Park, Si-Jae;Lee, In-Su;Chang, Yong-Keun;Lee, Sang-Yup
Journal of Microbiology and Biotechnology
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제13권4호
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pp.578-583
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2003
The desulfurization genes (dszABC) were cloned from Gordonia nitida. Nucleotide sequences similarity between the dszABC genes of G. nitida and those of Rhodococcus rhodochrous IGTS8 was 89%. The similarities of deduced amino acids between the two were 86% for DszA, 86% for DszB, and 90% for DszC. The G. nitida dszABC genes were expressed in several different Escherichia coli strains under an inducible trc promoter. Cultivation of these metabolically engineered E. coli strains in the presence of 0.2 mM dibenzothiophene (DBT) allowed the conversion of DBT to 2-hydroxybiphenyl (2-HBP), which is the final metabolite of the sulfur-specific desulfurization pathway. The maximum conversion of DBT to 2-HBP was 16% in 60 h. Recombinant E. coli was applied for the deep desulfurization of diesel oil supplemented into the medium at 5% (v/v). Sulfur content in diesel oil was decreased from 250 mg sulfur/1 to 212.5 mg sulfur/1, resulting in the removal of 15% of sulfur in diesel oil in 60 h.
탄수화물 형태의 당뇨치료제인 acarbose 및 그 대사체를 LC/MS를 사용하는 간편하고 감도 좋은 분석방법을 개발하였다. 혈장시료를 주사기 필터로 거른후 다른 시료전처리과정 없이 LC/MS에 직접 주입하여 분석하였다. Acarbose에 대한 검정곡선은 $0.1{\sim}10{\mu}g/m{\ell}$ 농도범위에서 $r^2=0.9963$의 선형성을 나타내었다. ${\alpha}$-Amylase와 ${\beta}$-amylase를 사용한 in vitro 배양 시험을 통해서 생성된 대사체 component-I과 component-II도 정성적으로 확인 가능하였다. 이러한 LC/MS 분석법은 acarbose의 약동력학적 연구는 물론이며 다른 탄수화물 형태 약물의 연구에도 활용이 가능할 것이다.
$AFB_1$의 대사산물 중 하나인 $AFM_1$을 사람과 돼지의 뇨에서 cdELISA를 통해 분석함으로써 간접적으로 $AFB_1$의 위해성 평가를 수행하고자 하였다. 항 $AFM_1$ 항체와 ${AFB_1}-HRP$를 이용한 cdELISA에서 $AFM_1$의 검출한계는 10 pg/mL로 나타났다. 사람의 요에 $AFM_1$을 3-100 pg/mL 농도가 되게 첨가한 후 cdELISA로 분석하였을 때 그 회수율은 117-167%(평균 139${\pm}$19.1)의 범위로 나타났다. 사람의 뇨 중 $AFM_1$의 오염량을 cdELISA로 분석한 결과 전체 172개의 시료 중 165개의 시료에서 평균 2.74${\pm}$1.89 pg/mL 농도로 검출되었다. 뇨 중 $AFM_1$의 일일배출량은 평균 3.97 ng/day으로 나타났고, $AFB_1$의 섭취량은 체내전환율 5%로 가정하였을 때, 79.4 ng/day로 추정되었다. 따라서 사람의 일일섭취추정량 (PDI)은 1.28 ng/kg bw/day로 나타났으며 돼지의 PDI는 9.2 ng/kg bw/day로 나타났다. 한편 $AFB_1$ 섭취의 위해성 평가에서 사람의 PDI는, 일일섭취감내량(TDI, 0.15 ng/kg bw/day)보다 8.5배나 높은 값을 보였지만 외국의 연구결과와 비교하였을 때 대체로 비슷하게 나타났다.
The characteristics of two different modes of perfusion culture, intermittent and continuous bleedings, were investigated by culturing the hybridoma cells producing von Willebrand Factor (vWF) monoclonal antibody (McAb) in a 15 L bioreactor without clogging the filter. Both culture methods exhibited similar profiles of cell density and metabolite concentrations during the culture period at the cell concentration of around 1${\times}$107 cells/mL. When the perfusion rate was increased, the intermittrnt bleeding culture showed problems of ammonia accumulation and decrease of cell viability. The continuous bleeding culture in terms of nutrient consumption and metabolite production kinetics. But the analysis of specific oxygen consumption rate showed that the specific oxygen consumption rate of intermittent bleeding culture was similar to that of exponential growth phase. The continuous bleeding culture showed higher specific oxygen consumption rate of intermittent bleeding culture. finally we proved the possibility of long-term operation of continuous bleeding culture and produced approximately 40 g of vWF McAb in a 15L bioreactor after one-month operation.
Jimenez-Quero, A.;Pollet, E.;Zhao, M.;Marchioni, E.;Averous, L.;Phalip, V.
Journal of Microbiology and Biotechnology
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제26권9호
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pp.1557-1565
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2016
Itaconic acid (IA) is a dicarboxylic acid included in the US Department of Energy's (DOE) 2004 list of the most promising chemical platforms derived from sugars. IA is produced industrially using liquid-state fermentation (LSF) by Aspergillus terreus with glucose as the carbon source. To utilize IA production in renewable resource-based biorefinery, the present study investigated the use of lignocellulosic biomass as a carbon source for LSF. We also investigated the production of fumaric acid (FA), which is also on the DOE's list. FA is a primary metabolite, whereas IA is a secondary metabolite and requires the enzyme cis-aconitate decarboxylase for its production. Two lignocellulosic biomasses (wheat bran and corn cobs) were tested for fungal fermentation. Liquid hydrolysates obtained after acid or enzymatic treatment were used in LSF. We show that each treatment resulted in different concentrations of sugars, metals, or inhibitors. Furthermore, different acid yields (IA and FA) were obtained depending on which of the four Aspergillus strains tested were employed. The maximum FA yield was obtained when A. terreus was used for LSF of corn cob hydrolysate (1.9% total glucose); whereas an IA yield of 0.14% was obtained by LSF of corn cob hydrolysates by A. oryzae.
The effects of inorganic nitrogen sources such as KNO$_3$ and NH$_4$ NO$_3$ on cell growth and production of chlorogenic acid and eleutheroside E derivative were investigated in 5L bioreactor cultures of Eleutherococcus senticosus. The cell growth in the 1/2MS medium containing 15mMKNO$_{3}$. The fresh weight of cells harvested from bioreactor was affected by the concentration ratio of NO$_3$$^{[-10]}$ and NH$_4$$^{+}$ in culture medium. At the viewpoint of secondary metabolite production, the production of chlorogenic acid was affected by the concentration of NH$_4$$^{+}$ in the culture medium, but not by the total concentration of nitrogen sources in the culture medium. Futhermore, eleutheroside E derivative production was also affected by the concentration ratio of NO$_3$$^{[-10]}$ and NH$_4$$^{+}$ in the culture medium. Base on those results, it is suggested that cell growth and production of secondary metabolite(chlorogenic acid and eleutheroside E derivative) could be manipulated by controlling the total concentration of nitrogen sources and the concentration ratio of NO$_3$$^{[-10]}$ and NH$_4$$^{+}$ in the culture medium. medium.
The Coumarin (1,2-benzopyrone) is the main secondary metabolite of Mikania laevigata Sch. Beep ex Baker and Mikania glomerata Spreng., which are popularly known as guaco. These plants have been used mainly in traditional medicine in the treatment of respiratory diseases because their bronchodilator effect. However, there are around 200 species of Mikania, which are quite similar in appearance. From these, only M. leavigata and M. glomerata have high concentrations of coumarins. In this line, the falsification of products Mikania based has been frequent. In this sense, this work demonstrated the application of the easy, fast, e not destructive method based in Nuclear Magnetic Resonance in quantitative mode (qNMR) for the determination of coumarin in both commercial and homemade guaco products. Thus, in the first step the compounds were extract from guaco leaves and syrups using chloroform (CHCl3), with or without ultrasound. About the method, was linear with a R2 = 0.9947 for 1,2-benzopyrone, with detection and quantification limits with were 0.11 and 0.36 mg mL-1 respectively. In the same line, the method was safe with RSD <0.3% and with recovery ranging from 93-101%. To confirm the applicability of the method, in the last step was applied to 10 real samples (6 from leaves and 4 from syrups). The content of the coumarin in the leaf extract ranged from 0.62 to 1.30 mg mL-1. For syrups I, II and IV, the content of coumarin was in accordance with the manufacturers. However, for de Syrup III, the concentration was 155% higher. In summary, the qNMR is a rapid method with minimal sample preparation that can be used to quantify coumarin in home-made plant extracts as well as in commercial samples as syrup for instance. This method is applicable for quality control of different plants-based products.
Due to steady increase of childhood asthma, exposure to air toxics including PAHs have been thought as an etiology for the asthma. PAHs -involvement in airway inflammation, such as IgE production, is the potential mechanism of the PAHs-induced asthma. Cytochrome P450s (CYPs), particularly CYP1A1 is known enzyme to metabolite PAHs and to be induced by PAHs. The CYP1A1 expression has been emphasized as an biomarker for PAHs - exposure. The present study was performed to clarify the etiology of childhood asthma with PAHs-exposure using mRNA expression of CYP1A1 . The study Objects were Korean children who were asthma patients (cases) or other hospital controls (N=20; age,3 $\~$ 16; boys,56$\%$). As result, we detected expression of the CYP1A1 in all peripheral blood specimens which were collected from the subjects. Moreover, we found approx. 300 fold-higher expression of the CYP1A1 in the cases than that in the controls (p(<)0.01). When we considered age which was related to Asthma, the above significant trend was somewhat diluted, however, the relation between asthma and the Cypih i expression waL stronger than that between asthma and age (chi square,7.99 vs. 3.34). Therefore, our study supports that PAHs induce or worse childhood asthma and suggests application of expression of the CYP1A1 as an initiation or progress biomarker for PAHs - induced childhood asthma.
Cyanobacteria, blue-green algae, are a rich source of bioactive secondary metabolites with many potential applications. The ubiquitin-proteasome proteolytic system plays an important role in selective protein degradation and regulates cellular events including apoptosis. Cancer cells are more sensitive to the proapoptotic effects of proteasome inhibition than normal cells. Thus, proteasome inhibitors can be potential anticancer agents. Cyanobacteria have been shown to be a rich source of highly effective inhibitors of proteases. A proteasome inhibitor was screened from an extract of the culture of Scytonema hofmanni on the basis of its inhibitory activity, which led to the isolation of nostodione A with an $IC_{50}$ value of 50${\mu}M$. Its structure was determined by spectroscopic methods such as $^{1}H$-NMR and ESI-MS spectral analyses.
Phenylglycine was obtained as the sole metabolite when .alpha.-aminophenylacetonitrile was ted to the culture broth of Aspergillus furmigatus furmigatus. The isolated phenylglycine showed L-configuration with 80% optical purity. Examination of the hydrolysis of the substrate to phenylglycine with cell free extracts, and the supernatant fraction and the particulate fraction both of which were obtained after ultracentrifugation of the cell free extract at 100,000g, indicated that the nitrile group hydrolyzing enzymes, nitrilase existed not only in cytoplasm, but in microsome fractions.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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