tryptophan uptake가 상당히 감소하였다. 또한 NaN, ($(2{\times}10^{-4}M)$)를 처리하였을 때의 ($[^3H]$)-tryptophan uptake 비율은 aroP 변이주가 $aroP^{-}$야생주보다 덜 감소하였다. E. coli $trpR^{-ts}/ColE_1 -trp^+$ 균주에 aroP 형질을 도입하였을 때 트립토판 방출이 $aroP^{-}$ 야생주에 비해서 4 배나 증가하였다.

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Mutation of Cellulose Synthase Gene Improves the Nutritive Value of Rice Straw

  • Su, Yanjing;Zhao, Guoqi;Wei, Zhenwu;Yan, Changjie;Liu, Sujiao
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제25권6호
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    • pp.800-805
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    • 2012
  • Rice straw is an important roughage resource for ruminants in many rice-producing countries. In this study, a rice brittle mutant (BM, mutation in OsCesA4, encoding cellulose synthase) and its wild type (WT) were employed to investigate the effects of a cellulose synthase gene mutation on rice straw morphological fractions, chemical composition, stem histological structure and in situ digestibility. The morphological fractions investigation showed that BM had a higher leaf sheath proportion (43.70% vs 38.21%, p<0.01) and a lower leaf blade proportion (25.21% vs 32.14%, p<0.01) than WT. Chemical composition analysis showed that BM rice straw was significantly (p<0.01) higher in CP (crude protein), hemicellulose and acid insoluble ash (AIA) contents, but lower in dry matter (DM), acid detergent fiber (ADFom) and cellulose contents when compared to WT. No significant difference (p>0.05) was detected in neutral detergent fiber (NDFom) and ADL contents for both strains. Histological structure observation indicated that BM stems had fewer sclerenchyma cells and a thinner sclerenchyma cell wall than WT. The results of in situ digestion showed that BM had higher DM, NDFom, cellulose and hemicellulose disappearance at 24 or 48 h of incubation (p<0.05). The effective digestibility of BM rice straw DM and NDFom was greater than that of WT (31.4% vs 26.7% for DM, 29.1% vs 24.3% for NDFom, p<0.05), but the rate of digestion of the slowly digested fraction of BM rice straw DM and NDF was decreased. These results indicated that the mutation in the cellulose synthase gene could improve the nutritive value of rice straw for ruminants.

Characteristics of a Rhodobacter sphaeroides mutant selected by increased growth rate under light-limiting photoheterotrophic conditions

  • Lim, Soo-Kyoung;Lee, Il-Han;Lee, Jeong K.
    • 한국식물학회:학술대회논문집
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    • 한국식물학회 1999년도 Proceedings of the 17th Symposium on Plant Biology Environmental Stress and Photosynthesis
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    • pp.55-67
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    • 1999
  • A puc -deleted cell of Rhodobacter sphaeroides grows with a doubling time longer than 160 h under the light-limiting photoheterotrophic ( 3 Watts [W]/㎡) conditions due to an absence of the peripheral light-harvesting B800-850 complex. A spontaneous fast-growing mutant, R.sphaeroides SK101 was ioslate dto have∼40-h doubling at 3 Watts/㎡, while the growth of the mutant was not distinguished from its parental strain during both aerobic and light-saturating photoheterotrphic (10W/㎡) growth. The B875 complex of SK101 under the light-limiting conditions was elevated by 20 to 30% compared with that of the puc -deleted cell, reflecting parallel increase of bacteriochlorophyll and carotenoid contents of the mutant. The formation of B875 complex of SK101 under the anaerobic dark conditions with dimethylsulfoxide was the same as that of the puc-deleted cell. suggesting that the mutation of SK101 result in the altered control of B875 complex formation by light. When puc is restored in SK101 , it is not B875 complex but B800-850 complex which formation is elevated. The mutation of SK101 affected the bchF transcription most drastically to show two to tenfold increase during both aerobic and photoheterotrophic growth. The mutated phenotype of SK101 was complemented with pW2, which contains approximately 100-kb HNA of the photosynthetic gene clusters. The complementing DNA was narrowed down to a 1.1-kb DNA containing orfQ and pufKBA . The mutation of SK101 appeared to be exerted through the mutation of the orfQ gene encoding a putative bacteriochlorophyll -mobilizing protein.

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저선량율의 감마선 조사에 의한 자주 달개비의 체세포 돌연변이 출현에 관한 연구 (Mutation Frequency of Tradescantia (BNL Clone 4430) Stamen Hairs Exposed to Low Dose of Gamma Ray in the KAERI ${\gamma}$-Field)

  • Shin Han Kwon;Young Il Lee;Kyu Hoi Chung;Jeung Haing Oh
    • Nuclear Engineering and Technology
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    • 제13권3호
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    • pp.161-167
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    • 1981
  • 자주달개비(Tradescantia) BNL clone 4430을 본 연구소 감마농장(${\gamma}$-field)에 거리별로 배치하고 ${\gamma}$-선을 3.6mR/day~182R/day의 선량율로 완조사시켜, 이 식물의 수술털에 나타나는 분홍색 체세포돌연변이를 대상으로 돌연변이의 출현율을 조사하는 한편 화기에 미치는 형태변화를 조사하였다. 분홍색 체세포돌연변이율은 22.2R/day의 선량율에서 수술털 1,000개당 85.81$\pm$6.45개로 가장 높았고, 이보다 높은 선량율에서는 오히려 변이율이 감소하여 포화선량효과를 초래하였다. 또한 3.6mR/day의 낮은 선량율체서도 이 체세포돌연변이율이 자연돌연변이율보다 증가하였음을 볼 수 있었으며 비교적 낮은 선량율 조사에서는 꽃, 수술, 수술털등의 형태적 변화가 없이 돌연 변이율만의 증가를 볼수가 있어 감마농장내에서 과수나 화목등 영년식물에 저선량의 완조사를 통해 체세포돌연변이의 유기가 가능할것으로 보이며, 한편 이 식물의 특성을 이용하여 저위 방사선에 의한 유전적변화를 탐지하는데에도 적절한 수단이 될 것 같다.

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