Recent trends in generating multiple, large-scale datasets provide new challenges to manipulating the relationship of different types of components, such as gene expression and drug response data. Integrative analysis of compound response and gene expression datasets generates an opportunity to capture the possible mechanism of compounds by using signature genes on diverse types of cancer cell lines. Here, we integrated datasets of compound response and gene expression profiles on NCI60 cell lines and constructed a network, revealing the relationship for 801 compounds and 341 gene probes. As examples, obtusol, which shows an exclusive sensitivity on a small number of colon cell lines, is related to a set of gene probes that have unique overexpression in colon cell lines. We also found that the SLC7A11 gene, a direct target of miR-26b, might be a key element in understanding the action of many diverse classes of anticancer compounds. We demonstrated that this network might be useful for studying the mechanisms of varied compound response on diverse cancer cell lines.
Journal of the Korean Society of Physical Medicine
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v.8
no.4
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pp.539-547
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2013
PURPOSE: This study examined the effects of exercise of diverse intensities on the expression of TNF-${\alpha}$(tumor necrosis factor-${\alpha}$) in the spinal cord in osteoarthritic rats. METHODS: Over a period of four weeks, the authors applied treadmill exercise programs of diverse intensities to Sprague-Dawley rats, to which intra-articular injection of monosodium iodoacetate(MIA, $3mg/50{\mu}l$, diluted in saline) was applied to the right knee joint to induce osteoarthritis. The four-week exercise program was not carried out with the control group(CG, n=10). Exercise programs of applicable intensities were applied to the low-intensity exercise group(LEG, n=10), moderate-intensity exercise group (MEG, n=10), and high-intensity exercise group(HEG, n=10) over the four weeks. Observations were made of expression of TNF-${\alpha}$ in the spinal cord in osteoarthritic rats using western blot analysis. RESULT: there were significant differences(p<.05) in the comparison of expression of TNF-${\alpha}$ between the four groups involved. The expression of TNF-${\alpha}$ in the spinal cord, the LEG and HEG had more elevated expression significantly than the CG(p<.05). But the MEG had reduced expression significantly than the CG(p<.05). CONCLUSION: These study results suggest that moderate-intensity exercise is effective in inhibition TNF-${\alpha}$ in the spinal cord. They also indicate that in prescribing exercise to treat osteoarthritic patients, exercise of moderate intensity is most suitable to patients' chronic pain, rather than low or high intensity.
In relation to spatial expression, the remediation theory of Jay David Bolter & Richard Grusin shows a sufficient possibility of providing extended idea and experience through the space of critical representation. The remediation theory discussed in the scope of new media says about the existence method and the development process of media through immersion into media and awakening, and one attribute of remediation which aims at the extension of another realistic experience and recognition through various media, contains common denominators which display diversity and complexity of installation space, and use the audience as expression elements. Therefore, this study aims to apply the remediation theory in order to interpret space using more diverse and multisensory expression methods. For achieving this purpose, this study found the connection among characteristics of hypermediacy which is an axis of installation and remediation theory, and analyzed diverse cases regarding installation space and characteristics of hypermediacy, depending on external aspects of form and expression and internal aspects of experience and cognition. The method of hypermediation expression in installation space converts the recognition about the basic custom of new experience, space and representation. This means that the logic of remediation could approach space by leading to more extended form and recognition. In conclusion, the characteristics of space and the possibility of extended expression revealed in the relationship between installation space and hypermediacy logic would provide another developmental significance for research on space design.
We assessed heterologous protein expression in 64 strains obtained from the Escherichia coli Reference (ECOR) collection, a collection representing diverse natural E. coli populations. A plasmid generating a glutathione S-transferase and plant carbonic anhydrase fusion protein (GST-CA) under the control of the tac promoter was introduced into the ECOR strains, and the quantity of the fusion protein was determined by SDS-PAGE. The foreign protein was generated at various levels, from very high (40 strains, high producers) to very low (six strains, low producers). Immunoblotting showed that the high producers expressed approximately 250-500 times more GST-CA protein than the low producers. The results of semi-quantitative RT-PCR showed that the low producers generated mRNA levels comparable to those of the high producers, thereby suggesting that, at least in this case, inefficient translation is a major cause of the low production. We introduced a different plasmid, which expressed a maltose binding protein and plant guanylate kinase fusion protein (MBP-GK) into the six low producers. Interestingly, five of these expressed MBP-GK at very high levels. Thus, we conclude that the production of a particular protein from an expression vector can vary considerably, depending on the host strain. Strains in the ECOR collection could function as useful alternative hosts when a desired level of protein expression is not obtained from commonly used strains, such as E. coli K12 or B derivatives.
Junaid, Muhammad;Lee, Aejin;Kim, Jaehyung;Park, Tae Jun;Lim, Su Bin
Molecules and Cells
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v.45
no.9
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pp.610-619
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2022
Cellular senescence plays a paradoxical role in tumorigenesis through the expression of diverse senescence-associated (SA) secretory phenotypes (SASPs). The heterogeneity of SA gene expression in cancer cells not only promotes cancer stemness but also protects these cells from chemotherapy. Despite the potential correlation between cancer and SA biomarkers, many transcriptional changes across distinct cell populations remain largely unknown. During the past decade, single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) technologies have emerged as powerful experimental and analytical tools to dissect such diverse senescence-derived transcriptional changes. Here, we review the recent sequencing efforts that successfully characterized scRNA-seq data obtained from diverse cancer cells and elucidated the role of senescent cells in tumor malignancy. We further highlight the functional implications of SA genes expressed specifically in cancer and stromal cell populations in the tumor microenvironment. Translational research leveraging scRNA-seq profiling of SA genes will facilitate the identification of novel expression patterns underlying cancer susceptibility, providing new therapeutic opportunities in the era of precision medicine.
Journal of the Korea Fashion and Costume Design Association
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v.15
no.4
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pp.157-173
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2013
In the pleats of the statue in the ancient Greece, a vivid expression is included about clothing, which has organic relationship with a human body. This study examined about diverse expressions of pleats that were shown in the Greek sculpture, based on understanding about a pleat meaning and function, and clothes. As a result, the clothes, which were shown in the statue in the ancient Greece, were reflecting spirit and fashion of the times. The pleats, which were expressed in clothing, are closely related to a human body and simultaneously are those that a sculptor showed own creative intention in a work by reflecting a historical demand, thereby having become an important element of dominating the image in the whole clothing. Also, a change and development in expression were being progressed according to a flow of each period. Amidst what expressiveness based on lines are excellent, the unity and the dynamic formative characteristic were forming the mainstream. The design-based elements related to these characteristics are judged to possibly give many inspirations to designers in the modern fashion design sphere, which is mixed diverse styles, and are considered to be able to be helpful even for establishing newer and more creative design.
The Journal of the Convergence on Culture Technology
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v.6
no.1
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pp.301-312
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2020
This study explores the patterns of the self-expression in terms of sharing the diverse pictures according to SNS use focused on the social relationships, and the effects of the diverse online activities on the off-line activity. The study results show that the more SNS use focused on the social relationships, the more sharing the diverse pictures in SNS as a tool of the self-expression. It also shows that the more SNS use focused on the social relationships and the more sharing the pictures with friends, the more active in off-line activity. Both of online and off-line network activities have the statistically significant positive effects on the life satisfaction, which implies that the more active in online and off-line network activities, the higher the life satisfaction.
Journal of the Korean Society of Physical Medicine
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v.9
no.2
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pp.193-200
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2014
PURPOSE: This study examined the effects of treadmill exercise of diverse intensities on the expression of IL-$1{\beta}$ (interleukine-$1{\beta}$) in the spinal cord in osteoarthritis rats. METHODS: The authors applied treadmill exercise of diverse intensity for 4 weeks to Sprague-Dawley rats to which intra-articular injection of monosodium iodoacetate(MIA, $3mg/50{\mu}l$, diluted in saline) was applied in the right knee joint to induce osteoarthritis. The four-week exercise was not applied to the control group(CG, n=15), while exercise of applicable intensity was applied to the low-intensity exercise group(LEG, n=15), moderate-intensity exercise group (MEG, n=15), and high-intensity exercise group(HEG, n=15) for four weeks. Observations were made of expression of IL-$1{\beta}$ in the spinal cord in osteoarthritis rats using western blot analysis. RESULTS: There were significant differences(p<.05) in the comparison of expression of IL-$1{\beta}$ in the spinal cord between the four groups involved. And the LEG and MEG had reduced expression of IL-$1{\beta}$ significantly than the CG(p<.05); in particular, the MEG showed the lowest expression. On the other hand, the HEG had more elevated expression of IL-$1{\beta}$ significantly than the CG(p<.05). CONCLUSION: As a result, factors that induce neuropathic pain such as IL-$1{\beta}$ are reduced; thus, the recovery of damaged neurons is improved and neuropathic pain is reduced. Further, when prescribing exercise to treat osteoarthritis patients, exercise of moderate intensity suitable for patients' physical conditions, rather than high intensity, maximizes the effects of this therapy.
This research is progressed to look out for efficient expression-elements of eroticism used in advertisements. Since these expressions of eroticism appealing to sex which is one of the primitive instincts of mankind are increasing in advertisements of cosmetic products which are used more often by recent high-rate-growth and the elevation of living conditions. The most usual expression-elements of eroticism in advertisement are exposure, pose, fashion style, make up, hair style and color. To analyze those expression-elements we made four pieces of fashion advertisement photos with four different types and surveyed both fashion majored students and non-fashion majored students. We applied regression analysis, ANOVA, and frequency analysis to verify the hypothesis. We found that in eroticism, the pose was the most important cognitive feature among the expression-elements and degree of cognition are varied according to major field and sexual interest. As a result, degree of cognition which effected by expression-elements will be varied even in same advertisement. In particular, convincing that the pose was the significant factor of eroticism cognition, expression of eroticism in advertisement would be more diverse and daring.
The objective of the study is to analyze expressions of modern fashion in relation to design principle of a science theory, fractal geometry, in order to identify various and multi-layered expressions of fashion. As for methodology, the study interprets principle and characteristics of fractal geometry based on literature review in areas of linguistic, philosophy, sociology and science. The research identifies expressive characteristics of fractal through empirical studies, and applies them to fashion in order to analyze how fractal design principles are reflected in modern fashion in terms of form and significance. Fractal aesthetics pursue order, balance, diversity and openness among disorder and insecurity. They are closely related to the function of modern fashion that works as a multi-layered code, instead of being confined to conventional idea about fashion that "functions" as "wear."
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[게시일 2004년 10월 1일]
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