• 수산해양기술연구
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• 제49권4호
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• pp.500-504
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• 2013

A total of 24 juvenile specimens of Thunnus tonggol (5.45~7.26mm in total length) of the Sombridae were collected from the southeast sea of Jeju Island during 26~30 July, 2013. Twenty-four specimens identified T. tonggol have melanophores distributed on the 1st dorsal-fin rays, the dorsal of head and vetral side. Three individulas were identified using mitochondrial DNA cytochrome oxidase submit 1 (CO1) sequences (452 base pairs). All were identified as T. tonggol, their mtCO1 sequences being consistent with those of Thunnus tonggol (d=0.000), followed by Thunnus albacares (d=0.002) and Thunnus obesus (d=0.007).

• Animal cells and systems
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• 제13권4호
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• pp.453-460
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• 2009

Morphological and molecular classifications were attempted in an effort to establish species-specific classifications of three species of the genus Pholis in Korea; these species were subjected to morphological and molecular methodologies using body measurements, RFLP, RAPD, and phylogenetic trees using the nucleotide sequences of mitochondrial 16S and 12S ribosomal DNAs, cytochrome c oxidase I, and cytochrome b. The data demonstrated that the three species of genus Pholis are distinct from each other, both morphologically and genetically.

• 생명과학회지
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• 제20권3호
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• pp.336-344
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• 2010

본 연구는 2008년에서 2009년 동안 속초, 월성, 거제도, 여수, 거문도, 서남해역에서 채집된 대구어미를 대상으로 유전적 집단구조를 조사했다. 시험에 사용된 28 마리 중에서 8 종류의 haplotype이 발견되었다. 상호 유전자 비교시 0.2-2.2% 범위에서 유전자 변이율을 볼 수 있었다. Gal haplotype은 월성, 거제도, 여수, 거문도, 서남해역에서 모두 발견된 haplotype으로 우리나라 대구의 가장 대표적인 haplotype인 것으로 추측된다. 그러나 Ga2, Ga3, Ga6, Ga7 haplotype은 속초에서만 나타났다. 또한 유전자 상호관계 분석에서도 속초에서 나타난 haplotype은 독립적인 개체군을 형성하고 있으면 다른 haplotype과의 유연 성립율은 50% 이하로 나타났다. 속초를 제외한 나머지 지역의 지역적 유전거리는 -0.0123 에서 -0.0423 이면 유전적 이동률은 거의 무한대로 보여 동일한 집단을 형성하고 있는 것으로 보였다. 그러나 속초와는 현저한 유전적 거리를 나타내고 있고, 속초의 유전적 다양성이 가장 낮게 나타나서 속초의 대구 개체군은 소형임과 아울러 다른 지역관의 유전적 이동이 거의 차단된 것으로 보인다. 따라서 우리나라에서 어획되는 대구 계군은 속초를 제외하고 활발한 유전적 이동으로 동일한 유전적 집단을 형성하고 있는 것으로 보인다.

• 환경생물
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• 제24권2호
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• pp.112-118
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• 2006

본 연구는 쥐노래미과(Hexagrammidae)에 속하고 양식산업에서 중요한 위치를 차지하고 있는 노래미, Hexagrammos otakii(Jordan et Starks)와 쥐노래미, H. agrammus(Temminck et Schlegel)의 미토콘드리아 cytochrome b(cyt b)유전자의 염기서열을 서로 비교 분석하였다. 총 489 bp크기의 cyt b 염기서열에서 종간의 변이는 거의 없었다(96%의 유사성).Neighbor-joining방법에 의한 노래미와 쥐노래미에서의 0.0342인 pairwise distance는 두 종이 분자계통유전학적으로 유사함을 시사한다. 이러한 연구 결과들은 쥐노래미(Hexagrammos)속을 대상으로 한 양식, 수산유전학 및 분자계통학 분야에 적용 가능할 것이다.

• Molecules and Cells
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• 제20권3호
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• pp.416-422
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• 2005

We previously used Southern blot analysis to detect restriction-length polymorphisms between male fertile and cytoplasmic male sterile (CMS) cytoplasms at the coxII and atp6 loci of the mtDNA of Capsicum annuum L. Two copies of atp6 were found in each male fertile and CMS pepper lines. Interestingly, one of the copies of atp6 in CMS pepper was a 3'-truncated pseudogene. The open reading frame of the coxII gene was the same in the fertile (N-) and CMS (S-) lines. However, the nucleotide sequence in the S-cytoplasm diverged from that in the N-cytoplasm 41 bp downstream of the stop codon. To develop CMS-specific sequence-characterized amplified region (SCAR) markers, inverse PCR was performed to characterize the nucleotide sequences of the 5' and 3' flanking regions of mitochondrial atp6 and coxII from the cytoplasms of male fertile (N-) and CMS (S-) pepper plants. Based on these data, two CMS-specific SCAR markers, 607 and 708 bp long, were developed to distinguish N-cytoplasm from S-cytoplasm by PCR. The CMS-specific PCR bands were verified for 20 cultivars containing either N- or S-cytoplasm. PCR amplification of CMS-specific mitochondrial nucleotide sequences will allow quick and reliable identification of the cytoplasmic types of individual plants at the seedling stage, and assessment of the purity of $F_1$ seed lots. The strategy used in this report for identifying CMS-specific markers could be adopted for many other crops where CMS is used for F1 seed production.

• 한국응용곤충학회지
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• 제55권4호
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• pp.523-528
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• 2016

풀무치(Locusta migratoria)는 벼과 작물(벼, 옥수수 등)에 큰 피해를 주는 세계적으로 유명한 메뚜기목 해충의 하나로서 밀도요인에 따라 형태와 행동적으로 구별되는 단독형(solitaria)과 군집형(gregaria)을 나타낸다. 풀무치는 전세계적으로 다양한 형태적인 변이가 알려져 있으나 최근의 분자생물학적 연구에 따르면 2가지 계통, 즉 남방계통(아프리카, 남유럽, 동남아시아, 호주)과 북방계통(동아시아, 유라시아)으로 나뉜다. 2014년 8월 전남 해남군 산이면에서 군집형 약충들이 대발생하여 주변 잡초 및 작물(벼, 기장)에 큰 피해를 주었다. 우리나라에서 군집형 풀무치의 발생에 대한 명확한 학술적 보고는 이번이 처음이다. 해남지역의 풀무치 대발생 지점에서 채집한 풀무치 12개체의 COI 염기서열을 분석한 결과, 0.0%-0.9%의 유전적 변이를 보였으며, 모두 북방계통에 속했다.

• Parasites, Hosts and Diseases
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• 제59권2호
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• pp.139-148
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• 2021

This study was carried out to provide information on the taxonomic classification and analysis of mitochondrial genomes of Spirometra theileri. One strobila of S. theileri was collected from the intestine of an African leopard (Panthera pardus) in the Maswa Game Reserve, Tanzania. The complete mtDNA sequence of S. theileri was 13,685 bp encoding 36 genes including 12 protein genes, 22 tRNAs and 2 rRNAs with absence of atp8. Divergences of 12 protein-coding genes were as follow: 14.9% between S. theileri and S. erinaceieuropaei, 14.7% between S. theileri and S. decipiens, and 14.5% between S. theileri with S. ranarum. Divergences of 12 proteins of S. theileri and S. erinaceieuropaei ranged from 2.3% in cox1 to 15.7% in nad5, while S. theileri varied from S. decipiens and S. ranarum by 1.3% in cox1 to 15.7% in nad3. Phylogenetic relationship of S. theileri with eucestodes inferred using the maximum likelihood and Bayesian inferences exhibited identical tree topologies. A clade composed of S. decipiens and S. ranarum formed a sister species to S. erinaceieuropaei, and S. theileri formed a sister species to all species in this clade. Within the diphyllobothridean clade, Dibothriocephalus, Diphyllobothrium and Spirometra formed a monophyletic group, and sister genera were well supported.

• 한국어류학회지
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• 제36권2호
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• pp.193-198
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• 2024

2023년 9월과 10월에 제주특별자치도 서귀포시 위미항에서 처음으로 동갈돔과에 속하는 1미기록종인 Ostorhinchus fleurieu (54.25 mm, 55.64 mm SL) 표본 2점이 채집되었다. O. fleurieu는 동속의 O. aureus와 매우 유사하지만, 새파수 (O. fleurieu는 19~23 vs O. aureus는 22~27), 꼬리자루 줄무늬의 형태(O. fleurieu는 가장자리가 불분명한 술통형 vs O. aureus는 가장자리가 뚜렷한 모래시계형) 등에서 잘 구분된다. 또한, 동갈돔과 2개체의 COI 염기서열 560 bp는 NCBI에 등록된 O. fleurieu의 염기서열(MT076481)과 100% 일치하였다. O. fleurieu의 새로운 국명으로 "꽃동갈돔"을 제안한다.

• Animal cells and systems
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• 제12권4호
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• pp.269-277
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• 2008

Siberian flying squirrel, an endangered species in South Korea, is distributed through major mountain regions of South Korea. The number of Siberian flying squirrel(Pteromys volans) in South Korea has decreased and their habitats are fragmented and isolated because of anthropogenic activities. So far no molecular genetic data has, however, been available for their conservation and management. To obtain better information concerning genetic diversity and phylogenetic relationships of the Siberian flying squirrel in South Korea, we examined 14 individuals from South Korea, 7 individuals from Russia, and 5 individuals from northeastern China along with previously published 29 haplotypes for 1,140 bp of the mtDNA cytochrome b gene. The 14 new individuals from South Korea had 7 haplotypes which were not observed in the regions of Russia and Hokkaido. The level of genetic diversity(0.616%) in the South Korean population was lower than that in eastern Russia(0.950%). The geographical distribution of mtDNA haplotypes and reduced median network confirmed that there are three major lineages of Siberian flying squirrel, occupying; Far Eastern, northern Eurasia, and the island of Hokkaido. The South Korean population only slightly distinct from the Eurasia, and eastern Russian population, and is part of the lineage Far Eastern. Based on these, we suggest that the South Korean population could be considered to belong to one partial ESU(Far Eastern) of three partial ESUs but a different management unit. However, the conservation priorities should be reconfirmed by nuclear genetic marker and ecological data.

• 농약과학회지
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• 제11권4호
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• pp.320-330
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• 2007

충북 진천군 이월면 장미재배지와 경남 밀양시 고추밭에서 채집한 담배가루이에 대해서 16S DNA 염기서열을 분석하였다. 각각의 PCR 산물을 EcoT14 I (Sty I)과 Stu I을 처리한 결과 경남 밀양시 고추밭에서 채집한 담배가루이는 Sty I 에서 555pp와 311bp 두 개의 단편이 만들어져 biotype Q임을 확인하였고, 충북진천군 장미재배지에서 채집한 담배가루이는 Stu I에서 560bp와 3060p 두 개의 단편이 만들어서 biotype B임을 확인하였다. 두 biotype에 대한 12종 살충제로 발육단계별 약제감수성, 침투이행성 및 잔효성을 비교하였고, esterase, acetylcholinesterase (AChE), glutathione S-transferase 등의 효소활성에 미치는 저해정도를 검토하였다. 두 biotype간에 약제감수성 차이가 있었고, biotype B가 Q보다 더 감수성이었다. 엽면침투이행성과 근부침투이행성 및 잔효성에서도 biotype B가 Q보다 더 감수성이었다. 유기인계인 fenitrothion과 카바메이트계인 fenothiocarb의 저해제에 대해서 esterase, acetylcholinesterase (AChE), glutathione S-transferase등의 효소활성에 미치는 영향을 검토한 결과, biotype Q가 B보다 활성이 높게 나타났다. 이상의 결과를 종합하여 볼 때 담배가루이 biotype Q가 B보다 약제에 대해서 저항성임을 알 수 있었다.