• Biotechnology and Bioprocess Engineering:BBE
• /
• 제11권3호
• /
• pp.179-186
• /
• 2006

End-Labeled Free-Solution Electrophoresis (ELFSE) is a new technique that is a promising bioconjugate method for DNA sequencing (or separation) and genotyping by both capillary and microfluidic device electrophoresis. Because ELFSE enables high-resolution electrophoretic separation in aqueous buffer alone (i.e., without a polymer matrix), it eliminates the need to load viscous polymer networks into electrophoresis microchannels. To achieve microchannel DNA separations with high performance, ELFSE requires monodisperse perturbing entities (i.e., drag-tags), which create a large amount of frictional drag when pulled behind DNA during free-solution electrophoresis, and which have other properties suitable for microchannel electrophoresis. In this article, the theoretical concepts of ELFSE and the required characteristics of the drag-tag molecules for the ultimate performance of ELFSE are reviewed. Additionally, the merits and limitations of current drag-tags are also discussed in the context of recent experimental data of ELFSE separation (or sequencing).

• KSBB Journal
• /
• 제25권2호
• /
• pp.199-204
• /
• 2010

Drag-tag으로 사용될 반복단위 단백질을 생물학적인 방법을 통해 생산함으로써 수용액 내에서 DNA 분리가 가능함을 확인하였다. 서로 다른 크기를 갖는 두 종류의 반복단위 단백질을 디자인하였고, 이를 발현시킨 뒤 정제하였다. 정제된 반복단위 단백질에 형광 dye를 포함하고 있는 100 base의 DNA를 연결하였고, 이 연결 물질을 모세관 내부가 수용액으로 충진된 microchip 상에서 전기영동 하였다. 그 결과 생물학적으로 생산된 반복단위 단백질이 SNP 분석과 같은 빠르고 효율적인 DNA 분석에 적합한 후보물질로 사용될 수 있음을 확인하였다.

• KSBB Journal
• /
• 제22권4호
• /
• pp.179-184
• /
• 2007

본 연구는 특정 아미노산들로 구성된 단위체가 반복되는 형태를 가지는 반복단위 단백질을 유전공학적으로 합성하는 방법들과 응용사례들을 소개하고 있다. 유전공학적 합성법은 단위체의 반복횟수를 정확하게 제어하면서 인식부위의 제한을 없애서 원하는 단백질만을 발현할 수 있도록 발전해왔으며, 최근 소개된 RDL과 CCM 방법에 의하여 가능해졌다. 반복단위 단백질의 응용사례로는 대표적으로 ELP, SLP, Prolamin 등의 단백질을 합성하여 생체재료나 약물전달시스템을 개발하는데 응용하거나, ELFSE의 drag-tag 개발에 응용되는 연구들이 진행되고 있다. 화학적으로 합성된 고분자에 비해 유전공학적으로 합성된 반복단위 고분자의 경우, 고유의 물리적 성질과 함께 환경에 미치는 유해함이 상대적으로 적다는 점 때문에 미래의 신소재로 기대되고 있다.