• 제목/요약/키워드: cytogenetic study

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Comparative Proteomic Analysis of Human Amniotic Fluid Supernatants with Down Syndrome Using Mass Spectrometry

  • Park, Ji-Sook;Cha, Dong-Hyun;Jung, Jin-Woo;Kim, Young-Hwan;Lee, Sook-Hwan;Kim, Young-Jun;Kim, Kwang-Pyo
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제20권6호
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    • pp.959-967
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    • 2010
  • Down syndrome (DS) is an abnormality of the 21st chromosome that commonly occurs in children born to older women. Thus, amniotic fluid (AF) is usually collected from such women for prenatal diagnosis. This study analyzed human AF supernatants (AFS) using a mass spectrometric (MS) approach to search for candidate biomarkers of a DS pregnancy. The AFS were collected from older pregnant women at weeks 16-18 of their gestation by amniocentesis for cytogenetic analysis. The AFS from the pregnancies carrying DS (n=4) or chromosomally normal (n=6) fetuses, as revealed by the cytogenetic analysis, were then subjected to global protein profiling based on liquid chromatography-electrospray ionization-tandem mass spectrometry (LC-ESI-MS/MS). Affinity chromatography was also applied prior to the LC-ESI-MS/MS to minimize the masking effect of highly abundant albumin and immunoglobulin and thereby increase the diversity of the identified proteins. As a result, at least 30 new AFS proteins were identified and 44 AFS proteins were found to be differentially expressed between the DS and normal cases, where 6 of the proteins were unique to the DS cases and 11 were unique to the chromosomally normal cases. In addition, in the DS cases, 19 AFS proteins were downregulated and 8 were upregulated to varying degrees. A Western blot analysis confirmed the LC-ESI-MS/MS data, indicating that the combined detection of apolipoprotein A-II (apoA-II) and alpha-fetoprotein (AFP) could be a potential tool for diagnosing DS cases.

미꾸라지($Misgurnus$ $mizolepis$)와 미꾸리($M.$ $anguillicaudatus$) 및 유도된 종간 잡종의 세포유전학적 연구 (Cytogenetic Analysis of Reciprocal Hybrids Reveals a Robertsonian Translocation between Mud Loach ($Misgurnus$ $mizolepis$) and Cyprinid Loach ($M.$ $anguillicaudatus$))

  • 이승기;김동수
    • 한국어류학회지
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    • 제24권1호
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    • pp.1-10
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    • 2012
  • 미꾸라지, 미꾸리 및 상반교배를 통해 유도된 종간 잡종의 세포유전학적 분석을 수행하였다. 미꾸라지와 미꾸리의 염색체 수는 각각 2n=48 (12M+4SM+32A), 2n=50 (10M+4SM+36A)이었고, 잡종군들의 염색체수는 각각 2n=49 (11M+4SM+34A)였다. 모든 그룹의 염색체는 동일한 arm number (NF=64)를 갖고 있었으며, 염색체 다형현상, 암수 간 이형의 염색체는 관찰되지 않았다. 적혈구의 크기, DNA 함량을 분석한 결과 잡종군들은 미꾸라지와 미꾸리의 중간 값을 나타냈다. 염색체의 NORs (nucleolar organizing regions)은 모두 동일한 중부염색체 단완부에서 Ag-positive signal이 나타났다. 이상의 결과는 미꾸라지의 1번 중부 염색체와 미꾸리의 차단부 염색체가 Robertsonian 형의 염색체 전좌 과정을 거쳤을 것을 시사한다.

Comparative Cytogenetic Characteristics and Physical Mapping of the 17S and 5S Ribosomal DNAs between Atractylodes japonica Koidz. and Atractylodes macrocephala Koidz.

  • Bang, Kyong-Hwan;Koo, Dal-Hoe;Kim, Hong-Sig;Song, Beom-Heon;Cho, Yong-Gu;Cho, Joon-Hyeong;Bang, Jae-Wook
    • 한국약용작물학회지
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    • 제11권4호
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    • pp.311-315
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    • 2003
  • This study was carried out to compare chromosomal characteristics between Atractylodes japonica and A macrocephala. Cytogenetic analysis was conducted based on karyotype analysis and physical mapping using fluorescence in situ hybridization. As a result of karyotype analysis by feulgen staining, somatic chromosome numbers of A. japonica and A. macrocephala were 2n=24. The length. of the mitotic metaphase chromosomes of A. japonica ranged from $0.70\;to\;1.60{\mu}m$ with a total length. of $12.11{\mu}m$ and the homologous chromosome complement comprised six metacentrics, five submetacentrics and one subtelocentrics. On the other hand, the length of the mitotic metaphase chromosomes of A. macrocephala ranged from $0.90\;to\;2.35{\mu}m$ with a total length of $16.58{\mu}m$ and the homologous chromosome complement comprised seven metacentrics and five submetacentrics. The total length of A. japonica chromosomes was shorter than that of A. macrocephala, but A. japonica had one subtelocentrics (chromosomes 4) different from A. macrocepha1a. chromosomes. The F1SH technique using 17S and 5S rDNA was applied to metaphase chromosomes. The signals for 17S rDNA were detected on the telomeric regions of chromosomes 4 and 5 in both A japonica and A. macrocephala. The 5S rDNA signal was found in the short arm of chromosome 1.

Role of fetal ultrasound in prenatally diagnosed de novo balanced translocations

  • Seong, Eui Sun;Youn, Hye Jin;Park, Min Kyung;Boo, Hye Yeon;Lee, Bom Yi;Ryu, Hyun Mee;Han, You Jung
    • Journal of Genetic Medicine
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    • 제15권1호
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    • pp.8-12
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    • 2018
  • Purpose: This study aimed to investigate fetal ultrasonographic findings in cases of prenatally diagnosed de novo balanced translocations and the role of fetal ultrasound in prenatal genetic counseling. Materials and Methods: We collected cases with de novo balanced translocations that were confirmed in chorionic villus sampling, amniocentesis, and cordocentesis between 1995 and 2016. A detailed, high-resolution ultrasonography was performed for prediction of prognosis. Chromosomes from the parents of affected fetuses were also analyzed to determine whether the balanced translocations were de novo or inherited. Results: Among 32,070 cases with prenatal cytogenetic analysis, 27 cases (1/1,188 incidence) with de novo balanced translocations were identified. Fourteen cases (51.9%) showed abnormal findings, and the frequency of major structural anomalies was 11.1%. Excluding the major structural anomalies, all mothers who continued pregnancies delivered healthy babies. Conclusion: Results of a detailed, high-resolution ultrasound examination are very important in genetic counseling for prenatally diagnosed de novo balanced translocations.

원발성 무월경 환자에 이어서 세포유전학적 연구 (Cytogenetic Studies in 236 Patients with Primary Amenorrhea)

  • 양영호;김창규;최동일;조동제;황동훈;허갑범
    • Clinical and Experimental Reproductive Medicine
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    • 제13권2호
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    • pp.153-159
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    • 1986
  • The high rate of chromosomal abnormalities in patients with primary amenorrhea implies the need for routine screening for chromosomal abnormalities among such patients. This study was designed for the cytogenetic analysis of 236 patients with primary amenorrhea, which was referred to Yonsei University Medical Center, from January, 1, 1974 to December, 31, 1985. The results were as follows: 1. Of the 236 patients, 145 cases (61.4%) showed normal karyotype, and 91 cases (38.6%) showed chromosomal abnormalities. 2. Gonadal dysgenesis was found in 56 cases, consisting of 42 cases, Turner's syndrome, 12 cases, pure gonadal dysgenesis, and 2 cases mixed gonadal dysgenesis. a) Turner's syndrome was found in 42 cases, consisting of 18 cases of 45, X and 24 cases of mosaicism. b) Pure gonadal dysgenesis was found in 12 cases, consisting of 10 cases of 46, XX and 2 cases of 46, XY. c) Mixed gonadal dysgenesis was found in 2 cases, consisting of 1 case of 46, XY and 1 case of 45, X/46, XY. 3. Intersex was found in 80 cases, consisting of 35 cases of 46, XX, and 45 cases of 46, XY. 4. Congenital anomalies of reproductive system was found in 82 cases and all cases were normal karyotype.

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북방전복, Haliotis discus hannai 3배체의 세포유전학적 연구 (Cytogenetic Analysis of the Triploid Pacific Abalone, Haliotis discus hannai)

  • 지영주;장영진
    • 한국패류학회지
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    • 제28권1호
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    • pp.37-43
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    • 2012
  • 북방전복, Haliotis discus hannai의 3배체를 제온자극으로 유도하고 부화유생인 trochophore를 이용하여 염색체 표본을 만들었고, 유도된 3배체와 정상 2배체 북방전복은 실내 유수식의 동일 환경에서 51개월 동안 사육되었으며 채취된 혈구를 채취하여 DNA 함량 측정에 사용되었다. 2배체 및 유도된 3배체의 염색체 수를 조사한 결과, 2배체 염색체 수는 2n = 36으로 나타났고, 3배체의 경우에는 3n = 54로 나타나 3배체는 2배체에 비해 1.5배의 염색체 수를 나타내었다. Flow cytometry로 인간의 백혈구를 control로 하여 북방전복의 DNA 함량을 측정한 결과, 북방전복의 DNA 함량은 1.743 pg/cell이었으며 3배체 북방전복의 DNA함량은 2배체 전복의 1.49배의 DNA 함량을 나타내어 3배체 특성인 모계 2n DNA 함량과 부계 n DNA함량을 나타내었다.

Three cases of rare SRY-negative 46,XX testicular disorder of sexual development with complete masculinization and a review of the literature

  • Lee, Bom Yi;Lee, Shin Young;Lee, Yeon Woo;Kim, Shin Young;Kim, Jin Woo;Ryu, Hyun Mee;Lee, Joong Shik;Park, So Yeon;Seo, Ju Tae
    • Journal of Genetic Medicine
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    • 제13권2호
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    • pp.78-88
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    • 2016
  • Purpose: To identify the clinical characteristics of SRY-negative male patients and genes related to male sex reversal, we performed a retrospective study using cases of 46,XX testicular disorders of sex development with a review of the literature. Materials and Methods:SRY-negative cases of 46,XX testicular disorders of sex development referred for cytogenetic analysis from 1983 to 2013 were examined using clinical findings, seminal analyses, basal hormone profiles, conventional cytogenetic analysis and polymerase chain reaction. Results: Chromosome analysis of cultured peripheral blood cells of 8,386 individuals found 19 cases (0.23%) with 46,XX testicular disorders of sex development. The SRY gene was confirmed to be absent in three of these 19 cases (15.8%). Conclusion: We report three rare cases of SRY-negative 46,XX testicular disorders of sex development. Genes on autosomes and the X chromosome that may have a role in sex determination were deduced through a literature review. These genes, through differences in gene dosage variation, may have a role in sex reversal in the absence of SRY.

자연산 3배체 붕어 (Carassius auratus) 클론 집단에 대한 유전학적 동정 (Genetic Identification on Natural Population of Triploid Crucian Carp, Carassius auraus in Korea)

  • 김응오;이종윤;남윤권;노재구;이상윤;김동수
    • 한국수산과학회지
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    • 제35권6호
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    • pp.589-594
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    • 2002
  • 국내에 서식하는 붕어 (Carassius auratus) 3배체 집단을 동정하고 이들을 대상으로 분자생물학적, 세포유전학적 및 형태학적 특징을 분석하였다. 본 자연산 붕어 3배체 집단은 전형적인 3배체의 세포 유전학적 특성들, 즉 이배체에 비해 1.5배의 세포 및 핵의 크기, 3n=150의 염색체수, 그리고 2배체 (3.6pg/cell)에 비해 1.5배 증가된 DNA 함량 (5.4 pg/cell)을 나타내었다. 또한 본 3배 체붕어 집단은 DNA fingerprinting 분석에 의해 유전적인 구성이 동일한 클론 집단인 것으로 판명되었고 클론 3배체 붕어들은 2배체와 비교시 매우 일양한 형태학적 특성을 나타내었으며 모두 암컷인 전암컷 집단이었다. 본 연구의 분석에 사용된 함안 집단의 3배체 붕어 집단 이외에도 논산, 주문진, 속초 및 삼례 붕어 집단을 대상으로 3배체 출현 빈도를 조사한 결과, 모든 지역에서 $80\%$ 이상의 높은 3배체 빈도를 보였다.

Validation of QF-PCR for Rapid Prenatal Diagnosis of Common Chromosomal Aneuploidies in Korea

  • Han, Sung-Hee;Ryu, Jae-Song;An, Jeong-Wook;Park, Ok-Kyoung;Yoon, Hye-Ryoung;Yang, Young-Ho;Lee, Kyoung-Ryul
    • Journal of Genetic Medicine
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    • 제7권1호
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    • pp.59-66
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    • 2010
  • 목 적: QF-PCR법은 흔한 염색체 이수성에 대한 빠른 산전 진단을 가능하게 하는데, 낮은 가격, 빠른 속도, 그리고 자동화가 가능하여 한꺼번에 많은 검체에 대해 적용할 수 있다는 장점들이 있다. 하지만 아직까지 국내에서 QF-PCR법은 산전 염색체 이수성 선별검사로 주로 사용되는 방법이 아니다. 본 연구에서는 한국인에서 빠른 산전 진단을 목적으로 시행하는 짧은 염기서열 반복(short tandem repeats, STR) 표지자를 이용한 QF-PCR법의 수행능을 검증하고자 한다. 대상 및 방법: 2007년에서 2009년까지 산전 염색체 이수성 선별을 목적으로 의뢰된 847개의 양수 검체에 대해 QF-PCR법을 시행하였는데 13번, 18번, 21번, X, Y염색체에 위치한 총 20개의 STR 표지자로 구성된 Elucigene kit (Gen-Probe, Abingdon, UK)를 사용하였다. 총 847개의 양수 검체에 대한QF-PCR 결과는 염색체 검사 결과와 비교하였고, STR 표지자의 정보력을 평가하기 위해서 각 표지자에 대해 이형접합체 지수(heterozygosity index)를 구하였다. 결 과: 총 847개 양수 검체에 대한 QF-PCR 검사 결과 19개(2.2%, 19/847)에서 13, 18, 21번 염색체와 X, Y염색체의 수적 이상이 관찰되었는데 염색체 검사에서도 동일한 결과를 보여100% 양성 예측율을 나타냈다. 하지만 염색체 검사 결과 7개(0.8%, 7/847) 검체에서 5개의 균형전좌와 2개의 불균형 염색체 이상이 관찰되었으나 QF-PCR에서는 진단되지 않았다. STR 표지자의 평균 이형접합체 지수(he-terozygosity index)는 0.76으로 서양인에서 보고된 0.8에 비해 다소 낮았다. 본 연구에서 D13S634표지자의 미세수준의 중복(submicroscopic duplication)이 1.4% (12/847)에서 관찰되었는데 이는 한국인에서 특징적인 소견으로 생각된다. 결 론: 본 기관에서는 산전 염색체 이수성 선별을 위한 QF-PCR법을 검증하였으며 효율적이고 신뢰할 수 있는 방법임이 입증되었다. 하지만 QF-PCR결과를 해석하기 위한 지침을 만들기 위해서 검사실마다 독립적으로 각각의 STR표지자에 대한 검증이 필요하며, 또한 QF-PCR법을 통상적인 염색체 검사 업무흐름에 통합하는 것이 필요하다고 사료된다.

FISH를 이용한 다운증후군과 에드워드증후군의 신속한 산전확인 : 309예의 임상적 고찰 (Rapid prenatal diagnosis of Down syndrome and Edward syndrome by fluorescence In situ hybridization : Clinical experience with 309 cases)

  • 강진희;이숙환;박상희;박지현;김지연;한원보;김인현;박상원;장진범;이경진;박희진;전혜선;이경주;신중식;차동현
    • Journal of Genetic Medicine
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    • 제4권1호
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    • pp.64-71
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    • 2007
  • 목 적 : 다운증후군과 에드워드증후군의 빠른 진단에 있어 FISH 검사의 임상적 유용성과 한계성을 보고하고자 한다. 방 법 : 유전질환이 의심되는 고위험임신 309예에서 양수 검사를 통해 미배양 양수세포에서 18번과 21번 염색체의 probes를 이용한 FISH 검사를 시행하고 이들의 결과를 염색체 핵형분석 결과와 비교하였다. 결 과 : 평균연령은 34.18세, 평균임신주수는 18주(126.12 일)의 309예에서 FISH 검사는 모두 성공하였다. 각각 1예씩의 다운증후군과 에드워드증후군이 FISH로 신속한 진단이 가능했으며 이들은 염색체 핵형 검사에서 확인하였다. 그러나 18번과 21번 이외의 염색체의 이수성과 구조적 이상은 발견하지 못했는데 모두 12예(3.9%)로 상당부분을 차지했다. 앞으로 산전 선별검사에 있어 FISH검사과정의 자동화 기계화로 더 시간을 단축하고 가격을 낮추는 방안이 계속 개발되어야 할 것이다.

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