• Fisheries and Aquatic Sciences
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• 제21권3호
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• pp.5.1-5.8
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• 2018

Stimulator of interferon gene (STING) is induced by various inflammatory agents, such as lipopolysaccharide and microbial pathogens, including virus and bacteria. In this study, we obtained a full-length cDNA of a STING homolog from olive flounder using rapid amplification of cDNA ends PCR technique. The full-length cDNA of Paralichthys olivaceus STING (PoSTING) was 1442 bp in length and contained a 1209-bp open reading frame that translated into 402 amino acids. The theoretical molecular mass of the predicted protein sequence was 45.09 kDa. In the PoSTING protein, three transmembrane domains and the STING superfamily domain were identified as characteristic features. Quantitative real-time PCR revealed that PoSTING expressed in all the tissues analyzed, but showed the highest level in the spleen. Temporal expression analysis examined the significantly upregulated expression of PoSTING mRNA after viral hemorrhagic septicemia virus (VHSV) stimulation. In contrast, no significant changes in the PoSTING expression were detected in Edwardsiella tarda-challenged group compared to the un-injected control. The expression of P. olivaceus type I interferon (PoIFN-I) was also highly upregulated upon VHSV challenge. These results suggest that STING might be involved in the essential immune defense against viral infection together with the activation of IFN-I in olive flounder.

• Archives of Pharmacal Research
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• 제23권5호
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• pp.525-530
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• 2000

mST3GaIV synthesizes ganglioside GM3, the precursor for simple and complex a- and b- series gangliosides, and the expression and regulation of mST3GaIV (CMP-NeuAc: lactosylceramide $\alpha$2,3-sialyltransferase) activity is central to the production of almost all gangliosides, a class of glycosphingolipids implicated in variety of cellular processes such as transmembrane signaling, synaptic transmission, specialized membrane domain formation and cell-cell interactions. To understand the developmental expression of mST3GaIV in mice, we investigated the spatial and temporal expression of mST3GaIV mRNA during the mouse embryogenesis [embryonic (E) days; 19, E11, E13, E15] by in situ hybridization with digoxigenin-labeled RNA probes. All tissues from 19 and E11 were positive for mST3GaIV mRNA. On E13, mST3GaIV mRNA was expressed in various neural and non-neural tissues. In contrast to these, on E15, the telencephalon and liver produced a strong expression of mST3GaIV which was a quite similar to that of E13. In this stage, mST3GaIV mRNA was also expressed in some non-neural tissues. These data indicate that mST3GaIV is differently expressed at developmental stages of embryo, and this may be importantly related with regulation of organogenesis in mice.

• Molecules and Cells
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• 제42권4호
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• pp.345-355
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• 2019

Eosinophilic chronic rhinosinusitis with nasal polyps (CRSwNP) is one of the most challenging problems in clinical rhinology. FZD5 is a receptor for Wnt5A, and its complex with Wnt5A contributes to activating inflammation and tissue modification. Nasal polyps and eosinophil/non-eosinophil counts are reported to be directly correlated. This study investigated the expression and distribution of FZD5, and the role of eosinophil infiltration and FZD5 in eosinophilic CRSwNP pathogenesis. The prognostic role of eosinophil levels was evaluated in seven patients with CRSwNP. Fifteen patients with CRS were classified based on the percentage of eosinophils in nasal polyp tissue. Methylated genes were detected using methylCpG-binding domain sequencing, and qRT-PCR and immunohistochemistry were used to detect FZD5 expression in nasal polyp tissue samples. The results showed that mRNA expression of FZD5 was upregulated in nasal polyps. FZD5 expression was significantly higher in nasal polyp samples from patients with eosinophilic CRSwNP than in those from patients with non-eosinophilic CRSwNP, as indicated by immunohistochemistry. Furthermore, inflammatory cytokine levels were higher in eosinophilic CRSwNP-derived epithelial cells than in normal tissues. In conclusion, FZD5 expression in nasal mucosal epithelial cells is correlated with inflammatory cells and might play a role in the pathogenesis of eosinophilic CRSwNP.

• IMMUNE NETWORK
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• 제20권5호
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• pp.39.1-39.13
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• 2020

Sjögren's syndrome (SS) is a chronic and systemic autoimmune disease characterized by lymphocytic infiltration in the exocrine glands. In SS, type I IFN has a pathogenic role, and recently, inflammasome activation has been observed in both immune and non-immune cells. However, the relationship between type I IFN and inflammasome-associated pyroptosis in SS has not been studied. We measured IL-18, caspase-1, and IFN-stimulated gene 15 (ISG15) in saliva and serum, and compared whether the expression levels of inflammasome and pyroptosis components, including absent in melanoma 2 (AIM2), NLR family pyrin domain containing 3 (NLRP3), apoptosis-associated speck-like protein (ASC), caspase-1, gasdermin D (GSDMD), and gasdermin E (GSDME), in minor salivary gland (MSG) are related to the expression levels of type I IFN signature genes. Expression of type I IFN signature genes was correlated with mRNA levels of caspase-1 and GSDMD in MSG. In confocal analysis, the expression of caspase-1 and GSDMD was higher in salivary gland epithelial cells (SGECs) from SS patients. In the type I IFN-treated human salivary gland epithelial cell line, the expression of caspase-1 and GSDMD was increased, and pyroptosis was accelerated in a caspase-dependent manner upon inflammasome activation. In conclusion, we demonstrate that type I IFN may contribute to inflammasome-associated pyroptosis of the SGECs of SS patients, suggesting another pathogenic role of type I IFN in SS in terms of target tissue -SGECs destruction.

• 한국발생생물학회지:발생과생식
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• 제17권4호
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• pp.299-309
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• 2013

Transforming growth factor (TGF) family is well known to induce the chondrogenic differentiation of mesenchymal stem cells (MSC). However, the precise signal transduction pathways and underlying factors are not well known. Thus the present study aims to evaluate the possible role of C2 domain in the chondrogenic differentiation of human mesenchymal stem cells. To this end, 145 C2 domains in the adenovirus were individually transfected to hMSC, and morphological changes were examined. Among 145 C2 domains, C2 domain of protein kinase C eta ($PKC{\eta}$) was selected as a possible chondrogenic differentiation factor for hMSC. To confirm this possibility, we treated $TGF{\beta}3$, a well known chondrogenic differentiation factor of hMSC, and examined the increased-expression of glycosaminoglycan (GAG), collagen type II (COL II) as well as $PKC{\eta}$ using PT-PCR, immunocytochemistry and Western blot analysis. To further evaluation of C2 domain of $PKC{\eta}$, we examined morphological changes, expressions of GAG and COL II after transfection of $PKC{\eta}$-C2 domain in hMSC. Overexpression of $PKC{\eta}$-C2 domain induced morphological change and increased GAG and COL II expressions. The present results demonstrate that $PKC{\eta}$ involves in the TGF-${\beta}3$-induced chondrogenic differentiation of hMSC, and C2 domain of $PKC{\eta}$ has important role in this process.

• 인지과학
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• 제21권4호
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• pp.447-458
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• 2010

시간 정보는 문서나 문장 등에서 매우 중요한 정보로 사용되기 때문에 다양한 종류의 데이터에서 시간 정보의 인식은 매우 중요하다. 시간 정보는 일정한 형태를 가진 것으로 간주되지만 실제 사용되는 시간 표현은 매우 다양하고 복잡하며 정보의 일부가 빈번하게 생략되는 경우가 발생한다. 본 연구에서는 시간 표현의 추출뿐만 아니라 추출된 표현을 정규화된 표준 형식으로 변환하는 범용 시간 표현 추출 및 변환 시스템을 제안한다. 다양한 시간 표현의 추출과 변환에 필요한 노력을 줄이고 새로운 데이터에 대한 확장성을 보장하기 위해 기본 시간 단위를 정의하였다. 추출단계에서는 기본 시간 단위의 조합으로 구성된 사전을 사용하여 가능한 시간 표현들을 추출한다. 정규화 변환 단계에서는 인접 추출 정보와 기준 시간 등을 사용하여 생략된 기본 시간 단위 정보를 복원하고 최종적으로 모든 기본 시간 정보들은 통합되어 정규화된 표준 형식으로 변환된다. 제안한 시스템은 모바일 기기 등의 잡음 환경에서 강인한 성능을 보장하며 영역이나 언어에 대해 독립적이므로 많은 영역에서 응용이 가능하다. 본 연구는 실험에서 다량의 오류가 포함된 SMS 데이터에서 시간 표현 추출 정확도 93.8%, 시간 표현 변환 정확율 93.2%을 보임으로써 오류에 강인하면서도 높은 성능을 유지함을 증명하였다.

• 생명과학회지
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• 제24권12호
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• pp.1269-1275
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• 2014

TALEN은 특정유전자를 표적 하여 knock-out 시킬 수 있는 새로운 개념의 유전자 클로닝 방법이다. TALEN 플라스미드에는 DNA binding 도메인과 Fok1 절단효소 기능이 융합되어 있기 때문에, genomic DNA 의 어느 부위라도 결합할 수 있고, 표적 염기서열을 절단하여 유전자 돌연변이를 유도할 수 있다. 본 연구에서 우리는 SETDB1 HMTase 유전자의 단백질 개시코돈 과 프로모터 -25 upstream 부위를 표적 하는 두 종의 TALEN constructs 를 제작하였다. 이를 위하여 두 단계의 클로닝이 진행되었다. 첫 번째는 모듈벡터에서 pFUS배열벡터로 표적서열을 옮겨 콜로니 PCR을 통해 smear밴드와 Esp1 제한 효소를 이용하여 약 1 kb의 insert가 들어 있음을 확인하였다. 두 번째는 배열 벡터로부터 TALEN 발현벡터로 옮기는 과정을 진행하였으며, 염기서열분석을 통해 확인하였다. 그 결과 최초의 고안된 모듈벡터 서열들이 약 100 bp 간격으로 배열되어 있음을 확인하였다. 제작된 TALEN-DBEX2 construct는 transfection을 통해 SETDB1의 발현이 사라지는 것을 확인하였고, T7E1 분석을 통하여 표적부위에서 돌연변이가 발생하였음을 추정할 수 있었다. 한편, TALEN-DBPR25 transfection을 통하여서도 SETDB1의 발현이 감소하는 현상을 확인 하였다. DBEX2, DBPR25를 이입시킨 HeLa 세포에서 세포 형태가 길어지는 현상을 관찰할 수 있었다. 그러므로 단백질 개시코돈 또는 -25 upstream을 표적 하는 TALEN knock-out 방법은 SETDB1 유전자의 기능연구에 매우 유용하다고 사료된다.

• Journal of Animal Science and Technology
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• 제50권2호
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• pp.265-272
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• 2008

지방세포분화 초기에 중요한 역할을 수행하는 것으로 보고되고 있는 C/EBPβ 유전자를 cloning하기 위하여 한우 26개월령 등심조직을 이용하여 Total RNA를 추출하고 RT-PCR을 수행한 결과 한우 및 흑한우 C/EBPβ는 1047bp, 348 아미노산 서열을 가지고 있었다. 한우 및 흑한우 C/EBPβ의 아미노산 서열을 NCBI에 등록된 Japanese black cattle C/EBPβ(NCBI accession No. NM_176788) 비교한 결과 약 97%의 상동성을 나타내었다. 또한 인간, 닭, 생쥐, 쥐의 C/EBPβ 아미노산 서열을 비교한 결과 각각 96%, 58%, 74%, 75%의 상동성을 나타내었다. 그러나 각 종간의 leucine zipper domain간의 상동성은 매우 높게 나타났다. 한우 C/EBPβ의 발현은 폐, 등심, 지방조직에서 나타나고 있으나, 지방조직에서 좀 더 많은 발현을 보이고 있었다. 그리고 C/EBPβ 유전자의 bZIP 영역에서 polymorphism이 나타나지 않음을 확인하였다.

• 한국콘텐츠학회논문지
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• 제20권3호
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• pp.200-208
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• 2020

웹의 활용과 기술의 발전으로 웹 디자인 영역은 점차 확대되어 가고 있지만, 관련 연구는 미비한 실정이다. 이에 웹 디자인의 변천 과정을 연구함으로써 웹 디자인 시장의 중요성을 인식하고, 향후 디자인 방향을 제시하고자 한다. 본 연구에서는 디자인의 표현기법 발현과 진화 배경과 디자인에 영향을 주는 정보기술의 흐름을 고찰하고, 이를 바탕으로 웹 디자인 변천 과정 분석 연구를 수행하였다. 이는 앞으로의 웹 디자인 영역 확장을 위한 기초 연구 자료로서 의의가 있다고 판단된다. 연구 범위로는 웹의 역사 30년을 기준으로 1990년부터 2000년대 초까지는 당시 이슈가 되었t던 웹 사이트 자료를 대상으로 하였고, 2000년대 중반부터는 웹 어워드 코리아의 대상 수상작을 분석 대상으로 선정하여 디자인 표현기법의 조형적 특성과 웹 디자인에 영향을 준 정보기술 특성을 분석하는 방법으로 연구를 수행하였다. 연구 결과 디자인 표현기법의 변화는 미니멀리즘과 스큐어모피즘으로 크게 나눌 수 있었고, 정보기술이 발전함에 따라 영향을 받으며 웹 디자인을 표현하는 방식이 다양하게 변화하는 것을 알 수 있었다. 앞으로도 다양한 디바이스의 출현과 영상 콘텐츠 활성화로 이와 조화를 이룰 수 있는 미니멀리즘의 영향을 받은 디자인이 지속할 것으로 예측된다.

• 생명과학회지
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• 제17권3호통권83호
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• pp.375-380
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• 2007

Dynamin은 여러 종류의 endocytosis 과정에서 최종적으로 endocytic vesicle을 membrane으로부터 분리하는데 중요한 역할을 하는 단백질이다. 이전의 보고에 의하면 dynamin-2는 Ras에 의해 암화된 세포에서 Ras signal의 신호 전달 단백질인 Grb2의 SH3 domain과 결합한다고 알려져 있다. 하지만 정상적인 세포 (NIH3T3)에 비해 Ras에 의해 암화된 세포 (NIH3T3(Ras))에서 이들 단백질의 발현이 높아지는지에 대해서는 아직 알려진 바가 없다. 본 연구에서는 먼저 NIH3T3 세포와 NIH3T3(Ras) 세포에서 dynamin-2와 Grb2의 단백질 발현을 보았는데, dynamin-2의 경우 NIH3T3 세포에 비해 NIH3T3(Ras) 세포에서 그 발현이 현저히 증가함을 볼 수 있었지만 Grb2의 경우 두 세포에서 발현의 차이를 관찰할 수 없었다. Competitive PCR을 이용하여 mRNA의발현정도를 확인하였을 때, 단백질 발현 정도와 마찬가지로 dynamin-2의 경우 NIH3T3(Ras) 세포에서 약 100배의 증가를 확인하였지만 Grb2의 경우 차이를 볼 수 없었다. Dynamin-2의 promoter 활성을 NIH3T3(Ras) 세포에서 관찰한 결과 start codon으로부터 300 bp에서 200 bp upstream에 dynamin-2의 promoter 활성을 조절하는 부위가 존재함을 확인할 수 있었다.