For decades, the microorganisms in arctic soils have been newly discovered according to the climate change and global warming. In this study, the chemical structure of a lipid A molecule from Pseudomonas sp. strain PAMC 28615 which was newly discovered from arctic soils was characterized by mass spectrometric approaches such as matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight (MALDI-TOF) and MALDI multi-stage tandem mass spectrometry (MS). First, lipopolysaccharide (LPS) from Pseudomonas sp. strain PAMC 28615 was extracted and subsequently hydrolyzed to obtain the lipid A. The parent ion peak at m/z 1632 was determined by MALDI-TOF MS, which also can validate our lipid A purification method. For detailed structural determination, we performed the multiple-stage tandem mass analysis ($MS^4$) of the parent ion, and subsequently the abundant fragment ions in each MS stage are tested. The fragment ions in each MS stage were produced from the loss of phosphate groups and fatty acyl groups, which could be used to confirm the composition or the position of the lipid A components. Consequently, the mass spectrometry-based lipid A profiling method could provide the detail chemical structure of lipid A from the Pseudomonas sp. strain PAMC 28615 as an arctic bacterium from the frozen arctic soil.
치환 8-퀴놀린올의 옥소몰리브덴(V)착물을 합성하고 착물의 원소분석, 자외선스펙트럼, 전자스펙트럼 및 전도도를 측정하였고 옥소몰리브덴(VI)착물과 함께 질량분석을 행하여 비교 검토하였다. 옥소몰리브덴(V) 착물은 비전해질이고 몰리브덴-산소의 신축진동은 $940cm^{-1}$ 부근에서 강한 흡수띠가 나타나고 결정장전이와 전하이동 전이가 일어났다. 질량분석 결과로 Mo(V, VI)착물에서 몰리브덴과 리간드의 조성이 1:2임을 확인할 수 있었고 옥소몰리브덴(VI)착물에서는 1:1조성의 착물의 질량수가 나타나지만 옥소몰리브덴(V)에서는 일부만 확인되었다.
각기 다른 양이온$(Na^+, Li^+, K^+, NH_4^+)$을 구조이성질체인 일련의 합성 올리고당에 첨가함으로써, 양이온의 결합정도가 올리고당의 연결위치에 따라 달라지리라는 것을 FAB CAD MS/MS(Fast Atom Bombardment Collision Activated Dissociation Mass Spectrometry/ Mass Spectrometry)를 이용하여 안정성 측면에서 연구하였다. 알카리 양이온화된(cationized) 올리고당들은 양성자화(protonated)된 형태보다 더 큰 안정성을 나타내어 -40 eV의 충돌 에너지 수중에서 연결부위와 작용기들이 분절된 스펙트럼형태를 보인 반면, 양성자화된 올리고당은 -10 eV에서 에서 같은 정도의 분절을 보였다. 첨가된 양이온 중, 칼륨 양이온이 첨가된 올리고당이 다른 것에 비해 안정화되어 triple quadrupole기종의 허용에너지 조건하에서는 분절이온을 생성하지 않는다. 다른 양이온화된 올리고당들은 충돌기체인 argon의 압력이 0.8mTorr 상태에서 양이온의 종류에 따라$Nap^+>Li^+>NH_4^+$순으로 안정성을 나타내었다. 올리고당과 결합하는 금속양이온들은 질소를 포함하고 있는 아미노당에 위치하며, 이는 아미노당을 포함하는 분절이온마다 각 양이온에 해당하는 만큼의 질량이 이동된 분절피크들이 나타나는 것으로 설명 가능하다. 또한 양이온화된 것이 양성자화된 것보다 더 큰 안정성을 지니는 이유는 금속 양이온과 아미노당의 N-acetyl 작용기 및 fucose의 산소 사이에 크라운에테르 형태의 결합을 형성하는 것으로 설명할 수 있다. 이 때 참여한 금속 양이온의 크기 및 연결위치-이성질 부분의 구조적 형태에 따라 결합정도의 차이를 보여 각기 다른 분절스펙트럼의 형태를 나타내며 안정성면에서도 1-6>1-4>1-3 연결위치의 순으로 나타났다.
LC/MS/MS를 이용하여 발기부전 (impotence) 치료제인 sildenafil 및 유사체인 homosildenafil, vardenafil, tadalafil을 분석하는 방법을 확립하였다. 이온화 방법으로는 electrospray ionization (ESI)와 atmospheric pressure chemical ionization (APCI) 방법을 사용하였으며 최대 감도와 재현성을 나타내는 조건을 찾기 위하여 여러 가지 파라미터를 변화시켜서 비교하였다. MRM (multiple reaction monitoring)을 위한 적절한 생성이온 (product ion)을 얻기 위하여 ESI 방법에서는 capillary voltage, cone voltage, extractor, entrance, RF lens를 변화시켰으나 전구이온 (precursor ion)을 제외한 뚜렸한 토막이온 (fragment ion)은 생성되지 않았다. 한편, APCI 방법의 경우 entrance, collision energy, exit, corona voltage, cone voltage, extractor, RF lens, cone gas, desolvation gas를 변화시켰을 때 다른 파라미터들의 변화에 따른 전구이온을 제외한 product ion 생성 패턴의 변화는 감지되지 않고 단지 RF lens 조건의 변화에서 precursor ion을 비롯한 토막이온들의 생성과 더불어 S/N의 증가로 인한 검출 한계의 향상이 나타났다. HPLC에서의 최적 분리 조건과 질량 분석기에서 최대 감도를 나타내는 이동상 조건도 조사되었는데 10 mM ammonium formate (pH 4.8):acetonitrile=70:30 의 등용매 용리조건이 좋은 감도를 나타내었으며, 최적의 방법인 ESI-MRM 방법에서 검출한계 (S/N>5)는 sildenafil은 $0.10{\mu}g/mL$, homosildenafil은 $0.025{\mu}g/mL$, vardenafil은 $0.025{\mu}g/mL$ 그리고 tadalafil은 $0.25{\mu}g/mL$이었다.
본 연구에서는 전극분무 이온화-이온 포획 질량 분석기를 이용하여 인체 IgG의 N-연결 글라이칸 중 이중촉각 구조를 가지면서 비환원 말단의 갈락토오즈 개수가 0, 1, 2 개인 서로 다른 세 가지 글라이칸의 단일 쪼개짐 (MS/MS) 및 다중 쪼개짐 현상을 관찰하고 이를 구조 분석에 이용하였다. MS/MS 분석에서는 퓨코오즈가 결합된 환원 말단의 N-아세틸 글루코사민의 0,2-고리 쪼개짐으로 파생되는 조각 피크가 가장 높은 세기로 나타나는 것을 관찰할 수 있었고, 전구체 피크와 별개로 연속적인 당 단위체의 쪼개짐이 일어나는 것을 알 수 있었다. 또한 G1 글라이칸의 경우에서만 비환원 말단의 갈락토오즈와 N-아세틸글루코사민이 결합된 채 쪼개지는 현상이 일어나는 것을 관찰할 수 있었다. 다중 쪼개짐 질량 분석 기법을 이용하여 MS/MS 스펙트럼에서 나타나는 조각 피크들의 구조를 재확인할 수 있었고, 이를 트리 구조로 정리할 수 있었다. 또한 추가적인 2,4-고리 쪼개짐 현상이 환원 말단 하나 바깥쪽의 N-아세틸 글루코사민에서 공통적으로 일어나는 것을 관찰할 수 있었다. 이와 같은 다중 쪼개짐 질량 분석기법을 이용하여 보다 복잡한 구조의 글라이칸 구조 분석에 이용될 수 있을 것으로 기대된다.
Fragmentations and ion-molecule reactions of ionized cyclohexane propionic acid and cyclohexane butyric acid were studied using FTMS and theoretical calculations. The difference in bond dissociation depending on the aliphatic chain length was investigated and mechanisms for the possible rearrangements depending on the aliphatic carbon length were suggested. The most abundant fragment ion of the ionized cyclohexane propionic acid was c-$C_6H_{11}CH_2\;^+$ formed from the molecular ion by the direct C-C bond cleavage, while that of the ionized cyclohexane butyric acid was c-$C_6H_9C(OH)=OH^+$ formed by rearrangement of the molecular ion from the acid to diol form and loss of propyl radical. Stabilities of the radical and distonic ions of $C_nH_{2n}O^{+\bullet}$ formed from the molecular ion were compared. Protonated molecules were dissociated into smaller ions by losing one or two water molecules. The $[nM + H]^+$, $[nM + H - H_2O]^+$, and $[nM + H - 2H_2O]^+$ with n = 2 and 3 were generated by solvation with the neutral molecules in the ICR cell at long ion trapping time.
The fragmentation patterns and ion-molecule reactions of two alkyn alcohols, 2-propyn-1-ol (HC≡$CCH_2$OH) and 2-methyl-3-butyn-2-ol (HC≡CC($CH_3)_2$OH), were investigated using Fourier transform mass spectrometry (FTMS). The most abundant fragment ions formed from the molecular ions were [M-H]$^+$ for 2-propyn-1-ol and [M-$CH_3]^+$ for 2-methyl-3-butyn-2-ol. The dehydrated ion, [M-$H_2O]^+$ was formed only from 2-propyn-1-ol in which $\alpha$ -hydrogen atoms were available for $\alpha,\;\alpha$ -elimination reaction. The protonated molecules were dissociated into [M+H-$H_2O]^+$ and [M+H-$C_2H_2]^+$ through dehydration and deacetylenylation processes. The formations of [M+H-$H_2O]^+$ and [M+H-$C_2H_2]^+$ from 2-methyl-3-butyn-2-ol were more favorable than those from 2-propyn-1-ol due to stabilization by two methyl groups at $\alpha$ -carbon. Ion-neutral complexes formed at long ion trapping time gave dehydrated and/or deacetylenylated ion products by further dissociation.
Park, Sehwan;Lee, Jihyeon;Cho, Soo Gyeong;Goh, Eun Mee;Lee, Sungman;Koh, Sung-Suk;Kim, Jeongkwon
Bulletin of the Korean Chemical Society
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제34권12호
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pp.3659-3664
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2013
Eight representative explosives (ammonium perchlorate (AP), ammonium nitrate (AN), trinitrotoluene (TNT), 2,4-dinitrotoluene (DNT), cyclonite (RDX), cyclotetramethylenetetranitramine (HMX), pentaerythritol tetranitrate (PETN), and hexanitrostilbene (HNS)) were comprehensively analyzed with an ion trap mass spectrometer in negative ion mode using direct infusion electrospray ionization. MS/MS experiments were performed to generate fragment ions from the major parent ion of each explosive. Explosives in salt forms such as AP or AN provided cluster parent ions with their own anions. Explosives with an aromatic ring were observed as either $[M-H]^-$ for TNT and DNT or $[M]^{{\cdot}-}$ for HNS, while explosives without an aromatic ring such as RDX, HMX, and PETN were detected as an adduct ion with a formate anion, i.e., $[M+HCOO]^-$. These findings provide a guideline for the rapid and accurate detection of explosives once portable MS instruments become more readily available.
Continuous Water-Soluble Organic Carbons (WSOC) by the Particle Into Liquid Sampler - Total Organic Carbon (PILS-TOC) analyzer were measured at the Seoul intensive monitoring site from June 17 through July 5 in 2014. In addition, the 24 hour integrated PM2.5 collected by Teflon and Quartz filters were analyzed for water soluble ions by Ion chromatography (IC), WSOC by TOC from water extracts, organic carbon (OC), elemental carbon (EC) by carbon analyzer using the thermal optical transmittance (TOT) method, and mass fragment ions (m/z) related to alkanes and PAHs (Poly Aromatic Hydrocarbons) by Gas Chromatography-Mass Spectrometer-Thermal Desorption (GC/MS-TD). Based on the statistical analysis, four different Carbonaceous Thermal Distributions (CTDs) from OCEC thermal-gram were identified. This study discusses the primary and secondary sources of WSOC based on the Classified CTD, organic mass fragments, and diurnal patterns of WSOC. The results provide knowledge regarding the origins of WSOC and their behaviors.
8종의 염소화유기인제 농약에 대한 전자충돌식으로 이온화시킨 질량분석법에 대하여 연구하였다. 대부분의 경우, 염소 원소를 포함하는 특성이온들은 그들의 동위원소에 기인하는 $^{37}Cl$ 피크에 의해 쉽게 확인되어진다. 즉 깨어진 이온의 염소 동위원소($^{37}Cl$)에 기인하는 피크량의 비를 측정함으로써 염소 원자수를 알 수 있다. 또한, 유기인제 부분은 과거에 보고되었던 질량분석 메카니즘과 비교하였을 때, 대체로 잘 일치함이 관측되었다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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