경주지방에서 사육 중인 경주개(동경이) 51두를 대상으로 8개의 microsatellite marker을 이용하여 DNA형을 분석한 결과 대립 유전자 수는 $4{\sim}12$개(평균 8.5개)로 검출되었으며 Expected heterozygosit와 PIC는 각각 $0.6162{\sim}0.8746$(평균 0.7587)와 $0.5461{\sim}0.8512$(평균 0.7167)으로 나타났고, PEZ3, PEZ6, PEZ12, FHC2054 marker는 PIC가 0.7이상으로 나타났다. 이들 marker는 향후 동경이의 개체식별 및 친자확인에 유용하게 쓰일 수 있다. 공시재료 51두 중 사육가에 의해 혈통이 알려진 5두를 대상으로 microsatellite marker를 이용하여 혈통을 분석한 결과 3두에서 현재 가계도와 일치하지 않았다. 따라서 앞으로 더 많은 연구를 통해서 동경이에 대한 체계적인 혈통 정립이 이루어져야 할 것이다.
Acrylamide is present as a contaminant in heated food products, predominantly from the precursor asparagine. Nonanchored inter simple sequence repeats (ISSRs) are arbitrary multiloci markers produced by PCR amplification with a microsatellite primer. In order to assess the feasibility of microsatellite primers as markers for DNA damage, the study was conducted on common bean (Phaseolus vulgaris L.) exposed to different concentrations of acrylamide. Polymorphisms were abundant among plant samples treated with acrylamide in comparison to control (untreated one) tested with 4- tri-nucleotide, 2 tetra-nucleotide, and 3- dinucelotide primers. The primer (CCG)4 was the best tested primer to generate polymorphism between the DNA of plants treated or not by acrylamide. Polymorphisms became evident as the presence and absence of DNA fragments in treated samples compared with the untreated one. The highest number of DNA variation on ISSR patterns was observed at the micromollar concentrations of acrylamide. Acrylamide was able to induce DNA damage in non concentration-dependent manner with effectiveness at micromollar concentrations. This study demonstrated that ISSR markers can be highly reliable for identification of DNA damage induced by acrylamide.
The genetic diversities of 10 Chinese pig populations were analyzed by using microsatellite DNA polymorphisms. The results showed that the mean heterozygosities of the 10 populations were between 0.4561 and 0.6446, the mean polymorphism information contents were 0.4241-0.6184 and the mean effective number of alleles were 2.4295-3.7573. These indicated that the genetic diversity of local Chinese pigs was high. The clustering of the 10 populations was nearly inaccordance with their geographical distributions.
Five China native cattle breeds have been characterized by using 10 microsatellite DNA markers. The studied populations can be divided into five groups: Luxi cattle, Nanyang cattle, Jinnan cattle, Qinchuan cattle and Yanbian cattle. Allele frequencies were calculated and used for the characterization of the breeds and the study of their genetic relationships. Heterozygosity, polymorphism information content, the effective number of alleles was calculated. Nei' standard genetic distance (1978) was calculated and used for a neighbor-joining tree construction. NJ tree showed that Luxi cattle, Nanyang cattle, Jinnan cattle and Qinchuan cattle are closely related, whereas Yanbian cattle are clearly distinct from other four populations. The genetic relationship of five breeds corresponds to their history and geographic origins. This work analyzes the recent origin of these populations and contributes to the knowledge and genetic characterization of China native breeds.
In this study, we investigated the genetic diversity and phylogenetic relationship of six duck populations by employing the genetic polymorphisms of 20 microsatellites. The parameters used in this study included number of alleles, average effective numbers of alleles (E) and average rates of heterozygosity of each population. The results showed that all the microsatellite loci were highly polymorphic except that the locus AJ515896 in Muscovy duck was 0. The average PIC (0.762), average h (0.7843) and average E (5.261) of the six duck populations were all high, indicating that the gene polymorphisms and genetic diversity were high. The test of Hardy-Weinberg equilibrium showed that the six populations in this study were all in Hardy-Weinberg disequilibrium. The F-statistic analysis results showed the range of FST was from 0.0205 (AJ515895) to 0.2558 (AJ515896). The mean FST was 0.0936. Phylogenetic study revealed that Peking duck (Z1 and Z4), Shaoxing duck, Cherry Valley duck and Aobaixing duck were clustered in one group, while the Muscovy duck was clustered in one group alone. The phylogenetic relationships among different populations were in accordance with their breeding history and distribution. Our data suggested that the 20 microsatellite loci were effective markers for analysis of genetic relationships among duck populations.
The genetic diversity of Korean native chicken is important for conservation of native chicken breeds and developing economically valuable traits in Korea. In this review, various types of genetic markers using Korean native chickens were investigated, which are mtDNA variations, microsatellite markers, markers in Major Histocompatibility Complex (MHC), and single nucleotide polymorphisms (SNPs). These genetic markers are suitable for breed discrimination and diversity studies because of their high polymorphism status. Thus, the purpose of this study was to summarize the genetic markers developed in the Korean native chickens and diversity studies using these breeds. Ultimately, these markers can be used for the future studies for understanding of genetic characteristics.
An enrichment library of GATA-repeats from genomic DNA was constructed in this study to isolate and characterize microsatellite loci in Tsaiya duck (Anas platyrhynchos). Thirty-three microsatellite markers were developed and used to detect polymorphisms in 30 Tsaiya ducks. A total of 177 alleles were observed and all loci except APT022 were polymorphic. The number of alleles ranged from 2 to 9 with an average of 5.5 per microsatellite locus. The observed and expected heterozygosity of these polymorphic markers ranged from 0.07 to 0.93 with an average number of 0.60 and 0.10 to 0.86 with an average number of 0.61, respectively. Among the polymorphic markers, the observed heterozygosities of 23 loci were higher than 0.50 (69.70%). The polymorphism information content (PIC) in the 32 loci ranged from 0.09 to 0.83 with an average of 0.57. Seven of the 33 duck microsatellite loci had orthologs in the chicken genome, but only APT004 had a similar core repeat to chickens. These microsatellite markers will be useful in constructing a genetic linkage map for the duck and a comparative mapping with the chicken can also provide a valuable tool for studies related to biodiversity and population genetics in this duck species.
Park, Yong-Jin;Cho, Gyu-Taek;Ma, Kyung-Ho;Lee, Sok-Young;Lee, Jung-Ro;Kim, Young-Chang;Cho, Eun-Gi;Kim Chang-Yung;Nam, Jung-Hyun;Rao, V. Ramanatha;Kang, Hee-Kyoung
Plant Resources
/
제7권2호
/
pp.93-103
/
2004
Genetic background and phylogenetic relationships among 20 Korean wheat cultivars were assessed using microsatellites after amplifying with 13 SSR primer pairs. Average allele number per primer pair was 3.36. Genetic similarities for every pair of cultivars ranged from 0.42 to 0.97, with 0.69 of overall average. Korean cultivars were divided into two major groups based on microsatellite DNA polymorphisms. Group I consisted of relatively old cultivars developed until 1970s, and group II contained the recent cultivars developed during 1980s and 1990s. Amongst old elite cultivars/lines, ‘Yukseung 3’, ‘Norin 12’ and ‘Norin 72’ contributed most to the genetic background of cultivars belonging to group I, and ‘Norin 4’, ‘Norin 12’, ‘Norin 43’ and ‘Norin 72’ to group II, respectively. The phylogenetic relationship of Korean wheat cultivars was in accordance with the genealogical data of each cultivar. The genetic background of each cultivar was assessed from the point of breeding and germplasm management such as variety identification and duplicated accessions for assisting in developing a system for the registration of new variety based on the molecular characterization in future.
A multiplex PCR system comprising 14 microsatellite markers was developed for genotyping analysis of the sea cucumber Stichopus japonicus. A total of 286 samples were used to evaluate genetic polymorphisms and forensic parameters of the microsatellite loci. In a single PCR reaction, all 14 loci were uniformly amplified and a total of 269 alleles were identified. The AJ19024 locus had the largest number of alleles (46), and its discriminatory power and exclusion power were 0.99 and 0.76, respectively. The fewest alleles (8) were present at the Psj2575 locus, which provided the lowest discriminatory power (0.81) and exclusion power (0.20). The mean number of alleles, mean heterozygosity, mean discrimination power and mean exclusion power per locus were 19.21, 0.70, 0.93, and 0.46, respectively. The combined matching probability for the 14 loci was $9.64{\times}10^{-19}$, and the combined power of exclusion was 0.999995. Thus, the forensic parameters evaluated in the present study demonstrated the utility of our multiplex PCR system for biological tracing methods, such as individual identification and paternity testing, in the sea cucumber.
Takahashi, H.;Nyamsamba, D.;Mandakh, B.;Zagdsuren, Yo.;Amano, T.;Nomura, K.;Yokohama, M.;Ito, S.;Minezawa, M.
Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
/
제21권7호
/
pp.947-953
/
2008
We studied genetic diversity and relationships among Mongolian goat populations on the basis of microsatellite DNA polymorphisms. DNA samples from eight populations (Bayandelger, Ulgii Red, Zavkhan Buural, Sumber, Zalaajinst White, Erchim Black, Dorgon, and Gobi Gurvan Saikhan) from geographically distinct areas of Mongolia were analyzed by using 10 microsatellite DNA markers. Since the 10 markers were highly polymorphic, the genetic characteristics of these native goat populations could be estimated. Genetic diversity within populations, as estimated by the expected heterozygosities, was high, ranging from 0.719 to 0.746, but genetic differentiation between populations was low, representing only 1.7% of the total genetic variation. The results suggest that Mongolian native goat populations still have a semi-wild genetic structure reflecting traditional Mongolian nomadism and the short history of artificial selection. The genetic relationships among the populations were not clear in the neighbor-joining tree generated from the modified Cavalli-Sforza chord genetic distances. By using principal components analysis, the five core populations of Mongolian native goats (Bayandelger, Ulgii Red, Zavkhan Buural, Sumber, and Dorgon) and the populations crossed with Russian breeds (Zalaajinst White, Erchim Black, and Gobi Gurvan Saikhan) were distinguished. There was no correlation between genetic relationships among the populations and the geographical distribution of the populations.
본 웹사이트에 게시된 이메일 주소가 전자우편 수집 프로그램이나
그 밖의 기술적 장치를 이용하여 무단으로 수집되는 것을 거부하며,
이를 위반시 정보통신망법에 의해 형사 처벌됨을 유념하시기 바랍니다.
[게시일 2004년 10월 1일]
이용약관
제 1 장 총칙
제 1 조 (목적)
이 이용약관은 KoreaScience 홈페이지(이하 “당 사이트”)에서 제공하는 인터넷 서비스(이하 '서비스')의 가입조건 및 이용에 관한 제반 사항과 기타 필요한 사항을 구체적으로 규정함을 목적으로 합니다.
제 2 조 (용어의 정의)
① "이용자"라 함은 당 사이트에 접속하여 이 약관에 따라 당 사이트가 제공하는 서비스를 받는 회원 및 비회원을
말합니다.
② "회원"이라 함은 서비스를 이용하기 위하여 당 사이트에 개인정보를 제공하여 아이디(ID)와 비밀번호를 부여
받은 자를 말합니다.
③ "회원 아이디(ID)"라 함은 회원의 식별 및 서비스 이용을 위하여 자신이 선정한 문자 및 숫자의 조합을
말합니다.
④ "비밀번호(패스워드)"라 함은 회원이 자신의 비밀보호를 위하여 선정한 문자 및 숫자의 조합을 말합니다.
제 3 조 (이용약관의 효력 및 변경)
① 이 약관은 당 사이트에 게시하거나 기타의 방법으로 회원에게 공지함으로써 효력이 발생합니다.
② 당 사이트는 이 약관을 개정할 경우에 적용일자 및 개정사유를 명시하여 현행 약관과 함께 당 사이트의
초기화면에 그 적용일자 7일 이전부터 적용일자 전일까지 공지합니다. 다만, 회원에게 불리하게 약관내용을
변경하는 경우에는 최소한 30일 이상의 사전 유예기간을 두고 공지합니다. 이 경우 당 사이트는 개정 전
내용과 개정 후 내용을 명확하게 비교하여 이용자가 알기 쉽도록 표시합니다.
제 4 조(약관 외 준칙)
① 이 약관은 당 사이트가 제공하는 서비스에 관한 이용안내와 함께 적용됩니다.
② 이 약관에 명시되지 아니한 사항은 관계법령의 규정이 적용됩니다.
제 2 장 이용계약의 체결
제 5 조 (이용계약의 성립 등)
① 이용계약은 이용고객이 당 사이트가 정한 약관에 「동의합니다」를 선택하고, 당 사이트가 정한
온라인신청양식을 작성하여 서비스 이용을 신청한 후, 당 사이트가 이를 승낙함으로써 성립합니다.
② 제1항의 승낙은 당 사이트가 제공하는 과학기술정보검색, 맞춤정보, 서지정보 등 다른 서비스의 이용승낙을
포함합니다.
제 6 조 (회원가입)
서비스를 이용하고자 하는 고객은 당 사이트에서 정한 회원가입양식에 개인정보를 기재하여 가입을 하여야 합니다.
제 7 조 (개인정보의 보호 및 사용)
당 사이트는 관계법령이 정하는 바에 따라 회원 등록정보를 포함한 회원의 개인정보를 보호하기 위해 노력합니다. 회원 개인정보의 보호 및 사용에 대해서는 관련법령 및 당 사이트의 개인정보 보호정책이 적용됩니다.
제 8 조 (이용 신청의 승낙과 제한)
① 당 사이트는 제6조의 규정에 의한 이용신청고객에 대하여 서비스 이용을 승낙합니다.
② 당 사이트는 아래사항에 해당하는 경우에 대해서 승낙하지 아니 합니다.
- 이용계약 신청서의 내용을 허위로 기재한 경우
- 기타 규정한 제반사항을 위반하며 신청하는 경우
제 9 조 (회원 ID 부여 및 변경 등)
① 당 사이트는 이용고객에 대하여 약관에 정하는 바에 따라 자신이 선정한 회원 ID를 부여합니다.
② 회원 ID는 원칙적으로 변경이 불가하며 부득이한 사유로 인하여 변경 하고자 하는 경우에는 해당 ID를
해지하고 재가입해야 합니다.
③ 기타 회원 개인정보 관리 및 변경 등에 관한 사항은 서비스별 안내에 정하는 바에 의합니다.
제 3 장 계약 당사자의 의무
제 10 조 (KISTI의 의무)
① 당 사이트는 이용고객이 희망한 서비스 제공 개시일에 특별한 사정이 없는 한 서비스를 이용할 수 있도록
하여야 합니다.
② 당 사이트는 개인정보 보호를 위해 보안시스템을 구축하며 개인정보 보호정책을 공시하고 준수합니다.
③ 당 사이트는 회원으로부터 제기되는 의견이나 불만이 정당하다고 객관적으로 인정될 경우에는 적절한 절차를
거쳐 즉시 처리하여야 합니다. 다만, 즉시 처리가 곤란한 경우는 회원에게 그 사유와 처리일정을 통보하여야
합니다.
제 11 조 (회원의 의무)
① 이용자는 회원가입 신청 또는 회원정보 변경 시 실명으로 모든 사항을 사실에 근거하여 작성하여야 하며,
허위 또는 타인의 정보를 등록할 경우 일체의 권리를 주장할 수 없습니다.
② 당 사이트가 관계법령 및 개인정보 보호정책에 의거하여 그 책임을 지는 경우를 제외하고 회원에게 부여된
ID의 비밀번호 관리소홀, 부정사용에 의하여 발생하는 모든 결과에 대한 책임은 회원에게 있습니다.
③ 회원은 당 사이트 및 제 3자의 지적 재산권을 침해해서는 안 됩니다.
제 4 장 서비스의 이용
제 12 조 (서비스 이용 시간)
① 서비스 이용은 당 사이트의 업무상 또는 기술상 특별한 지장이 없는 한 연중무휴, 1일 24시간 운영을
원칙으로 합니다. 단, 당 사이트는 시스템 정기점검, 증설 및 교체를 위해 당 사이트가 정한 날이나 시간에
서비스를 일시 중단할 수 있으며, 예정되어 있는 작업으로 인한 서비스 일시중단은 당 사이트 홈페이지를
통해 사전에 공지합니다.
② 당 사이트는 서비스를 특정범위로 분할하여 각 범위별로 이용가능시간을 별도로 지정할 수 있습니다. 다만
이 경우 그 내용을 공지합니다.
제 13 조 (홈페이지 저작권)
① NDSL에서 제공하는 모든 저작물의 저작권은 원저작자에게 있으며, KISTI는 복제/배포/전송권을 확보하고
있습니다.
② NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 상업적 및 기타 영리목적으로 복제/배포/전송할 경우 사전에 KISTI의 허락을
받아야 합니다.
③ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 보도, 비평, 교육, 연구 등을 위하여 정당한 범위 안에서 공정한 관행에
합치되게 인용할 수 있습니다.
④ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 무단 복제, 전송, 배포 기타 저작권법에 위반되는 방법으로 이용할 경우
저작권법 제136조에 따라 5년 이하의 징역 또는 5천만 원 이하의 벌금에 처해질 수 있습니다.
제 14 조 (유료서비스)
① 당 사이트 및 협력기관이 정한 유료서비스(원문복사 등)는 별도로 정해진 바에 따르며, 변경사항은 시행 전에
당 사이트 홈페이지를 통하여 회원에게 공지합니다.
② 유료서비스를 이용하려는 회원은 정해진 요금체계에 따라 요금을 납부해야 합니다.
제 5 장 계약 해지 및 이용 제한
제 15 조 (계약 해지)
회원이 이용계약을 해지하고자 하는 때에는 [가입해지] 메뉴를 이용해 직접 해지해야 합니다.
제 16 조 (서비스 이용제한)
① 당 사이트는 회원이 서비스 이용내용에 있어서 본 약관 제 11조 내용을 위반하거나, 다음 각 호에 해당하는
경우 서비스 이용을 제한할 수 있습니다.
- 2년 이상 서비스를 이용한 적이 없는 경우
- 기타 정상적인 서비스 운영에 방해가 될 경우
② 상기 이용제한 규정에 따라 서비스를 이용하는 회원에게 서비스 이용에 대하여 별도 공지 없이 서비스 이용의
일시정지, 이용계약 해지 할 수 있습니다.
제 17 조 (전자우편주소 수집 금지)
회원은 전자우편주소 추출기 등을 이용하여 전자우편주소를 수집 또는 제3자에게 제공할 수 없습니다.
제 6 장 손해배상 및 기타사항
제 18 조 (손해배상)
당 사이트는 무료로 제공되는 서비스와 관련하여 회원에게 어떠한 손해가 발생하더라도 당 사이트가 고의 또는 과실로 인한 손해발생을 제외하고는 이에 대하여 책임을 부담하지 아니합니다.
제 19 조 (관할 법원)
서비스 이용으로 발생한 분쟁에 대해 소송이 제기되는 경우 민사 소송법상의 관할 법원에 제기합니다.
[부 칙]
1. (시행일) 이 약관은 2016년 9월 5일부터 적용되며, 종전 약관은 본 약관으로 대체되며, 개정된 약관의 적용일 이전 가입자도 개정된 약관의 적용을 받습니다.