As an effort to explore fungal diversity, fungal survey was undertaken in 2018 in Jangheung, Korea. For the survey, medicinal plant leaves were sampled from Selaginella tamariscina, Serratula coronata ssp. insularis, Scutellaria baicalensis, Scrophularia buergeriana and subjected to fungal isolation. Four unrecorded fungal species, Paraboeremia selaginellae, Colletotrichum camelliae, Alternaria eichhorniae, and Phomopsis capsici were obtained from the survey. This study described their morphological characteristics including colony features formed on media, light microscopic images and molecular characteristics of nucleotide sequences of the ITS and 28S rDNA regions.
Splice site prediction in DNA sequence is a basic search problem for finding exon/intron and intron/exon boundaries. Removing introns and then joining the exons together forms the mRNA sequence. These sequences are the input of the translation process. It is a necessary step in the central dogma of molecular biology. The main task of splice site prediction is to find out the exact GT and AG ended sequences. Then it identifies the true and false GT and AG ended sequences among those candidate sequences. In this paper, we survey research works on splice site prediction based on support vector machine (SVM). The basic difference between these research works is nucleotide encoding technique and SVM kernel selection. Some methods encode the DNA sequence in a sparse way whereas others encode in a probabilistic manner. The encoded sequences serve as input of SVM. The task of SVM is to classify them using its learning model. The accuracy of classification largely depends on the proper kernel selection for sequence data as well as a selection of kernel parameter. We observe each encoding technique and classify them according to their similarity. Then we discuss about kernel and their parameter selection. Our survey paper provides a basic understanding of encoding approaches and proper kernel selection of SVM for splice site prediction.
LEE Y.;JUNG J. H.;CHUNG H. S.;PARK Y. S.;KIM H. R.;KIM H. G.;KIM B. G.;KIM J. S.;HAN S. T.
Journal of The Korean Astronomical Society
/
v.29
no.spc1
/
pp.173-174
/
1996
We have mapped $17 deg^2$ region toward Galactic anticenter in $^{12}CO$ J = 1 - 0 using the 3 mm SIS receiver on the 14 m telescope at Taeduk Radio Astronomy Observatory (TRAO). The region mapped in this paper is the first target of the Galactic AntiCenter CO Survey Project (GACCOS) and was selected comparing with IRAS Sky Survey Atlas (ISSA) images at 100${\mu}m$. Molecular emission of the target area is found to be very extended and is well matching with the FIR emission boundary. There are several pieces of clouds, and as some of spectra show several peaks, there seem to be several clouds overlapped in some directions. The Velocity of Local Standard of Rest ($V_{LSR}$) of the CO emission of the mapped region ranges from -20 to +10 km/s. It is also found that the two cloudlets located around I = $180^{\circ}$ have $V_{LSR}$ = -20 km/s, which is very abnormal. The peak antenna temperature of 13 K arises near the H II Region S241.
Stars form through the gravitational collapse of molecular clouds. However, the rate at which a star gains most of its mass and the physics that drives the main phase of stellar growth is still unclear. The typical luminosity of observed protostars is smaller than what expected from the Shu's inside-out collapse model, which predicts a constant mass accretion rate. The episodic accretion model has been suggested as a solution of this luminosity problem. The JCMT Transient survey is a long term monitoring program using JCMT/SCUBA-2 to detect accretion variability of protostars in the eight nearby star-forming regions. Recently, we found a rise of the 850 micron flux at a clump in the Serpens main region at the rate of ~17% relative to the mean flux over previous observations. The submm clump is associated with a class I protostar, EC53, which has been reported as a binary system with a periodic variability. In this talk, we will provide a brief overview of the JCMT Transient Survey project, present the detection of the variable source, and discuss about follow-up observations.
Backgrounds/Aims: Patients who undergo pancreatic surgery with venous resection have high rates of morbidity/mortality. Also, they are high-risk for postoperative venous thromboembolism. Whether this group should be routinely anticoagulated is unknown. This study aimed to establish current anticoagulation practices. Methods: A survey (https://form.jotform.com/220242489107048) was sent out to pancreatic surgeons. Questions covered center volume, venous resection/reconstruction techniques and anticoagulation policies. Results: Sixty-five centers from 17 countries responded. Following a "side-bite" venous resection with a patch repair, 40% used an autologous vein patch, 27% used peritoneum, and 27% used a bovine patch. After formally resecting a segment of vein, 17% of centers used an interposition graft (IG). Left renal vein (41%) and polytetrafluoroethylene (73%) grafts were the most commonly used autologous and prosthetic IGs, respectively. Following a prosthetic IG, an autologous IG, and a "side-bite" resection, 59%, 28%, and 19% of centers provided therapeutic anticoagulation, respectively (66% used low molecular-weight heparin). The duration of therapy provided varied from inpatient stay only (14%) to six months (32%). Conclusions: Our global survey indicates that anticoagulation practices are highly variable. Centers do not agree on when to anticoagulate, how to anticoagulate, or the duration of therapy. A robust trial is required to provide clarity.
We present a multi-dimensional reduction method of the surveyed cube database obtained using a single- dish radio telescope in Taeduk Radio Astronomy Observatory (TRAO). The multibeam receiver system installed at the 14 m telescope in TRAO was not optimized at the initial stage, though it became more stabilized in the following season. We conducted a Galactic Plane survey using the multibeam receiver system. We show that the noise level of the first part of the survey was higher than expected, and a special reduction process seemed to be definitely required. Along with a brief review of classical methods, a multi-dimensional method of reduction is introduced; It is found that the 'background' task within IRAF (Image Reduction and Analysis Facility) can be applied to all three directions of the cube database. Various statistics of reduction results is tested using several IRAF tasks. The rms value of raw survey data is 0.241 K, and after primitive baseline subtraction and elimination of bad channel sections, the rms value turned out to be 0.210 K. After the one-dimensional reduction using 'background' task, the rms value is estimated to be 0.176 K. The average rms of the final reduced image is 0.137 K. Thus, the image quality is found to be improved about 43% using the new reduction method.
Sohrabi, Amir;Mirab-Samiee, Siamak;Rahnamaye-Farzami, Marjan;Rafizadeh, Mitra;Akhavan, Setareh;Hashemi-Bahremani, Mohammad;Modarressi, Mohammad Hossein
Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
/
v.15
no.16
/
pp.6745-6748
/
2014
Background: Nowadays, molecular biomarkers have critical roles for cancer diagnosis and prognosis in clinical laboratories. Human papillomaviruses are the main agents for etiology of cervical carcinoma. The present survey was conducted to evaluate the genes methylation in cervical cancer and precancerous lesions involvement with HPV genotypes. Materials and Methods: C13orf18 and C10rf166 (MULl or Mulan) DNA methylation as potential biomarkers and risk factors was investigated in 112 liquid based cytology and Formalin-Fixed Paraffin-Embedded tissue specimens in Iranian females with cervical intraepithelial neoplasia and dysplasia. Results: In this survey, HPV18 (61.6%) and HPV16 (42.9%) proved to be the most common HPV genotypes identified by In-House Multiplex Real Time PCR. There were no significant relationship between HPV positivity and the methylated DNA genes mentioned above (p>0.05). Conclusions: Our MethyLight data demonstrated that these genes could not be considered as specific, sensitive and suitable prognostic biomarkers in cervical dysplasia related HPV. It is suggested that further studies with more patients should be done on candidate methylated markers in different countries in order to plan for cervical cancer prevention.
We have carried out simultaneous 22GHz $H_2O$ and 44GHz Class I $CH_3OH$ maser survey of 112 ultra-compact HII regions (UCHIIs) twice in 2010 and 2011. We detected $H_2O$ maser and $CH_3OH$ maser emission from 76(68%) and 49(44%) UCHIIs, respectively. Among them 15 $H_2O$ masers and 32 $CH_3OH$ masers are new detections. These high detection rates suggest that the occurrence periods of both masers are significantly overlapped with the UCHII phase. $CH_3OH$ masers always have small (<10 km s-1) relative velocities with respect to the natal molecular cores, while $H_2O$ masers often show larger velocities. We find 20 UCHIIs with $H_2O$ maser lines at relative velocities >30 km s-1. The formation and disappearance of $H_2O$ masers is frequent over one-year time interval. In contrast, $CH_3OH$ masers usually do not show substantial variation in intensity, velocity, or shape. The isotropic luminosities of both masers well correlate with the bolometric luminosities of the central stars when data points of lowand intermediate-mass protostars are added: $L_{H_2O}=5.89{\times}10^{-9}{(L_{bol})^{0.69}}$ and $L_{CH_3OH}=4.27{\times}10^{-9}{(L_{bol})^{0.62}}$. They also tend to increase with the 2cm radio continuum luminosity of UCHIIs and the 850 um continuum luminosity of the associated molecular cores. We discuss some individual sources.
We present the preliminary result from our KVN single-dish observations of the MALATANG sample. The MALATANG (Mapping the dense molecular gas in the strongest star-forming Galaxies) is one of the JCMT legacy surveys on the nearest 23 IR-brightest galaxies beyond the Local Group. The goal of the MALATANG survey is to map the sample in the dense gas tracers (HCN and HCO+J=4-3), and probe the relationships between the dense molecular gas and star formation activities. As a complementary study, we recently launched a KVN/KaVA program on the same sample, in order to measure their flux densities and parsec-scale jet/outflows in the millimeter regime, which will be greatly useful in understanding the initial conditions of the feedback process. In this work, we present the preliminary result from our pilot KVN single-dish program on a sub-sample, which will be used to select the future VLBI imaging study under plan. We investigate the KVN spectral energy distributions (SED) of the sample as a function of the power source of the luminous IR brightness of each target (starburst? AGN? or hybrid?). We also discuss the technical challenges that we experienced during our KVN observations due to the large size of the sample in the sky.
Acarapis mites, including Acarapis woodi, Acarapis externus, and Acarapis dorsalis, are parasites of bees which can cause severe damage to the bee industry by destroying colonies and decreasing honey production. All 3 species are prevalent throughout many countries including UK, USA, Iran, Turkey, China, and Japan. Based on previous reports of Acarapis mites occurring in northeast Asia, including China and Japan, we investigated a survey of Acarapis mite infestations in honey bees in Korean apiaries. A total of 99 colonies of Apis mellifera were sampled from 5 provinces. The head and thorax of 20 bees from each colony were removed for DNA extraction. PCR assays were performed with 3 primer sets, including T, A, and K primers. Results indicated that 42.4% (42/99) of samples were Acarapis-positive by PCR assay which were sequenced to identify species. Each sequence showed 92.6-99.3% homology with reference sequences. Based on the homology, the number of colonies infected with A. dorsalis was 32 which showed the highest infection rate among the 3 species, while the number of colonies infected with A. externus and A. woodi was 9 and 1, respectively. However, none of the Acarapis mites were morphologically detected. This result could be explained that all apiaries in the survey used acaricides against bee mites such as Varroa destructor and Tropilaelaps clareae which also affect against Acarapis mites. Based on this study, it is highly probable that Acarapis mites as well as Varroa and Tropilaelaps could be prevalent in Korean apiaries.
본 웹사이트에 게시된 이메일 주소가 전자우편 수집 프로그램이나
그 밖의 기술적 장치를 이용하여 무단으로 수집되는 것을 거부하며,
이를 위반시 정보통신망법에 의해 형사 처벌됨을 유념하시기 바랍니다.
[게시일 2004년 10월 1일]
이용약관
제 1 장 총칙
제 1 조 (목적)
이 이용약관은 KoreaScience 홈페이지(이하 “당 사이트”)에서 제공하는 인터넷 서비스(이하 '서비스')의 가입조건 및 이용에 관한 제반 사항과 기타 필요한 사항을 구체적으로 규정함을 목적으로 합니다.
제 2 조 (용어의 정의)
① "이용자"라 함은 당 사이트에 접속하여 이 약관에 따라 당 사이트가 제공하는 서비스를 받는 회원 및 비회원을
말합니다.
② "회원"이라 함은 서비스를 이용하기 위하여 당 사이트에 개인정보를 제공하여 아이디(ID)와 비밀번호를 부여
받은 자를 말합니다.
③ "회원 아이디(ID)"라 함은 회원의 식별 및 서비스 이용을 위하여 자신이 선정한 문자 및 숫자의 조합을
말합니다.
④ "비밀번호(패스워드)"라 함은 회원이 자신의 비밀보호를 위하여 선정한 문자 및 숫자의 조합을 말합니다.
제 3 조 (이용약관의 효력 및 변경)
① 이 약관은 당 사이트에 게시하거나 기타의 방법으로 회원에게 공지함으로써 효력이 발생합니다.
② 당 사이트는 이 약관을 개정할 경우에 적용일자 및 개정사유를 명시하여 현행 약관과 함께 당 사이트의
초기화면에 그 적용일자 7일 이전부터 적용일자 전일까지 공지합니다. 다만, 회원에게 불리하게 약관내용을
변경하는 경우에는 최소한 30일 이상의 사전 유예기간을 두고 공지합니다. 이 경우 당 사이트는 개정 전
내용과 개정 후 내용을 명확하게 비교하여 이용자가 알기 쉽도록 표시합니다.
제 4 조(약관 외 준칙)
① 이 약관은 당 사이트가 제공하는 서비스에 관한 이용안내와 함께 적용됩니다.
② 이 약관에 명시되지 아니한 사항은 관계법령의 규정이 적용됩니다.
제 2 장 이용계약의 체결
제 5 조 (이용계약의 성립 등)
① 이용계약은 이용고객이 당 사이트가 정한 약관에 「동의합니다」를 선택하고, 당 사이트가 정한
온라인신청양식을 작성하여 서비스 이용을 신청한 후, 당 사이트가 이를 승낙함으로써 성립합니다.
② 제1항의 승낙은 당 사이트가 제공하는 과학기술정보검색, 맞춤정보, 서지정보 등 다른 서비스의 이용승낙을
포함합니다.
제 6 조 (회원가입)
서비스를 이용하고자 하는 고객은 당 사이트에서 정한 회원가입양식에 개인정보를 기재하여 가입을 하여야 합니다.
제 7 조 (개인정보의 보호 및 사용)
당 사이트는 관계법령이 정하는 바에 따라 회원 등록정보를 포함한 회원의 개인정보를 보호하기 위해 노력합니다. 회원 개인정보의 보호 및 사용에 대해서는 관련법령 및 당 사이트의 개인정보 보호정책이 적용됩니다.
제 8 조 (이용 신청의 승낙과 제한)
① 당 사이트는 제6조의 규정에 의한 이용신청고객에 대하여 서비스 이용을 승낙합니다.
② 당 사이트는 아래사항에 해당하는 경우에 대해서 승낙하지 아니 합니다.
- 이용계약 신청서의 내용을 허위로 기재한 경우
- 기타 규정한 제반사항을 위반하며 신청하는 경우
제 9 조 (회원 ID 부여 및 변경 등)
① 당 사이트는 이용고객에 대하여 약관에 정하는 바에 따라 자신이 선정한 회원 ID를 부여합니다.
② 회원 ID는 원칙적으로 변경이 불가하며 부득이한 사유로 인하여 변경 하고자 하는 경우에는 해당 ID를
해지하고 재가입해야 합니다.
③ 기타 회원 개인정보 관리 및 변경 등에 관한 사항은 서비스별 안내에 정하는 바에 의합니다.
제 3 장 계약 당사자의 의무
제 10 조 (KISTI의 의무)
① 당 사이트는 이용고객이 희망한 서비스 제공 개시일에 특별한 사정이 없는 한 서비스를 이용할 수 있도록
하여야 합니다.
② 당 사이트는 개인정보 보호를 위해 보안시스템을 구축하며 개인정보 보호정책을 공시하고 준수합니다.
③ 당 사이트는 회원으로부터 제기되는 의견이나 불만이 정당하다고 객관적으로 인정될 경우에는 적절한 절차를
거쳐 즉시 처리하여야 합니다. 다만, 즉시 처리가 곤란한 경우는 회원에게 그 사유와 처리일정을 통보하여야
합니다.
제 11 조 (회원의 의무)
① 이용자는 회원가입 신청 또는 회원정보 변경 시 실명으로 모든 사항을 사실에 근거하여 작성하여야 하며,
허위 또는 타인의 정보를 등록할 경우 일체의 권리를 주장할 수 없습니다.
② 당 사이트가 관계법령 및 개인정보 보호정책에 의거하여 그 책임을 지는 경우를 제외하고 회원에게 부여된
ID의 비밀번호 관리소홀, 부정사용에 의하여 발생하는 모든 결과에 대한 책임은 회원에게 있습니다.
③ 회원은 당 사이트 및 제 3자의 지적 재산권을 침해해서는 안 됩니다.
제 4 장 서비스의 이용
제 12 조 (서비스 이용 시간)
① 서비스 이용은 당 사이트의 업무상 또는 기술상 특별한 지장이 없는 한 연중무휴, 1일 24시간 운영을
원칙으로 합니다. 단, 당 사이트는 시스템 정기점검, 증설 및 교체를 위해 당 사이트가 정한 날이나 시간에
서비스를 일시 중단할 수 있으며, 예정되어 있는 작업으로 인한 서비스 일시중단은 당 사이트 홈페이지를
통해 사전에 공지합니다.
② 당 사이트는 서비스를 특정범위로 분할하여 각 범위별로 이용가능시간을 별도로 지정할 수 있습니다. 다만
이 경우 그 내용을 공지합니다.
제 13 조 (홈페이지 저작권)
① NDSL에서 제공하는 모든 저작물의 저작권은 원저작자에게 있으며, KISTI는 복제/배포/전송권을 확보하고
있습니다.
② NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 상업적 및 기타 영리목적으로 복제/배포/전송할 경우 사전에 KISTI의 허락을
받아야 합니다.
③ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 보도, 비평, 교육, 연구 등을 위하여 정당한 범위 안에서 공정한 관행에
합치되게 인용할 수 있습니다.
④ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 무단 복제, 전송, 배포 기타 저작권법에 위반되는 방법으로 이용할 경우
저작권법 제136조에 따라 5년 이하의 징역 또는 5천만 원 이하의 벌금에 처해질 수 있습니다.
제 14 조 (유료서비스)
① 당 사이트 및 협력기관이 정한 유료서비스(원문복사 등)는 별도로 정해진 바에 따르며, 변경사항은 시행 전에
당 사이트 홈페이지를 통하여 회원에게 공지합니다.
② 유료서비스를 이용하려는 회원은 정해진 요금체계에 따라 요금을 납부해야 합니다.
제 5 장 계약 해지 및 이용 제한
제 15 조 (계약 해지)
회원이 이용계약을 해지하고자 하는 때에는 [가입해지] 메뉴를 이용해 직접 해지해야 합니다.
제 16 조 (서비스 이용제한)
① 당 사이트는 회원이 서비스 이용내용에 있어서 본 약관 제 11조 내용을 위반하거나, 다음 각 호에 해당하는
경우 서비스 이용을 제한할 수 있습니다.
- 2년 이상 서비스를 이용한 적이 없는 경우
- 기타 정상적인 서비스 운영에 방해가 될 경우
② 상기 이용제한 규정에 따라 서비스를 이용하는 회원에게 서비스 이용에 대하여 별도 공지 없이 서비스 이용의
일시정지, 이용계약 해지 할 수 있습니다.
제 17 조 (전자우편주소 수집 금지)
회원은 전자우편주소 추출기 등을 이용하여 전자우편주소를 수집 또는 제3자에게 제공할 수 없습니다.
제 6 장 손해배상 및 기타사항
제 18 조 (손해배상)
당 사이트는 무료로 제공되는 서비스와 관련하여 회원에게 어떠한 손해가 발생하더라도 당 사이트가 고의 또는 과실로 인한 손해발생을 제외하고는 이에 대하여 책임을 부담하지 아니합니다.
제 19 조 (관할 법원)
서비스 이용으로 발생한 분쟁에 대해 소송이 제기되는 경우 민사 소송법상의 관할 법원에 제기합니다.
[부 칙]
1. (시행일) 이 약관은 2016년 9월 5일부터 적용되며, 종전 약관은 본 약관으로 대체되며, 개정된 약관의 적용일 이전 가입자도 개정된 약관의 적용을 받습니다.