Cellular autolytic enzyme was isolated from the supernatant fluid of exponentially growing cuiture of Cl. butyricum ID-113. The autolysin was partially pruified by ammonium sulfate fractionation, chromatography on DEAE-Sephadex A-50 and gel filtration through Sephadex G-200. This autolytic enzyme lysed SDS-treated cell wall fractions of Cl. butyricum ID, but not whole cells at all. Its optimum pH and temperature were 5.0 and 37$^{\circ}C$, respectively. This enzyme was relatively stable at neutral pH, but sensitive to heat treatment. Enzyme activity was not influenced by the addition of various divalent cation, but inhibited by Cu$^{++}$.
The gene encoding Thermus caldophilus GK24 polyphosphate kinase (Tca PPK) was cloned and sequenced. The gene contains an open reading frame encoding 608 amino acids with a calculated molecular mass of 69,850 Da. The deduced amino acid sequence of Tca PPK showed a 40% homology to Escherichia coli PPK, and $39\%$ to Klebsiella aerogenes PPK. The Tca ppk gene was expressed under the control of the T7lac promoter on pET-22b(+) in E. coli and its enzyme was purified about 70-fold with $36\%$ yield, following heating and HiTrap chelating HP column chromatography. The native enzyme was found to have an approximate molecular mass of 580,000 Da and consisted of eight subunits. The optimum pH and temperature of the enzyme were 5.5 and $70^{\circ}C$, respectively. A divalent cation was required for the enzyme activity, with $Mg^2+$ being the most effective.
The electrokinetic transport characteristics of salts were investigated using nitrate and sulfate accumulated saline greenhouse soil. Within 8 days, 95% of nitrate was removed from the soil, while sulfate removal was 19% for 8 days. The low removal of sulfate came from adsorption reaction on the soil particles or organic matter and precipitation with calcium. Divalent cations such as calcium and magnesium were transported toward cathode via electromigration, and most monovalent cation such as potassium was removed. The pattern of residual electrical conductivity was similar with that of sulfate. Based on the results, electrokinetic technique is effective to restore nitrate-accumulated saline soil, but is not effective to restore sulfate-accumulated soil.
The main purpose of this research was to examine the adsorption/ion exchange characteristics of radioactive species such as cesium and strontium onto synthetic Na-birnessite (sodium-birnessite). As part of efforts to investigate the sorption behavior of cesium and strontium onto synthetic Na-birnessite, batch isotherm tests were performed under different experimental conditions. Na-birnessite was synthesized by the oxidation of $Mn^{2+}$ ions in sodium hydroxide solution. The synthetic Na-birnessite was characterized by powder x-ray diffraction (XRD), scanning electron microscopy (SEM), energy-dispersive x-ray spectroscopy (EDS), and Brunauer-Emmett-Teller (BET) surface area analysis. Cesium and strontium concentrations were determined by atomic absorption spectroscopy (AAS). The removal efficiency of strontium by Na-birnessite was around 95 % which was much higher than that of cesium (~ 32 %). The results imply that strontium has a higher affinity for Na-birnessite than cesium because strontium, divalent cation leads to larger electrostatic attraction than monovalent cesium.
Phospholipase D(PLD) is the enzyme catalyzing the hydrolysis of the terminal phosphcester bond of phospholipid head group to produce phosphatidic acid and the corresponding base. The effect of spermine on the PLD activity of rat brain mitochondrial preparation was investigated. Spermine, in the presence of oleic acid, activates the rat brain mitochondrial PLD, whose effect was further enhanced by the presence of divalent cation, $Ca^{2+}$, $Mg^{2+}$, and $Ba^{2+}$. Among the various monoamines tested, only histamine at the high concentration was effective in activation the PLD. Polylysine increased the PLD activity, particularly, the longer chain of the molecule activated the PLD more effectively. There was no significant difference in the substrate specificity for the PLD activity between phosphatidylcholine(PC) and phoshpatidylethanolamine (PE). This substrate specifitiy is different from the PE specificity reported for the intestinal mitochondrial PLD.
Park, Hyoung-Ryun;Seo, Jung-Ja;Shin, Sung-Chul;Lee, Hyeong-Su;Bark, Ki-Min
Bulletin of the Korean Chemical Society
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제28권9호
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pp.1573-1578
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2007
Fluorescence quenching of norfloxacin (NOR) by Cu2+, Ni2+, Co2+ and Mn2+ was studied in water. The change in the fluorescence intensity and lifetime was measured as a function of quencher concentration at various temperatures. According to the Stern-Volmer plots, the NOR was quenched both by collisions and complex formation with the same quencher. However, the static quenching had a more important effect on the emission. Large static and dynamic quenching constants support significant ion-dipole and orbital-orbital interactions between NOR and cations. The both quenching constants by Cu2+ were the largest among quenchers. Also, quenching mechanism of Cu2+ was somewhat different. The change in the absorption spectra due to the quencher provided information on static quenching. The fluorescence of NOR was relatively insensitive to both the dynamic and static quenching compared with other quinolone antibiotics. This property can be explained by the twisted intramolecular charge transfer.
The possible mechanism of the DNA strand breaking activity of the hot-water extract of Fructus Chaenomelis (dried fruit of Chaenomeles sinensis) in a closed circular duplex replica form DNA (RFI DNA) was studied through agarose gel electrophresis under various conditions. Induction of DNA strand scission by the hot-water extract of C. sinensis occurred in dose and time-dependent manners. $Cu^{2+}$ was indispensable for the induction of DNA strand breakage. Exogeneous chelating agents inhibited the DNA breaking activity, conforming the catalytic action of $Cu^{2+}$ on generation of free radicals responsible for oxidative damage. Antioxidant enzymes and some radical scavengers were used to investigate the major radical species triggering the DNA strand scission, demonstrating that a highest inhibitory activity was found in the presence of catalase, while less in the presence of tiron (a scavenger for superoxide radical), 2-aminoethyl-isothiuroniumbromide-HBr, cysteamine (scavengers for hydroxyl radical), and 1,4-diazabicyclo [2,2,2] octane (a scavenger for singlet oxygen) in decreasing order. The findings implied that oxygen radical species generated in presence of transition divalent cation during the oxidation of some compounds contained in the hot-water extract of C. sinensis is mainly responsible for inducing genotoxicity.
The physiological effects of oligogalacturonic acid (OGA:D. P. 6-7), a product of acid hydrolysis of polygalacturonic acid (PGA), on ethylene biosynthesis in mung bean (Vigna radiata W.) hypocotyl segments was studied. Among PGA, OGA and monogalacturomic acid (MGA), only OGA stimulated ethylene production in mung bean hypocotyl segments, and the most effective concentraton of OGA was 50$\mu\textrm{g}$/mL. Time course data indicated that this stimulatiion effect of OGA appeared after 90 min incubation period and continued until 24 h. When indol-3-acetic acid (IAA) and 1-aminocyclopropane-1-carboxylic acid (ACC) were treated with OGA to investigate the mechanism of OGA on ethylene production, they did not show synergistic effects on ethylene production. The stimulation of ethylene production by OGA was due to the increase of in vivo ACC synthase activity, but OGA treatment had no effect of in vivo ACC oxidase activity. The effect of aminoethoxy vinyl glycine (AVG) and Co2+, the inhibitor of ethylene synthesis, was siminished a little by the OGA, but the treatment of Ca2+, known to increase ACC, with OGA did not increase the ethylene production, this effect seems to be specific for Ca2+ because other divalent cation, Mg2+, did not show the inhibition of OGA-indyuced ethylene production. It is possible that the OGA adopts a different signal transduction pathway to the ethylene bioxynthesis.
A novel Chryseobacterium sp. JK1 strain isolated from soil had been reported that this isolate produced large amount of extracellular protease at mesophilic temperature in previous study. The optimal temperature and pH of extracellular protease were $40^{\circ}C$ and 7.0, respectively, showing narrow range of optimal temperature and relatively broad activity from pH 6.0 to 9.0. In addition, the protease showed greatest activity against skim milk and lowest against bovine serum albumin (BSA). The protease strongly inhibited by ethylenediaminetetraacetic acid (EDTA), ethylene glycol tetraacetic acid (EGTA) or phenylmethylsulfonyl fluoride (PMSF), and addition of cation $Ag^+$ or $Cu^{2+}$, and slightly inhibited by $Al^{3+}$. No significant inhibition was found with pepstatin, and addition of cation, $K^+$, $Ca^{2+}$, $Na^+$, $Fe^{2+}$ or $Mg^{2+}$. On the contrary, protease was enhanced by addition of divalent cation $Mn^{2+}$ (5 mM). Zymography analysis of concentrated culture supernatant revealed two major bands at 67 and 145 kDa. These results suggest that Chryseobacterium sp. JK1 strain produced extracellular neutral serine proteases which could apply in food industry.
Nano-sized iron colloids are formed as acid mine drainage is exposed to surface environments and is introduced into surrounding water bodies. These iron nanomaterials invoke aesthetic contamination as well as adverse effects on aqueous ecosystems. In order to control them, the characteristics of their behaviour should be understood first, but the cumulative research outputs up to now are much less than the expected. Using zero-valent iron (ZVI) and magnetite, this study aims to investigate the behaviour of iron nanomaterials according to the change in the composition and pH of background electrolyte and the concentration of natural organic matter (NOM). The size and surface zeta potential of iron nanomaterials were measured using dynamic light scattering. Characteristic behaviour, such as aggregation and dispersion was compared each other based on the DLVO (Derjaguin, Landau, Verwey, and Overbeek) theory. Whereas iron nanomaterials showed a strong tendency of aggregation at the pH near point of zero charge (PZC) due to electrostatic attraction between particles, their dispersions became dominant at the pH which was higher or lower than PZC. In addition, the behaviour of iron nanomaterials was likely to be more significantly influenced by cations than anions in the electrolyte solutions. Particularly, it was observed that divalent cation influenced more effectively than monovalent cation in electrostatic attraction and repulsion between particles. It was also confirmed that the NOM enhanced the dispersion nanomaterials with increasing the negative charge of nanomaterials by coating on their surface. Under identical conditions, ZVI aggregated more easily than magnetite, and which would be attributed to the lower stability and larger reactivity of ZVI.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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