Many species in Gymnodiniales, which are unarmored dinoflagellates, are responsible for marine algal blooms and some of them have potent toxin in the cell. Their taxonomy has so far been well-defined, and several genera (e.g. Akashiwo, Gymnodinium, Karenia) have recently been re-described. In Korea, few works have been carried out on their taxonomical and molecular studies. This study focused on comparison of both morphological and molecular characteristics of five unarmored dinoflagellates on Korean coastal water: Akashiwo sanguinea, Cochlodinium polykrikoides, Gymnodinium catenatum, Gymnodinium impudicum and Karenia aureolum (=K. mikimotoi). Morphological characteristics observed here was in good accordance with the original descriptions of individual species. In addition, none of difference was found in morphological comparisons between the Korean and foreign strains. Furthermore, molecular analysis showed that the SSU rDNA sequences were generally identical according to each species. In some distinct features, A. sanguinea, which has generally the same morphological features, were divided into two groups: one was Korean isolates including European isolates, the other was American isolates. In the two groups, the nucleus was positioned differently: middle of the cells in the Korean isolates (GnSg02, GnSg03), near the epicone in American isolates (CCMP1593, CCMP1837). In addition, this was strongly supported by phylogenetic analysis, inferred from the SSU rDNA sequences. K. aureolum (GrAr01) was corresponded to European G. aureolum (=K. mikimotoi) in shape and position of nucleus, chloroplast, however, which is similar to K. digitata in view of having a finger-like sulcus. This was in good agreement with phylogenetic study of these species. G. catenatum have identical morphology except the ridge location, and their genotype of SSU rDNA was also identical to GenBank data of the same species. From this study, we found that the five Korean unarmored dinoflagellates are identical morphological characteristics and genotype to each species of foreign isolates.
The re-identification of two Korean tonguefishes, Cynoglossus interruptus and Symphurus orientalis, was carried out using eight specimens collected from Korean waters in 2007 and 2013. C. interruptus is characterized by having a single row of scales between rows connected to the supraorbital line and the middle lateral line, 107–113 dorsal fin rays, 86–89 anal fin rays, and 53–55 vertebrae. S. orientalis is characterized by having a 1-2-2-2-2 ID pattern, 97–100 dorsal fin rays, 83–89 anal fin rays, and 52–55 vertebrae. Molecular analysis using mitochondrial DNA Cytochrome Oxidase subunit I sequences showed that specimens of the two species corresponded well to Japanese C. interruptus and Taiwanese S. orientalis, respectively. Therefore, although several reports have raised questions regarding the distribution of C. interruptus and S. orientalis in Korean waters, morphological and molecular data confirm that these two species are indeed distributed in these waters.
Kim, Se-Joo;Choi, Joong-Ki;Ryu, Seong-Ho;Min, Gi-Sik
Animal cells and systems
/
제15권3호
/
pp.251-258
/
2011
Ciliates are considered one of the most diverse protozoa and play significant roles in ecology. For successful taxonomic study of these microscopic eukaryotes, a staining procedure is necessary, due mainly to intrinsic difficulties in recognizing characteristics from living cells. Although molecular taxonomy has been used to resolve the ambiguities associated with traditional morphology-based taxonomy, extraction of genomic DNA from stained ciliate cells is not available yet. In the present study, we describe a method to extract genomic DNA from a single protargol-impregnated euplotid cell. By using $HgCl_2$ as a fixative and modulating the exposure time of bleach solution in the protargol impregnation, high-quality genomic DNA can successfully be extracted from a stained single cell with minimal loss of morphological integrity. This technique will contribute to the effectiveness of combined approaches of molecular and morphological taxonomy from single ciliate cells.
Joo Yeon Youn;Kyong Ha Han;Kyeong Yoon Kwak;Hyeon Ho Shin
환경생물
/
제41권4호
/
pp.608-615
/
2023
The morphological features of germling cells were examined to identify an unspecified resting cyst (described as Cochlodinium cf. polykrikoides-like resting cyst) in the Korean coastal area. LSU rRNA gene sequences were also obtained from a strain established from the germling cells. The resting cysts isolated from Korean coastal sediment were characterized as being brown in color, having a large dark-red body, and fibrous lobed ornaments. The germling cells were ellipsoidal with an irregular outline and had an open comma-shaped ASC (apical structure complex), a wide and deep cingulum, and a deep sulcus. These morphological features were consistent with those of previously described harmful dinoflagellate Pseudocochlodinium profundisulcus. The molecular phylogeny revealed that the germling cells and P. profundisulcus were conspecific. Based on these morphological and phylogenetic data, this study documents the occurrence of P. profundisulcus in a Korean coastal area for the first time.
The genus Pterosiphonia includes twenty-one currently described species of red algae that occur in temperate to tropical regions of the Atlantic and Pacific Oceans. Pterosiphonia spinifera was originally described as Polysiphonia spinifera from Peru and later transferred to Pterosiphonia. Pterosiphonia spinifera has been reported from Peru as Pterosiphonia pennata, which was originally described from the Mediterranean Sea. Recently, Pterosiphonia arenosa was described based on specimens of P. pennata from Korea. We collected P. spinifera along the coast of Peru and P. arenosa near the type locality in Korea. We compared them with the isotype specimens of P. arenosa using both morphological and molecular data. Our morphological observations and our phylogenetic analysis of rbcL sequences demonstrate that P. spinifera and P. arenosa are conspecific and indicate that P. arenosa is a later synonym of P. spinifera. Our study confirms the wide occurrence of P. spinifera in the western and eastern Pacific Ocean.
Laurencia is a red algal genus that was described by J.V. Lamouroux in 1813. The main characteristics of this genus have been known as the presence of four pericentral cells in an axial segment, secondary pit connections between adjacent epidermal cells, and the presence of corps en cerise in both epidermal and trichoblast cells. Additionally, the tetrasporangia are arranged in a parallel manner, and male branches feature terminal cup-shaped spermatangial pits. Currently, sixteen Korean Laurencia species have been reported based on their morphological characteristics. In this study, Laurencia decussata and L. pacifica have been added as new records to the Korean algal flora based on a combination of morphological observations and molecular analyses of rbcL sequences. Laurencia decussata has expanded from Australia and New Zealand to Korea, while the distribution of L. pacifica has expanded from USA and Mexico to Korea.
Leaves of Chionanthus retusus were found to be damaged by leaf spot disease associated with a fungus in Iksan, Korea. Leaf spots were angular to irregular, vein-limited, scattered, 1-8 mm diameter, brownish-gray to dark brown when dry, with heavy fructification. The pathogen causes premature defoliation of C. retusus plant and was identified as Pseudocercospora chionanthi-retusi based on morphological and molecular-phylogenetic analyses. The phylogenetic tree was constructed using multi-locus DNA sequence data of partial actin (actA), partial translation elongation factor 1-alfa (tef1), partial DNA-directed RNA polymerase II second largest subunit (rpb2) genes, and internal transcribed spacer regions. Current study provides detail morphological description of P. chionanthi-retusi on C. retusus in Korea, with supports of phylogenetic analysis and pathogenicity test.
Rubus crataegifolius is a shrub species and is primarily distributed throughout Asia and Europe. We collected 550 representative samples of the eleven populations in Korea to estimate leaf variation within species. The 35 morphological characteristics allowed us to resolve well-supported fixed characteristics and variable characteristics. Sixteen of twenty-three quantitative characteristics and five of twelve qualitative characteristics showed significant differences among populations. We argued that the population differentiation can accounted for the variation in phenetic characteristics such as spine in this species, but were less successful in accounting for variation in other traits. Within a polystatistic leaf structure, their morphological differences could be modulated by ecological pressure such as temperature, altitude, duration of sunshine, and solar radiation. The phenogram showed two distinct clades. One was a group in central Korea and the other was a group in the southern regions of Korea. If morphological characteristics in R. crataegifolius populations reflect their ecological niche, morphology should be regarded with caution as the main criterion for population studies in R. crataegifolius.
Kim, Gi-Jun;Song, Young-Ha;Gi, Gwang-Yeon;Kim, Seong-Tae;Lee, Ja-Hyun;Han, Tae-Ho
원예과학기술지
/
제29권3호
/
pp.240-246
/
2011
The principal objective of this study was to estimate the availability of morphological data on the basis of the guidelines of the International Union for the Protection of New Varieties of Plants (UPOV) with regard to the identification of the rose germplasm. The correlation of morphological traits and random amplified polymorphic DNA (RAPD) marker data among 44 rose cultivars was assessed via a mantel test. Thirty eight phenotypes were employed for morphological analysis. Sixteen primers were utilized for RAPD analysis, and these generated 225 polymorphic bands. The dendrogram based on the RAPD markersgrouped 44 rose cultivars according to their horticultural types. No significant correlation was observed between the morphological and RAPD marker data. We concluded that current UPOV traits could not be applied to study genetic variation. Further studies on morphological traits are required for the analysis of genetic variation among cultivars.
Morphological and molecular information of two marine algae collected from Korea is given. One belonging to a green alga, is characterized by small size up to 4 cm high, much branched thalli on all sides, slender and linear branchlets which is constricted near base, axes without prominent branch scars, chloroplasts with a prominent central pyrenoid. The other, as a brown alga, is distinct from other Korean species in having cylindrical elevated projections at all parts of thallus axis, leaves with slightly serrulate margin together with distinct midrib bearing spines and absence to rarely occurred vesicles. In phylogenetic tree based on rbcL sequences, these two species are nested in the same clade with Bryopsis triploramosa and Sargassum polyporum, respectively. In this study, these two species are newly recorded in the Korean marine algal flora based on the morphological and molecular data.
본 웹사이트에 게시된 이메일 주소가 전자우편 수집 프로그램이나
그 밖의 기술적 장치를 이용하여 무단으로 수집되는 것을 거부하며,
이를 위반시 정보통신망법에 의해 형사 처벌됨을 유념하시기 바랍니다.
[게시일 2004년 10월 1일]
이용약관
제 1 장 총칙
제 1 조 (목적)
이 이용약관은 KoreaScience 홈페이지(이하 “당 사이트”)에서 제공하는 인터넷 서비스(이하 '서비스')의 가입조건 및 이용에 관한 제반 사항과 기타 필요한 사항을 구체적으로 규정함을 목적으로 합니다.
제 2 조 (용어의 정의)
① "이용자"라 함은 당 사이트에 접속하여 이 약관에 따라 당 사이트가 제공하는 서비스를 받는 회원 및 비회원을
말합니다.
② "회원"이라 함은 서비스를 이용하기 위하여 당 사이트에 개인정보를 제공하여 아이디(ID)와 비밀번호를 부여
받은 자를 말합니다.
③ "회원 아이디(ID)"라 함은 회원의 식별 및 서비스 이용을 위하여 자신이 선정한 문자 및 숫자의 조합을
말합니다.
④ "비밀번호(패스워드)"라 함은 회원이 자신의 비밀보호를 위하여 선정한 문자 및 숫자의 조합을 말합니다.
제 3 조 (이용약관의 효력 및 변경)
① 이 약관은 당 사이트에 게시하거나 기타의 방법으로 회원에게 공지함으로써 효력이 발생합니다.
② 당 사이트는 이 약관을 개정할 경우에 적용일자 및 개정사유를 명시하여 현행 약관과 함께 당 사이트의
초기화면에 그 적용일자 7일 이전부터 적용일자 전일까지 공지합니다. 다만, 회원에게 불리하게 약관내용을
변경하는 경우에는 최소한 30일 이상의 사전 유예기간을 두고 공지합니다. 이 경우 당 사이트는 개정 전
내용과 개정 후 내용을 명확하게 비교하여 이용자가 알기 쉽도록 표시합니다.
제 4 조(약관 외 준칙)
① 이 약관은 당 사이트가 제공하는 서비스에 관한 이용안내와 함께 적용됩니다.
② 이 약관에 명시되지 아니한 사항은 관계법령의 규정이 적용됩니다.
제 2 장 이용계약의 체결
제 5 조 (이용계약의 성립 등)
① 이용계약은 이용고객이 당 사이트가 정한 약관에 「동의합니다」를 선택하고, 당 사이트가 정한
온라인신청양식을 작성하여 서비스 이용을 신청한 후, 당 사이트가 이를 승낙함으로써 성립합니다.
② 제1항의 승낙은 당 사이트가 제공하는 과학기술정보검색, 맞춤정보, 서지정보 등 다른 서비스의 이용승낙을
포함합니다.
제 6 조 (회원가입)
서비스를 이용하고자 하는 고객은 당 사이트에서 정한 회원가입양식에 개인정보를 기재하여 가입을 하여야 합니다.
제 7 조 (개인정보의 보호 및 사용)
당 사이트는 관계법령이 정하는 바에 따라 회원 등록정보를 포함한 회원의 개인정보를 보호하기 위해 노력합니다. 회원 개인정보의 보호 및 사용에 대해서는 관련법령 및 당 사이트의 개인정보 보호정책이 적용됩니다.
제 8 조 (이용 신청의 승낙과 제한)
① 당 사이트는 제6조의 규정에 의한 이용신청고객에 대하여 서비스 이용을 승낙합니다.
② 당 사이트는 아래사항에 해당하는 경우에 대해서 승낙하지 아니 합니다.
- 이용계약 신청서의 내용을 허위로 기재한 경우
- 기타 규정한 제반사항을 위반하며 신청하는 경우
제 9 조 (회원 ID 부여 및 변경 등)
① 당 사이트는 이용고객에 대하여 약관에 정하는 바에 따라 자신이 선정한 회원 ID를 부여합니다.
② 회원 ID는 원칙적으로 변경이 불가하며 부득이한 사유로 인하여 변경 하고자 하는 경우에는 해당 ID를
해지하고 재가입해야 합니다.
③ 기타 회원 개인정보 관리 및 변경 등에 관한 사항은 서비스별 안내에 정하는 바에 의합니다.
제 3 장 계약 당사자의 의무
제 10 조 (KISTI의 의무)
① 당 사이트는 이용고객이 희망한 서비스 제공 개시일에 특별한 사정이 없는 한 서비스를 이용할 수 있도록
하여야 합니다.
② 당 사이트는 개인정보 보호를 위해 보안시스템을 구축하며 개인정보 보호정책을 공시하고 준수합니다.
③ 당 사이트는 회원으로부터 제기되는 의견이나 불만이 정당하다고 객관적으로 인정될 경우에는 적절한 절차를
거쳐 즉시 처리하여야 합니다. 다만, 즉시 처리가 곤란한 경우는 회원에게 그 사유와 처리일정을 통보하여야
합니다.
제 11 조 (회원의 의무)
① 이용자는 회원가입 신청 또는 회원정보 변경 시 실명으로 모든 사항을 사실에 근거하여 작성하여야 하며,
허위 또는 타인의 정보를 등록할 경우 일체의 권리를 주장할 수 없습니다.
② 당 사이트가 관계법령 및 개인정보 보호정책에 의거하여 그 책임을 지는 경우를 제외하고 회원에게 부여된
ID의 비밀번호 관리소홀, 부정사용에 의하여 발생하는 모든 결과에 대한 책임은 회원에게 있습니다.
③ 회원은 당 사이트 및 제 3자의 지적 재산권을 침해해서는 안 됩니다.
제 4 장 서비스의 이용
제 12 조 (서비스 이용 시간)
① 서비스 이용은 당 사이트의 업무상 또는 기술상 특별한 지장이 없는 한 연중무휴, 1일 24시간 운영을
원칙으로 합니다. 단, 당 사이트는 시스템 정기점검, 증설 및 교체를 위해 당 사이트가 정한 날이나 시간에
서비스를 일시 중단할 수 있으며, 예정되어 있는 작업으로 인한 서비스 일시중단은 당 사이트 홈페이지를
통해 사전에 공지합니다.
② 당 사이트는 서비스를 특정범위로 분할하여 각 범위별로 이용가능시간을 별도로 지정할 수 있습니다. 다만
이 경우 그 내용을 공지합니다.
제 13 조 (홈페이지 저작권)
① NDSL에서 제공하는 모든 저작물의 저작권은 원저작자에게 있으며, KISTI는 복제/배포/전송권을 확보하고
있습니다.
② NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 상업적 및 기타 영리목적으로 복제/배포/전송할 경우 사전에 KISTI의 허락을
받아야 합니다.
③ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 보도, 비평, 교육, 연구 등을 위하여 정당한 범위 안에서 공정한 관행에
합치되게 인용할 수 있습니다.
④ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 무단 복제, 전송, 배포 기타 저작권법에 위반되는 방법으로 이용할 경우
저작권법 제136조에 따라 5년 이하의 징역 또는 5천만 원 이하의 벌금에 처해질 수 있습니다.
제 14 조 (유료서비스)
① 당 사이트 및 협력기관이 정한 유료서비스(원문복사 등)는 별도로 정해진 바에 따르며, 변경사항은 시행 전에
당 사이트 홈페이지를 통하여 회원에게 공지합니다.
② 유료서비스를 이용하려는 회원은 정해진 요금체계에 따라 요금을 납부해야 합니다.
제 5 장 계약 해지 및 이용 제한
제 15 조 (계약 해지)
회원이 이용계약을 해지하고자 하는 때에는 [가입해지] 메뉴를 이용해 직접 해지해야 합니다.
제 16 조 (서비스 이용제한)
① 당 사이트는 회원이 서비스 이용내용에 있어서 본 약관 제 11조 내용을 위반하거나, 다음 각 호에 해당하는
경우 서비스 이용을 제한할 수 있습니다.
- 2년 이상 서비스를 이용한 적이 없는 경우
- 기타 정상적인 서비스 운영에 방해가 될 경우
② 상기 이용제한 규정에 따라 서비스를 이용하는 회원에게 서비스 이용에 대하여 별도 공지 없이 서비스 이용의
일시정지, 이용계약 해지 할 수 있습니다.
제 17 조 (전자우편주소 수집 금지)
회원은 전자우편주소 추출기 등을 이용하여 전자우편주소를 수집 또는 제3자에게 제공할 수 없습니다.
제 6 장 손해배상 및 기타사항
제 18 조 (손해배상)
당 사이트는 무료로 제공되는 서비스와 관련하여 회원에게 어떠한 손해가 발생하더라도 당 사이트가 고의 또는 과실로 인한 손해발생을 제외하고는 이에 대하여 책임을 부담하지 아니합니다.
제 19 조 (관할 법원)
서비스 이용으로 발생한 분쟁에 대해 소송이 제기되는 경우 민사 소송법상의 관할 법원에 제기합니다.
[부 칙]
1. (시행일) 이 약관은 2016년 9월 5일부터 적용되며, 종전 약관은 본 약관으로 대체되며, 개정된 약관의 적용일 이전 가입자도 개정된 약관의 적용을 받습니다.