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헬리코박터 파일로리에서 fdxA 유전자에 의한 메트로니다졸 내성 조절 기전 연구 (Mechanism of Metronidazole Resistance Regulated by the fdxA Gene in Helicobacter pylori.)

  • 남원희;이선미;김은실;김진호;정진용
    • 생명과학회지
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    • 제17권5호
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    • pp.723-727
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    • 2007
  • 본 연구는 H. pylori에서 metronidazole내성에 관여하는 유전자를 발견하고 이들 유전자들의 상호 조절 기전을 밝힘으로서 위장질환의 원인균인 H. pylori를 퇴치하기 위한 기본바탕을 마련하고자 수행되었다. 우선적으로 metronidazole 내성을 조절하는 유전자인 fdxA(ferredoxin)에 의한 metronidazole 내성 조절 기전을 밝히기 위하여 다음의 연구를 수행하였다. Type I 균주인 26695균주의 fdxA 유전자에 chloramphenicol 내성 유전자를 삽입하여 결손돌연변이주를 구축하였다. fdxA의 비활성화에 의한 rdxA 및 frxA 유전자의 발현을 알아보기 위하여 2-D electrophoresis와 MALDI-TOP-MS을 이용하여 fdxA 유전자의 비활성화에 의해 over-expressed protein과 under-expressed protein을 검색하였다. 본 실험의 결과로 type I 균주인 26695에서 fdxA 유전자를 비활성화시킨 결과 frxA 유전자의 발현양이 증가함을 northern으로 확인하였으며, 또한 fdxA유전자의 downstream에 위치한 유전자들이 H. pylori의 생존에 중요한 역할은 한다는 것을 알 수 있었다. 또한 2-D electrophoresis와 MALDI-TOP-MS을 이용하여 fdxA 유전자의 inactivation에 의해 over-expressed protein으로 nifU-like protein(HP0221), frxA(HP0642), nonheme ferritin(HP0653)와 아직 기능이 밝혀지지 않은 hypothetical protein(HP0902) 등이 발견되었다. 그리고 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase(HP0089), (3R)-hydroxymyristoyl ACP dehydratase(HP1376)과 thioredoxin(HP1458)등이 under-expressed protein으로 발견되었다.

WDM 슬러티드 링 네트워크의 MAC 프로토콜 성능분석 (Performance analysis of a MAC protocol on WDM slotted ring networks)

  • 박강수;정수환;김종훈;신종덕
    • 한국통신학회논문지
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    • 제25권6A호
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    • pp.893-899
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    • 2000
  • 광섬유의 대역폭을 보다 효율적으로 활용하기 위한 방안으로 각각의 채널에 서로 다른 파장을 사용하여 하나의 광섬유에 동시에 전송하는 파장분할 다중화 방식(WDM, Wavelength Division Multiplexing)이 최근 주목받고 있다. WDM 전송 시스템은 광 송수신기의 비용이 고가이므로 경제적인 구축을 위해서는 최소한의 광 송수신기를 사용하여야 하고 성능 파라미터인 전송률(throghput)과 시간 지연의 분석이 중요한 의미를 갖는다. 본 논문에서는 각 노드에 단일 큐 버퍼와 각각 1개씩의 파장가변송신기(TTX), 파장가변수신기(TRX), 파장고정수신기(FRX)가 장착된 슬러티드 링 MAC 프로토콜을 통계적 접근 방법으로 분석하였으며 컴퓨터 실험을 통하여 분석의 타당성을 검증하였다.

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Helicobacter pylori에서 metronidazole 내성이 미치는 생물학적 영향 (Biological Effect of Metronidazole Resistance in Helicobacter Pylori)

  • 이진혁;이선미;남원희;김은실;김진호;강호영;정진용
    • 생명과학회지
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    • 제15권6호
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    • pp.955-960
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    • 2005
  • 메트로니다졸은 인체 위장질환의 원인균인 헬리코박터 파일로리를 박별하기위해 처방하는 주요 약제이다 그러나 인체로부터 분리한 헬리코박터 파일로리 균주는 메트로니다졸에 내성을 가지는 경우가 일반적이며, 이러한 내성원인은 이 균주의 염색체 상에 존재하는 두 종류의 nitroreductase 유전자인 rdxA와frxA 유전자가 비활성화됨에 따라 유발된다. 본 연구에서는 헬리코박터 파일로리 균에서 rdxA 유전자에 변이를 도입하여 메트로니다졸에 내성을 가지는 균주를 구축하여, 메트로니다졸 내성이 균주에 미치는 생물학적 영향을 관찰하고자 하였다. In vitro상에서 메트로니다졸 내성균주는 대조균과 비교하여 exponential phase에서는 거의 차이 없이 증식하였으나 stationary phase에서는 빠르게 생육활성을 잃는 것을 관찰할 수 있었다. 또한 생쥐를 이용한 동물 실험에서 메트로니다졸 내성균주는 생쥐의 위장 내에서 서식하는 능력을 상실함을 알 수 있었다. 그러나 이러한 생육 활성을 회복시켜주는 compensate템 mutation을 가진 균주를 쉽게 얻을 수 있었으며 이 균주는 생쥐에 감염시키면 위장 내에서 서식하는 능력을 회복함을 알 수 있었다.

Targeted Panel Exome Sequencing in Suspected Monogenic Diabetes: Single-Center Pilot Study

  • Lee, Sangwoo;Lee, Gi Min;Lee, MiSeon;Lee, Rosie;Moon, Jung Eun
    • Journal of Interdisciplinary Genomics
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    • 제4권1호
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    • pp.7-10
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    • 2022
  • Purpose:Maturity onset diabetes of the young (MODY) is the most common hereditary form of diabetes mellitus (DM), with similar clinical manifestations to type 1 or type 2 DM, leading to diagnostic ambiguity. Despite increased genetic research on monogenic DM, studies with Asian populations are limited. Therefore, we investigated mutation in possible monogenic DM and MODY in Korean children and aldolescents. Methods: Targeted panel exome sequencing including 32 targets genes was performed for 41 patients with suspected monogenic DM at Kyungpook National University Children's Hospital. Results: Variants were detected in 19 patients, including those in known MODY-associated genes (HNF4A, GCK, HNF1A, CEL, PAX4, INS, and BLK) and monogenic DM-associated genes (WFS1, FRX6, and GLIS3). Conclusion: MODY variants were detected more than expected. Targeted exon sequencing is helpful in diagnosing MODY or possible monogenic DM patients.