• 미생물학회지
• /
• 제54권1호
• /
• pp.31-37
• /
• 2018

캄필로박터 제주니 균(Campylobacter jejuni)은 세균성위장관감염증을 일으키는 수인성식품매개질환의 중요한 원인 균으로 알려져 있다. 2014년부터 2016년까지 경기지역에서 발생된 17번의 식중독에서 캄필로박터 제주니 균에 감염된 430명의 환자와 조리종사자에게서 208건의 균주를 선별하였다. 선별된 균주의 유전적 상관관계와 유전형분포를 확인하기 위하여 PFGE와 multiplex-PCR typing 방법을 사용하여 비교분석 하였다. 47개의 Penner-type으로 구분되는 캄필로박터 제주니 균의 혈청형을 multiplex-PCR typing을 이용하여 35개의 유전형으로 구분할 수 있는 것을 확인하였고 선별된 균주에서 7개의 유전형(HS2, HS4A, HS8, HS15, HS29, HS41, HS53)으로 구분되는 것을 확인하였다. 가장 많은 케이스에서 분리된 유전형은 HS2였고 7건의 식중독케이스에서 확인되었다. PFGE를 통하여 11건의 식중독에서 모두 5개의 그룹으로 분류되었고 그룹간의 유사성은 61.8에서 66.6%였다. 본 연구는 다양한 유전자 분석방법을 통하여 경기도내에서 분리된 캄필로박터 제주니 균의 유전적 다양성을 파악하고 향후 집단발생시 환자의 분리 균주 간의 상관관계 규명하며 캄필로박터 감염증의 발생 및 확산 방지에 필요한 기초자료를 마련하고자 한다.

• 보존과학연구
• /
• 통권22호
• /
• pp.27-40
• /
• 2001

DNA typing is often used to determine identity from human remains. Recently, the molecular biological analysis of ancient deposits has become possible since methods for the recovery of DNA conserved in bones or teeth from archaeological remains have been developed. In the field of archaeology, one of the most promising approaches is to identify the individuals present in a mass burial site. We performed nuclear DNA typing and mitochondrial DNA sequencing analysis based on PCR from a Korea ancient human remain excavated from Sa-chon Nuk-island and civilian access controlline(CACL). A femur bone were collected and successfully subjected to DNA extraction, quantification, PCR amplification, and subsequently typed for several shot tandem repeat(STR)loci. 4 types of STR systems used in this study were CTT multiplex(CSF1PO, TPOX, TH01), FFv multiplex(F13A01, FESFPS, vWA), Silver STRⅢ multiplex(D16S539, D7S820, D13S317), and amelogenin for sex determination. This studies are primarily concerned with the extraction, amplification, and DNA typing of ancient human bone DNA samples. Also, it is suggestive of importance about closely relationship between both fields of archaeology and molecular biology.

• 한국동물위생학회지
• /
• 제25권3호
• /
• pp.275-283
• /
• 2002

Forty strains of Staphylococcus aureus were isolated from mastitic milk. As a result of antimicrobial susceptibility test, the strains of S aureus revealed 47.5% were resistant to ampicillin and penicillin, and 7.5% to gentamicin. But 45% of isolates were sensitive to antimicrobial agents tested. In case of enterotoxin production, 56.3% of 16 strains produced enterotoxin D. Two strain of enterotoxin D producers produced both enterotoxin B and D. According to isolation date, 15 representative strains were selected. As a results of pulsed field gel eletrophoresis analysis of the 15 representative strains, 14 strains were identical. Therefore we consider the identical strains of S aureus have caused continuously bovine mastitis in this dairy farm. If autogenous vaccine can be made by the strains, it will work well for the prevention of bovine mastitis caused by S aureus.

• 한국동물위생학회지
• /
• 제37권4호
• /
• pp.247-252
• /
• 2014

The economic impact of swine mycoplasma infection is high. An accurate diagnosis is often difficult and time consuming. We report the development and validation of an effective multiplex polymerase chain reaction (PCR) assay that detects Mycoplasma (M.) hyopneumoniae and M. hyorhinis. The multi detection of M. hyopneumoniae and M. hyorhinis primer set were employed to detect mycoplasma species and typing of the species was performed on the basis of sequence analysis of the PCR product. The target nucleic acid fragments were specifically amplified by M. hyopneumoniae and M. hyorhinis PCR with 16S ribosomal DNA primers. Single and mixed Mycoplasma species DNA templates were used to evaluate the specificity of the multiplex assay. The corresponding specific DNA products were amplified for each pathogen. The multiplex PCR assay provides a novel tool for simultaneous detection and differentiation of M. hyopneumoniae and M. hyorhinis.

• 한국동물번식학회:학술대회논문집
• /
• 한국동물번식학회 2002년도 춘계학술발표대회 발표논문초록집
• /
• pp.180.1-180
• /
• 2002

• 대한수의학회지
• /
• 제47권4호
• /
• pp.399-407
• /
• 2007

Cause of high lethality and dissemination to human being, new development of rapid method for the detection of highly pathogenic Avian Influenza Virus (AIV) is still necessary. For the detection of AIV subtype H5N1, typical pathogenic AIV, new method to confirm sub-typing of this virus is also needed. For the purpose of ultra-rapid detection and sub-typing of hemagglutinin and neuraminidase of AIV, this study was planned. As the results we could demonstrate an ultra-rapid multiplex real-time PCR (URMRT PCR) for the detection of AIV In this study, the URMRT PCR were optimized with synthesized AIV H5- and AIV Nl-specific DNA templates and GenSpector TMC, which is a semiconductor process technology based real-time PCR system with high frequencies of temperature monitoring. Under eight minutes, the amplifications of two AIV subtype-specific PCR products were successfully and independently detected by 30 cycled ultra-rapid PCR, including melting point analysis, from $1{\times}10^3$ copies of mixed template DNA. The URMRT PCR for the detection of AIV H5N 1 developed in this study could be expected to apply not only detections of different AIVs, but also various pathogens. It was also discussed that this kind of the fastest PCR based detection method could be improved by advance of related technology in near future.

• 생명과학회지
• /
• 제21권7호
• /
• pp.947-952
• /
• 2011

현재까지 다수의 역학연구를 통해 피부에 발생한 보통사마귀에서 제 1, 2, 3, 4, 7, 10, 27, 57 및 65형의 인유두종바이러스가 검출되었다. 그러나 기존의 중합효소연쇄반응(conventional polymerase chain reaction, PCR)을 이용하는 경우 절차가 복잡하여 시간이 오래 걸리는 단점이 있었다. 이번 연구를 통해 저자들은 보통사마귀에서 가장 흔히 검출되는 6가지 유전자형의 인유두종바이러스를 한번에 확인 가능한 간편한 muliplex PCR의 개발을 목표로 하였다. 인유두종바이러스의 염기서열분석을 통해, L1에서 E6, 그리고 E2에서 L2 사이의 유전자간영역(intergenic region)으로 부터 6쌍의 primer를 고안하였으며, L1 유전자서열 분석을 통해 multiplex PCR의 특이성을 확인하였다. 총 129개의 조직표본 중 109개에서 제 1, 2, 3, 4, 27, 57형의 인유두종바이러스를 확인하였다. 이번 연구의 primer를 이용한 인유두종바이러스 검출의 민감도와 특이도는 각각 85%와 99.5%였다. 이러한 primer 세트로 인유두종바이러스가 검출되지 않은 20개의 조직표본의 경우, 또 다른 HPV primer를 사용한 추가적인 multiplex PCR을 시행하여 7개 표본에서 제 7형 및 65형의 인유두종바이러스가 검출되었다. 이상의 결과는 본 연구를 통해 새롭게 고안된 multiplex PCR 기법을 통해 보통사마귀에서의 인유두종바이러스를 보다 정확하고 빠르게 검출할 수 있다는 것을 보여 준다.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
• /
• 제19권11호
• /
• pp.1470-1474
• /
• 2009

This paper describes the development a of direct multiplex reverse transcription-nested polymerase chain reaction (PCR) method, devised for simultaneous detection and typing of influenza viruses. This method combines the direct reverse transcription reaction without RNA purification with the enhancement of sensitivity and specificity of nested PCR. The method successfully detected three major human influenza viruses: influenza virus A subtype 1 (H1N1) and subtype 3 (H3N2), and influenza B virus (B). The minimum number of virus particles (pfu/ml) necessary for detection in spiked saliva samples was 200 (H1N1), 140 (H3N2), and 4.5 (B). The method's sensitivity and simplicity will be convenient for use in clinical laboratories for the detection and subtyping of influenza and possibly other RNA viruses.

• 한국미생물·생명공학회지
• /
• 제31권4호
• /
• pp.334-341
• /
• 2003

2001년 경북지역 콜레라 유행시 설사환자에서 V. cholerae O1 El Tor형 90주를 분리하였다. 분리균을 대상으로 ctxA, tcpA, hlyA gene에 대한 multiplex-PCR 시험에서는 분리균 모두에서 302, 223, 471 bps크기의 DNA 증폭산물 band를 확인하였다. ctxA 및 ctxB gene 부위의 유전자 염기서열 비교에서 분리균과 GenBank에 수록된 균간의 유형의 차이를 보였다. PFGE typing 실험에서는 분리균 모두에서 동일한 amplicon 단편을 나타내었다. 또한, 2002년 8월부터 10월까지 콜레라균 서식가능성 규명을 위해 경북 동해안 일대에서 plankton 시료채취 및 V. cholerae O1 및 V. cholerae O139의 rfb 및 CT gene 검출을 위한 multiplex-PCR 확인실험에서는 ctxA gene의 DNA band는 일부 검출되었으나, V. cholerae O1 및 V. cholerae O139는 분리되지 않았다. 험에서 ctxA gene DNA band는 검출되었으나, V. cholerae O1 및 V. cholerae O1는 분리되지 않았다.

• 대한수의학회지
• /
• 제38권3호
• /
• pp.553-558
• /
• 1998

Using the previous established multiplex PCR (mPCR), the presence of six kinds of staphylococcal superantigen (SAg) genes was investigated for nineteen Staphylococcus aureus isolates from the commercialized meat sources. As a result, only one isolate from pork among 19 S aureus isolates (5.3%) was confirmed as a potential SAg producer and harbored sec gene. The results in this study suggest that meat may not be major contagion of staphylococcal food poisoning (SFP) in Korea and that staphylococcal enterotoxin type C may be associated with the disease. Also, the mPCR method in this study can be a useful genotypic method which can overcome the typical disadvantages of conventional antibody-based methods due to antigenic homology, and furthur survey on food-borne S aureus isolates can provide the important epidemiological data for SFP in Korea.