• 대한바이러스학회지
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• 제26권1호
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• pp.31-45
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• 1996

C형 간염바이러스 (HCV)는 각 개체간에 뉴클레오티드 서열상의 다양성을 나타내고, 이러한 유전적 다양성이 임상병리적 증상과 밀접한 연관이 있을 것으로 고려되어 왔다. 본 연구에서는 HCV E1과 NS5B 부위의 염기서열 분석을 통해 한국의 C형 간염바이러스의 분포와 다양성에 관해 분석하고, 발생계통도를 그려 HCV간의 진화적 거리를 확인하였다. 염기서열분석은 서울대학교 병원과 충남대학교 병원으로부터 얻은 56개의 HCV-양성 혈청을 대상으로 RT-PCR과 PCR 과정을 통해 얻은 유전자 산물을 클로닝하여 수행되었다. 56개의 혈청중 53개의 샘플에서 HCV RNA가 검출되었다. 이들 53개 샘플에 대한 분석 곁과, 유전형 1a, 1b, 2a, 2b, 7a가 각각 5.7, 45.3, 45.3, 1.9, 1.9%로 분포하고 있고, 1b형과 2a형이 한국에서의 주요한 HCV 유전형으로 밝혀졌다. 본 연구는 염기서열 분석을 통해 한국에서 1b형과 마찬가지로 2a형도 높은 빈도로 분포하고 있고, 비록 분포 빈도는 낮지만 1a 형과 7a 형도 존재하고 있음을 밝힌 최초의 보고이다.

• 대한의생명과학회지
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• 제11권2호
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• pp.121-128
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• 2005

A total of 30L monocytogenes strains from different sources including 13 strains isolated from the foreign imported meat were genotyped in order to establish their genetic relatedness and to compare them with the foreign isolates. PFGE analysis of genomic DNA showed the $11\~16$ fragments ranging in size from 38 to 504 kb. Eleven different PFGE types $(1\~11)$ were identified in the dendrogram at $75\%$ similarity, and the two major PFGE types, type 1 and 2, contained $94\%$ of domestic isolates (16/17). All isolates from domestic beef and pork carcass were grouped in each different type, however, isolates from chicken were clustered together with those from pork and beef. We also found all foreign strains were unrelated with each other, regardless of geographic criteria and that they could be differentiated from those from the domestic isolates by PFGE pattern. The PFGE pattern of one isolate from chicken wing, which the chicken meat was found to be imported from foreign country, was closely related to that of isolate from the Thailand.

• Journal of Microbiology
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• 제45권1호
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• pp.69-74
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• 2007

Escherichia coli is a clonal species, and occurs as both commensal and pathogenic strains, which are normally classified on the basis of their O, H, and K antigens. The O-antigen (O-specific polysaccharide), which consists of a series of oligosaccharide (O-unit) repeats, contributes major antigenic variability to the cell surface. The O-antigen gene cluster of E. coli O66 was sequenced in this study. The genes putatively responsible for the biosynthesis of dTDP-6-deoxy-L-talose and GDP-mannose, as well as those responsible for the transfer of sugars and for O-unit processing were identified based on their homology. The function of the wzy gene was confirmed by the results of a mutation test. Genes specific for E. coli O66 were identified via PCR screening against representatives of 186 E. coli and Shigella O type strains. The comparison of intergenic sequences located between galF and the O-antigen gene cluster in a range of E. coli and Shigella showed that this region may perform an important function in the homologous recombination of the O-antigen gene clusters.

• IMMUNE NETWORK
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• 제11권6호
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• pp.324-335
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• 2011

The human leukocyte antigen (HLA), the major histocompatibility complex (MHC) in humans has been known to reside on chromosome 6 and encodes cell-surface antigen-presenting proteins and many other proteins related to immune system function. The HLA is highly polymorphic and the most genetically variable coding loci in humans. In addition to a critical role in transplantation medicine, HLA and disease associations have been widely studied across the populations worldwide and are found to be important in prediction of disease susceptibility, resistance and of evolutionary maintenance of genetic diversity. Because recently developed molecular based HLA typing has several advantages like improved specimen stability and increased resolution of HLA types, the association between HLA alleles and a given disease could be more accurately quantified. Here, in this review, we have collected HLA association data on some autoimmune diseases, infectious diseases, cancers, drug responsiveness and other diseases with unknown etiology in Koreans and attempt to summarize some remarkable HLA alleles related with specific diseases.

• 보존과학연구
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• 통권23호
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• pp.59-75
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• 2002

In this study human bones and teeth, excavated from the Myeongam-risite in Asan, Chungcheongnam-do Province, have been analysed by nuclear DNA typing and mitochondrial DNA sequencing methods. Twenty-one samples of long bones and twenty-seven samples of teeth from twenty-one individuals were collected and analysed. Among these thirteenteeth were successfully subjected to nuclear DNA extraction, quantification, and PCR(Polymerase Chain Reaction) amplification. Silver STR III (D16S539, D7S820, D13S317) multiplex PCR method was used in this study for a short tandem repeat (STR) analysis. Mitochondrial DNAs of tooth samples were also amplified and sequenced by a DNA sequencer. These analyses show that a sample from Burial no. 29 and one from Burial no. 38(right) possessed the same maternal inheritance. This may suggest that the Myeongam-ri cemetery was used by a kin group for a relatively long period of time.

• 대한임상검사과학회지
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• 제37권3호
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• pp.149-154
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• 2005

대학병원의 임상검체에서 extended-spectrum-${\beta}$-lactamase (ESBL)생성 Klebsiella pneumoniae 51균주를 분리하였다. ESBL생성 K. pneumoniae 51균주는 광범위한 항생제에 내성을 보였고 대부분의 균주는 amikacin, gentamycin과 ciprofloxacin항생제에 내성을 나타내었다. 대학병원에서 분리한 51균주를 randomly amplified polymorphic DNA (RAPD)로 분석한 결과 충남대학병원 21균주와 충북대학병원에서 분리한 10균주는 Ia 와 Ib에 속하였고 경상대학 병원에서 분리한 20균주는 IIa, IIb에 속하였다. ESBL 생성 K. pneumoniae 51균주는 RAPD 분석으로 4가지의 유전형으로 구분 할 수 있었고 유전적으로 다양하였다. 이상의 결과로 RAPD 분석은 유전형분석에 빠르고 단순하고 경제적인 방법임을 알 수 있었다.

• 대한미생물학회지
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• 제21권2호
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• pp.233-241
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• 1986

Patients of chronic hepatic diseases(n=107) including chronic hepatitis caused by hepatitis B virus infections(n=31), liver cirrhosis(n=53), and hepatocellular carcinoma(n=23) were examined to ascertain genetic relationship between chronic hepatic diseases and histocompatibility antigen. Peripheral blood lymphocytes were separated from whole blood by the method of Ficoll/Hypaque gradient. Total 54 histocompatibility antigens(class I antigens: 41, class II antigens: 13) were analysed by performing of complement dependent microlymphocytotoxicity method using Terasaki's and Catholic Medical College tissue typing plates. HLA antigen frequencies were compared with those of 661 normal controls. The following results were obtained: 1. HLA antigen frequencies of HLA-Bw46, -Bw76, -Cw1, -Cw6, and HLA-DR8 in chronic hepatitis patients were shown to be higher than those in controls(P<0.01). 2. HLA antigen frequencies of HLA-Bw46, -Cw7(P<0.01), and HLA-B37, -Bw58, -Cw1, -MT1(P < 0.05) in liver cirrhosis patients were shown relatively higher frequencies than those in controls. 3. In patients with hepatocellular carcinoma, antigens of HLA-A1, -A26, -Cw3, -Cw7 and HLA-DR6 were dominantly detected. 4. There were negative associations with HLA-Cw4, and -DR4 in patients of chronic hepatic diseases(P < 0.05).

• 한국응용곤충학회지
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• 제55권2호
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• pp.177-188
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• 2016

알파 프로테박테리아(${\alpha}-proteobacterium$)인 볼바키아(Wolbachia) 세균은 절지동물 세포내의 중요한 공생균 중의 하나이다. 그람 음성 세균인 이 공생균은 기주동물의 여러 생물적 과정에 관여하고 있으며, 현재 생물적 방제 수단으로 주목 받고 있다. 볼바키아는 기주 세포의 세포질에 서식하는 세균인데 암컷을 통하여 세대간 전염된다. 볼파키아의 감염 개체 밀도를 높이기 위해 기주의 생식방식을 조작하는 다양한 전략을 발달시켰다. 볼바키아 유전자형 계통은 볼바키아 표면 단백질(WSP)의 고변이영역 아미노산 서열과 복합좌위 서열 타이핑(Multilocus sequence typing, MLST)으로 결정된다. 상이한 유전계통 판별은 wsp, 16S rRNA, ftsZ, gltA, groEL 등 유전자 분자표지를 이용하게 된다.. 이 계통 볼바키아 세균과 그들의 우월한 표현형이 농업해충과 인간의 질병매개 곤충에 대한 방제 프로그램에서 이용 가능성이 고려되고 있다. 볼바키아 표현형들은 세포질불일치(cytoplasmic incompatibility, CI), 단성생식 유도(parthenogenesis induction, PI), 여성화(feminization, F), 수컷치사(male killing, MK) 등을 유발하는 것으로 알려져 있다. 기타 볼바키아 세균의 농업과 위생곤충 방제 프로그램에서 응용 방안을 고찰하였다.

• 보존과학회지
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• 제30권4호
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• pp.409-416
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• 2014

유적지에서 발굴되는 조선시대 인골은 보존 상태가 대부분 양호하여 형질인류학, 유전학, 그리고 화학적 연구를 수행할 수 있다. 본 연구에서는 김포 장기동 유적지에서 발굴된 조선시대 인골 6개체에 대한 DNA 분석을 통하여 미토콘드리아 DNA 변이형을 결정하였으며, 성별 분석결과를 토대로 남성 피장자의 Y 하플로그룹을 동정하였다. 유전자 분석에 앞서 보존상태가 양호한 것으로 판단되는 인골 6구를 대상으로 조직학 지수를 판별하였다. 미토콘드리아 DNA 변이형은 아시아인에서 높은 빈도로 나타나는 G, R11, M7, A5 등의 하플로그룹이 확인되었다. 인골의 성별을 확인하기 위하여 아밀로제닌 유전자 분석을 수행한 결과, 6구의 인골에서 여성 4구와 남성 2구의 성별을 확인할 수 있었다. 남성으로 판명된 인골에 Y 염색체 단일염기다형성 분석을 적용해본 결과, 하플로그룹 O로 확인되었다. 향후 출토 인골의 광범위한 분석을 위하여 인골을 선별한 경우에는 본 연구에서 제시한 조직학 지수를 적용하고, 미토콘드리아 DNA와 핵 DNA의 다양한 분석을 병행하여 출토 인골간의 유연관계를 규명하는 것이 필요하다.

• 미생물학회지
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• 제53권3호
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• pp.156-162
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• 2017

레지오넬라증은 인공수계환경이 레지오넬라균에 오염되었을 때 에어로졸의 전파에 의하여 집단 발생되는 심각한 폐렴과 높은 치명률을 일으키는 호흡기질환이다. 본 연구에서는 경기도내 수계시설로부터 147주의 레지오넬라균을 검출하였고, 시설별, 수계환경별 분포현황을 조사하였다. 분리한 레지오넬라균 중에서 Legionella pneumophila의 검출률은 85.7%로 높게 나타났으며, 혈청군을 분석한 결과 L. pneumophila serogroup (sg) 1이 주로 검출되었다. Non-L. pneumophila 중에서는 L. wadsworthii이 가장 많이 검출되었다. L. pneumophila sg 1의 유전학적 다양성을 분석하기 위해 pulsed field gel electrophoresis (PFGE)와 sequence-based typing (SBT) 방법을 사용하여 비교 분석하였다. 32주에 대해 PFGE 분석 결과 22개의 PFGE pattern을 보였고, SBT 분석 결과 9개의 유형으로 나누어졌다. PFGE와 SBT 분석에서 모두 크게 3개 group으로 분류되어 매우 유사한 결과를 나타냈다. SBT 유형 중 ST1이 가장 우점하였고, 2개의 새로운 유형도 찾아낼 수 있었다. SBT는 데이터베이스가 잘 구축되어 있어 균주 간의 유전학적 유형분석을 쉽고, 간단하게 할 수 있기 때문에 레지오넬라증의 분자역학적 연구에 유용한 방법임을 확인할 수 있었다.