최근에 반도체 소자 및 마이크로머신, 바이오센서 등에 사용되는 미세 부품에 대한 연구 개발이 활발히 진행되고 있다. 미세 부품을 제작하기 위한 MEMS 공정은 대표적으로 화학용액을 이용한 습식식각, 플라즈마를 이용한 건식식각 등이 주를 이룬다. Micro blaster는 경도가 강하고 화학적 내성을 가지며 용융점이 높아 반도체 MEMS 공정에 어려움이 있는 기판을 다양한 형태로 식각 할 수 있는 기계적인 식각 공정 기술이라 할 수 있다. Micro blaster의 식각 공정은 고속의 날카로운 입자가 공작물을 타격할 때 입자의 아래에는 고압축응력이 발생하게 되고, 이 고압축 응력에 의하여 소성변형과 탄성변형이 발생된다. 이러한 변형이 발전되어 재료의 파괴 초기값보다 크게 되면 크랙이 발생되고, 점점 더 발전하게 되면 재료의 제거가 일어나는 단계로 이루어진다. 본 연구에서는 micro blaster 장비를 반도체 MEMS 공정에 적용하기 위한 식각 특성에 관하여 확인하였다. Micro blaster 장비와 식각에 사용한 파우더는 COMCO INC. 제품을 사용하였다. Micro blaster를 $Al_2O_3$ 파우더의 입자 크기, 분사 압력, 기판의 종류, 노즐과 기판과의 간격, 반복 횟수, 노즐 이동 속도 등의 공정 조건에 따른 식각 특성에 관하여 분석하였다. 특히 실제 반도체 MEMS 공정에 적용 가능한지 여부를 확인하기 위하여 바이오 PCR-chip을 제작하였다. 먼저 glass 기판과 Si wafer 기판에서의 식각률을 비교 분석하였고, 이 식각률을 바탕으로 바이오 PCR-chip에 사용하게 될 미세 홀과 미세 채널, 그리고 미세 챔버를 형성 하였다. 패턴을 형성하기 위하여 TOK Ordyl 사의 DFR(dry film photoresist:BF-410)을 passivation 막으로 사용하였다. Micro blaster에 사용되는 파우더의 직경이 수${\mu}m$ 이상이기 때문에 $10\;{\mu}m$ 이하의 미세 채널과 미세홀을 형성하기 어려웠지만 현재 반도체 MEMS 공정 기술로 제작 연구되어지고 있는 바이오 PCR-chip을 직접 제작하여 micro blaster를 이용한 반도체 MEMS 공정 기술에 적용 가능함을 확인하였다.
본 논문에서는 hard handoff 발생시에 sender와 MN 사이의 전 구간의 RSVP session을 재설정하는 문제를 해결하기 위해 이미 설정되어 있는 RSVP session 지원 node를 검색하고, 종단 간 전구간이 아닌 경로가 변경 되는 node에서 자원을 할당하는 데이터의 전송 경로 회유 방안을 제안하였다. 기존의 설정된 RSVP session을 지원하는 노드를 검색하기 위한 처리 과정으로써, PCR 알고리즘을 제안하였으며 PCR 알고리즘을 동작시키고, 기존의 PATH 메시지와 RESV 메시지의 교환 절차를 줄임으로써, 전송되는 데이터를 바로 회유 시킬 수 있도록 Route_Reconf 메시지를 새롭게 정의 하였다. PCR 과 Route_Reconf 메시지를 사용하여 session이 유지됨과 종단간 RSVP session 재설정 없이 중간 노드의 경로 변경을 통해 그로 인해 효율적으로 자원 관리가 이루처질 수 있음을 증명하기 위하여 시뮬레이션을 수행하였다.
본 논문에서는 hard handoff 발생시에 sender와 MN 사이의 전 구간의 RSVP session을 재설정하는 문제를 해결하기 위해 이미 설정되어 있는 RSVP session 지원 node를 검색하고, 종단 간 전구간이 아닌 경로가 변경 되는 node에서 자원을 할당하는 데이터의 전송 경로 회유 방안을 제안하였다. 기존의 설정된 RSVP session을 지원하는 노드를 검색하기 위한 처리 과정으로써, PCR 알고리즘을 제안하였으며 PCR 알고리즘을 동작시키고, 기존의 PATH 메시지와 RESV 메시지의 교환 절차를 줄임으로써, 전송되는 데이터를 바로 회유 시킬 수 있도록 Route_Reconf 메시지를 새롭게 정의 하였다. PCR 과 Route_Reconf 메시지를 사용하여 session이 유지됨과 종단간 RSVP session 재설정 없이 중간 노드의 경로 변경을 통해 그로 인해 효율적으로 자원 관리가 이루어질 수 있음을 종명하기 위하여 시뮬레이션을 수행하였다.
본 연구는 사람 치수세포 및 치주인대세포의 차이를 알아보고자 배양한 각각의 세포를 CDNA microarray assay를 통하여 유전자의 발현정도의 차이를 비교하였다. 그 결과를 바탕으로 각각의 세포에서 2배 이상의 유전자 발현의 차이를 보이는 유전자중 특징적인 3가지 유전자를 선택하여 RT-PCR로 검증한 결과 다음과 같은 결론을 얻었다; 1. Microarray assay 결과, 치주인대 세포에 비해 치수 세포에서 2배 이상 발현한 유전자 수는 총 51개가 나타났다. 2. RT-PCR의 결과, 치주인대세포에 비해 치수 세포에서 ITGA4, TGF-${\beta}2$ 등이 높게 나타났다. 3. Microarray assay결과, 치수 세포에서 비해 치주인대 세포에서 2배 이상 발현한 유전자 수는 총 19개가 나타났다. 4. RT-PCR의 결과, 치수 세포에 비해 치주인대세포에서 LUM, WISP1, MMP1 등이 높게 나타났다. 본 연구 결과로 치수세포에는 상아질 형성에 관여하는 특징적인 유전자가 치주인대세포에 비해 높게 발현되었으며, 치주인대세포에는 교원질 합성에 관여하는 특징적인 유전자가 치수세포에 비해 높게 발현되어, 치수세포와 치주인데 세포는 유전자 발현의 차이가 나타남을 알 수 있었다.
Tan Congping;Qin Song;Zhang Qun;Jiang Peng;Zhao Fangqing
Journal of Microbiology
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제43권4호
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pp.361-365
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2005
In this study, we chronicle the establishment of a novel transformation system for the unicellular marine green alga, Dunaliella salina. We introduced the CaMV35S promoter-GUS construct into D. salina with a PDS1000/He micro-particle bombardment system. Forty eight h after transformation, via histochemical staining, we observed the transient expression of GUS in D. salina cells which had been bombarded under rupture-disc pressures of 450 psi and 900 psi. We observed no GUS activity in either the negative or the blank controls. Our findings indicated that the micro-particle bombardment method constituted a feasible approach to the genetic transformation of D. salina. We also conducted tests of the cells' sensitivity to seven antibiotics and one herbicide, and our results suggested that 20 ${\mu}g$/ ml of Basta could inhibit cell growth completely. The bar gene, which encodes for phosphinothricin acetyltransferase and confers herbicide tolerance, was introduced into the cells via the above established method. The results of PCR and PCR-Southern blot analyses indicated that the gene was successfully integrated into the genome of the transformants.
본 논문에서는 기존의 PCR 장비가 가지고 있는 낮은 경제성, 장비의 대형화, 긴 분석 시간 등과 같은 단점을 해결하기 위하여 ATMEGA128 마이크로 칩을 사용 continuous-flow PCR 칩의 온도를 제어 하였다. Polydimethylsiloxane (PDMS)와 산화 인듐-주석(Indium tin-oxide, ITO) 유리 기판을 사용하여 continuous-flow PCR 칩을 제작하였고 PDMS를 주조 하여 마이크로 채널을 형성하였다. 또한 유리 기판위에 ITO 전극을 패터닝하여 마이크로 히터를 제작하였다. 이 결과 continuous-flow PCR 칩에서 빠르고 정확한 온도 제어를 통한 DNA 중합 효소 연쇄반응 결과를 얻을 수 있었다.
Newcastle disease (ND) is a highly contagious infection of poultry, Two pathology-based techniques, in situ RT-PCR and in situ hybridization (ISH) were applied to formalin-fixed, paraffin-embedded tissues from chickens naturally infected with velogenic ND virus (VNDV). Two pairs of primers and a probe for ISH and in situ RT-PCR, respectively, were selected from highly conserved region of matrix gene of NDV. The ISH experiment was carried out using MicroProbe$^{TM}$ capillary action system within 2 hours. In situ RT-PCR was performed using MicroProbe$^{TM}$ capillary action system and GeneAmp In Situ PCR system. With ISH and in situ RT-PCR, viral nucleic acid was detected in the central nervous system of chickens from infected with neurotropic velogenic Newcastle disease virus (NVNDV), whereas viral nucleic acid was detected in various organs or tissues of chickens from infected with viscerotropic velogenic Newcastle disease virus (VVNDV). In the NVND group, positive signals were characteristically defined in the cytoplasm of neuron, vascular endothelial cells, and perivascular mononuclear macrophages in the central nervous system. One of NVND group, chicken from one farm exhibited positive signals in the bronchial epithelium. The VVND group chickens showed positive reaction in the macrophages, vascular endothelium, and bronchiolar epithelium. Markedly, viral nucleic acid was detected in the macrophages of morphologically normal tissues which were peripheral or located in distant areas from lesions. The central nervous system of chickens infected with VVND virus had positive signals in the vascular endothelial cell, perivascular mononuclear macrophages and some neuron. The number and intensity of the positive cells by in situ RT-PCR were more and stronger, respectively, in comparison with those by ISH. Particularly, positive reaction was detected in macrophages infiltrating in cardiac muscle by in situ RT-PCR, but not obtained by ISH. Therefore, these results demonstrated that ISH is a rapid diagnostic method for detection of NDV and in situ RT-PCR can be used as an efficient method for detection of low viral load infection or subclinical viral infection of NDV.
MEMS(Micro Electro Mechanical System) 기술에서 실리콘 식각기술의 중요성으로 플라즈마 식각기술의 개발이 꾸준히 진행되고 있다. 본 연구에서는 ICP(Inductive Coupled Plasma)를 이용하여 플라즈마를 발생시켜, 이온에너지를 증가시키지 않고도 이온밀도를 높이고 이온입자들에 의한 식각의 방향성을 가할 수 있는 새로운 플라즈마 기술을 이용하였다. 이같이 플라즈마를 이용하여 실리콘웨이퍼를 식각하여 제조하는 MEMS 응용분야는 다양하나, 본 연구에서는 미생물배양에 응용할 수 있는 PCR(Polymerase Chain Reaction)장치 제작을 위한 식각에 이용하였다. Platen power, Coil power 및 Process pressure에 다양한 변화를 주어 각 변수에 따른 식각속도를 관찰하였다. 각 공정별 변수를 변화시킨 결과 Platen 12W, Coil power 500W, 식각/Passivation Cycle 6/7sec 일 경우 식각속도는 $1.2{\mu}m/min$ 이었고, sidewall profile은 $90{\pm}0.7^{\circ}$로 나타나 매우 우수한 결과를 보였다. 분 연구에 SF6를 식각에 이용하였으며 공정의 최적화를 통하여 사용량을 최소화하여환경영향이 최소가 될 수 있는 가능성이 있었다.
Cell cycle progression is regulated by both transcriptional and post-transcriptional mechanisms. MicroRNAs (miRNAs) emerge as a new class of small non-coding RNA regulators of cell cycle as recent evidence suggests. It is hypothesized that expression of specific miRNAs oscillates orderly along with cell cycle progression. However, the oscillated expression patterns of many candidate miRNAs have yet to be determined. Here, we describe miRNA expression profiling in double-thymidine synchronized HeLa cells as cell cycle progresses. Twenty-five differentially expressed miRNAs were classified into five groups based on their cell cycle-dependent expression patterns. The cyclic expression of six miRNAs (miR-221, let-7a, miR-21, miR-34a, miR-24, miR-376b) was validated by real-time quantitative RT-PCR (qRT-PCR). These results suggest that specific miRNAs, along with other key factors are required for maintaining and regulating proper cell cycle progression. The study deepens our understanding on cell cycle regulation.
Tumor-associated microRNAs have been detected in serum or plasma, but whether plasma microRNA-21 (miR-21) could be a potential circulating biomarker for gastric cancer (GC) prognosis in Chinese is still uncertain. Real-time quantitative reverse transcription PCR (qRT-PCR) was employed in this study to compare the relative expression of miR-21 between pre-operative and post-operative paired plasmas from 42 patients with primary GCs. The results showed that the expression levels of miR-21 in the post-operative plasmas were significantly reduced by an average of 18.2 times in all patients when compared to the pre-operative plasmas, and by 22.1 times in the subgroup of patients without family history, while only 1.76 times in the subgroup of patients with a family history. With respect of clinicopathological characteristics, the plasma miR-21 expression was highly associated with differentiation degree and lymph node metastasis rate. The results suggested plasma miR-21 could be a novel potential biomarker for GC prognosis and evaluation of surgery outcomes, especially in patients without a family history.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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