A DNA barcode based on 648 bp of cytochrome c oxidase I (COI) gene aims to build species-specific libraries for animal groups. However, it is hard to recover full-length (648 bp) barcode gene from environmental fecal samples due to DNA degradation. In this study, we designed a new primer set (K_Bird), which amplifies a 226 bp fragment targeted an inner position of full-length COI barcode based on 102 species of Korean birds to improve amplification success, and we attempted to identify bird species from 39 avian fecal samples collected during 4 months from Jinan, South Korea. Simultaneously, we conducted a dietary analysis using a universal DNA mini-barcode (Uni_Minibar) from same fecal samples. In silico analysis on newly designed mini-barcode represented that genetic distances were 0.5% in species and 9.1% in genera. Intraspecific variations of 149 species out of 174 species (86%) between Korea and North America were within the threshold (5.3% threshold in this study). From environmental fecal samples collected in Jinan, we identified seven avian species, which have high similarity (99-100%) with registered COI sequences in GenBank. Eight kinds of prey species, such as moth, spider, fly, and dragonfly, were identified in dietary analysis. We suppose that our strategy applying mini-barcode for environmental fecal samples, might be a useful and convenient tool for species identification and dietary analysis for birds.
This work developed the basic motive design utilizing the physical beauty of the traditional ornaments used uniquely by Korean females and suggested some textile designs and fashion cultural product designs. As a research method, computer design programs Adobe Illustrator CS3 and Adobe Photoshop CS3 were used as well as literature examination. The motive was mainly based on the dwiggoji and ddeoljam, which are female ornaments. The formative shape in woman ornaments was classified into four kinds: plant, animal, geometry, and hybrid. The hybrid type was divided further into such combinations as plant, animal, and geometry, which came up with 8 fundamental motives for design development in total. With regard to the basic motive design, the coordinated concept was adopted with a combination of traditional taste and contemporary taste in harmony for the expression of delicate image on the condition that the basic format in female ornament is maintained. Textile design was processed with symmetry, rotation, repeat, and overlap as fundamental motive. As to the design for fashion cultural products, design mapping was proposed for neckties, handbags, clutches, shirts, and one-pieces. Utility and beauty in the traditional ornaments unique to Korean women could be recognized once again through this work. This work also assured the possibility for the endless improvement as a design development motive with originality.
The study was conducted to investigate the antioxidative effect of various extracted propolis. After addition of those extracts to soybean oil at the same level, their antioxidative effects were compared by Rancimat test. The control without added antioxidant showed the shortest Antioxidative Index(AI). The AI of the general Water Extracted Propolis(GWEP) and boiling WEP(BWEP) added to soybean oil were 4.51 and 5.02, respectively. The oxidation period in the BWEP was longer than the ascorbic acid and the GWEP. This result indicated that BWEP had more antioxidative effect than GWEP.
This study was carried out to investigate quality characteristics of dry-cured hams in the domestic market. Two kinds of dry-cured hams were processed with pork leg (T1) and pork neck (T2). Five 24-month dry-cured legs (T1, 5.3-6.1 kg) and twenty 4-month dry-cured pork necks (T2, 1.5-1.9 kg) were used in this experiment. They were stored at $4^{\circ}C$ chilling room and quality characteristics were investigated. Moisture content, water activity, cholesterol content, CIE $L^*$, VBN, total plate counts and lactic acid bacteria of T1 were significantly higher (p<0.05) than those of T2, whereas fat content, ${NO_2}^-$, CIE $a^*$, TBARS and Warner-Bratzler shear force values of T2 were significantly higher (p<0.05) than those of T1. In fatty acid compositions, palmitoleic acid and stearic acid in T2 were significantly higher (p<0.05) than T1, however, oleic and linoleic acid in T2 was significantly lower (p<0.05) than T1. In free amino acids, the total content and individual content of asparagin, leucine and phenylalanine in T1 were higher than those of T2 (p<0.05). The aroma score of T2 was higher than that of T1 in sensory evaluation (p<0.05). In conclusion, two kinds of dry-cured hams were different in their final characteristics and could enhance the consumer's appeal of pork meat in Korean market.
To use the earth heat for the livestock housing, an underground heat exchanger is developed and pipes are layed in the depth of 2.5m under the ground. The pipes have two different kinds of diameter (200mm, 100mm) and materials (PE, PVC). The results of heating effect in winter and spring are following. The temperature in different soil depth varies from 5$^{\circ}C$ by 1.5m depth, to 9$^{\circ}C$ by 3.5m. So it should be better to have the depth greater than 2.5m. The difference of air temperature between the inside and outside pipe was 9.9 Kelvin(K) with 200mm diameter and 13.4K with the 100mm diameter with the same material in winter. By the lower outside temperature from -7.2$^{\circ}C$, it could keep the air temperature above 6$^{\circ}C$ through the 100mm diameter pipe. The heating performance was 593 W with 200mm diameter, 118W with 100mm diameter (PE), and 115W with 100m diameter (PVC), respectively. As the outside temperature varies from -1.5$^{\circ}C$ to 18.6$^{\circ}C$ in early spring, the air temperature through the pipes show 4∼8$^{\circ}C$. While the difference between maximum and minimum outside temperature is 14K, the one through the pipes could be reduced by 2K. Pipes with small diameter can more reduce the difference than the pipe with larger diameter.
Kim, Sung Woo;Choi, Jin Seok;Ko, Yeoung-Gyu;Do, Yoon-Jung;Byun, Mijeong;Park, Soo-Bong;Seong, Hwan-Hoo;Kim, Chong-Dae
Korean Journal of Poultry Science
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제41권1호
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pp.21-27
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2014
To preserve chicken genetic materials like cryopreserved spermatozoa, various kinds of freezing agents like glycerol, dimethylsuloxide, dimethylformamide or dimethylacetamide have been used for rooster semen preparation. Recently, the usage of N-methylacetamide (MA) for Ogye rooster semen preservation resulted in hatched chicken successfully. In this study, we investigated the effects of 7, 9 and 11% of MA on the viability, fertility and hatchability of frozen-thawed rooster semen using artificial insemination. The results of viability, fertility and hatchability in frozen semen with 7%, 9% or 11% MA were $35.16{\pm}6.12%$, $67.83{\pm}15.3%$ and $66.2{\pm}16.3%$ of motile sperm rate, 21.5%, 34.7% and 25% of fertility rate, and 100%, 89.5% and 87.5% of hatchability rate. The results of control group with frozen semen were 96.0% of fertility rate and 92.2% of hatchability rate. With these results, the concentration range of MA as a freezing agent of rooster semen could be 7~9% of media. The higher concentration of 9 % MA could decrease the fertility rate of thawed semen not the rate of hatchability rate. So the use of MA without affecting fertility rate would be a key point of freezing method of rooster semen for poultry genetic resource preservation.
A series of experiments was carried out to determine the possibility for the non-ionic surfactant (NIS) as a feed additive for ruminant animals. The effect of the NIS on (1) the enzyme distribution in the rumen fluids of Hereford bulls, (2) the growth of pure culture of rumen bacteria and (3) rumen anaerobic fungi, (4) the ruminal fermentation characteristics of Korean native cattle (Hanwoo), and (5) the performances of Holstein dairy cows were investigated. When NIS was added to rumen fluid at the level of 0.05 and 0.1% (v/v), the total and specific activities of cell-free enzymes were significantly (p<0.01) increased, but those of cell-bound enzymes were slightly decreased, but not statistically significant. The growth rates of ruminal noncellulolytic species (Ruminobacter amylophilus, Megasphaera elsdenii, Prevotella ruminicola and Selenomonas ruminantium) were significantly (p<0.01) increased by the addition of NIS at both concentrations tested. However, the growth rate of ruminal cellulolytic bacteria (Fibrobacter succinogenes, Ruminococcus albus, Ruminococcus flavefaciens and Butyrivibrio fibrisolvens) were slightly increased or not affected by the NIS. In general, NIS appears to effect Gram-negative bacteria more than Gram-positive bacteria; and non-cellulolytic bacteria more than cellulolytic bacteria. The growth rates of ruminal monocentric fungi (Neocallimastix patriciarum and Piromyces communis) and polycentric fungi (Orpinomyces joyonii and Anaeromyces mucronatus) were also significantly (p<0.01) increased by the addition of NIS at all concentrations tested. When NIS was administrated to the rumen of Hanwoo, Total VFA and ammonia-N concentrations, the microbial cell growth rate, CMCase and xylanase activities in the rumen increased with statistical difference (p<0.01), but NIS administration did not affect at the time of 0 and 9 h post-feeding. Addition of NIS to TMR resulted in increased TMR intake and increased milk production by Holstein cows and decreased body condition scores. The NEFA and corticoid concentrations in the blood were lowered by the addition of NIS. These results indicated that the addition of NIS may greatly stimulate the release of some kinds of enzymes from microbial cells, and stimulate the growth rates of a range of anaerobic ruminal microorganisms, and also stimulate the rumen fermentation characteristics and animal performances. Our data indicates potential uses of the NIS as a feed additive for ruminant animals.
Ann Ji-Young;Sa Soo-Jin;Cao Yang;Lee Sang-Young;Cheon Hee-Tae;Yang Boo-Keun;Park Choon-Keun
Reproductive and Developmental Biology
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제30권2호
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pp.135-141
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2006
The present study was conducted to investigate the effects of cumulus cells and porcine follicular fluid (pFF) on plasminogen activator (PA) activity and oocytes maturation in vitro in the pig. The cumulus-oocyte complexes (COCs) and denuded oocytes (DOs) were incubated in NCSU-23 medium with or without 10% pFF for 0, 24, or 48 hr. In the presence of cumulus cells, the proportions of oocytes matured to metaphase-II stage were significantly (P<0.05) higher in medium with pFF than without pFF (69.8 vs. 37.7%, respectively). When COCs and DOs were cultured in the presence of pFF, tissue-type PA (tPA), urokinase-type PA (uPA), and tPA-PA inhibitor (tPA-PAI) were observed in COCs, and PA activities were higher at 48 hr than 24 hr. When COCs and DOs were cultured in the absence of pFF, tPA and tPA-PAI were observed in COCs, and PA activities were increased as duration of culture increased. No PA activities were detected in DOs regardless of pFF supplementation. When porcine oocytes were cultured in the presence of pFF for 24 and 48 hrs, the activities of tPA-PAI, tPA, and uPA were observed in both COCs and DOs. In medium of absence of pFF, PA activities were observed in oocytes with cumulus cells only. On the other hand, three plasminogen-dependent lytic bands (tPA-PAI, tPA, and uPA) were observed in pFF cultures. Particularly uPA activity was higher than the other kinds of PA activity. When oocytes and cumulus cells were separated from porcine COCs at 0 hr of culture, tPA-PAI, tPA, and uPA were detected in cumulus cells at 48 hr of culture, but no PA activities were in DOs. The presence of pFF and cumulus cells in maturation medium stimulated not only nuclear and cytoplasmic maturation in porcine COCs, but also PA production by cumulus cells and COCs. It is possible that PAs produced by cumulus cells migrated through the gap junction between oocyte and cumulus cells. These results suggest that porcine oocytes have no ability to produce PA themselves.
This study was carried out to analyze the genetic polymorphisms of genomic DNA of blood and meat for conservation of the genetic resources and genetic improvement of Korean Native goat. The genetic identification between Korean Native goat and imported goat was examined using RAPD(random amplified polymorphisms DNAs) analysis with 30 Korean Native goat, 10 hybrid, 10 imported goat. 10 Korean native goat meat and 10 imported goat meat. The results obtained from this study were summarized as follows: 1. Genomic DNA from Korean native goat, hybrid and imported goat could be obtained above about 23kb size using 0.5% agarose gel electrophoresis and the ratio of optical density at 260nm to that at 280nm was between 1.7 and 2.0 using UV spectrophtometer instrument. 2. In the results of the gene identification between Korean Native goat and hybrid, and imported goat using RAPD methods with random primer of 110 kinds, only Korean native goat showed a specific band at about 369bp using a random primer OPO-19 (5'-CAA ACG TCG G-3'), but imported goat and hybrid not showed. 3. Also, in the results of the gene identification between Korean Native goat meat and imported goat meat using RAPD methods with random primer, Korean native goat only showed a specific band at about 369bp using a random primer No. 19(5'-CAA ACG TCG G-3'), but imported goat not showed.
Kim, Y.B.;Yoo, J.Y.;Lee, J.Y.;Kim, G.W.;Park, H.Y.
Journal of Animal Science and Technology
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제46권3호
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pp.307-314
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2004
Xenotransplantation of porcine organs has the potential to overcome the severe. shortage of human tissues and organs available for human transplantation. The swine represents an ideal source of such organs because of their plentiful supply and their numerous anatomical and physiological similarities to the human. However, this procedure also carries with a number of safety issues relating to the zoonotic infections. Porcine endogenous retrovinJses(PERVs), \Wich are germ line transmitted and persist without symptoms in the pigs, are most concerning zoonotic viroses. In order to analyze the prevalence of PERV in domestic pigs, four kinds of pigs'(Landrace, Berkshire, Yorkshire, and Duroc) genomic DNA were isolated from their hair follicles. PCR analysis was carried out for detection of PERVs using subgroup A/B/C and E pol sequence primers. All pigs (20 heads) tested had high copy number of PERVs within genomes. Subgroup A/B/C and E pol gene sequences from 20 isolates were determined by direct sequencing. Sequence analysis showed pol sequences are highly conserved among intra- and inter-subspecies(99.l and 98.8%, respectively). As a first report of PERV prevalence in Korea pigs, our data would be the basic concepts of PERV transmission study in xenotransplantation.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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