The photoreaction of 5,7-dimethoxycoumarin with adenosine has been carried out in a dry film state. The mixture of DMC and adenosine was irradiated with 350 nm UV light and two major products were isolated. The structure was determined by various spectroscopic measurements involving $^{13}C$ nuclear magnetic resonance and fast atom bombardment mass spectrometry. These addition products were produced by covalent bond formation between the pyrone ring at carbon 3 or 4 and the sugar ring moiety of adenosine at carbon 5'.
;The electronic state calculations for various types of ceramic materials have beell performed by the use of $DV-X\;{\alpha}$ cluster method. The molecular orbital levels and wave functions for model clusters have been computed to study the electronic properties ami chemical bonding of the ceramics. For ${\beta}-sialon(Si_{6-z}Al_zO_zN_{8-z})$ which is a high temperature structural material based on ${\beta}-Si_3N_4$, we have made model cluster calculations to estimate the strength of chemical bonding between atoms by the Mulliken population analysis. It is found that the covalent bonding between Si and N atoms is very strong in pure ${\beta}-Si_3N_4$, but the covalency around solute atom is considerably weakened when Si atom is substituted by AI. This tendency is enhanced by an additional substitution of oxygen atom for N. The result calculated can well explain the experimental data of changes in mechanical properties such as the reductions of Young's modulus and Vickers hardness with increment of z-value in ${\beta}-sialon$. Various model clusters for transition metal oxides which show many interesting physical and chemical properties have also been calculated. High-valent perovskite-type iron oxides EMFe0_3E(M=Ca and Sr) possess very interesting magnetic and chemical properties. In these oxides, iron exists as $Fe^{4+}$ state, but the experimental measurement of Mossba~er effect suggests that disproportionation $2Fe^{4+}=Fe^{3+}+Fe^{5+}$ takes place for $CaFe0_3$ at low temperatures. The model cluster calculations for these compounds indicated the existence of considerably strong covalent bonding of Fe-O. The calculations of hyperfine interaction at iron neucleus show very good agreement with the experimental Mossbauer measurements. The result calculated also implies that the disproportionation reaction is strongly possible by assuming the quenching of breathing phonon mode at low temperatures.tures.
금속유기구조체(metal-organic frameworks, MOF)는 넓은 비표면적, 규칙적인 구조 및 높게 분산된 금속 성분 등 뛰어난 물리화학적 특성으로 인해 활발한 연구가 이뤄지고 있는 다공성 물질이며, 특히 가스의 흡착, 분리 매체로서 뛰어난 성능이 보고되고 있다. MOF를 이용한 온실가스 이산화탄소의 흡착 연구는 상온 고압 영역에서 이산화탄소 저장 공정과 상온 저압 영역에서 이산화탄소 흡착 공정의 두 범주로 나눌 수 있으며, MOF의 넓은 비표면적 외에도 (1) MOF의 빈 배위결합 자리, (2) MOF의 기능화, (3) MOF의 상호 침투 효과, 및 (4) 이온 교환 효과를 이용한 연구 결과가 보고되고 있다. MOF 물질들은 비교적 낮은 수분 및 열에 대한 안정성이 문제로 제기되고 있으며, 제올라이트 유사 구조체(zeolitic imidazolate frameworks, ZIF) 또는 유기 골격 구조체(covalent organic frameworks, COF) 물질의 이산화탄소 흡착 특성이 거론되고 있다. 본 소고에서는 MOF를 이용한 이산화탄소 흡착에 대한 최근의 연구 결과를 본 연구실의 실험 결과를 중심으로 간략히 소개하고자 한다.
휘발성 유기화합물을 제거하는 허니콤 흡착제의 제조 성분인 무기질 섬유에 흡착력이 뛰어난 제올라이트를 화학 결합시켰다. 무기질 섬유를 염산, 황산 또는 플루오르화 수소산 등으로 처리하여 표면의 불순물을 제거하여 제올라이트의 접합 능력을 향상시켰다. 무기질 섬유와 제올라이트의 표면에 매달은 클로로프로필, 아미노프로필 또는 에폭시기 등을 서로 반응시켜 두 물질을 화학 결합시켰으며, 연결 화합물로 고분자 폴리에틸렌이민을 사용하기도 하였다. 결합상태는 전자현미경으로 관찰하였고, BET 표면적 분석을 통하여 제올라이트 접합량을 유추하였다. 폴리에틸렌이민을 사용하면 제올라이트를 무기질 섬유에 많이 결합시킬 수 있었다.
Raw-starch-digesting enzyme (RSDA) was immobilized on Amberlite beads by conjugation of glutaraldehyde/polyglutaraldehyde (PG)-activated beads or by crosslinking. The effect of immobilization on enzyme stability and catalytic efficiency was evaluated. Immobilization conditions greatly influenced the immobilization efficiency. Optimum pH values shifted from pH 5 to 6 for spontaneous crosslinking and sequential crosslinking, to pH 6-8 for RSDA covalently attached on polyglutaraldehyde-activated Amberlite beads, and to pH 7 for RSDA on glutaraldehyde-activated Amberlite. RSDA on glutaraldehyde-activated Amberlite beads had no loss of activity after 2 h storage at pH 9; enzyme on PG-activated beads lost 9%, whereas soluble enzyme lost 65% of its initial activity. Soluble enzyme lost 50% initial activity after 3 h incubation at $60^{\circ}C$, whereas glutaraldehyde-activated derivative lost only 7.7% initial activity. RSDA derivatives retained over 90% activity after 10 batch reuse at $40^{\circ}C$. The apparent $K_m$ of the enzyme reduced from 0.35 mg/ml to 0.32 mg/ml for RSDA on glutaraldehyde-activated RSDA but increased to 0.42 mg/ml for the PG-activated RSDA derivative. Covalent immobilization on glutaraldehyde Amberlite beads was most stable and promises to address the instability and contamination issues that impede the industrial use of RSDAs. Moreover, the cheap, porous, and non-toxic nature of Amberlite, ease of immobilization, and high yield make it more interesting for the immobilization of this enzyme.
The native form of serpin (serine protease inhibitor) is kinetically trapped in metastable state. Metastability in these proteins is critical to their biological function. Serpins inhibit target proteases by forming a stable covalent complex in which the cleaved reactive site loop of the serpin is inserted into $\beta$-sheet A of the serpin with concomitant translocation of the protease to the opposite of the initial binding site. Despite recent determination of the crystal structures of a Michaelis protease-serpin complex as well as a stable covalent complex, details on the kinetic mechanism remain unsolved. In this study we constructed several $\alpha$$_1$-antitrypsin variants and examined their kinetic mechanism of loop translocation and formation of protease-serpin complex by stopped-flow experiments of fluorescence resonance energy transfer as well as quenched-flow experiment. We report here the relationship of serpin's conformational switch mechanism with Inhibitory activity. There is little direct correlation between loop insertion rate and inhibitory activity. Rather, disrupting a salt bridge between R196 and E354 accelerates loop translocation even though it impairs the inhibitory activity. Moreover, the serpin's reactive site loop is translocated, at least partially, prior to loop cleavage.
The antitumor antibiotic (+)-CC-1065 can alkylate N3 of guanine in certain sequences. A previous high-field $^1H$ NMR study on the$(+)-CC-1065d[GCGCAATTG*CGC]_2$ adduct ($^*$ indicates the drug alkylation site) showed that drag modification on N3 of guanine results in protonation of the cross-strand cytosine [Park, H-J.; Hurley, L. H. J. Am. Chem. Soc.1997, 119,629]. In this contribution we describe a further analysis of the NMR data sets together with restrained molecular dynamics. This study provides not only a solution structure of the (+)-CC-1065(N3- guanine) DNA duplex adduct but also new insight into the molecular basis for the sequence- specific interaction between (+)-CC-1065 and N3-guanine in the DNA duplex. On the basis of NOESY data, we propose that the narrow minor groove at the 7T8T step and conformational kinks at the junctions of 16C17A and 18A19T are both related to DNA bending in the drugDNA adduct. Analysis of the one-dimensional $^1H$ NMR (in $H_2O$) data and rMD trajectories strongly suggests that hydrogen bonding linkages between the 8-OH group of the (+)-CC-1065 A-sub-unit and the 9G10C phosphate via a water molecule are present. All the phenomena observed here in the (+)-CC-1065(N3-guanine) adduct at 5'$-AATTG^*$are reminiscent of those obtained from the studies on the (+)-CC-1065(N3-adenine) adduct at $5'-AGTTA^*$, suggesting that (+)-CC-1065 takes advantage of the conformational flexibility of the 5'-TPu step to entrap the bent structure required for the covalent bonding reaction. This study reveals a common molecular basis for (+)-CC-1065 alkylation at both $5'-TTG^*$ and $5'-TTA^*$, which involves a trapping out of sequence-dependent DNA conformational flexibility as well as sequence-dependent general acid and general base catalysis by duplex DNA.
Aspergillus niger유래의 $\beta$-glucosidase를 (1)glutarald-ehyde를 가교제로 한 chitin과 chitosan담체에 covalent linkage (2)Amberite IRA93과 DEAE-cellulose담체에 succinylation시킨 후 흡착, 그리고 (3)alginarte, polyacry-lamide를 각종 가교제를 이용 entrapment등의 방법으로 고정화 하였다. Glutaraldehyde를 가교제로써 chitosan을 활성화시킨후 $\beta$-glucosidase를 고정화 시켰을때 효소활성 회수율이 31.5%로 가장 높았고, 또한 column형 반응기에서의 15일 경과 후 효소활성 유지도도 69%로서 가장 우수하였다. 또한 succinylation시킨 효소를 Amberite IRA93 담체에 흡착시켰을 때 효소활성 회수율은 24.7%였고 효소 활성유지도는 62%였다. 반면에 entra-pment 방법에 의한 $\beta$-glucosidase의 고정화는 효소의 계속적인 용출로 $\beta$-glucosidase의 고정화에는 적합하지 않았다. Chitosan담체에서의 고정화 최적조건을 조사한 결과 가교제인 glutaraldehyde의 최적농도는 0.4%였고, glutaraldehyde의 최적 반응 pH는 4.8이었다. 또한 column형 반응기를 이용하여 cellobiose로부터 glucose로의 전환율을 조사하여 고정화 효소의 효용성을 검토하였다.
융합단백질의 절단을 위해 EK를 고정화하여 액상 절단반응과 같은 80%의 절단수율을 얻을 수 있었다. 그리고 니켈 친화칼럼을 이용하여 간단한 정제공정을 구축하였다. 공유결합한 EK의 경우 니켈친화 결합한 EK보다 높은 재접힘 수율을 나타내었고 풀림과 재접힘을 이용하여 효소의 초기 활성을 회복함에 따라서 반복사용을 통한 경제적인 절단공정을 구축할 수 있게 되었다. 그러나 고정화 과정에서 효소의 활성이 감소하는 문제점과 고정화 수율을 높이기 위한 연구가 필요하다.
본 연구에서는 고정화 UK를 이용한 융합단백질의 절단방응에 대해 UK의 고정화, 고정화 UK의 특성과 절단방응, 절단반응 후의 분리정제 그리고 고정화 UK으 재생에 대해 실험하였다. 고정화 수율은 99% 이상이였고 고정화 후의 효소활성은 80%를 유지하였다. 융합단백질 전단반응에서 액상 UK와 고정화 UK를 이용한 회분식 반응 모두 약 70%의 절단반응을 얻었고, 특히 고정화 UK의 사용시 부반응이 매우 낮은 이점이 있었다. 컬럼식 절단반응에서는 기절의 주입속도에 따라 절단수율은 크게 변화하였다. 최적의 유속은 50%의 절단수율을 얻은 1 bed volume/h로 설정하였다. 고정화 효소반응의 이점인 안정성과 반복사용 측면에서는 액상 UK 대비 고정화 UK가 높은 열안정성을 보였고 낮은 pH에서는 10% 이상 높은 활성을 유지하였다. 반복사용을 위해 6M GuHCl을 사용하여 인위적으로 풀림, 재접힘을 한 경우 98%의 활성을 얻음으로 타당성이 있음을 제시하였다. 또한 목적 단백질의 분리를 위하여 산침전 후 expanded bed adsorption 크로마토그래피를 이용함으로써 연속화된 고수율의 정제공정을 가능하게 하였다. 이러한 고정화 UK를 이용한 절단방응 및 정제시스템을 구축함으로써 융합단백지의 생산공정에 매우 유용하게 사용될 것으로 생각되어진다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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