Background: The biological activity and pharmacological effects of rare ginsenosides have been proven to be superior to those of the major ginsenosides, but they are rarely found in ginseng. Methods: Ginsenoside Rb1 was chemically transformed with the involvement of methanol molecules by a synthesized heterogeneous catalyst 12-HPW@MeSi, which was obtained by the immobilization of 12-phosphotungstic acid on a mesoporous silica framework. High-performance liquid chromatography coupled with mass spectrometry was used to identify the transformation products. Results: A total of 18 transformation products were obtained and identified. Methanol was found to be involved in the formation of 8 products formed by the addition of methanol molecules to the C-24 (25), C-20 (21) or C-20 (22) double bonds of the aglycone. The transformation pathways of ginsenoside Rb1 involved deglycosylation, addition, elimination, cycloaddition, and epimerization reactions. These pathways could be elucidated in terms of the stability of the generated carbenium ion. In addition, 12-HPW@MeSi was able to maintain a 60.5% conversion rate of Rb1 after 5 cycles. Conclusion: Tandem and high-resolution mass spectrometry analysis allowed rapid and accurate identification of the transformation products through the characteristic fragment ions and neutral loss. Rare ginsenosides with methoxyl groups grafted at the C-25 and C-20 positions were obtained for the first time by chemical transformation using the composite catalyst 12-HPW@MeSi, which also enabled cyclic heterogeneous transformation and facile centrifugal separation of ginsenosides. This work provides an efficient and recyclable strategy for the preparation of rare ginsenosides with the involvement of organic molecules.
A time-of-flight and energy (TOF-E) detection system for the measurement of 236U accelerator mass spectrometry (AMS) has been developed to improve the 236U/238U sensitivity at Micro Analysis Laboratory, Tandem accelerator (MALT), The University of Tokyo. With observing TOF distribution of 235U, 236U and 238U, this TOF-E detection system has clearly separated 236U from the interference of 235U and 238U when measuring three kinds of uranium standards. In addition, we have developed a novel method combining kernel-based density estimation method and multi-Gaussian fitting method to estimate the 236U/238U sensitivity of the TOF-E detection system. Using this new estimation method, 3.4 × 10-12 of 236U/238U sensitivity and 1.9 ns of time resolution are obtained. 236U/238U sensitivity of TOF-E detection system has improved two orders of magnitude better than that of previous gas ionization chamber. Moreover, unknown species other than uranium isotopes were also observed in the measurement of a surface soil sample, which has demonstrated that TOF-E detection system has a higher sensitivity in particle identification. With its high sensibility in mass determination, this TOF-E detection system could also be used in other heavy isotope AMS.
Objectives: Semecarpus anacardium Linn. is a plant well-known for its antimicrobial, antidiabetic and anti-arthritic properties in the Ayurvedic and Siddha system of medicine. This has prompted the screening of this plant for antibacterial activity. The main aims of this study were to isolate compounds from the plant's seeds and to evaluate their antibacterial effects on clinical bacterial test strains. Methods: The n-butanolic concentrate of the seed extract was subjected to thin layer chromatography (TLC) and repeated silica gel column chromatography followed by elution with various solvents. The compound was identified based on observed spectral (IR, $^1H$ NMR, $^{13}C$ NMR and high-resolution mass spectrometry) data. The well diffusion method was employed to evaluate the antibacterial activities of the isolated acyclic isoprenoid compound (final concentration: $5-15{\mu}g/mL$) on four test bacterial strains, namely, Staphylococcus aureus (MTCC 96), Bacillus cereus (MTCC 430), Escherichia coli (MTCC 1689) and Acinetobacter baumannii (MTCC 9829). Results: Extensive spectroscopic studies showed the structure of the isolated compound to be an acyclic isoprenoid ($C_{21}H_{32}O$). Moreover, the isoprenoid showed a remarkable inhibition of bacterial growth at a concentration of $15{\mu}g/mL$ compared to the two other doses tested (5 and $10{\mu}g/mL$) and to tetracycline, a commercially available antibiotic that was used as a reference drug. Conclusion: The isolation of an antimicrobial compound from Semecarpus anacardium seeds validates the use of this plant in the treatment of infections. The isolated compound found to be active in this study could be useful for the development of new antimicrobial drugs.
An acinomycin complex isolated from culture broth of a soil microorganism, SNUS 9305-011 has been examined by High performance liquid chromatography (HPLC). From the analysis of the fractions obtained by column chromatography of the ethyl acetate extract, three actinomycin components are confimed . The HPLC analysis is carried out with a CN-bonded nucleosil column. Comparison of the retention times of the components with those of actinomycin D, C complex, $X_{o{\beta}$, and V and suggests that they are different actinomycins. FBA mass spectra fo the coponents also shows different molecular ions from those of standards and other reported actionbmycins. The present work has demonstrated that actinomycin components can be separated by a CN-bonded HPLC column, and that ocmparison of their HPLC chormatograms with authentic smaples and information on their molecular ions can be successfully employed for indentification of actionmycins.
Lee, Eun Goo;Yoon, Young Cheol;Yoon, Jihyun;Lee, Seul Ji;Oh, Yu-Kyoung;Kwon, Sung Won
Biomolecules & Therapeutics
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v.29
no.6
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pp.582-595
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2021
Researchers have endeavored to identify the etiology of inflammatory bowel diseases, including Crohn's disease and ulcerative colitis. Though the pathogenesis of inflammatory bowel diseases remains unknown, dysregulation of the immune system in the host gastrointestinal tract is believed to be the major causative factor. Omics is a powerful methodological tool that can reveal biochemical information stored in clinical samples. Lipidomics is a subset of omics that explores the lipid classes associated with inflammation. One objective of the present systematic review was to facilitate the identification of biochemical targets for use in future lipidomic studies on inflammatory bowel diseases. The use of high-resolution mass spectrometry to observe alterations in global lipidomics might help elucidate the immunoregulatory mechanisms involved in inflammatory bowel diseases and discover novel biomarkers for them. Assessment of the characteristics of previous clinical trials on inflammatory bowel diseases could help researchers design and establish patient selection and analytical method criteria for future studies on these conditions. In this study, we curated literature exclusively from four databases and extracted lipidomics-related data from literature, considering criteria. This paper suggests that the lipidomics approach toward research in inflammatory bowel diseases can clarify their pathogenesis and identify clinically valuable biomarkers to predict and monitor their progression.
Objective: This study was aimed to establish a quantitative detection method for meat contamination based on specific polypeptides. Methods: Thermally stable peptides with good responses were screened by high resolution liquid chromatography tandem mass spectrometry. Standard curves of specific polypeptide were established by triple quadrupole mass spectrometry. Finally, the adulteration of commercial samples was detected according to the standard curve. Results: Fifteen thermally stable peptides with good responses were screened. The selected specific peptides can be detected stably in raw meat and deep processed meat with the detection limit up to 1% and have a good linear relationship with the corresponding muscle composition. Conclusion: This method can be effectively used for quantitative analysis of commercial samples.
The enantiomeric separation of lactic acid for its absolute configuration has become important task for understanding its biological origin and metabolic process involved in the formation of lactic acid. It involves the conversion of enantiomers as diastereomeric O-pentafluoropropionylated (S)-(+)-3-methyl-2-butyl ester and the direct separation by gas chromatography-mass spectrometry on a achiral capillary column. The (R)- and (S)-lactic acids were completely separated with a high resolution of 1.9. The newly developed method showed good linearity (r ${\geq}$ 0.999), precision (% relative standard deviation = 3.4-6.2), and accuracy (% relative error = -7.7-1.4) with the detection limit of 0.011 ${\mu}g/mL$. When the method was applied to determine the absolute configuration of lactic acid in Lactobacillus delbrueckii subsp. lactis 304 (LAB 304), the composition (%) of (R)-lactic acid in the cell pellet and in the culture medium were $89.0{\pm}0.1$ and $78.2{\pm}0.4$, respectively. Thus, it was verified that the present method is useful for the identification and composition test of lactic enantiomers in microorganisms.
Oh Seungkyung;Kim Sungsoo S.;Figer Donald F.;Morris Mark
Bulletin of the Korean Space Science Society
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2004.10b
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pp.290-292
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2004
Near-IR observations of the central few parsecs of our Galaxy from the HST/NICMOS have been analyzed to produce H, K photometry. We have cross-identified our photometry with the Keck high-resolution spectrometry of the central 0.5 pc of our galaxy to distinguish evolved late-type stars from early-type stars, and use late-type stars as tracer population. We perform several statistical tests to find the best fitting parameters of stellar density distribution and velocity dispersion models, then derive volume number densities and velocity dispersions. The volume number density distribution has power law index $1.55\~1.7$. We then derive the mass distribution in the Central region of our Galaxy using the Jeans equation.
Proceedings of the Korean Institute of Electrical and Electronic Material Engineers Conference
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2005.07a
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pp.185-186
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2005
Intrinsic gettering is usually used to improve wafer quality which is an important factor for reliable ULSI devices. The two-step annealing method was adopted in order to investigate interactions between oxygens and secondary defects during oxygen precipitation process in lightly and heavily boron doped silicon wafers with high energy $^{11}B^+$ ion implantation. Secondary defects were inspected nearby the projected range by high resolution transmission electron microscopy. Oxygen pileup was measured in the vicinity of the projected range by secondary ion mass spectrometry for heavily boron doped silicon wafers.
A new cyclic peptide (six-membered amino acid), gamakamide-E (L-Leu-L-Met (SO)-L-Me-Phe-L-Leu-D-Lys-L-Phe), was isolated as a strongly bitter tasting compound from cultured oysters, Crassostrea gigas. The molecular formula of $C_{43}H_{61}N_7O_8S$ was deduced from high resolution fast atom bombardment mass spectrometry (HR FAB-MS) ($[M+H]^+$ m/z 836.4356 ${\Delta}$= -2.4 mmu). Its unique structure including a hydantoin structure was firstly elucidated by nuclear magnetic resonance (NMR) analysis. Stereochemistries of constituent amino acids were determined by chiral high performanced liquid chromatography analysis of natural and synthesized peptides.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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