• Tuberculosis and Respiratory Diseases
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• 제63권2호
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• pp.128-138
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• 2007

연구배경: INH 내성은 katG 와 inhA(ORF와 promoter)의 변이에 의한 것으로 알려져 있다. 유전자 변이는 지역적으로 종류와 빈도가 다르게 나타날 수 있는데 기존 국내의 연구보고들은 흔하다고 알려진 katG의 463 코돈만을 추적한 것들이었다. 따라서 본 연구는 국내에서 분리된 INH 내성균들의 두 유전자에서 나타날 수 있는 변이의 종류와 빈도를 확인하고자 하였다. 연구방법: 대한결핵협회 결핵연구원에서 MDR-TB로 판명된 INH 내성 결핵균 29주로부터 bead beater-phenol법으로 DNA를 추출하여 katG(2,223 bp), inhA ORF(-77~897, 975 bp) 및 inhA promoter(-168~80, 248 bp) 염기서열 결정 및 분석은 ABI PRISM 3730 XL Analyzer 및 MegAlign package를 사용하였다. 결과: 모든 균주들은 분석 표적으로 사용한 세 유전자 부위 중에서 적어도 한 개 이상의 유전자 부위에 변이가 있었다. INH 내성균은 거의 대부분(>93%) katG의 변이를 갖고 inhA 유전자 변이만 있는 경우는 드물어 INH 내성을 결정하는 중요한 요인은 katG의 변이 인 것을 확인할 수 있었다. katG 부위에서 Arg463Leu 변이와 Ser315Thr 변이가 높은 빈도(62.1% 및 55.2%)로 발견되었고, katG 완전결실과 inhA promoter-15($C{\rightarrow}T$) 변이도 일정한 빈도로 나타남을 볼 수 있었다. 그 외 inhA ORF 변이도 1주에서 1종류의 변이가 발견되었다. 결론: 기존 연구결과에서는 보고되지 않고 본 연구에서 처음으로 확인된 변이들도 14 종류나 있어서, INH 내성은 주로 katG 혹은 일부 inhA 특정 부위의 변이가 주도하지만 이들 외에도 다양한 변이가 존재한다는 것을 알 수 있었다. 이들 새로이 확인된 변이들은 염기서열 분석에 의한 INH 내성 여부 판단 시, 기존 알려진 변이 외에 보조 자료로 사용할 수 있을 것으로 생각한다.

• KSBB Journal
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• 제21권6호
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• pp.461-465
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• 2006

본 연구에서는 저온에서 발현이 유도되고 지속적으로 발현된다고 알려진 대장균의 6개의 유전자 (frdA, glpB, hypE, katG, nupG, ompT)에 대한 promoter의 단백질 생산성을 알아보기 위하여 GFP를 reporter 단백질로 이용하여 각각의 promoter들에 대한 $37^{\circ}C$와 $15^{\circ}C$에서의 발현도와 저온 유도성에 대하여 고찰하였다. nupG promoter의 경우 $37^{\circ}C$와 $15^{\circ}C$ 모두에서 지속적인 유전자 발현도를 보였으나 promoter에 의한 저온 유도성은 없는 것으로 판별되었다.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제14권3호
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• pp.466-469
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• 2004

The recombinant bioluminescent Escherichia coli strains, DPD2511 and TV 1061 containing the katG and grpE promoters, respectively, from Vibrio fischeri fused to luxCDABE, were used to detect the adaptive and repair responses to oxidative damage caused by hydrogen peroxide $(H_2O_2)$, and protein damage due to phenol. The response ratio, represented as the bioluminescence induced in subsequent inductions of DPD2511 and TV1061 with the mother cells previously induced by each chemical, i.e., $H_2O_2$ and phenol during the previous induction stage, decreased suddenly compared with the ratio of the control culture of each strain, meaning there is a possible adaptive response to stress caused by chemicals. Protein damage due to phenol was completely repaired by the second culturing after the initial induction, as was oxidative damage caused by $H_2O_2$ which was also rapidly repaired, as detected by the recovery of bioluminescence level. This result suggests that E. coli promptly adapt and repair oxidative and protein damage by $H_2O_2$ and phenol completely.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제15권1호
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• pp.48-54
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• 2005

A comparison of promoter fusions with the luxCDABE genes from Vibrio fischeri and Photorhabdus luminescens was made using promoters from several genes (katG, sodA, and pqi-5) of E. coli that are responsive to oxidative damage. The respective characteristics, such as the basal and maximum bioluminescence and the relative bioluminescence, were compared. E. coli strains carrying fusions of the promoters to P. luminescens lux showed higher basal and maximally induced bioluminescent levels than strains carrying the same promoter fused to the luxCDABE genes from V. fischeri. The sensitivities between the strains were similar, regardless of the luciferase used, but lower response ratios were seen from strains harboring the P. luminescens lux fusions. Furthermore, using the two katG::lux fusion strains, the bioluminescence from the P. luminescens lux fusion strain, DK1, was stable after reaching a maximum, while that of strain DPD2511 decreased very rapidly due to substrate limitation.

• 한국생물공학회:학술대회논문집
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• 한국생물공학회 2000년도 추계학술발표대회 및 bio-venture fair
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• pp.187-190
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• 2000

본 연구는 5가지의 발광성 미생물을 이용하여 유해 방사선으로 알려져 있는 ${\gamma}-rays$가 여러가지 cellular stresses 중, 특히 유전자 손상과 생물막 손상을 유발하였는데, 이들의 손상 정도가 총 방사선량과 상관관계가 있음을 발생하는 bioluminescence 로써 확인하였다. 뿐만 아니라, 선량률의 변화를 통하여 방사선으로 인한 유전자 손상 및 일반적인 독성 효과가 큰 영향을 받는 것을 확인하였는데, 선량률 증가에 따라 이들 손상정도가 증가하는 것으로 보아 선량률이 genetic 및 radioprotecion에 심각한 영향을 미치는 것을 확인하였다.

• Tuberculosis and Respiratory Diseases
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• 제55권5호
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• pp.440-448
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• 2003

연구배경 : 다제내성균의 신속한 확인을 가능케 해주는 감수성검사법은 신속한 처방결정을 통해 환자의 치료 성공률을 향상 시킴과 동시에 다제내성균의 전파를 조기에 차단할 수 있게 되어, 국가 결핵관리 사업의 효율성을 증대시킬 수 있다. 방 법 : 아이나 또는 리팜피신 내성에 관련된 유전자 rpoB, katG, inhA, ahpC 등의 돌연변이를 검출할 수 있는 probe를 합성하였고, 총 502개의 내성균을 대상으로 중함효소연쇄반응 역교잡반응법으로 내성균 검출을 시도하였다. 결 과 : 264개의 리팜피신 내성균 중에서 Ser531Leu돌연변이가 46%를 차지하였고, codon 526에서는 32% 의 균주에서 돌연변이를 보였으며, codon 516에서는 10%의 균주가 돌연변이를 나타냈다. 469개의 아이나 내성균 중에서는 64%가 katG 유전자의 Ser315Thr 돌연변이를 나타내었고, 19%의 균은 inhA 유전자 promoter 돌연변이를 가지고 있었으며, ahpC유전자 돌연변이는 3%에 불과하였다. 역교잡반응법에 의한 검출율은 아이나 내성균 중 80%이상이었으며, 리팜피신 내성균에서도 92%이상을 검출할 수 있었다. 결 론 : 역교잡반응법에 의해 리팜피신 뿐만 아니라 아이나에 대한 감수성검사를 신속하게 수행할 수 있음을 확인하였고, 이 검사법은 특히 재발 또는 다제내성이 의심되는 환자의 처방 결정에 매우 유용한 수단이 될 수 있다.

• Journal of Microbiology
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• 제35권4호
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• pp.277-283
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• 1997

Promoters inducible by paraquat, a superocide-generating agent, were isolated from Escherichia coli using a promoter-probing plasmid pRS415 with promoterless lacA gene. Twenty one promoters induced by paraquat were selected and further characterized. From sequence analysis, thirteen of the promoters were mapped to their specific loci on the Escherichia coli chromosome. Several promoters were mapped to the upstream of known genes such as usgl, katG, and mglB, whose relationships with superoxide response have not been previously reported. Other promoters were mapped to the upstream region of unknown open reading frames. Downstream of HC 96 promoter are uncharacterized ORFs whose sequences are homologous to ABC-transporter subunits. Downstream of HC84 promoter is an ORF encoding a transcriptional regulator-like protein, which contains a LysR family-specific HTH (helix-turn-helix) DNA bindign motif. We investigated whether these promoters belong to the soxRS regulon. All promoters except HC96 were found to belong to the soxRS regulon. The HC96 promoter was significantly induced by paraquat in the soxRS deletion mutant strain. The basal transcription level of three promoters (HE43, HC71, HD94) significantly increased at the stationary phase, implying that they are regulated by RpoS. However, paraquat inducibility of all promoters disappeared in the stationary phase, suggesting that SoxRS regulatory system is active only in rapidly growing cells.