• 생태와환경
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• 제53권3호
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• pp.275-285
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• 2020

한강수계 상천천에서 한강납줄개 Rhodeus pseudosericeus와 떡납줄갱이 R. notatus의 잡종으로 추정되는 2개체를 채집하였다. 자연잡종 개체의 체색은 황갈색으로 한강납줄개와 떡납줄갱이의 중간적인 특성을 나타냈지만, 전반적으로 떡납줄갱이의 특징이 두드러졌다. 계수 및 계측형질에서 등지느러미 기조수, 뒷지느러미 기조수, 종렬비늘 수의 3가지 형질은 hybrid index (HI) 값이 0으로 나타나 떡납줄갱이의 형질을 따랐다. 체장에 대한 등지느러미 기점 거리 (HI=74.6), 뒷지느러미 기점 거리 (HI=75.3), 배지느러미 기점 거리 (HI =77.6)는 한강납줄개의 형질을 따르는 것으로 나타났다. 새파수(HI=55.3), 체장에 대한 체고(HI=67.9), 두장에 대한 문장(HI=43.4), 양안간격(HI=44.8)의 4가지 형질은 한강납줄개와 떡납줄갱이의 중간형질을 나타내는 것으로 나타났다. 나머지 14가지 형질은 0과 100 사이를 벗어나 잡종개체만의 고유한 특성을 나타냈다. Recombination activating gene 1 (RAG1) 분석결과 잡종개체는 부모종의 유전자가 중복되어 나타나 자연잡종으로 판별되었으며, cytochrome b gene (COB)를 분석한 결과 한 개체는 한강납줄개를 모계로, 또 다른 한 개체는 떡납줄갱이가 모계로 나타났다.

• 한국수산과학회지
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• 제56권5호
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• pp.708-715
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• 2023

Hybridization is a major production method used to combine beneficial traits from two different species to obtain a potentially dominant trait. In China, Takifugu obscurus and T. rubripes were artificially crossed, and the resulting hybrids had an average body weight 38.06-8.93% higher than that of the parental species, which enabled the hybrids to be grown in freshwater. This study aimed to provide the basic data necessary for the classification of T. obscurus♀×T. rubripes♂ hybrids in terms of economic value and market potential. Morphological comparing the morphology of hybrids and parental species, we discovered that the hybrids had intermediate traits of the parental species. In morphometrics, the hybrid index (HI) value of head length against standard length was close to the trait of T. rubripes, and the HI values of preanal length and predorsal length were close to those of T. obscurus; however, the HI values of nasal length, snout length, length of anal fin, length of pectoral fin, caudal peduncle depth and caudal peduncle length were found to be unique characteristics of the hybrids. Regarding molecular analysis, a 99.8% nucleotide sequence similarity was found between the hybrid and T. obscurus.

• 대한방사선치료학회지
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• 제26권1호
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• pp.91-98
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• 2014

목 적 : 본 연구에서는 기존의 방사선 치료 기법인 3D-CRT 방법을 기반으로 치료 Energy와 Wedge를 변형 시킨 Hybrid 치료계획을 세워, open rectangular field를 사용한 2D-RT와 현재 가장 많이 시행되고 있는 방사선치료의 형태인 3D-CRT, 그리고 Hyrid paln 의 각각의 치료계획에 따른 선량분포, 선량-체적 히스토그램을 이용하여 산출된 값들을 비교, 분석하여 Hybrid 치료계획의 유용성을 평가하고자 한다. 대상 및 방법 : 본원에서 방사선 치료를 받은 환자 5명을 대상으로 전산화 단층촬영장치(RT-16GE)를 이용해 CT모의치료를 시행하여 영상을 획득하였다. 치료계획실에서는 이미지 관심영역표시는 종양은 CTV으로, 정상장기는 폐, 심장으로 나타냈다. 치료계획은(pinncle-ver 9.2)은 표적에는 충분한 선량을 정상장기에는 선량이 최소화 되도록 치료계획을 세웠다. 결 과 : Homogeneity Index의 선량비교는 2D-RT (open rectangular field): 38.32, TW(conformal wedge field): 32.01 FIF(field in field): 29.22, HYBRID(energy combine, wedge combine): 30.57으로 나타났다. 2D-RT, TW, FIF Hybrid $V_{75_-lung}$은 각각 112.33, 125.14, 121.3, 123.78. $V_{50_-lung}$은 155.43, 159.62, 157.96, 159.06. $V_{25_-lung}$은 199.86, 200.22, 198.65, 200.31. $V_{50_-heart}$는 각각 26.07, 27.1, 26.85, 27.17 $V_{30_-heart}$ 33.71, 34.37, 34.15, 34.65로 나타났다. 결 론 : HYBRID planning에서 표적에는 3D-CRT 에 비해 비교적 뛰어난 선량분포와 유방을 보호함을 보여주지만 폐와 심장에 많은 선량이 조사됨을 치료계획 시 주의해야 하고 앞으로 해결해야 할 과제라 생각된다. HYBRID 으로 Energy를 혼합하여 사용한다면, 타겟에 보다 더 적절한 coverage가 이루어질 수 있을 것으로 보인다. breast 뿐만 아닌 Lung cacner 치료와 같이 불균질한 부위의 치료에 적용한다면 보다 더 최적을 결과를 이루어낼 수 있을 것으로 사료된다.

• Genomics & Informatics
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• 제16권4호
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• pp.29.1-29.5
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• 2018

Hybrid capture-based targeted sequencing is being used increasingly for genomic variant profiling in tumor patients. Unique molecular index (UMI) technology has recently been developed and helps to increase the accuracy of variant calling by minimizing polymerase chain reaction biases and sequencing errors. However, UMI-adopted targeted sequencing data analysis is slightly different from the methods for other types of omics data, and its pipeline for variant calling is still being optimized in various study groups for their own purposes. Due to this provincial usage of tools, our group built an analysis pipeline for global application to many studies of targeted sequencing generated with different methods. First, we generated hybrid capture-based data using genomic DNA extracted from tumor tissues of colorectal cancer patients. Sequencing libraries were prepared and pooled together, and an 8-plexed capture library was processed to the enrichment step before 150-bp paired-end sequencing with Illumina HiSeq series. For the analysis, we evaluated several published tools. We focused mainly on the compatibility of the input and output of each tool. Finally, our laboratory built an analysis pipeline specialized for UMI-adopted data. Through this pipeline, we were able to estimate even on-target rates and filtered consensus reads for more accurate variant calling. These results suggest the potential of our analysis pipeline in the precise examination of the quality and efficiency of conducted experiments.

• 대한방사선치료학회지
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• 제30권1_2호
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• pp.161-167
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• 2018

목 적 : 동일 선상축(co-axial image)의 다발성 뼈 전이암에 대한 하이브리드 세기변조(modified hybrid-VMAT) 계획의 유용성을 평가하고자 한다. 대상 및 방법 : 동일 선상축의 다발성 뼈 전이암환자 총 5명을 대상으로 치료계획시스템(Ray station, 5.0.2.35, Sweden)을 이용하여 치료계획을 수립하였다. 치료계획용적(planning target volume, PTV) 처방 선량은 30 Gy로 설정하여 총 3가지 치료계획: 용적변조회전치료계획(volumetric modulated arc therapy, VMAT); 배경방사선(background)을 고려하지 않은 하이브리드 용적변조회전치료계획(hybrid VMAT, VMAT(h)); 배경방사선을 고려한 하이브리드 용적변조회전치료계획(modified hybrid VMAT, VMAT(mh))을 비교하였다. 선량용적히스토그램(dose volume histogram, DVH)을 이용하여 PTV의 maximum dose($D_{max}$), mean dose($D_{mean}$), 처방선량지수(conformity index, CI), 선량균질지수(homogeneity Index, HI) 및 손상위험장기(organ at risk, OAR)의 선량을 분석하였다. 또한 monitor unit(MU)와 치료시간(beam on time)을 분석하였다. 결 과 : VMAT, VMAT(h)과 VMAT(mh)의 PTV $D_{max}$는 3188.33 cGy, 3526 cGy, 3285.67 cGy이고, $D_{mean}$은 3081 cGy, 3252 cGy, 3094 cGy이고, CI는 $1.35{\pm}0.19$, $1.43{\pm}0.12$, $1.30{\pm}0.06$이고, HI는 $1.06{\pm}0.01$, $1.14{\pm}0.06$, $1.09{\pm}0.02$로 평가되었다. VMAT(h)과 VMAT(mh)의 OAR은 3 % 증가와 18 % 감소하는 것으로 평가되었다. 추가적으로 평균 MU는 904.90, 911.73, 1202.13 그리고 평균 Beam on time은 $128.67{\pm}10.97$초, $167.33{\pm}7.57$초, $190.33{\pm}4.51$초 소요되었다. 결 론 : 다중표적 치료 시에는 modified Hybrid-VMAT를 적용하면 선량의 겹침이 보정되어 과선량(over dose) 조사되는 것을 방지하는 다중표적을 치료할 수 있다. 그리고 PTV의 선량포함을 만족하면서 주위의 정상장기를 더 효과적으로 보호할 수 있는 치료계획이 가능하다. 또한 modified Hybrid-VMAT의 임상적 효능을 확인하기 위해 많은 수의 환자를 대상으로 한 장기 추적 관찰이 필요하다.

• 한국토양비료학회지
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• 제9권2호
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• pp.83-92
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• 1976

수도품종(水稻品種) 57개(個)을 선발(選拔), 연대별(年代別)로 3분(分)하여 이들의 여러 질소효율(窒素効率)을 무비(無肥)와 시비조건(施肥條件)에서 조사(調査)하고 그 상호관계(相互關係)를 단순상관(單純相關) 분석(分析)으로 살펴봤다. 상호관계(相互關係)는 한개 군내(群內)에서나 세군(群)의 모든 품종간(品種間)에서 동일(同一)하였다. 정조수량(正租收量)은 Fe(시비효율(施肥効率); 증수량(增收量)/시비량(施肥量)), E(질소(窒素)의 정조생산효율(正租生産効率)), Ef(흡수시비질소효율(吸收施肥窒素効率)), Eu(비료질소이용율(肥料窒素利用率); 흡수시비질소(吸收施肥窒素)/N시비량(施肥量))과 고도(高度)의 유의상관(有意相關)을 보였다. E는 수확지수(收穫指數)(HI), 전이율(轉移率)(T), 정조(正租) 및 고중(藁中)의 질소농도(窒素濃度)(GN% 및 SN%)와 유의정상관(有意正相關)이었다. E는 Ef에 거의 의존(依存)하였으며 통일계통(統一系統)은 부분적(部分的)으로 Es(흡수토양질소효율(吸收土壤窒素効率))에 의존(依存)하였다. Ef는 Eu보다 Fe에 기여하는바가 컸다($Fe=Ef{\times}Eu$). 재래종군(在來種群)에서 장려군(奬勵群)으로 발전(發展)하면서 Ef와 Eu는 모두 증가(增加)하였으나 장려군(奬勵群)에서 통일군(統一群)으로 발전(發展)할때는 Ef와 Es만이 현저히 증가(增加)하였다. 수도품종간(水稻品種間)에서 E와 Fe가 Ef에 의존도(依存度)가 크다는 사실은 전보(前報)에 보고(報告)한 토양간(土壤間)에서 E와 Fe가 Es와 Eu에 의존도(依存度)가 크다는 사실(事實)과 좋은 대조(對照)가 된다. Ef는 시비하(施肥下)에서 수도품종(水稻品種)을 선발(選拔)하는데 가장중요(重要)한 지표(指標)로 나타났다.