• 미생물학회지
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• 제43권2호
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• pp.116-123
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• 2007

본 연구는 부산지역 하천에서 plasmid 매개성 광범위 ${\beta}-lactam$ 분해효소(extended spectrum ${\beta}-lactamase;\;ESBL$)를 생성하는 세균을 분리하여 생성된 광범위 ${\beta}-lactam$ 분해효소를 유형별로 분류하기 위함이다. Escherichia coli 6균주와 Klebsiella pneumoniae 15균주가 피전달균주인 Escherichia coli J53 $Azid^{R}$에 plasmid 매개성 광범위 ${\beta}-lactam$ 분해효소 생성 인자를 전달하였다. PCR 후 얻은 유전인자를 plasmid로 매개된 광범위 ${\beta}-lactam$ 분해효소 유전자의 염기서열 분석결과, E. coli와 K. pneumoniae 유전자를 BCM Search Launcher 및 GenBank nucleotide database를 통하여 검색한 결과 ESBL 유형은 TEM-52형과 SHV-12형이었다. TEM-52는 E. coli와 K. pneumoniae 양쪽에서 분리되었다. 그러나 SHV-12는 K. pneumoniae에서만 분리되었다. 이상의 결과로부터 plasmid 매개성 광범위 ${\beta}-lactam$ 분해효소를 생성하는 세균이 한국에서는 이미 임상범위를 넘어 자연계까지 확산되었음을 알 수 있었다.

• 대한임상검사과학회지
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• 제41권4호
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• pp.153-157
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• 2009

The production of extended-spectrum ${\beta}$-lactamases ($ESBL_S$) of the TEM or SHV type by bacterial pathogens is a major threat to the use of the clinically important expanded-spectrum cephalosporins. The characterization of the SHV ESBLs producing Klebsiella pneumoniae strains present in clinical isolates is time-consuming processes. We describe here in the development of a novel system, which consists of a real time PCR. We found 11 K. pneumoniae strains to be presumptive strains ESBLs producers by clinical and laboratory standards institute (CLSI) guidelines. The double disk synergy test showed 8 ESBL positive and conventional PCR showed 10 SHV ESBL positive, which were K. pneumoniae strains isolates. By real time PCR analysis, SHV gene in 11 of 11 strains were identified. When sequencing analysis was compared with real time PCR, both analysis were presented 99% similarity. In this study, we used a rapid, sensitive, and specific real-time PCR (RT-PCR) method for detection of the assay SHV ESBL producing K. pneumoniae strains in clinical isolates.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제16권11호
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• pp.1837-1840
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• 2006

Because there are no unified nomenclature systems for either GES-type or IBC-type extended-spectrum ${\beta}-lactamases$ (ESBLs), we propose a unified and definitive nomenclature system for GES/IBC-type ESBLs. This proposed nomenclature update is greatly helpful in two points: (i) it would not confuse microbiologists studying GES-type ESBLs, fundamentally preventing misleading nomenclature of these antibiotic resistance genes, and (ii) the definitive renaming of GES/IBC-type ESBLs can help some researchers to correctly designate new GES-type ESBLs such as novel enzymes identified trom some nationwide surveys.

• 대한임상검사과학회지
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• 제39권3호
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• pp.161-166
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• 2007

To develop a rapid and reliable single-tube-based PCR technique for detection simultaneously the quinolone resistance qnrA, qnrB and qnrS genes. After multiple alignment, primers were designed to detect known qnr variants. I was used for A total of 43 extented-spectrum ${\beta}$-lactamases (ESBLs) producing Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae isolated from university hospital were tested for screening, as with qnr genes. In optimized conditions, all positive controls confirmed the specificity of the PCR primers. Out of 43 isolates, qnrA genes were detected 19 (44.2%), qnrB genes 5 (11.7%), qnrS genes 15 (34.9%) and 8 (18.6%) isolates were not detected. I report here a fast and reliable technique for rapid screening of qnr positive strains to be used for epidemiological surveys.

• Journal of Microbiology
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• 제43권2호
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• pp.172-178
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• 2005

To determine the prevalence and genotypes of $\beta$-lactamases among clones of a metagenomic library from the cold-seep sediments of Edison seamount (10,000 years old), we performed pulse-field gel electrophoresis, antibiotic susceptibility testing, pI determination, and DNA sequencing analysis. Among the 8,823 clones of the library, thirty clones produced $\beta$-lactamases and had high levels of genetic diversity. Consistent with minimum inhibitory concentration patterns, we found that five ($167\%$) of thirty clones produced an extended-spectrum $\beta$-lactamase. 837- and 259-bp fragments specific to bla$_{TEM}$ genes were amplified, as determined by banding patterns of PCR amplification with designed primers. TEM­1 was the most prevalent $\beta$-lactamase and conferred resistance to ampicillin, piperacillin, and cephalothin. TEM-116 had a spectrum that was extended to ceftazidime, cefotaxime, and aztreonam. The resistance levels conferred by the pre-antibiotic era alleles of TEM-type $\beta$-lactamases were essentially the same as the resistance levels conferred by the TEM-type alleles which had been isolated from clinically resistant strains of bacteria of the antibiotic era. Our first report on TEM-type $\beta$-lactamases of the pre-antibiotic era indicates that TEM-type $\beta$-lactamases paint a picture in which most of the diversity of the enzymes may not be the result of recent evolution, but that of ancient evolution.

• 미생물학회지
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• 제42권2호
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• pp.125-130
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• 2006

본 연구에서는 도축장과 도축물에서 plasmid 매개성 광범위 ${\beta}$-lactam (extended spectrum ${\beta}$-lactamase) 분해효소를 생성하는 Klebsiella pneumoniae와Escherichia coli가 분리됨으로서 한국에서는 이들 균주가 임상범위를 넘어 자연계까지 확산되었음을 확인하였다. 디스크 확산 시험, 등전점 수치, 접합시험 등을 통하여 돼지의 분변으로부터 최종 10균주의 접합자를 얻었고 이들의 형별결정은 아미노산서열분석과 기준주와 대조등을 BCM Search Laucncher 및 NCBI blast를 통해 이루어졌다. 광범위 ${\beta}$-lactam 유형은 Klebsiella pneumoniae 8균주가 TEM-52형이었고 2균주 Escherichia coli가 SHV-12형이었다. CMY-1형은 본 연구에서 분리되지 않았다.

• 대한임상검사과학회지
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• 제38권3호
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• pp.173-178
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• 2006

The production of extended-spectrum ${\beta}$-lactamases ($ESBL_S$) is the main mechanism of bacterial resistance to third-generation cephalosporins and monobactams, whose prevalence varies depending on the different geographical areas. In the last years it has increased notably to the point of being considered a health problem of great importance. The characterization of the ESBLs producing Klebsiella penumoniae strains present in clinical isolates is time-consuming. I describe here the development of a new system, which consists of a multiplex PCR. I found 51 K. pneumoniae strains to be presumptive strains ESBLs producers by clinical and laboratory standards institute (CLSI) guidelines. The double disc synergy test showed 47 positive K. pneumoniae, which were K. pneumoniae isolates. All ESBLs producing K. pneumoniae strains were resistant to antibiotic amikacin, gentamicin and ciprofloxacin. By multiplex PCR analysis, $bla_{TEM}$ gene in 17 strains 44 $bla_{SHV}$ genes and $bla_{CTX}$ genes in 33 strains were identified. In this study, the multiplex polymerase chain reaction (PCR) assay was a good method to detect and differentiate ESBLs producing K. penumoniae strains in clinical isolates.

• Journal of Yeungnam Medical Science
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• 제16권2호
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• pp.270-276
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• 1999

Extended-spectrum ${\beta}$-lactamases(ESBL)은 penicillin과 cephalosporin뿐 아니라 oxyimino-${\beta}$-lactam 제재도 내성을 가지며 Klebsiella pneumoniae와 Escherichia coli의 ESBL 생성율은 전세계적으로 증가하고 있다. 내성율은 ${\beta}$-lactam제의 사용량에 영향을 받으므로 시기, 지역, 병원, 병동 등에 따라서 차이가 있을 수 있어 각 병원에서 발생하는 내성균주를 수시로 파악할 필요가 있다. 이에 저자들은 영남대학교 의과대학 부속병원 미생물 검사실에서 동정된 K. pneumoniae와 E. coli를 대상으로 ESBL 생성율을 구하고 이들 환자의 정보를 분석하여 병원 감염관리와 감염환자의 치료에 지침을 마련하고자 하였다. 실험에 사용된 K. pneumoniae의 51.6%, E. coli의 16.0%에서 ESBL생성 양성을 보였다. 대부분의 ESBL생성 양성 균주는 중환자실과 여기를 거쳐간 환자를 중심으로 동정되어 이들에 대한 치료와 내성균주 전파에 특별한 주의를 요하며 계속적인 변동상황에 주의를 기울여야 할 것으로 생각된다.

• 한국미생물학회:학술대회논문집
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• 한국미생물학회 2009년도 International Meeting of the Microbiological Society of Korea
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• pp.68-69
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• 2009

• 디지털융복합연구
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• 제14권10호
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• pp.349-354
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• 2016

다양한 extended-spectrum ${\beta}$-lactamase (ESBL)를 생성하는 폐렴막대균의 출현 및 확산은 세균에 의한 감염증 치료에 어려움을 가중시키고 있다. 본 연구에서는 충청지역에서 분리된 폐렴막대균을 대상으로 ESBL 유전자를 검출하고 항균제 감수성 양상을 조사하였다. 또한 같은 클론에서 유래하였는지를 확인하기 위해 repetitive element sequence-based (REP)-PCR을 수행하였다. 충청지역에서 분리된 폐렴막대균 102균주 중 21균주가 CTX-M-14 및/또는 CTX-M-15를 생성하는 것으로 나타났으며 이 균주들은 3세대 cephalosporin 계열 항균제에 대해 70% 이상의 높은 내성율을 보였다. 본 연구에서 분리된 CTX-M형 ESBL생성 폐렴막대균은 다양한 클론으로부터 유래되었으며 그 중 일부는 지역사회에 확산되어 있음이 확인되었다. 이러한 폐렴막대균의 감염 및 확산을 방지하기 위해서는 감염관리의 강화가 필요하다. 아울러 좀 더 효과적인 내성세균의 관리를 위해서는 내성유전자의 생물학적 조사와 통계학적 분석을 통해 통합적으로 구축된 데이터베이스를 모니터링 할 필요가 있을 것으로 사료된다.