• 미생물학회지
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• 제48권4호
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• pp.328-331
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• 2012

울릉도 연안의 심해(1500 m)에 서식하는 미생물의 다양성을 조사하였다. Ultramembrane filter를 사용하여 해양미생물을 여과한 다음 미생물군집 DNA를 정제하여 16S rDNA를 증폭하였다. Pyrosequencing 방법으로 염기서열을 분석한 결과 총 13,029 reads를 얻었으며, 이중에 54.1%가 uncultured bacteria, 23.4%가 alphaproteobacteria, 22.3%가 gammaproteobacteria이었고 flavobacteria, actinobacteria, epsilonproteobacteria 등이 0.2%이내에서 분포하고 있었다. 울릉도 지역의 해양심층수에서 배양이 가능한 것으로 알려진 미생물로서는 alphaproteobacteria의 Rhodobacteraceae과 (family), gammaproteobacteria의 Alteromonadaceae, Halomonadaceae, Piscirickettsiaceae과가 주로 분포하였다.

• 생명과학회지
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• 제28권10호
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• pp.1179-1185
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• 2018

최근 괭생이모자반(Sargassum horneri)은 제주의 해안가와 해변, 연근해 양식장 등 매년 대량으로 속출되어 인근 양식업자 및 주민에게 막대한 피해를 주고 있는 추세이다. 본 연구에서는 제주 인근 연안으로 흘러 들어온 괭생이 모자반에 서식하고 있는 미생물의 다양성을 탐색하고 동정을 통한 미생물의 기능을 파악함으로써 생태학적 문제에 관한 기초자료를 제공하고자 하였다. Proteobacteria는 분리 된 균주 중 88%를 차지한 우점문으로 ${\alpha}-proteobacteria$강은 6속 10종으로 Pseudorhodobacter속이 40%를 차지하고 Paracoccus속 20%, Rhizobium, Albirhodobacter, Skermanella 및 Novosphingobium 속은 각각 10%를 차지했다. ${\beta}-proteobactera$강은 5속 10종으로 Hydrogenophaga속이 50%, Azoarcus 20%, 나머지 Oxalicibacterium, Duganella, Xenophilus속은 각각 10%를 차지했다. ${\gamma}-proteobacteria$강은 13속 57종으로 Proteobacteria문에서 74%로 우점강을 차지했고, Shewanella는 23%, Pseudomonas속 12%, Cobetia 19%, Rahnella, Vibrio 및 Serratia속은 4%, 나머지 Rheinheimera, Raoultella, Pantoea, Acinetobacter, Moraxella 및 Psychrobacter속은 2%를 차지했다. Actinobacteria는 1속 2종으로 Gordonia와 Nocardioides속이 각각 50%를 나타냈다. Bacteroidetes문은 3속 5종으로 Lacihabitans, Mariniflexile속은 33%, 나머지 Dyadobacter, Cellulophaga와 Ferruginibacter속은 11%를 차지했다.

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제44권4호
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• pp.535-539
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• 2016

제주도 넙치 양식장에서 주로 발생하는 어류질병세균인 S. parauberis, S. iniae, E. tarda에 대한 피해를 줄이고자 갈륨을 이용하여 어류질병세균을 억제하고자 한다. 본 연구진은 Sp, Si, Et의 생육도와 biofilm 형성능을 확인하였으며, 세균의 성장도와 biofilm 형성능간의 특정한 패턴은 없었으며 세균의 성장도가 높다 하더라도 biofilm을 활발히 형성하지 않음을 알 수 있었다. 어류질병세균이 형성하는 biofilm을 저해하기 위해 갈륨을 2.0, 4.0, 8.0 mg/ml로 첨가하여 저해능을 확인한 결과 72시간째 biofilm의 형성이 크게 저해되는 것을 확인하였다. 또한 biofilm을 저해하는 동시에 균주의 사멸능을 확인하기 위해 resazurin assay와 propidium iodide를 이용하여 염색한 결과 갈륨의 농도에 따라 균주의 사멸이 증가하는 것을 확인하였다. 이에 따라 in vitro 상에서 갈륨이 어류질병세균의 biofilm을 억제하는 동시에 균주를 사멸시키는 물질로서 가치가 있다고 사료된다.

• 한국산학기술학회:학술대회논문집
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• 한국산학기술학회 2010년도 추계학술발표논문집 2부
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• pp.1025-1028
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• 2010

The bacteriological examination of spring water in Seogwipo-city was conducted. A total 11 spring water samples were performed from January to April, 2010. During the study period, the range of temperature was from 0.7 to $15.4^{\circ}C$, and result of the analyses showed that hydrogen ion concentrations (pH) for spring water was 0.33 to 7.8. salinity levels for sample average of 0.5 to 1.04‰, as the result of measuring dissolved oxygen (DO) for spring water showed that water dissolved oxygen were 1.02 to 7.14 mg/${\ell}$. The range of total coliform of spring water sample at 11 stations located in the designated spring water were <1.8~>1,600 MPN/100mL. And the range of geometric mean of total coliform were 1.9~117.1 MPN/100mL, The range of fecal coliform of spring water sample at 11 stations located in the designated spring water were <1.8~>1,600 MPN/100mL. And the range of geometric mean of fecal coliform were 1.8~68.1 MPN/100mL, respectively. Level of microbial contamination was examined in 11 samples for indication of bacterial contamination such as heterophic bacteria, EscherichiacoliO157;H7, salmonella spp., Vibrio parahaemolyticus, Staphylococcus aureus, Shigella spp. Were frequently detected from the spring water. Salmonella spp., S.aureus were detected in the range of $0{\sim}1.0{\times}10^1$, $0{\sim}3.0{\times}10^1$ CFU/ml, respectively. And the Escherichia coli O157;H7, Vibrio parahaemolyticus, Shigella spp. Were not detected from the examined spring water samples.

• 미생물학회지
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• 제49권3호
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• pp.282-285
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• 2013

강원도 고성군 근해에서 수심 300 m와 500 m의 심층수에 서식하는 해양미생물 분포를 조사하였다. 심해미생물을 16S rRNA genes pyrosequencing 방법으로 분석한 결과 300 m 심층수 시료에서 얻은 19,474 reads에서 Alphaproteobacteria와 Gammaproteobacteria가 각각 57.41%와 38.85%의 분포 비율을 보였다. 심해 500 m의 시료에서 얻은 82,806 reads에서는 Gammaproteobacteria가 99.64%로 대부분을 차지하였다. 수심 300 m에서는 Rhodobacterales (57.31%)가 우점하였고, 수심 500 m에서는 Alteromonadales (45.65%)와 Oceanospirillales (34.61%)가 우점하였다. Operational Taxonomic Units와 diversity indexes (Shannon과 Simpson)를 기준으로 할 때 해양미생물의 다양성은 수심 500 m지역이 수심 300 m지역보다 더 높게 나타났다.

• 한국생명과학회:학술대회논문집
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• 한국생명과학회 2006년도 제47회 학술심포지움 및 추계국제학술대회
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• pp.81.1-81.1
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• 2006

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제24권11호
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• pp.1559-1565
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• 2014

Cellulase and xylanase are main hydrolysis enzymes for the degradation of cellulosic and hemicellulosic biomass, respectively. In this study, our aim was to develop and test the efficacy of a rapid, high-throughput method to screen hydrolytic-enzyme-producing microbes. To accomplish this, we modified the 3,5-dinitrosalicylic acid (DNS) method for microwell plate-based screening. Targeted microbial samples were initially cultured on agar plates with both cellulose and xylan as substrates. Then, isolated colonies were subcultured in broth media containing yeast extract and either cellulose or xylan. The supernatants of the culture broth were tested with our modified DNS screening method in a 96-microwell plate, with a $200{\mu}l$ total reaction volume. In addition, the stability and reliability of glucose and xylose standards, which were used to determine the enzymatic activity, were studied at $100^{\circ}C$ for different time intervals in a dry oven. It was concluded that the minimum incubation time required for stable color development of the standard solution is 20 min. With this technique, we successfully screened 21 and 31 cellulase- and xylanase-producing strains, respectively, in a single experimental trial. Among the identified strains, 19 showed both cellulose and xylan hydrolyzing activities. These microbes can be applied to bioethanol production from cellulosic and hemicellulosic biomass.

• 한국어병학회지
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• 제29권1호
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• pp.1-5
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• 2016

Isopods are parasitic crustaceans that pose serious threat to fisheries. Several studies have tried to explore the host-pathogen relationship between marine fishes and isopods. The present study aims to understanding the secondary infections in marine fishes pertaining to isopods. To assess the secondary infection in infected fishes, parasite infested and healthy tissues of fishes were collected. The samples were subjected to standard microbiological procedure to identify the presence of pathogenic bacteria and fungi. Our results showed the branchial region had the higher microbial load of non-sporulating cenocytic fungi in infected fishes. Moreover, fungal strains isolated from the parasitic lesion confirmed that the parasitation and body lesion facilitates the entry of several pathogenic microbes at the damaged host tissue. More over the immune regulation of fish fights back by producing minute cysts, trying to encapsulate the growing fungus. But this may eventually lead to systemic infestation and death of the fish.

• 미생물학회지
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• 제49권2호
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• pp.179-183
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• 2013

해양에서 유래된 미생물들은 지금까지 다양한 대사체들을 생산해 왔다. 해양 미생물로부터 대사체를 규명해 내고자 하는 연구의 일환으로, Aspergillus protuberus가 선택되었다. 이 균주를 대량 배양하여 배양물을 유기용매로 추출한 후, 추출물을 실리카 겔 칼럼 크로마토그라피로 분획하였다. 그 후 분획물에 분취용 HPLC 등을 실시하여 총 3종의 대사체들을 분리하였다. 분리된 대사체들의 화학적 구조는 NMR, MS, UV 등의 기기분석 방법을 이용하여 각각 deoxybrevianamide E (1), brevianamide V (2) 및 ergosterol peroxide (3)로 동정하였다. 이 A. protuburutus가 생산해 내는 대사체에 관한 연구는 본 연구에서 처음으로 이루어졌다.

• Biomolecules & Therapeutics
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• 제24권4호
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• pp.347-362
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• 2016

Marine sponges have been considered as a drug treasure house with respect to great potential regarding their secondary metabolites. Most of the studies have been conducted on sponge's derived compounds to examine its pharmacological properties. Such compounds proved to have antibacterial, antiviral, antifungal, antimalarial, antitumor, immunosuppressive, and cardiovascular activity. Although, the mode of action of many compounds by which they interfere with human pathogenesis have not been clear till now, in this review not only the capability of the medicinal substances have been examined in vitro and in vivo against serious pathogenic microbes but, the mode of actions of medicinal compounds were explained with diagrammatic illustrations. This knowledge is one of the basic components to be known especially for transforming medicinal molecules to medicines. Sponges produce a different kind of chemical substances with numerous carbon skeletons, which have been found to be the main component interfering with human pathogenesis at different sites. The fact that different diseases have the capability to fight at different sites inside the body can increase the chances to produce targeted medicines.