• 한국정보통신학회논문지
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• 제12권5호
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• pp.921-929
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• 2008

최근 데이터 통합을 위한 방안으로 데이터 이질성을 해결하기 위한 많은 연구가 진행되고 있다. 우리가 제안하는 시스템의 구성요소는 XMDR 래퍼와 XMDR 저장소이다. XMDR 래 퍼는 XMDR의 표준 정보를 기반으로 인터페이스를 생성하고, 표준 정보와 로컬스키마 간의 매핑정보를 이용하여 글로벌 XMDR 쿼리와 로컬 쿼리 간의 상호변환을 수행함으로써 기존 시스템의 이질성을 해결한다. XMDR 저장소는 표준 정보와 로컬간의 매핑정보를 관리하는 XMDR과 수행된 결과를 저장하는 Proxy DB로 구성되어 있다. 사용자는 동일한 인터페이스를 사용하고, XMDR 래퍼가 XMDR의 메타 시멘틱 온톨로지를 이용하여 스키마의 이질성을 해결뿐만 아니라 인스턴스 시멘틱 온톨로지를 통한 값의 의미에 따른 이질성도 고려함으로써 중복된 질의를 수행하지 않아도 된다. 따라서 본 논문에서는 이러한 데이터 이질성을 해결하고 효율적인 데이터 통합을 위한 데이터 그리드 래퍼를 제안한다.

• 정보관리학회지
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• 제29권1호
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• pp.231-251
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• 2012

본 연구에서는 서지 정보를 확장하기 위한 방안으로 링크드 데이터를 선정하였다. 링크드 데이터는 웹 공간을 통해 공유 가능한 식별기호와 데이터 구조 및 링크 정보를 제공하기 때문이다. 특히 링크드 데이터는 서지 온톨로지와 결합하여 서지데이터를 확장시키는데 유용하다. 이에 링크드 데이터와 서지 온톨로지를 분석하고, 연계 가능한 링크드 데이터를 검토하였다. 그리고 이를 바탕으로 링크드 데이터로 구축된 기존의 전거 데이터 및 서지 데이터를 연계하였다. 이러한 실험적 연계를 통해 향후 링크드 데이터를 효과적으로 활용하기 위한 과제를 도출할 수 있었다. 즉, 1) 다양한 링크드 데이터 중에서 각 기관에서 적합한 데이터를 선정할 수 있어야 하며, 2) 선정된 링크드 데이터를 연계하기 위한 기준을 정립해야 하고, 마지막으로 3) 자관의 고유한 데이터를 개발하여 이를 다시 공유해 나가야 할 것을 제안하였다.

• 한국정보과학회 언어공학연구회:학술대회논문집(한글 및 한국어 정보처리)
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• 한국정보과학회언어공학연구회 2006년도 제18회 한글 및 한국어 정보처리 학술대회
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• pp.81-88
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• 2006

컴퓨터를 활용한 지식과 정보의 고도 처리를 위해 온톨로지를 구축하고 활용하려는 요구가 강해지고 있다. 이런 요구에 부흥하여 온톨로지의 구축 방법에 대한 많은 연구가 이루어지고 있다 그러나 현재까지의 온톨로지 구축 이론과 온톨로지 개발 도구가 실제 구현 목적과 사례에 따라 제한적인 부분에서 개발되어 사용되고 있다. 그러므로 구축하고자 하는 분야의 온톨로지에 맞는 적절한 구축 프로세스와 도구가 필요하다. 분야 온톨로지(domain ontology)를 구축함에 있어 특정 분야의 전문가 또는 비전문가가 언어자원으로부터 지식을 개념화(conceptualization), 형식화(formalization)하여 온톨로지를 구축할 수 있도록 분야 관련 언어자원에 근거하여 온톨로지를 구축할 수 있는 온톨로지 구축 프로세스(OntoProcessl))를 제안한다. 그리고, 다수의 온톨로지 구축자가 동시에 같은 분야의 온톨로지를 구축할 경우, 개념화 과정에서 서로 다른 구축자가 동일한 개념을 중복 정의하거나, 형식화 과정에서 형식언어 이해 부족으로 인한 구축 능률 저하 문제가 발생할 수 있다. 이를 위해 메타 온톨로지(meta ontology)를 이용하여 다중 온톨로지를 구축할 때 발생하는 문제를 해결하는 다중 온톨로지 구축 프로세스를 제안한다. 현재 이 프로세스에 근거하여 온톨로지 구축 시스템(OntoCS2))을 개발하였고 국가 IT 온톨로지 인프라 기술 개발 프로젝트에서 IT분야 온톨로지의 개발에 활용되고 있다.

• 한국산학기술학회:학술대회논문집
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• 한국산학기술학회 2003년도 Proceeding
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• pp.57-64
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• 2003

Achieving the beneficiary goal of recent discovery in human genome project still needs a way to retrieve and analyze the exponentially expanding bio-related information. Research on bio-related fields naturally applies knowledge discovered to the current problem and make inferences to extract new information where shared concepts and data containing information need to be defined and used in a coherent way. In such a professional domain, while the need to help users reduce their work and to improve search results has been emerged. methods for systematic retrieval and adequate exchange of relevant information are still in their infancy. The design of our system aims at improving the quality of information retrieval in a professional domain by utilizing both corpus-based and concept-based ontology. Meta-rules of helping users to make an adequate query are formed into an ontology in the domain. The integration of those knowledge permits the system to retrieve relevant information in a more semantic and systematic fashion. This work mainly describes the query models with details of GUI and a secondary query generation of the system.

• 한국경영과학회:학술대회논문집
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• 한국경영과학회/대한산업공학회 2003년도 춘계공동학술대회
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• pp.1136-1141
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• 2003

Due to the lack of digitally usable standards, it has been known to be difficult to handle the biological data. For example, the name of genes and proteins changes over time or has several synonyms indicating different entities. To cope with these problems, several communities, including the Gene Ontology Consortium and PubGene are making their efforts to move science toward the semantic web vision. Although some progress has been made, its expressivity is not sufficient for full-fledged ontological modeling and reasoning. This paper suggests a methodology for representing and extracting biological knowledge by using Web Ontology Language (OWL) as an extension of Resource Description Framework Schema (RDFS). Some benefits of our approach are: (1) to ensure extended sharing of biological meta data on the Web, and (2) to enrich additional expressivity and the semantics of RDFS+OWL.

• Journal of Periodontal and Implant Science
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• 제51권1호
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• pp.18-29
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• 2021

Purpose: The aim of this study was to compare the characteristic expression patterns of advanced periodontitis in 2 cohort data sets analyzed using different microarray platforms, and to identify differentially expressed genes (DEGs) through a meta-analysis of both data sets. Methods: Twenty-two patients for cohort 1 and 40 patients for cohort 2 were recruited with the same inclusion criteria. The 2 cohort groups were analyzed using different platforms: Illumina and Agilent. A meta-analysis was performed to increase reliability by removing statistical differences between platforms. An integrative meta-analysis based on an empirical Bayesian methodology (ComBat) was conducted. DEGs for the integrated data sets were identified using the limma package to adjust for age, sex, and platform and compared with the results for cohorts 1 and 2. Clustering and pathway analyses were also performed. Results: This study detected 557 and 246 DEGs in cohorts 1 and 2, respectively, with 146 and 42 significantly enriched gene ontology (GO) terms. Overlapping between cohorts 1 and 2 was present in 59 DEGs and 18 GO terms. However, only 6 genes from the top 30 enriched DEGs overlapped, and there were no overlapping GO terms in the top 30 enriched pathways. The integrative meta-analysis detected 34 DEGs, of which 10 overlapped in all the integrated data sets of cohorts 1 and 2. Conclusions: The characteristic expression pattern differed between periodontitis and the healthy periodontium, but the consistency between the data sets from different cohorts and metadata was too low to suggest specific biomarkers for identifying periodontitis.

• Asia pacific journal of information systems
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• 제13권2호
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• pp.145-170
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• 2003

Open Decision Support System(DSS) is an automated and transparent system that is built to be shared both within and across organizations. The open DSS has been thought to be a set of decision components that are communicating through Web protocols. These characteristics intuitively invite the Web services concepts, which are currently one of the new trends in network-based business services. However, web services still are not active enough to be autonomous, and to provide for composing functionalities. These lead to the motivation on building a sophisticated web service to contain these features and to utilize web services on behalf of the user. This paper aims to propose a new concept of Meta Web Service, a web service-based open DSS. Decision modules in a dynamic and open DSS can be viewed as a web service. The Meta Web Service understands the users problem statement with ontology, performs web service discovery, web service composition, and automatically generates codes for composite web service execution. A prototype of example web service has been developed to show the feasibility of the proposed idea.

• 한국정보통신학회논문지
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• 제10권12호
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• pp.2212-2220
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• 2006

최근 기업들은 레거시 시스템들간의 데이터 상호 운용하기 위해 기업들은 이미 보유하고 있는 레거시 업무와 EAI 시스템을 도입하고 있다. 협업적인 거래 환경에서의 EAI 시스템은 유기적으로 통합하고 공유함으로서 효율적인 검색을 기대할 수 있다. 그러나 기존 레거시 시스템은 특정 목적에 따라 설계단계부터 상호 운용성을 고려하지 않고 독자적으로 관리되므로 EAI는 표준기술 적용이 어려우므로 별도의 전용 EAI 솔루션을 도입해야 한다. 이러한 문제를 해결하기 위해 데이터 통합을 이용하여 메타데이터 레지스트리를 이용한다. 그러나 메타데이터의 다양한 타입과 의미론적 명세, 데이터 이질성 문제, 이기종간의 시스템 이질성에 대한 문제도 야기된다. 따라서 본 논문에서는 웹 환경에서 데이터 상호운용을 위한 XMDR(eXtended Meta-Data Registry) 기반의 검색 시스템을 제안한다.

• Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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• 제14권1호
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• pp.457-461
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• 2013

Prostate cancer is a leading cause of death in male populations across the globe. With the advent of gene expression arrays, many microarray studies have been conducted in prostate cancer, but the results have varied across different studies. To better understand the genetic and biologic mechanisms of prostate cancer, we conducted a meta-analysis of two studies on prostate cancer. Eight key genes were identified to be differentially expressed with progression. After gene co-expression analysis based on data from the GEO database, we obtained a co-expressed gene list which included 725 genes. Gene Ontology analysis revealed that these genes are involved in actin filament-based processes, locomotion and cell morphogenesis. Further analysis of the gene list should provide important clues for developing new prognostic markers and therapeutic targets.

• 한국콘텐츠학회논문지
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• 제9권4호
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• pp.55-64
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• 2009

RFID 기술은 동시에 여러 개의 사물을 자동으로 인식할 수 있어 유비쿼터스 응용 서비스를 제공하는데 활용할 수 있으며, 이 경우 응용 서비스와 RFID 리더 장치 사이의 교량 역할을 하는 RFID 미들웨어가 필요하다. 본 논문은 기존 EPCglobal의 ALE 미들웨어에서 다양한 RFID 리더를 처리하기 위하여 미들웨어 내부에 소스 코드 형태로 RFID 리더의 스트림 정보 등을 하드 코팅하여 처리하고 있어, 새로운 RFID 리더를 처리하기 위하여 다시 RFID 미들웨어의 소스를 수정해야 하는 단점을 해결하고자 다양한 유형의 RFID 리더 장치들을 효과적으로 처리하기 위한 방법을 제안한다. 이를 위하여 다양한 RFID 리더들의 미들웨어 접속 정보, 데이터 프로토콜 정보, 스트림 정보 등을 온톨로지 메타 데이터로 구축하여 데이터베이스에 저장한 후 리더 장치에서 읽은 데이터를 해석하기 위하여 활용한다. 본 방법을 이용하면 새로운 유형의 RFID 리더 장치가 등장하여도 이에 대한 온톨로지만 추가함으로써 미들웨어 변경 없이 리더 장치를 처리할 수 있음은 물론, RFID리더 온톨로지 재사용을 통하여 미들웨어를 효과적으로 확장할 수 있다.