이 연구의 목적은 물-오일 계면에서 특이적인 lipase 활성을 측정할 수 있는 high-throughput assay 방법을 확립하는 것이다. 이 방법은 pH에 따라 형광의 세기가 변하는 fluorescein의 특성을 이용하여 lipase의 작용으로 방출되는 지방산으로 인한 pH 변화를 fluorescein의 형광 변화로 측정하도록 되어 있다. 활성의 측정은 오일 에멀션과 fluorescein 그리고 효소를 포함하는 반응 용액을 반응시키면서 일정한 간격으로 형광을 측정함으로써 이루어진다. 이 방법을 통해 형광의 세기가 효소의 양에 비례하는 속도로 감소하는 것을 관찰할 수 있었으며 시간에 따른 형광 변화 그래프로부터 계산한 반응 속도가 효소의 양에 선형으로 비례한다는 것을 확인할 수 있었다. 또 한 가지 중요한 사실은 assay를 하는데 있어서 pH 6.0-8.0의 범위에서 다른 pH 조건을 사용할 수 있었다는 점이다.
본 연구에서는 심혈관계 질환의 표지인자인 콜레스테롤의 농도를 새롭게 개발한 형광 크로마토그라피 방법에 의하여 측정 하고자 시도하였다. 개발된 측정 시스템은 크로마토그라피 스트립이 들어 있는 카트리지, 발색제 AEC, 콜레스테롤 옥사데이즈 (Cholesterol Oxidase, CO), 콜레스테롤 에스트라아제(Cholesterol Esterase, CE), 호스래 디쉬페록시다아제 (Horseradish peroxidase, HRP)를 포함하는 효소혼합 수용액, 그리고 형광 판독기로 구성되어 었다. 콜레스테롤 농도 변화에 따른 형광 세기 변화로 얻은 상관계수 r= 0.968로 측정 가능한 농도 범위에서 신뢰할 만한 직선성 관계를 제시하여 주었다. 회복률과 Hitachi 747 검사기기와 비교 테스트에서는 각각 106.5-94%와 상관관계 r = 0.939 (p<0.001)로 비교적 높은 유의성을 보여주었다. 따라서 본 연구에서 개발된 새로운 콜레스테롤 농도 측정법은 빠른 반응 시간 (8분)과 적은 시료량 ($5\;{\mu}l$)을 사용하기에 시료를 실험실로 운반할 필요없이 클리닉에서 측정 가능한 준현장검사 플랫폼형으로 개발되었으며 기존의 고가의 자동화 장비를 사용하는 생화학적 진단방식 대체용으로의 응용이 기대된다.
Restriction endonucleases play an important role in molecular cloning, clinical diagnosis, and pharmacological drug studies. In this study, DNA-templated copper nanoclusters (DNA-CuNCs) were used to detect AluI endonuclease activity due to their high fluorescence emission and rapid synthesis of DNA-CuNCs under ambient conditions. Results showed that AluI activity was detected in a highly sensitive manner at low concentrations of AluI endonuclease by the fluorescence intensity of DNA-CuNCs. Additionally, its inhibition was monitored in the presence of daidzein under optimal conditions.
Melanin concentrating hormone is a neuropeptide highly expressed in the brain that regulates several physiological functions mediated by receptors in the G-protein coupled receptor family, especially plays an important role in the complex regulation of energy balance and body weight mediated by the melanin concentrating hormone receptor subtype 1 (MCH1). Compelling pharmacological evidence implicating MCH1 signaling in the regulation of food intake and energy expenditure has generated a great deal of interest by pharmaceutical companies as MCH1 antagonists may have potential therapeutic benefit in the treatment of obesity and metabolic syndrome. Although fluorescence-based calcium mobilization assay platform has been one of the most widely accepted tools for receptor research and drug discovery, fluorescence interference and shallow assay window limit their application in high throughput screening and have led to a growing interest in alternative, luminescence-based technologies. Herein, a luminescence-based functional assay system for the MCH1 receptor was developed and validated with the mitochondrial targeted aequorin. Aequorin based functional assay system for MCH1 presented excellent Z' factor (0.8983) and high signal-to-noise ratio (141.9). The nonpeptide MCH1 receptor antagonist, SNAP 7941 and GSK 803430, exhibited $IC_{50}$ values of 0.62 ${\pm}$ 0.11 and 12.29 ${\pm}$ 2.31 nM with excellent correlation coefficient. These results suggest that the aequorin based assay system for MCH1 is a strong alternative to the traditional GPCR related tools such as radioligand binding experiments and fluorescence functional determinations for the compound screening and receptor research.
Xu, Kui;Stern, Alvin S.;Levin, Wayne;Chua, Anne;Vassilev, Lyubomir T.
BMB Reports
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제36권4호
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pp.421-425
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2003
The serine/threonine protein kinase family is a large and diverse group of enzymes that are involved in the regulation of multiple cellular pathways. Elevated kinase activity has been implicated in many diseases and frequently targeted for the development of pharmacological inhibitors. Therefore, non-radioactive antibody-based kinase assays that allow high throughput screening of compound libraries have been developed. However, they require a generation of antibodies against the phosphorylated form of a specific substrate. We report here a time-resolved fluorescence assay platform that utilizes a commercially-available generic anti-phosphothreonine antibody and permits assaying kinases that are able to phosporylate threonin residues on protein substrates. Using this approach, we developed an assay for Cdc7/Dbf4 kinase activity, determined the $K_m$ for ATP, and identified rottlerin as a non-ATP competitive inhibitor of this enzyme.
A simple quantitative assay method for ribonuclease activity has been developed. This method is based on the decrease of fluorescence intensity emitted by the ethidium bromide bound to RNA due to the degradation of RNA by ribonuclease. The substrate RNA was reacted with ribonuclease A and the fluorescence intensity was measured after the addition of ethidium bromide. The intensity difference was calculated using a blank reaction mixture containing no RNase. Whole cellular RNA substrate produced a significant error and was not suitable for this assay method possibly because of local microheterogeniety caused by high molecular weight rRNA. but satisfying results were obtained with tRNA substrate. The intensity difference increased linearly by raising enzyme concentration up to $2{\times}10^{-4}$ Kunitz Units of ribonuclease A. More refined and reliable results were obtained by use of initial reaction velocities which were calculated from the plots of intensity difference vs time. A linear relationship between initial velocities and enzyme concentrations was observed up to 0.01 Kunitz Units of enzyme.
Deep blue fluorescence of resorcin blue-stained callose was observed only in the potato leafroll virus (PLRV)-infected potato plants, but not in other potato viruses investigated. The plant sections stained with aniline blue showed non-specific fluorescence regardless of PLRV infection, which means that aniline blue is not suitable for the staining of callose induces by PLRV infection. The fluorescence of resorcin blue-stained callose was more easily detectable than autofluorescence by a direct fluorescence detection method because of its deep blue color. The lateral branch of lower leaves was turned out to be the best material for fluorescence observation of all plant parts tested. In comparison of diagnostic efficacy of this technique to enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA), PLRV infected potato plants showed corresponding increment of the fluorescence of resorcin blue stained callose as absorption values in ELISA increased. In the future, the criteria measuring the fluorescence objectively are thought to be determined for the practical application to the diagnosis of potato leafroll disease.
세포막에서의 지방산 이동은 매우 빠르게 일어나므로 방사성 원소를 사용해서는 여러가지 단점이 있고, 정확한 이동속도 측정에도 어려움이 많았다 최근에 개발된 FRET assay는 형광성 물질과 형광성 물질을 상쇄시키는 quencher를 사용한 실험방법 이다. 이는 공명 에너지 이동의 원리를 이용한 것으로 형광광도계, stopped-flow장치를 사용하여 소수성 물질 이동을 직접 컴퓨터 모니터로 측정하는 방법으로 기존방법의 단점을 보완하였다. Donor막에는 형광성 표지를 붙인 지방산이 들어 있고 acceptor막에는 형광을 흡수하는 물질이 들어 있어서 형광성 지방산이 donor에서 acceptor로 이동하면 형광도가 감소하며, 시간에 따른 형광도 감소를 측정하여 지방산 이동속도를 측정하는 방법이다. 형광성 표지를 이용하여 소수성 물질 이동에 사용되는 또 다른 방법은 self-Quenching assay이다. 형광 물질의 농도가 높아지면 서로 형광을 흡수하는 성질을 이용한 방법으로 주로 micelle에서의 물질 이동에 많이 쓰인다. Donor micelle에는 높은 농도의 형광성 지방산이 들어 있고 acceptor micelle에는 형광성 지방산이 들어 있지 않을 때 형광성 지방산이 donor에서 acceptor로 이동하면 형광도가 증가하게 되고 시간에 따른 형광도 증가를 측정하는 방법이다.
본 연구는 식물세포막을 파괴시켜 제초활성을 나타내게 하는 화합물(막과산화형 제초제)을 미지의 많은 화합물로부터 신속하게 탐색하기 위한 새로운 검정법을 확립하기 위하여 실시되었으며, 확립한 전체적인 검정과정은 다음과 같다. 96-well microplate에 시험용액 $200{\mu}L$ 넣고 여기에 오이자엽으로부터 적출한 직경 4 mm의 절편 1개씩을 띄운다. 항온실의 광조건 하에서 회전진탕기로 조금씩 흔들어주면서 8시간 배양한 후 절편을 제거한 다음, 배양액에 HVA와 HRP를 첨가하여 반응시킨 후 마이크로평판용 형광검출기를 이용하여 형광도(Ex 320 nm, Em 425 nm)를 측정한다. 형광변화량이 높을수록 제초활성이 높은 것으로 판단한다. 본 방법은 96-well microplate에서 작업을 수행할 수 있고 형광검출 기술을 이용함으로써 검정과정과 작업을 간편하게 하여 검정효율을 기존보다 현저히 높인 것이 특징이다. 아울러 활성검정을 추출된 효소가 아닌 잎 절편수준에서 수행하기 때문에 보다 실용화에 근접한 정량적 데이터를 얻을 수 있는 장점을 가진다.
We present a microfluidic chip designed for the detection of antibody by using quantum dots fluorescence and a microbead-based assay. A custom designed PDMS microfluidic chip with multi-layer channel is utilized for capturing microbeads; antibody injection into each micro-well; QD injection; and fluorescence detection. The experiment using the fabricated microfluidic chip has been performed on solutions with various concentrations of antibody and has shown correlated fluorescent intensities.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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