• 제목/요약/키워드: e-B/L Korea

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Complete genome sequence of functional probiotic candidate Lactobacillus amylovorus CACC736

  • Soyeon Park;Jung-Ae Kim;Hyun-Jun Jang;Dae-Hyuk Kim;Yangseon Kim
    • Journal of Animal Science and Technology
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    • 제65권2호
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    • pp.473-477
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    • 2023
  • Lactobacillus amylovorus CACC736 was originated from swine feces in Korea. The complete genome sequences of the strain contained one circular chromosome (2,057,809 base pair [bp]) with 38.2% guanine-cytosine (GC) content and two circular plasmids, namely, pCACC736-1 and pCACC736-2. The predicted protein-coding genes, which are encoding the clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR)-associated proteins, biosynthesis of bacteriocin (helveticin J), and the related proteins of the bile, acid tolerance. Notably, the genes related to vitamin B-group biosynthesis (riboflavin and cobalamin) were also found in L. amylovorus CACC736. Collectively, the complete genome sequence of the L. amylovorus CACC736 will aid in the development of functional probiotics in the animal industry.

Optical spectroscopy of LMC SNRs to reveal the origin of [P II] knots

  • Aliste C., Rommy L.S.E.;Koo, Bon-Chul;Seok, Ji Yeon;Lee, Yong-Hyun
    • 천문학회보
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    • 제46권2호
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    • pp.65.2-66
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    • 2021
  • Observational studies of supernova (SN) feedback are limited. In our galaxy, most supernova remnants (SNRs) are located in the Galactic plane, so there is contamination from foreground/background sources. SNRs located in other galaxies are too far, so we cannot study them in detail. The Large Magellanic Cloud (LMC) is a unique place to study the SN feedback due to their proximity, which makes possible to study the structure of individual SNRs in some detail together with their environment. Recently, we carried out a systematic study of 13 LMC SNRs using [P II] (1.189 ㎛) and [Fe II] (1.257 ㎛) narrowband imaging with SIRIUS/IRSF, four SNRs (SN 1987A, N158A, N157B and N206), show [P II]/[Fe II] ratio much higher than the cosmic abundance. While the high ratio of SN 1987A could be due to enhanced abundance in SN ejecta, we do not have a clear explanation for the other cases. We investigate the [P II] knots found in SNRs N206, N157B and N158A, using optical spectra obtained last November with GMOS-S mounted on Gemini-South telescope. We detected several emission lines (e.g., H I, [O I], He I, [O III], [N II] and [S II]) that are present in all three SNRs, among other lines that are only found in some of them (e.g., [Ne III], [Fe III] and [Fe II]). Various line ratios are measured from the three SNRs, which indicate that the ratios of N157B tend to differ from those of other two SNRs. We will use the abundances of He and N (from the detection of [N II] and He I emission lines), together with velocity measurements to tell whether the origin of the [P II] knots are SN ejecta or CSM/ISM. For this purpose we have built a family of radiative shock with self-consistent pre-ionization using MAPPINGS 5.1.18, with shock velocities in the range of 100 to 475 km/s. We will compare the observed and modeled line fluxes for different depletion factors.

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Prevalence, Serotype Diversity, Genotype and Antibiotic Resistance of Listeria monocytogenes Isolated from Carcasses and Human in Korea

  • Oh, Hyemin;Kim, Sejeong;Lee, Soomin;Lee, Heeyoung;Ha, Jimyeong;Lee, Jeeyeon;Choi, Yukyung;Choi, Kyoung-Hee;Yoon, Yohan
    • 한국축산식품학회지
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    • 제38권5호
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    • pp.851-865
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    • 2018
  • This study investigated the prevalence of Listeria monocytogenes in slaughterhouses, and determined serovars and genotypes, and antibiotic resistance of the isolates obtained from slaughterhouses and humans in Korea. Two hundred ninety samples were collected from feces (n=136), carcasses [n=140 (cattle: n=61, swine: n=79)], and washing water (n=14) in nine slaughterhouses. Eleven human isolates were obtained from hospitals and the Korea Center for Disease Control and Prevention. Listeria monocytogenes was enriched and identified, using polymerase chain reaction (PCR) and 16S rRNA sequencing. Serovars and presence of virulence genes were determined, and genetic correlations among the isolates were evaluated by the restriction digest patterns of AscI. Antibiotic resistance of L. monocytogenes isolates were examined against 12 different antibiotics. Of 290 slaughterhouse samples, 15 (5.17%) carcass samples were L. monocytogenes positive. Most L. monocytogenes isolates possessed all the virulence genes, while polymorphisms in the actA gene were found between carcass and human isolates. Serovars 1/2a (33.3%) and 1/2b (46.7%) were the most frequent in carcass isolates. Genetic correlations among the isolates from carcass and clinical isolates were grouped within serotypes, but there were low geographical correlations. Most L. monocytogenes isolates were antibiotic resistant, and some strains showed resistance to more than four antibiotics. These results indicate that L. monocytogenes are isolated from carcass and human in Korea, and they showed high risk serotypes and antibiotic resistance. Therefore, intensive attentions are necessary to be aware for the risk of L. monocytogenes in Korea.

충남 공주 제민평야의 홀로세 환경연구 (A Study on the Holocene Environments of the Jemin Plain in Gongju, Chungnam Province)

  • 박지훈;이애진
    • 한국지형학회지
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    • 제24권2호
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    • pp.65-78
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    • 2017
  • In this study, stable carbon isotopic analysis (22 specimens) and magnetic susceptibility analysis (23 specimens) were conducted out on the specimens collected from two points (trench DT1, DT2) in the floodplain of Jemincheon(hereinafter the Jemin plain) to reconstruct the Holocene Environments (Period I, Period II, Period III) of the Jemin plain in Gongju, Chungnam. The results were as follows: In Period I (approximately 7,480~4,940 yrs B.P.) and especially around 7,480~7,320 yrs B.P., it was cool-dry and there were two minor climate fluctuations. This period received a continuous flow of sediments, rather than massive amounts of sediments due to abrupt flooding, and therefore, there was almost no soilization process. Period II(approximately 4,940~2,600 yrs B.P.) was also relatively cool-dry. However, in Period II b, unlike I, the minor climate fluctuations were less pronounced. In this period, flooding and desiccation repeated, inducing soilization processes especially around 3,160 yrs B.P. In Stage III (~360 yrs B.P.), it was warm and humid compared to II b. However, in III a, there was no inflow of sediments due to irregular flooding, and in fact, soilization process was more manifested than during II b due to the impact of the desiccation environment. However, there were some mass movements from Bonghwang Mt. (a.s.l. 147m) caused by heavy rains and typhoon during III b (approximately 360 yrs B.P.), thus moving a large amount of debris (i.e. gravel), which resulted in sedimentation.

Complete genome sequence of Lactococcus lactis strain K_LL005, a xylose-utilizing bacterium isolated from grasshopper (Oxya chinensis sinuosa)

  • Kim, Hyeri;Guevarra, Robin B.;Cho, Jae Hyoung;Kim, Hyeun Bum;Lee, Ju-Hoon
    • Journal of Animal Science and Technology
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    • 제63권1호
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    • pp.191-193
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    • 2021
  • Lactococcus lactis is a fermentative lactic acid bacterium that is used extensively in food fermentations. The L. lactis strain K_LL005 was isolated from the grasshopper (Oxya chinensis sinuosa) gut in Korea. In this study, we reported the complete genome sequence of Lactococcus lactis K_LL005. The final complete genome assembly consist of one circular chromosome (2,375,093 bp) with an overall guanine + cytosine (G + C) content of 35.0%. Annotation results revealed 2,281 protein-coding sequences (CDSs), 19 rRNAs, and 68 tRNA genes. Lactococcus lactis K_LL005 has a gene encoding xylose metabolism such as xylR, xylA, and xylB (xylRAB).

한국에 유통중인 신선편이 채소류의 미생물 품질 및 병원성 세균의 오염도 조사 (Microbial and Pathogenic Contamination of Ready-to-eat Fresh Vegetables in Korea)

  • 배영민;홍유진;강동현;허성기;이선영
    • 한국식품과학회지
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    • 제43권2호
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    • pp.161-168
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    • 2011
  • 신선 농식품은 일반적으로 가열하지 않고 직접 신선한 상태로 섭취하기 때문에 병원성 미생물에 오염되어 있을 경우 식중독을 일으킬 수 있다. 이에 본 연구는 한국에 유통되는 총 20종의 채소에서 총균수, 대장균군, 대장균, 효모, 곰팡이 및 병원성 세균(S. aureus, L. monocytogenes, B. cereus, Salmonella, E. coli O157:H7, C. sakazakii, Shigella, Campylobacter)을 측정하여 신선농식품의 미생물 오염실태를 조사하였다. 채소의 총균수와 대장균군의 분포는 각각 3.74-8.04 log CFU/g, 0.16-5.02 log CFU/g 수준이였으며 이중에서 미나리, 새싹, 숙주, 도라지에서 가장 높은 수준의 미생물이 관찰되었다. 유기농과 비유기농의 상추와 깻잎의 오염도를 관찰했을 때, 두 군의 일반 미생물 수준에는 유의적 차이가 나타나지 않았다. 신선 농식품에 오염된 병원성 세균을 조사하였을 때, 선택배지를 이용한 분리법에서 L. monocytogenes가 배추, 양상추, 오이, 콩나물에서 검출되었고, B. cereus는 상추, 깻잎, 당근, 미나리, 새싹에서 검출되었으며, Campylobacter의 경우는 20종 모두에서 한번 이상 검출되었다. 이중 API kit로 동정한 결과 총 48개의 시료가 양성으로 판명되었으며 마지막으로 real-time PCR법과 16S rRNA sequencing법을 이용하여 확인한 결과 깻잎, 당근, 미나리, 새싹에서 발견된 B. cereus만이 양성으로 확인되었다. 따라서 본 연구결과로부터 몇몇 신선 농식품에서 B. cereus가 검출되었으며 비교적 높은 총균수와 대장균군의 수준을 확인할 수 있었다. 또한 본 연구결과 분리방법에서 선택배지나 API kit를 이용하였을 때 몇몇 병원성 세균에 대해서는 맞지 않는 양성결과가 확인되었으므로 이에 신선 농식품에서 보다 정확하게 분리할 수 있는 방법의 개발이 필요할 것으로 사료된다.

어린잎채소 생산 농장의 위생지표세균과 병원성미생물 오염도 조사 (Investigation of Microbial Contamination Level during Production of Baby Leafy Vegetables)

  • 이은선;곽민규;김원일;안현미;이효섭;류송희;김황용;류재기;김세리
    • 한국식품위생안전성학회지
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    • 제31권4호
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    • pp.264-271
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    • 2016
  • 본 연구는 어린잎 채소와 생산환경에서 미생물학적 오염도를 조사하고자 수행하였다. 이를 위하여 11종의 어린잎채소와 종자, 관개용수, 상토, 작업도구 및 작업자 장갑 등 총 126개의 시료를 채취하여 위생지표세균(대장균군, E. coli)과 병원성미생물(Escherichia coli O157:H7, Salmonella spp., Staphylococcus aureus, Listeria monocytogenes, Bacillus cereus)을 조사하였다. 그 결과, 종자와 관개용수를 제외한 대부분의 시료에서 대장균군이 검출되었다. E. coli는 분석시료 중 10.3% (13/126)에서 검출되었으며 검출된 시료로는 관개용수, 칼, 작업자 장갑, 및 다채, 적무, 청경채였다. 또한 B. cereus는 상토, 작업도구 및 청경채, 비트, 적근대 등 총 38% (48/126)의 시료에서 검출되었다. 한편 E. coli O157:H7, Salmonella spp., L. monocytogenes는 검출되지 않았다. 본연구의 결과로 미루어 볼 때 어린잎채소는 미생물 안전성면에서는 크게 우려할 수준은 아니지만 어린잎채소의 미생물오염을 사전 예방하는 차원에서 농업현장에서 쉽게 실천할 수 있는 위생관리 기술 개발과 보급이 필요하다고 판단된다.

국내 생산단계 농산물의 미생물학적 안전성 조사 (Investigation of Microbiological Safety of on-farm Produce in Korea)

  • 김원일;곽민규;조아라;류상돈;김세리;류송희;김황용;류재기
    • 한국식품위생안전성학회지
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    • 제32권1호
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    • pp.20-26
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    • 2017
  • 국제적으로 식중독 세균이 오염된 농산물의 신선 섭취에 따른 식중독 사고가 빈번하게 발생되고 있다. 본 연구는 국내 생산단계 수박, 참외, 고추, 당근, 상추, 배추, 양배추, 셀러리, 버섯, 보리, 옥수수, 복숭아, 포도를 대상으로 위생지표세균과 식중독 세균의 오염도를 분석하였다. 2013년부터 2015년까지 각 작물별로 3곳 이상의 주산지에서 총 1,820점의 시료를 수집하여 일반호기성세균, 대장균군, B. cereus, S. aureus의 정량적 분석과 E. coli, E. coli O157:H7, Salmonella spp., L. monocytogenes의 정성적 분석을 수행하였다. 일반호기성세균은 전체 시험대상 농산물에서 0.01~7.18 log CFU/g 범위의 밀도를 나타냈고, 대장균은 총 651점의(35.8%) 시료에서 나타났다. B. cereus는 0.01~2.48 log CFU/g 범위로 총 169점의(9.3) 시료에서 나타났고, S. aureus는 총 14점의(0.7%) 시료에서 0.01~1.69 log CFU/g 범위로 나타났다. 정성적 분석에서 E. coli는 총 101점의(5.5%) 시료에서 양성인 것으로 나타났고, E. coli O157:H7, Salmonella spp., L. monocytogenes는 모두 음성인 것으로 나타났다. 본 연구 결과를 통해 국내 생산단계 농산물의 전반적인 미생물학적 오염도를 파악할 수 있고 농산물 중 미생물 기준 설정 등에 대한 과학적 근거로써 미생물위험평가(Microbiological Risk Assessment)의 기초자료로써 활용이 가능할 것으로 기대한다.

흰털오가피와 더덕 추출물을 첨가한 발효유 급여가 마우스의 면역기능에 미치는 영향 (Effects of Fermented Milk Containing Herb Extract from Acanthopanax divaricatus var. albeofructus and Codonopsis Ianceolata on the Immune Status of Mouse)

  • 임상동;성기승;김기성;한동운
    • 한국축산식품학회지
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    • 제27권1호
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    • pp.95-101
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    • 2007
  • 흰털오가피의 면역활성 증진 효과를 알아보기 위하여 선발된 수컷 마우스를 대상으로 하여 발효유에 흰털오가피 (뿌리 : 잎 : 줄기)와 더덕 열수추출건조물을 (5 : 2 : 1.5) : 1.5 비율로 혼합하여 투여한 그룹 1 mg/mL(A), 3 mg/mL(B), 9 mg/mL(C) 3그룹으로 나누어 임상적용 경로인 경구투여를 선택하여 발효유를 각각 3 mL/kg씩 위내로 직접 투여하였다. 대조군은 발효유만 먹인 그룹(D)과 식염수만 먹인 그룹(E)을 두었다. 흰털오가피의 함량이 ICR계 수컷 마우스의 면역기능에 미치는 영향에 대해 알아본 결과 모든 그룹에서 마우스의 증체량과 체중 증가는 유의성 있는 차이를 보이지 않았고, 7주와 10주령에 안락사 시킨 마우스의 각 장기 무게에서도 간, 신장, 심장, 폐, 고환의 무게에서는 유의성 있는 차이를 보이지 않았다. 비장계수는 7주령 C군과 10주령 B군에서 유의성(p<0.05)있는 증가가 있었으며, 식이 지속기간이 길어질수록 증가된 반면, 흉선계수는 모든 군에서 유의성 있는 증가가 관찰되지 않았다. 항체생산 세포수는 흰털오가피 투여군이 대조군에 비해 증가하였으며, 7주령에 비해 10주령이 감소하는 경향을 보였다. 항원에 대한 항체 생성량을 알아보기 위하여 혈구응집반응을 실시한 결과 흰털오가피 투여군이 대조군에 비하여 증가하는 경향을 보였고 10주령 C군에서 유의성 있는 차이를 보였다. 면역글로블린 농도는 흰털오가피 투여군에서 증가하였고, 7 및 10주령 C군에서 유의성이 있었다.

고추와 고추 재배 토양의 미생물 오염도 조사 (Evaluation on Microbial Contamination in Red Pepper and Red Pepper Cultivated Soil in Korea)

  • 정보름;서승미;전혜진;노은정;김세리;이데레사;류재기;류경열;정규석
    • 한국식품위생안전성학회지
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    • 제33권5호
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    • pp.347-353
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    • 2018
  • 고추는 한국의 식생활에서 필수적인 향신료로서 대부분이 건조 보관되면서 소비되고 있으며 식품 제조용 및 조미료로써 광범위하게 활용되고 있다. 고추와 고추 재배 토양에서 미생물 오염도를 확인하고자 본 연구에서는 고추 재배 농가(I, II, III, IV, V)에서 시료를 채취하여 일반세균수, 대장균군, 대장균은 정량적 분석을 수행하였고, Salmonella spp., E. coli O157:H7, L. monocytogenes, B. cereus는 정성적 분석을 수행하였다. 고추 63점과 재배 토양 54점의 일반세균수는 각각 2.97~8.13 log CFU/g, 5.91~7.65 log CFU/g이었고 재배 토양이 고추보다 좀 더 높은 미생물 분포를 보였다. 대장균군은 고추에서, 그 범위가 1.87~6.71 log CFU/g 수준으로 나타났고 재배 토양에서, 그 범위는 0.67~6.16 log CFU/g 수준으로 나타났다. 대장균은 고추에서는 전혀 검출되지 않았고 토양 시료 54점 중3점(6%)에서 0.83~4.36 log CFU/g 수준으로 검출되었다. 5개 농가의 고추, 재배 토양 시료에서 Salmonella spp., E. coli O157:H7, L. monocytogenes등은 검출되지 않았고, B. cereus는 고추 63점 중 3점(5%)에서 검출되었고 재배 토양 54점 중 53점(98%)에서 검출되었다. 농산물에서의 미생물 오염은 생산, 가공, 유통의 전 과정에서 일어날 수 있으므로 각 단계에서의 철저한 위생관리가 요구된다.