• 제목/요약/키워드: fundamental informatics

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Choosing Optimal STR Markers for Quality Assurance of Distributed Biomaterials in Biobanking

  • Chung, Tae-Hoon;Lee, Hee-Jung;Lee, Mi-Hee;Jeon, Jae-Pil;Kim, Ki-Sang;Han, Bok-Ghee
    • Genomics & Informatics
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    • 제7권1호
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    • pp.32-37
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    • 2009
  • The quality assurance (QA) is of utmost importance in biobanks when archived biomaterials are distributed to biomedical researchers. For sample authentication and cross-contamination detection, the two fundamental elements of QA, STR genotyping is usually utilized. However, the incorporated number of STR markers is highly redundant for biobanking purposes, resulting in time and cost inefficiency. An index to measure the cross-contamination detection capability of an STR marker, the mixture probability (MP), was developed. MP as well as other forensic parameters for STR markers was validated using STR genotyping data on 2328 normal Koreans with the commercial AmpFlSTR kit. For Koreans, 7 STR marker (D2S1338, FGA, D18S51, D8S1179, D13S317, D21S11, vWA) set was sufficient to provide discrimination power of ${\sim}10^{-10}$ and cross-contamination detection probability of ${sim}1$. Interestingly, similar marker sets were obtained from African Americans, Caucasian Americans, and Hispanic Americans under the same level of discrimination power. Only a small subset of commonly used STR markers is sufficient for QA purposes in biobanks. A procedure for selecting optimal STR markers is outlined using STR genotyping results from normal Korean population.

Heritabilities of Facial Measurements and Their Latent Factors in Korean Families

  • Kim, Hyun-Jin;Im, Sun-Wha;Jargal, Ganchimeg;Lee, Siwoo;Yi, Jae-Hyuk;Park, Jeong-Yeon;Sung, Joohon;Cho, Sung-Il;Kim, Jong-Yeol;Kim, Jong-Il;Seo, Jeong-Sun
    • Genomics & Informatics
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    • 제11권2호
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    • pp.83-92
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    • 2013
  • Genetic studies on facial morphology targeting healthy populations are fundamental in understanding the specific genetic influences involved; yet, most studies to date, if not all, have been focused on congenital diseases accompanied by facial anomalies. To study the specific genetic cues determining facial morphology, we estimated familial correlations and heritabilities of 14 facial measurements and 3 latent factors inferred from a factor analysis in a subset of the Korean population. The study included a total of 229 individuals from 38 families. We evaluated a total of 14 facial measurements using 2D digital photographs. We performed factor analysis to infer common latent variables. The heritabilities of 13 facial measurements were statistically significant (p < 0.05) and ranged from 0.25 to 0.61. Of these, the heritability of intercanthal width in the orbital region was found to be the highest ($h^2$ = 0.61, SE = 0.14). Three factors (lower face portion, orbital region, and vertical length) were obtained through factor analysis, where the heritability values ranged from 0.45 to 0.55. The heritability values for each factor were higher than the mean heritability value of individual original measurements. We have confirmed the genetic influence on facial anthropometric traits and suggest a potential way to categorize and analyze the facial portions into different groups.

뇌졸중 노인의 기능장애 정도, 일상생활 수행능력, 우울과 삶의 질 간의 관계 (The Relationship of Dysfunctions Degree, Daily Living Activity, Depressiveness and Quality of Life among the Elderly Suffering from Stroke)

  • 박인숙;김도연;강창렬
    • 보건의료산업학회지
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    • 제5권2호
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    • pp.173-186
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    • 2011
  • The purpose of this study was to know dysfunctions degree, daily living activity, depression and quality of life among stroke elderly person; and to know what kind of factors affecting to quality of life of the stroke elderly person; after that provide a fundamental data to nursing arbitration plan about increase height quality of life of the stroke elderly person. The study subjects were collected 119 people, over than 60 age, who were diagnosed with stoke in D hospital, living in B city. The data was collected by using personal interviews and questionnaire, from Nov 2008 to Jan 2009. The questionnaire were Pre-Stroke MRDS(Modified Rankin Disability Scale), Barthel-ADL(Activities of Daily Living), K-IADL(Korean-Instrumental Activities of Daily Living), GDS-15(Geriatric Depression Scale-15-question form) methods. The pre-stroke MRDS was appeared a functional obstacle. The mean score of activity of daily living was 18.24 which showed the subjects were mildly disabled, the score of instrumental activities of daily living was 7.94 which showed the mildly abled, and score of depressiveness was 7.41 which showed the subjects were mildly depression. There was a significantly correlation among MRDS, ADL, IADL, depressiveness and quality of life. Through these study result, important to check the old subjects' depressiveness, cognitive functions, daily living abilities, dysfunctions degree to main tain their quality of life.

초등 교과서의 디지털 리터러시 현황 분석을 통한 초등 정보 교과 독립 적용 탐구 (Exploring the Independent Application of Elementary Information Education through Analysis of Digital Literacy in Elementary School Textbooks)

  • 성영훈
    • 정보교육학회논문지
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    • 제25권2호
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    • pp.265-277
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    • 2021
  • 기술의 발전에 따라 디지털 리터러시의 개념이 기능과 도구 활용 중심에서 사회, 문화적 맥락에서 의사소통과 참여의 범위까지 확장되고 있다. 특히 코로나19와 같은 원격학습환경에서 학습자의 디지털 리터러시 역량은 더욱 중요하고 필요하다. 본 연구에서는 초등학교 교과서에 나타난 디지털 리터러시에 대한 분석과 점검을 통해 디지털 리터러시 교육 개선 방안에 대해 연구하였다. 이를 위해 디지털 리터러시를 구성하는 기초적 지식, 기술 및 역량으로 구성된 준거를 통해서 분석하였다. 연구 결과 초등학교 교과서의 디지털 리터러시 교육 내용은 기능과 도구 중심으로 제시되고, 특정 영역 등에 편중되어 있고 체계성, 연계성 등에서 부족한 부분이 발견되었다. 이에 초등 정보교과 독립을 통한 디지털 리터러시의 교과 체계 구성과 교육과정의 구체적인 구성 방안 및 예비교사의 실천 역량 강화를 위한 방안에 대해 제시하였다.

한국어 낭독과 자유 발화의 운율적 특성 (Korean prosodic properties between read and spontaneous speech)

  • 유승미;이석재
    • 말소리와 음성과학
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    • 제14권2호
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    • pp.39-54
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    • 2022
  • 본 연구의 목적은 L2KSC(외국어로서의 한국어 음성 말뭉치)의 한국어 부분에서 한국어 낭독과 자유 발화를 분석하여 음성 유형의 운율 차이를 명확히 하는 것이다. 이를 위해 문장의 조음 길이, 조음 속도, 한 문장 내 휴지 길이 및 휴지 빈도, 문장 F0값을 변수로 설정하고 통계적 방법론(t-검정, 상관 분석, 회귀 분석)을 통해 분석하였다. 실험결과, 낭독과 자유 발화는 각 문장을 구성하는 운율구 형태가 구조적으로 달랐는데 각 발화 유형을 구별하는 운율적 요소로는 조음 길이, 휴지 길이, 휴지 빈도로 나타났다. 통계적 결과에서는 낭독 발화는 조음 속도와 조음 길이의 상관관계가 가장 높았는데, 이는 주어진 문장이 길수록 화자가 더 빨리 말하는 것을 설명하였다. 그러나 자유 발화에서는 문장의 조음 길이와 휴지 빈도 사이의 관계가 높았다. 전반적으로 자유 발화에서는 문장을 만들기 위해 짧은 억양구가 지속적으로 만들어지는데, 그런 이유로 더 많은 휴지가 발생하여 문장이 더 길어지는 것으로 나타났다.

PERISTALTIC PUMPING OF AN ELLIS FLUID IN AN INCLINED ASYMMETRIC CHANNEL

  • A. SMALL;P. NAGARANI;M. NARAHARI
    • Journal of applied mathematics & informatics
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    • 제41권1호
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    • pp.51-70
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    • 2023
  • The flow of an incompressible Ellis fluid in an inclined asymmetric channel, driven by peristaltic waves was studied under low Reynolds number and long wavelength assumptions. The wave on each side of the channel are assumed to be an infinite train of sinusoidal waves, both having the same constant wave speed and wavelength however, they vary in wave amplitude, channel half width and phase angle. We derived expressions for the axial and transverse velocities, volume flow rate, pressure rise per unit wavelength and streamlines. The effects of varying the wave amplitudes, the phase angle, the channel width, the angle of inclination of the channel as well as the fluid parameters on the flow were analyzed. Trapping conditions were determined and the presence of reflux highlighted using the streamlines for the necessary channel and fluid conditions. By varying the fluid parameters, changes in the fluid that deviated from the Newtonian case resulted in a reduction in the axial velocity in the neighborhood of the center of the channel and a simultaneous increase in the velocity at the periphery of the channel. A nonlinear relation was observed with the pressure rise and the volume flow rate. This nonlinear relation is more pronounced with an increase in the absolute value of the volume flow rate. For Newtonian fluids a linear relation exists between these two variables. The fluid parameters had little effects on the streamlines. However, variations of the wave amplitudes, volume flow, channel width and phase angle had greater effects on the streamlines and hence the trapped region.

R프로그래밍을 활용한 공유경제의 한국인 집단지성: 텍스트 마이닝 및 시계열 분석 (Korean Collective Intelligence in Sharing Economy Using R Programming: A Text Mining and Time Series Analysis Approach)

  • 김재원;윤유동;정유진;김기연
    • 인터넷정보학회논문지
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    • 제17권5호
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    • pp.151-160
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    • 2016
  • 본 연구의 목적은 최근 창조경제 또는 사회적 경제 관점에서 주목받고 있는 공유경제라는 키워드에 관해 현대 한국인들이 가지고 있는 대중적인 문화 및 사회적 인식, 즉 집단지성의 변화 추세를 조사하는 것이다. 이를 위해, 본 연구는 빅데이터 분석 관점의 텍스트 마이닝 기법을 적용하여 최근 5년 간 사회 문화적 집단지성의 객관적이고 가시적인 연간 변화 및 패턴들을 발견하고 이해하고자 한다. 월드 와이드 웹에서 크롤링(crawling) 기법과 구글링(googling)을 통해 분석에 필요한 2010년부터 2014년까지 축적된 상당한 양의 공유경제를 주제로 한 기존 문헌들의 시계열 웹 메타 데이터를 수집하였다. 결과적으로, 많은 양의 가공되지 않은 공유경제 키워드 관련 원 자료들은 R프로그래밍 분석을 통해 보다 의미 있는 가치 있는 '워드 클라우딩' 형태의 그래프나 그림으로 분석처리 되었다. 아직까지 시기적으로 공유경제에 관해 축적된 자료나 집단지성이 양적으로 미비함에도 불구하고, 본 연구는 지식처리 관점에서 시계열 빅데이터 분석을 수행한 선행연구라는 점에서 의미가 있다. 따라서 본 연구의 결과는 향후 산학 분야에서 공유경제 관련 시장분석과 소비자 행동학 관련 후속 연구들을 위해 1차 자료로서 학문적 시사점을 제공할 수 있다.