• 제목/요약/키워드: in vitro detection

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Monoclonal Antibody-Based Indirect-ELISA for Early Detection and Diagnosis of Epiphytic Didymella bryoniae in Cucurbits

  • Lee, Sun-Cheol;Han, Ki-Soo;Lee, Jung-Han;Kim, Dong-Kil;Kim, Hee-Kyu
    • The Plant Pathology Journal
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    • 제19권5호
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    • pp.260-265
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    • 2003
  • Gummy stem blight caused by Didymella bryoniae occurs exclusively in cucurbits. This fungus has been known not to produce its pycnidium in vitro unless irradiated. In this study, cultural conditions for the mass-production of pycnidiospore by Metal Halide (MH) lamp irradiation were maximized. The mycelia were cultured at $26^{\circ}C$ on PDA for 2 days under dark condition, and then the plate was illuminated with MH lamp continuously for 3-4 days at $26^{\circ}C$. Results show that a great number of pycnidia were simultaneously formed. The pycnidiospores produced were then used as immunogen. Fusions of myeloma cell (v-653) with splenocytes from immunized mice were carried out. Two hybridoma cell lines that recognized the immunogen D. bryoniae were obtained. One monoclonal antibody (MAb), Dbl, recognized the supernatant while another MAb, Db15, recognized the spore. Two clones were selected which were used to produce ascite fluid of the two MAb, Dbl and Db15, the immunotypes of which were identified as IgG1 and IgG2b, respectively. Titers of MAb Dbl and MAb Db15 were measured and the absorbance exceeded 0.5 even at a $10^{-5}$ dilution. The MAbs reacted positively with D. bryoniae but none reacted with other viral isolates, Cucumber mosaic virus and Cucumber green mottle mosaic virus. Sensitivity of MAb was precise enough to detect spore concentration as low as $10^{-3}$/well by indirect ELISA. Characterization of the MAbs Dbl, Db15 antigen by heat and protease treatments, which suggests that the epitope recognized by these two MAbs was glycoprotein.

도축돈의 마이코플라즈마성 폐렴에 관한 연구 2. 폐조직에서의 균분리와 nested-PCR방법에 의한 동정 (Studies on the mycoplasmal pneumonia in slaughter pigs. 2. Isolation of mycoplasmas from lung tissues and identification of isolates by nested-PCR technique)

  • 임영택;석호봉
    • 대한수의학회지
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    • 제42권2호
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    • pp.225-229
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    • 2002
  • We report that mycoplasma organisms from lung tissues of slaughter pigs were identified to genes fragments with references use of nested-PCR technique(nPCR). Seven strains of mycoplasma species were isolated from 70 lung tissues. The organisms were detected by in vitro amplification of 16S rRNA and 23S rRNA genes. Nucleotide sequences of the spacer between 16S and 23S in the ribosomal RNA operons of mycoplasma were identified by the analysis of products from the nested PCR. Four common PCR primers, MhF1, MhF2 MhR1 and MhR2, were designed by analysis between these sequences by first amplified with F1, R1 and second with F2, R2, respectively. Specific amplification of the spacer region for reference strains of M. hyopneumoniae, M. hyorhinis, M. flocculare were confirmed by first round of PCR in which the traduced fragments of 690bp, 460bp, 630bp. But amplications of second round was changed to 240bp, 210bp, 230bp, respectively. Three different strains (M. hyopneumoniae:4, M. hyorhinis:2, M. flocculare:1) were detected by the nested-PCR technique. The results suggest that the detection of swine mycoplasma by n-PCR can be analyzed the nucleotide sequences between rRNA operons and homology study.

크립토스포리디움 활성 및 감염성 판정을 위한 direct RT-PCR, cell culture RT-PCR 및 cell culture IFA의 비교 (Comparison of Direct RT-PCR, Cell Culture RT-PCR and Cell IFA for Viability and Infectivity Assay of Cryptosporidium)

  • 박상정;유재란;김종민;임연택;진익렬;정현미
    • 생명과학회지
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    • 제16권5호
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    • pp.729-733
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    • 2006
  • 크립토스포리디움의 활성 및 감염성 판정을 위해 Direct RT-PCR, 세포배양 후 RT-PCR 및 면역형광염색법을 비교한 결과는 다음과 같다. 1) 크립토스포리디움의 HSP70 gene에 대해 direct RT-PCR한 결과, 민감도가 매우 높아 저농도로 존재하는 환경시료에서의 크립토스포리디움 활성을 모니터링하는데 장점이 있을 것으로 보이나, 감염성의 판정은 알 수 없으며, 정량화가 안되는 단점이 있었다. 2) ${\beta}-tubulin$ gene에 대해 RT-nested PCR을 한 결과 크립 토스포리디움의 난포낭이 $1{\times}10^4$ 세포수정도 되어야 검출이 되는 것으로 나타나 HSP70 gene에 대한 RT-PCR결과와 비교할 때 10,000배 이상 민감도가 떨어지는 것으로 나타났다. 3) 세포배양 후 RT-PCR 또는 면역형광염색법을 이용할 경우에는 민감도가 direct RT-PCR보다 다소 떨어지는 단점이 있었으나 크립토스포리디움의 오염원이나 오염이 심한 지역의 감염성 조사에 적합할 것으로 나타났으나, 정량화가 필요한 경우에는 세포배양 후 면역형광염색법이 효과적일 것으로 나타났다.

Monoclonal Antibody-Based Indirect-ELISA for Early Detection, Diagnosis and Monitoring of Epiphytic Didymella bryoniae in Cucurbits.

  • Lee, Seon-Chul;Shim, Chang-Ki;Kim, Dong-Kil;Bae, Dong-Won;Kyo, Seo-Il;Kim, Hee-Kyu
    • 한국식물병리학회:학술대회논문집
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    • 한국식물병리학회 2003년도 정기총회 및 추계학술발표회
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    • pp.133.1-133
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    • 2003
  • Gummy stem blight, caused by Didymella bryoniae occurs exclusively on cucurbits. This fungus has been known not to produce its pycnidium in vitro unless irradiated. Through this study, we optimized cultural conditions for mass-production of pycnidiospore by Metal Halide Lamp irradiation. In brief, the mycelial was cultured at $26^{\circ}C$ on PDA, for 2 days under the darkness, and then the plate was illuminated with MH lamp continuously for 3-4 days at $26^{\circ}C$, a great number of pycnidia was simultaneously formed. Thus produced pycnidiospores were used as immunogen. From fusions of myeloma cell (v-653) with splenocytes from immunifed mice were car ried out. And, two hybridoma cell lines that recognized the immunogen Didymella bryoniae were obtained. One Monoclonal Antibody, Db1, recognized the supernatant and the other monoclonal antibody, Db15, recognized the spore. Two clones were selected which were used to produce ascite fluid two MAb Db1 and Db15, were immunotyped and identified as IgG1 and IgG2b, respectively. Titer of MAb Db1 and MAb Db15 was measured absorbance exceeded 0.5 even at a $10^{-5}$ dilution. The MAbs reacted positively with Didymella bryoniae but none reacted with other of fungi and CMV, CGMMV Sensitivity of MAb was precise enough to detect spore concentration as low as $10^{3}$ well by indirect ELISA characterization of the MAb Db1, Db15 antigen by heat and protease treatments show that the epitope recognized by the MAb Bb1, Db15 were a glycoprotein.

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유산균 발효유 및 starter에서 항생제내성 유산균 분리 및 전달성 R plasmids 분포조사 (Isolation of antibiotic resistant Lactobacillus spp from fermented milk and starters, and detection of transmissible R plasmids)

  • 백귀정;서형석;노영선;양해동;허부홍;서이원;정동석;송희종
    • 한국동물위생학회지
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    • 제29권3호
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    • pp.277-285
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    • 2006
  • Plasmids are covalently closed circular molecules of DNA that are stably inherited and replicate somewhat independently of the bacterial chromosome. Genes carried on plasmids can mediate a wide variety of important functions, including antibiotics (R plasmids) and heavy metals resistance, toxins production, cell penetration, iron chelation, complement resistance, and metabolic characteristics such as sucrose and lactose fermentation. Fifty strains of lactobacilli were isolated from 26 staters and 29 fermented milk products. They were classified 27 strains as Lactobacillus paracasei subsp paracasei, 11 stains as Lactococcus lactis subsp cremoris, 6 strains as L delbrueckii subsp lactis, 4 strains as L acidophius, and 2 strains as L delbrueckii subsp bulgaricus. All of these strains were examined for drug resistance and transferability of R plasmids. All of the isolates were sensitive to Am, C, CF, E, NB, P, T, and Te. But resistant to SXT 94% (47 strains), K 66% (33 strains), S 56% (28 strains), ENR 50% (25 strains), NOR 38% (19 strains) CIP 38% (19 strains), GM 16% (8 strains), and N 14% (7 strains), in order. And 32 different resistant patterns were found. The most frequently encountered patterns were CIP-ENR-K-NOR-S-SXT (5 strains). In vitro R plasmids transfer experiment, 57 antibiotic resistant strains which were not transfer to the recipient 2 Escherichia coli strains by conjugation, These results indicate that Lactobacillus in internal trade market' stater recognize R factor but transmissible R plasmid is not existed.

Effect of High Speed Drying on Antioxidant Properties of Enzymatic Digests from Citrus By-products and Their Protective Effect on DNA Damage Induced by $H_2O_2$

  • Senevirathne, Mahinda;Kim, Soo-Hyun;Um, Byung-Hun;Lee, Jung-Suk;Ha, Jin-Hwan;Lee, Won-Woo;Jeon, You-Jin
    • Food Science and Biotechnology
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    • 제18권3호
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    • pp.672-681
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    • 2009
  • The aim of this study was to evaluate the antioxidant activities of enzymatic digests from citrus by-products (CBPs) prepared by high speed drying (HSD). HSD needs a short time (60 min) for drying and can be used in a commercial scale. Enzymatic digests were prepared from the CBPs using 6 enzymes such as aminoglucosidase (AMG), celluclast, pectinex, termamyl, ultraflo, and viscozyme. Antioxidant activities of AMG digest from CBPs were evaluated by different in vitro models such as 1,1-diphenyl-2-picrylhydrazyl (DPPH), hydroxyl, alkyl, $H_2O_2$ scavenging, metal chelating, lipid peroxidation, and comet assays, and exhibited strong activities. The antioxidant compounds were detected by an high performance liquid chromatography (HPLC) coupled on-line to an 2,2'-azino-bis(3-ethylbenzothiazoline-6-sulfonic acid ($ABTS^+$) scavenging detection system, and found that hesperidin was the key compound. Therefore, the results obtained in this study suggest that HSD is an effective method to transform wet CBPs into dried form, and CBPs are potential source of natural antioxidant.

pncA 유전자의 염기 서열 결정에 의한 결핵균의 Pyrazinamide 내성 진단 (Detection of Pyrazinamide Resistance in Mycobacterium Tuberculosis by Sequencing of pncA Gene)

  • 황지윤;곽경록;박혜경;이지석;박삼석;김윤성;이정유;장철훈;이민기;박순규
    • Tuberculosis and Respiratory Diseases
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    • 제50권1호
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    • pp.94-105
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    • 2001
  • 연구배경 : Pyrazinamide(PZA)는 결핵의 1차 치료 약제이며, 산성 환경 하에서만 작용하기 때문에 in vitro에서 생물학적인 감수성 검사를 하는 것이 어렵다. pncA는 PZase를 생성하는 유전자로 이의 돌연변이가 결핵균의 PZase 활성을 소실시켜 결핵균이 PZA에 대해서 내성을 획득하게 되는 기전으로 추정된다. 본 연구에서는 PZA의 생물학적 감수성, PZase 활성 및 pncA 유전자의 돌연변이 사이의 관계를 검토하고, 아울러 결핵균의 pncA 의 염기서열 결정이 PZA 내성을 예측하는데 이용될 수 있는지를 알아보고자 하였다. 방법 : 폐결핵 환자의 객담에서 분리된 결핵균 28균주를 대상으로 하여, 절대농도법으로 PZA의 감수성을 검사하고, pncA 유전자의 open reading frame 전체 561 bp를 포함하는 710 bp 크기의 유전자를 선택적으로 증폭하였다. PCR 증폭 산물을 직접 염기서열 결정에 이용하였고, GenBank에서 확인한 결핵균 야생주의 pncA 염기서열과 비교하여 돌연변이 여부를 확인하였다. 결과 : PZase 활성이 있는 6균주 모두 pncA의 돌연변이가 없었으나, 1균주(16.7%)는 절대농도법에 의한 감수성 검사에서 위내성으로 나타났다. PZase 활성이 없는 22균주 중 21균주(95.5%)는 pncA의 돌연변이가 확인되었고, 생물학적 감수성 검사에서는 20균주가 PZA 내성, 1균주는 검사 불능, 1균주는 감수성을 보였다. pncA의 돌연변이의 양상(중복 1예 포함)은 promotor 지역과 pncA의 전 open reading frame에 걸쳐서 단일 염기의 치환에 의한 silent mutation 1개, missense mutation 10개, nonsense mutation 1개, 3염기가 삽입된 insertion 1개, 1~3개의 염기가 삽입된 frame shift mutation 4개, 그리고 2~2347개의 염기가 결실된 frame shift mutation 2개였다. 그리고 나머지 3균주는 모두 pncA유전자의 open reading frame 상부의 11번째 염기가 똑같이 adenine에서 guanine으로 치환되어 있었다. 결론 : pncA의 돌연변이는 결핵균의 PZase 활성의 소실에 의한 PZA 내성의 주요 기전이며, 특히 pncA 시작 codon의 상부 11 번째 위치의 염기 치환은 promotor의 돌연변이에 의한 PZA 내성의 주요 부위인 것으로 추정된다. Automatic sequencing에 의한 pncA의 염기서열 결정은 결핵균의 PZA 내성 진단을 위한 빠르고 효과적인 방법으로 이용할 수 있으며, PZA 내성 결핵균의 균주간 연관성을 규명하기 위한 역학 조사의 목적으로 이용할 수 있을 것으로 생각된다.

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Detection and Characterization of Two Novel Forms of A Cytosolic Phospholipase $A_2$-Activating Factor in Bovine Brain

  • Park, Jae-Sin;Jung, Kwang-Mook;Jung, Sung-Yun;Na, Doe-Sun;Kim, Dae-Kyong
    • 한국응용약물학회:학술대회논문집
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    • 한국응용약물학회 1996년도 춘계학술대회
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    • pp.187-187
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    • 1996
  • 세포질에 존재하는 100 kDa Phospholipase $A_2$(cPLA$_2$)는 인지질의 sn-2 위치의 에스테르결합을 가수분해함으로서 Prostaglandin과 Leukotriene등 Eicosanoids 생합성의 전구체인 아라키돈산과 Platelet activating factor(PAF)를 생합성하는 전구체를 동시에 생성시키는 효소로 염증과 세포손상등에 중요한 역할이 기대된다. 본 효소의 활성화 기전을 규명하고자 하는 최근의 활발한 연구에도 불구하고 불명확한 점이 많은 것이 현실이다. 특히 세포를 자극하였을 때 유리되는 아라키돈산의 증가율과 세포를 파괴한 후 조제한 가용성분획에서 측정한 활성의 증가율과는 많은 차이를 나타냈다. 이러한 결과부터 cPLA$_2$ 효소 자체를 활성화시키는 어떤 인자를 가정하였다. 최근, PLA$_2$의 또다른 형태인 14 kDa의 분비성 PLA$_2$의 in vitro 활성을 증가시키는 인자가 동정되어 그 생화학적 특성이 규명되고 있으나 이 인자는 cPLA$_2$의 활성에는 아무런 증가효과를 나타내지 않았다. 본 연구자들은 소의 뇌조직에서 cPLA$_2$의 활성을 증가시키는 인자를 발견하고 그의 생화학적인 특성을 규명하였다. 돼지 비장에서 정제한 cPLA$_2$를 사용하였으며 소의 뇌 조직의 가용성 분획으로부터 본 활성화 인자를 동정하였으며 그 활성분획을 양이온 크로마토그라피로서 Mono S EPLC와 Superose 12 Sepharose gel filtration 크로마토그라피를 이용하여 더욱 분리한 결과 약 70 kDa과 25 kDa에서 각각 용출되었다. 이렇게 부분정제한 활성은 췌장에서 분리한 group I과 흰주의 group I과 흰주의 혈소판에서 분리한 group II PLA$_2$에 대해서는 아무런 증가효과를 나타내지 않는 반면, cPLA$_2$의 활성만을 약 5배 증가시켰다. 본 활성은 cPLA$_2$ 효소량의 증가에 따라 활성의 증가효과가 정차 감소하므로 화학량적인 반응(Stoichiometric reaction)일 것으로 예상되었다.

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Emodin Inhibits Breast Cancer Cell Proliferation through the ERα-MAPK/Akt-Cyclin D1/Bcl-2 Signaling Pathway

  • Sui, Jia-Qi;Xie, Kun-Peng;Zou, Wei;Xie, Ming-Jie
    • Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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    • 제15권15호
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    • pp.6247-6251
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    • 2014
  • Background: The aim of the present study was to investigate the involvement of emodin on the growth of human breast cancer MCF-7 and MDA-MB-231 cells and the estrogen (E2) signal pathway in vitro. Materials and Methods: MTT assays were used to detect the effects of emodin on E2 induced proliferation of MCF-7 and MDA-MB-231 cells. Flow cytometry (FCM) was applied to determine the effect of emodin on E2-induced apoptosis of MCF-7 cells. Western blotting allowed detection of the effects of emodin on the expression of estrogen receptor ${\alpha}$, cyclin D1 and B-cell lymphoma-2 (Bcl-2), mitogen-activated protein kinases (MAPK) and phosphatidylinostiol 3-kinases (PI3K). Luciferase assays were emplyed to assess transcriptional activity of $ER{\alpha}$. Results: Emodin could inhibit E2-induced MCF-7 cell proliferation and anti-apoptosis effects, and arrest the cell cycle in G0/G1 phase, further blocking the effect of E2 on expression and transcriptional activity of $ER{\alpha}$. Moreover, Emodin influenced the ER ${\alpha}$ genomic pathway via downregulation of cyclin D1 and Bcl-2 protein expression, and influenced the non-genomic pathway via decreased PI3K/Akt protein expression. Conclusions: These findings indicate that emodin exerts inhibitory effects on MCF-7 cell proliferation via inhibiting both non-genomic and genomic pathways.

인공신경망을 이용한 기계식 판막의 생체외 모의 혈전현상 검출 (In-Vitro Thrombosis Detection of Mechanical Valve using Artificial Neural Network)

  • 이혁수;이상훈
    • 대한의용생체공학회:의공학회지
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    • 제18권4호
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    • pp.429-438
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    • 1997
  • 기계식 판막은 매몰식 인공장기에 널리 사용돼 왔으며, 판막의 이상은 환자의 죽음으르 의미한다. 판막의 이상에 영향을 미치는 것은 많은 요소들이 있는데 대표적으로 기계적인 고장과 혈전현상이 있다. 그래서 비침습적으로 이것들을 발견하는 것이 필요하게 된 것이다. 이 논문의 목적은 스펙트럼의 해석과 인공신경망을 이용하여 혈전현상을 발견하는데 있다. 신호의 측정은 공압식 좌심실 보조장치에 장착한 기계식 판막으로부터 마이크로폰과 증폭기를 이용하였다. 디스크 위의 모의 혈전현상과 봉합링의 주위에 혈전현상, 20%, 40% 60%로 자라나는 혈전현상은 펠레세인과 실리콘을 이용하여 제작하였다. 기초 성능 평가를 위해 1KHz 정현파를 인가하여 시스템을 평가하였으며, 정상적인 판막과 5 종류의 혈전현상의 스펙트럼은 혈전현상의 정보를 지닌 개폐시 peak의 신호 파형에서 구하였다. 데이터의 정량적인 해석을 위해 7,000개의 입력 노드와 20개의 은닉층과 1개의 출력층으로 이루어진 인공신경망을 사용하였다. 결론적으로 훈련된 인공신경망을 사용한 결과 정상 판막과 비정상 판막을 판단하는데 90%의 판단능력을 보였다. 이상의 실험을 통해 판막의 이상유무를 신호의 스펙트럼 해석과 인공신경망을 통해 평가할수 있음을 알 수 있었다. 본 논문의 결과는 앞으로 인공장기를 몸속에 지니고 있는 환자에게서 장기의 상태를 지속적으로 감시할 수 있는 기술적 토대를 제공할 것이다.

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