• Title/Summary/Keyword: mFOLD

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미호종개 metallothionein 유전자의 구조 및 중금속 노출과 고온 자극에 대한 MT mRNA의 발현 특징 분석 (Gene Structure and Altered mRNA Expression of Metallothionein in Response to Metal Exposure and Thermal Stress in Miho Spine Loach Cobitis choii (Cobitidae; Cypriniformes))

  • 이상윤;남윤권
    • 한국어류학회지
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    • 제23권1호
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    • pp.61-69
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    • 2011
  • 멸종위기 어류 미호종개(Cobitis choii)로부터 중금속해독 단백질(metallothionein) 유전자를 분리, 클로닝하고 중금속 및 고온 스트레스에 대한 전사 발현 특정을 분석하였다. 미호종개 metallothionein는 gDNA, mRNA 및 아미노산 서열 모두에서 경골 어류 MT들의 구조적 특징을 잘 보전하고 있었으며, 생물정보분석을 통해 미호종개 MT 유전자 5'-upstream 영역은 중금속 조절, 면역 반응 및 온도 반응에 관여하는 다양한 전사 조절인자들의 부착 위치들을 포함하는 것으로 관찰되었다. 카드뮴(Cd), 구리(Cu), 니켈(Ni), 망간(Mn) 및 아연(Zn)을 이용한 침지 노출 실험(0.5 및 $1.0\;{\mu}M$; 24시간)에서 미호종개 MT mRNA 발현은 구리 및 카드뮴 처리군에서 가장 많이 유도되었고($1.0\;{\mu}M$ Cu 처리군에서 최대 10배), 망간 처리군에서는 비교적 적은 양의 MT 발현이 유도된 반면(2배), 아연 및 니켈 노출 군에서는 유의적인 MT 발현의 증감이 관찰되지 않았다. 또한 미호종개 MT 전사 발현은 고온 자극 ($25^{\circ}C$로부터 $31^{\circ}C$까지 증가)에도 민감하게 반응하는 것으로 나타나, $31^{\circ}C$ 도달시점에서 $25^{\circ}C$ 초기 MT mRNA 발현 수준보다 9배 높은 mRNA 발현이 관찰되었다. 본 연구 결과는 MT 기반의 유전자 발현 분석을 이용함으로써, 향후 멸종위기 어류 미호종개의 스트레스 반응 연구에 유용한 기초 자료를 제공할 수 있다고 기대된다.

림포사이트 및 클로널 마크로파지계를 모델로 한 더덕열수추출물의 면역증강작용 (Immunostimulative Effect of Hot-Water Extract from Codonopsis lanceolata on Lymphocyte and Clonal Macrophage)

  • 이종화
    • 한국식품과학회지
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    • 제34권4호
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    • pp.732-736
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    • 2002
  • 더덕열수추출물의 면역증강효과를 조사하였다. 더덕열수추출물을 1에서 $25\;{\mu}g/mL$의 농도로 첨가했을 때 BSA로 면역된 마우스의 림파절 세포는 무첨가군에 비해 2.8에서 11.2배의 세포증식 효과를 나타냈다. 더덕열수추출물은 인삼열수추출물보다 증식효과가 높게 나타났으며, 면역증강효과가 알려진 B. adolescentis M101-4 와는 유사한 정도의 효과를 보였다. 비장 및 Peyer's patch 세포에 대해서는 1에서 $25\;{\mu}g/mL$의 더덕열수추출물을 첨가했을 때 각각 4.2에서 13.8배, 3.1에서 6.9배의 증식효과를 나타냈다. 더덕열수추출물은 또한 RAW 264.7 세포주에 의한 $TNF-{\alpha}$ 나 IL-6 같은 사이토카인 생산을 자극하였다. RAW 264.7 세포를 lipopolysaccharide로 자극했을 경우, $TNF-{\alpha}$ 및 IL-6는 무첨가군에 비해 별다른 증진효과를 나타내지 않았으나, 자극하지 않은 RAW 264.7 세포에 대해서는 $TNF-{\alpha}$는 12.6에서 67.8배, Il-6는 2.8에서 10.1배 증가하였다. 이상의 결과로 더덕열수추출물을 이용하여 노화 및 질병에 따라 수반되는 면역력 감소를 방지하는 기능성식품 및 신소재로의 개발이 기대된다.

배양신경세포의 저산소증모델에서 대황 물추출물에 의한 유전자 표현 변화의 microarray 분석 (Microarray Analysis of Gene Expression by Rhei Rhizoma Water Extracts in a Hypoxia Model of Cultured Neurons)

  • 이현숙;송진영;문일수
    • 생명과학회지
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    • 제19권1호
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    • pp.21-33
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    • 2009
  • 대황(Rhei Rhizoma; RR, 대황(大黃))은 Rheum officinale Baill.와 Rheum palmatum L.(polygonaceae)의 땅속부분으로 남아시아의 민속의학에서 간 및 신장의 손상을 치료하는데 널리 이용되고 있다. 본 연구에서는 배양한 흰쥐 해마신경세포의 저산소증모델을 이용하여 대황의 물추출물이 유전자 표현에 미치는 영향을 microarray 방법을 이용하여 조사하였다. 배양 후 10일 (DIV10)에 추출물을 배지에 $2.5{\mu}g/ml$ 농도로 첨가하고, DIV13에 저산소증(2% $O_2$/5% $CO_2$, $37^{\circ}C$, 3 h)을 유발한 후 24 시간 후에 total RNA를 분리하여 microarray에 사용하였다. MA-plot에 의하면 표현이 연화된 대부분의 유전자는 ${\pm}2$배 이내로 증감되었다. 이 가운데 Global M 값이 0.2(즉, 15%)보다 더 증가한 유전자는 472종, Global M 값이 -0.2(즉, -15%)보다 더 감소한 유전자는 725종이였다. 세포의 생존과 관련된 유전자 가운데 세포자연사 억제유전자인 Tegt(2.4배), Nfkb1 (2.4배), Veg (1.8배), Ngfr (1.6배) 등이 크게 증가하였으며, 반면에 자연사 촉진유전자인 Bad (-64%), Cstb (-66%)는 감소하였다. 스트레스를 극복하는데 필요한 유전자인 Defb3 (2.7배), Cygb (2.2배), Ahsg (2.18배), Alox5 (2배) 등도 크게 증가하였다. 그리고 세포 성장을 촉진하는 유전자인 Erbb2 (1.84배), Mapk12 (1.8배)도 크게 증가하였다. 따라서 대황의 물추출물은 세포생존에 필요한 유전자를 증가시키고, 세포사를 유도하는 유전자는 감소시킴으로서 저산소층 스트레스에서 신경세포의 사망을 억제하는 것으로 해석된다.

Supported Liquid Membrane을 이용한 Short Peptide의 추출 (Extraction of Short Peptide Using Supported Liquid Membranes)

  • 이재흥;박기문
    • 한국축산식품학회지
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    • 제25권3호
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    • pp.340-343
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    • 2005
  • SLM을 이용한 short peptide의 분리를 목적으로 donor phase의 pH 및 acceptor phase의 염농도, membrane의 carrier 농도 차에 따른 peptide의 이동속도를 확인한 결과는 다음과 같다. 즉, pH 7.0 이하에서는 acceptor phase의 NaCl 농도나 carrier 농도에 상관없이 Gly-Tyr의 이동속도는 거의 영향을 끼치지 않았고, pH 7.0 이상에서는 이동속도가 급격히 증가함을 알 수 있었다. 그리고 Aliquat가 $8\%$ 함유된 D-SLM과 $20\%$ 함유된 H-SLM의 경우 Gly-Tyr의 이동속도는 H-SLM이 D-SLM보다 pH 9.0, 0.25 M NaCl 용액에서는 약 3배, pH 8.0, 1.0 M NaCl용액에서는 10배 정도 빠르게 이동하였다. 또한 H-SLM에서 acceptor phase의 NaCl 농도가 1.0 M 인 경우 0.25 M에 비해 10배 정도 이동속도가 빠른 것으로 나타났다. 따라서, short peptide인 Gly-Tyr의 SLM을 이용한 추출에서 donor phase의 pH 7.0 이상, carrier 농도가 높은 H-SLM 사용, acceptor phase의 염 농도가 높을수록 이동속도가 빠른 것으로 나타났다.

Pseudomonas spp.의 원형질체 생성과 재생 (The Spheroplast Formation and Regeneration of Pseudomonas spp.)

  • 이주실;이영록
    • 미생물학회지
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    • 제24권1호
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    • pp.24-31
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    • 1986
  • Pseudomonas 속에 속하는 여러균주의 원형질체 생성을 위한 최적조건과 이들의 재생에 영향을 미치는 몇 가지 요인들을 조사하였다. Pseudomonas는 lysozyme ($100{\mu}g/ml$)과 10mM EDTA를 처리하였을 때 99.0%에서 99.9%까지 원형침체로 천환 되었으며, 이때 사용한 완충액의 최적 pH는 8.0이였고 효소처리는 상온에서 진탕하지 않고 처리하였을 때가 비교적 균주간에 차이가 없이 효과적으로 원형질체가 생성되었다. $MgCl_{2}$ 그러고 Streptomycin수용액이 윈형 질체의 안정성을 높였고, 원형질체의 생성에는 $Mg^+\;and\;Na^+$ 이온이 효과적으로 작용하였다. 원형질체의 재생은 Rich Regeneration Medium배지에 20mM $MgCl_{2}$를 첨가하였을 때 원형질체의 재생율이 28배까지 증가하였다. 원형질체의 생성과 그것을 희석하는데 사용한 완충액에 1% Bovine Serum Albumlne를 첨가한 경우 재생율이 10배 가까이 증가되었고, 또한 완충액에 1% BSA를 첨가하고 재생배지에 0.5% 제라틴을 첨가했을 때에는 14배까지 재생율이 증가되어다.

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4,4'-Diaponeurosporene from Lactobacillus plantarum subsp. plantarum KCCP11226: Low Temperature Stress-Induced Production Enhancement and In Vitro Antioxidant Activity

  • Kim, Mibang;Jung, Dong-Hyun;Seo, Dong-Ho;Park, Young-Seo;Seo, Myung-Ji
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제31권1호
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    • pp.63-69
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    • 2021
  • Carotenoids, which have biologically beneficial effects and occur naturally in microorganisms and plants, are pigments widely applied in the food, cosmetics and pharmaceutical industries. The compound 4,4'-diaponeurosporene is a C30 carotenoid produced by some Lactobacillus species, and Lactobacillus plantarum is the main species producing it. In this study, the antioxidant activity of 4,4'-diaponeurosporene extracted from L. plantarum subsp. plantarum KCCP11226 was examined. Maximum carotenoid content (0.74 ± 0.2 at A470) was obtained at a relatively low temperature (20℃). The DPPH radical scavenging ability of 4,4'-diaponeurosporene (1 mM) was approximately 1.7-fold higher than that of butylated hydroxytoluene (BHT), a well-known antioxidant food additive. In addition, the ABTS radical scavenging ability was shown to be 2.3- to 7.5-fold higher than that of BHT at the range of concentration from 0.25 mM to 1 mM. The FRAP analysis confirmed that 4,4'-diaponeurosporene (0.25 mM) was able to reduce Fe3+ by 8.0-fold higher than that of BHT. Meanwhile, 4,4'-diaponeurosporene has been confirmed to be highly resistant to various external stresses (acid/bile, high temperature, and lysozyme conditions). In conclusion, L. plantarum subsp. plantarum KCCP11226, which produces 4,4'-diaponeurosporene as a functional antioxidant, may be a potentially useful strain for the development of functional probiotic industries.

Effect of Exogenous Sulfur on Hydrogen Peroxide, Ammonia and Proline Synthesis in White Clover (Trifolium repens L.)

  • Baek, Seon-Hye;Muchamad, Muchlas;Lee, Bok-Rye;Kim, Tae-Hwan
    • 한국초지조사료학회지
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    • 제42권3호
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    • pp.195-200
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    • 2022
  • Sulfur is an essential element in plants, including amino acids, vitamin synthesis, and acting as an antioxidant. However, the interaction between endogenous sulfur and proline synthesis has not been yet fully documented. White clover (Trifolium repens L.) is known as a species highly sensitive to sulfate supply. Therefore, this study aimed to elucidate the role of sulfur in regulating proline metabolism in relation to ammonia detoxification and hydrogen peroxide (H2O2) accumulation in white clover. The detached leaves of white clover were immersed in solution containing different concentration of sulfate (0, 10, 100, and 1000 mM MgSO4). As MgSO4 concentrations were increased, the concentration of H2O2 increased up to 2.5-fold compared to control, accompanied with H2O2 detection in leaves. Amino acid concentrations significantly increased only at higher levels (100 and 1000 mM MgSO4). No significant difference was observed in protein concentration. Proline and ∆1-pyrroline-5-carboxylate (P5C) concentrations slightly decreased at 10 and 100 mM MgSO4 treatments, whereas it rapidly increased over 1.9-fold at 1000 mM MgSO4 treatment. Ammonia concentrations gradually increased up to 8.6-fold. These results indicate that exogenous sulfur levels are closely related to H2O2 and ammonia synthesis but affect proline biosynthesis only at a higher level.

지질과 phycobiliproteins 고생산성 Arthrospira platensis 변이주 분리 (Isolation of Arthrospira platensis Mutants Producing High Lipid and Phycobiliproteins)

  • 김영화;이재화
    • KSBB Journal
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    • 제27권3호
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    • pp.172-176
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    • 2012
  • In this study, microalgae Arthrospira platensis (A. platensis) mutants induced by ethyl methane sulfonate (EMS) and further selection for resistance of cerulenin, a potent inhibitor of fatty acid synthase, were characterized. The mutants selected by $2{\mu}M$, $5{\mu}M$ and $10{\mu}M$ of cerulenin were designated EC2, EC5 and EC10, respectively. Under normal growth conditions, the mutants and parental strain exhibited similar growth pattern. The mutants of A. platensis showed enhanced lipid accumulation and phycobiliproteins (phycoerythrin, phycocyanin). The lipid content of mutants EC2 and EC5 was about 4.4 and 4.8-fold higher than wild type. The phycoerythrin and phycocyanin content of mutants EC2 and EC5 was increased about 1.5 and 6.9-fold and 1.4 and 3.8-fold, respectively, compared to the wild type. The chlorophyll and carotenoid content of mutants was slightly increased. The high lipid and pigment contents exhibited by A. platensis mutants would make an excellent candidate for the production of commercially interesting biologically active compounds.

Effects of Acute Metal Exposures on the Viability and mRNA Expression of Metallothionein in Hemibarbus mylodon Fry

  • Bang, In-Chul;Cho, Young-Sun;Lee, Il-Rho;Nam, Yoon-Kwon
    • 생태와환경
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    • 제40권4호
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    • pp.489-494
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    • 2007
  • Transcriptional modulation of metallothionein (MT) during acute metal exposures (cadmium, copper or zinc) was examined in fry of Hemibarbus mylodon, a threatened fish species in Korean peninsula. Viability of H. mylodon fry was most affected by copper exposure (up to 79% of mortality at 1 ppm for 48 hours) and considerably by cadmium exposure (21 to 54% of mortality). On the other hand, Zn showed the least adverse effect on the viability (0 to 13% of mortality) of this species. Based on the semi-quantitative RT-PCR analysis, the stimulation of MT mRNA in response to metal exposures followed generally in a dose-dependent fashion where cadmium was the most potent inducer for the induction of MT transcripts in fry (up to more than 5-fold) while the lowest response was observed in zinc-exposed group (2-fold at maximum). From the exposure using environmentally realistic doses of cadmium (0 to 0.05 ppm for 24 hours), MT expression at mRNA level was also sensitively modulated toward upregulation up to more than 3-fold as relative to non-exposed control. Results from the present study would be a good basis for understanding the adaptive capacity and stress physiology of this endangered fish species during metal pollution.

Initial Protein Concentration and Residual Denaturant Concentration Strongly Affect the Batch Refolding of Hen Egg White Lysozyme

  • Guise, Andrew D.;Chaudhuri, Julian B.
    • Biotechnology and Bioprocess Engineering:BBE
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    • 제6권6호
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    • pp.410-418
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    • 2001
  • The effects of several variables on the refolding of hen egg white lysozyme have been studied, Lysozyme was denatured in both urea, and guanidine hydrochloride(GuHCl), and batch refolded by dilution (100 to 1000 fold) into 0.1 M Tris-HCI, pH 8.2 mM EDTA 3 mM reduced glutathione and 0.3 mM oxidised glutathions. Refolding was found to be sensitive to temperature, with the highest refolding yield obtained at 50$\^{C}$. The apparent activation energy for lysozyme re-folding wasf ound to be 56kJ/mol, Refolding by dilution results in low concentrations of both de-naturant and reducing agent species. It was found that the residual concentrations obtained dur-ing dilution(100-fold dilution:[GuHCI]=0.06 mM, [DTT]=0.15 mM) were significant and could inhibit lysozyme refolding. This study has also shown that the initial protein concentration (1-10mg/mL) that is refolded is an important parameter. In the presence of residual GuHCl and DTT higher refolding yields were obtained when starting from higher initial lysozyme concentra-tions. This trend was reversed when residual denaturant components were removed from the re-folding buffer.

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