• 제목/요약/키워드: construction taxonomy

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낙동강 하구 생태계의 종속영양세균의 군집구조 분석 및 수리학적 분류 (Characterization and Numerical Taxonomy of Heterotrophic Bacterial Community in Naktong Estuarine Ecosystem)

  • 귄오섭;조경제
    • 미생물학회지
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    • 제30권6호
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    • pp.444-449
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    • 1992
  • 낙동강 하구생태계에 분포한 종속영양세균의 환경 변화에 따른 군집구조의 변화를 파악하기 위해 총 858 균주를 분리하여 수리학적 방법에 의해 분석하였다. 종의 다양성(H') 은 1.54-3.49 로, 하구언 건설 전의 수치와 큰 차이가 없었으나, 균등성지수(evenness index)(J') 는 0.31-0.80 으로 감소하였다. Physiological tolerance index 중 수온에 대한 지수(P') 는 수심이 얕은 정점에서, pH 와 염분에 대한 $P_{h}$$P_{s}$ 는 담수와 해수가 교차하는 정점에서 높았다. 우점의 cluster 를 속 (genus) 수준에서 동정한 결과 Aeromonas, Vibrio, Pseudomonas, Acinetobacter-Morexella, Alcaligenes, Flavobacterium, Micrococcaceae, Enterobacteriaceae 등으로 분류되어 하구언 축조 전과 동일한 종류의 세균뷴포를 나타냈으나 그 출현비율은 달랐다. 이와 같은 결과로 미루어 하구언 축조 등에 따른 낙동강 하구역의 환경변화는 분포세균의 종류보다는 생리적 특셩에 영양을 미쳐 특정종의 우점을 나타나게 한 것으로 사료된다.

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낙동강 보 구간에서 남조류의 천이 및 Dolichospermum 속(Nostocales, Cyanophyceae)의 분류학적 고찰 (Succession of Cyanobacterial Species and Taxonomical Characteristics of Dolichospermum spp. (Nostocales, Cyanophyceae) in the Weir Regions of the Nakdong River)

  • 류희성;신라영;서경애;이정호;김경현
    • 한국물환경학회지
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    • 제34권5호
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    • pp.503-513
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    • 2018
  • Freshwater cyanobacterial genus Dolichospermum is one of the most commonly spotted types of phytoplankton, whereas a limited number of studies on morphology of Dolichospermum spp. have been performed in South Korea. The purpose of this study is to investigate the succession pattern of cyanobacteria after weir construction, as well as morphological characteristics of Dolichospermum spp. from natural samples collected in the weir regions of Nakdong River. A total of 31 cyanobacterial taxa observed in this study were classified as belonging to 15 genera, 5 families, and 3 orders. Among them, morphological characteristics in the four species were classified into genus Dolichospermum, for most of the planktic former members of the genus Anabaena, were observed through light microscopy. Water bloom frequently occurred in the middle region of Nakdong River, the maximum number of cyanobacterial species appeared in the lower region of Nakdong River. The appearance of order Chrooccocales was only observed during summer when population density of Microcystis aeruginosa reached an annual peak. In contrast, filamentous cyanobacteria was observed throughout the whole year, even if when water temperature was lower than $5^{\circ}C$. It implied that the low-temperature-adapted filamentous cyanobacteria can grow in a range of water temperatures. Coil diameter of D. crassum from natural samples was $75{\sim}140{\mu}m$ ($ave.=91.3{\mu}m$; n = 94), slightly larger than those reported by previous studies. Dolichospemum smithii ($Kom{\grave{a}}rek$) Wacklin et al. 2009, was described for the first time in Nakdong River.

데이터베이스 모델링 기법을 이용한 국가표준식물목록 전산화 연구 (Database Model for Korea Plant Name Index)

  • 이유미;김휘
    • 식물분류학회지
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    • 제37권3호
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    • pp.309-321
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    • 2007
  • 산림청 국립수목원과 한국식물분류학회가 공동으로 국내 최초로 전산화된 식물목록 데이터베이스를 구축하였다. 그 결과로 재배종을 포함한 약 7,000 분류군을 대상으로 항상 최신의 자료를 갱신할 수 있는 국가표준식물목록을 온라인상에 구현하였다. 국가표준식물목록은 37명의 국내 전문분류학자가 참여한 우리나라 식물목록과 관련된 최대 규모의 프로젝트이다. 본 연구는 국가표준식물목록 생성과정을 분석하고 이를 통해 관계형 데이터베이스 모델을 수립하였다. 개발된 광릉 데이터베이스 모델은 식물목록과 관련된 문헌과 다양한 분류학 자료를 제공할 수 있도록 설계 되었다. 이 모델은 다양한 분류학적 수준의 학명과 잡종명, 재배명, 이명, 기본명, 국명 및 명명법과 관련된 기타 자료를 함께 제공할 수 있다. 따라서, 국가표준식물목록 데이터베이스는 앞으로 개발될 생물정보시스템들의 개발에 있어 식물의 학명과 관련된 정확하고 일관성이 있는 표준 데이터베이스 기반을 제공하게 되었다.

Assessment of genetic diversity of Prangos fedtschenkoi (Apiaceae) and its conservation status based on ISSR markers

  • Mustafina, Feruza U.;Kim, Eun Hye;Son, Sung-Won;Turginov, Orzimat T.;Chang, Kae Sun;Choi, Kyung
    • 식물분류학회지
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    • 제47권1호
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    • pp.11-22
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    • 2017
  • Prangos fedtschenkoi (Regel et Schmalh.) Korovin (Apiaceae) is an endemic species for mountainous Middle Asia, which is both a rare and useful plant. Organic extractions from this species are being used in pharmaceutics and cosmetology. In recent years, P. fedtschenkoi distribution area has considerably decreased, presumably, resulting from human activities such as agriculture, construction works, overgrazing and collection from wild for pharmaceutic purposes. Six populations were found in Uzbekistan and their genetic divergence and differentiation were studied with 10 inter-simple sequence repeat (ISSR) markers, selected out of 101. Totally 166 amplified ISSR fragments (loci) were revealed, of which 164 were polymorphic. Relatively moderate level of polymorphism was found at population level with polymorphic bands ranging from 27.71% to 47.59%. Mean P = 39.05%, $N_a=1.40$, $N_e=1.25$, S.I. = 0.21, and $H_e=0.14$ were revealed for all loci across six populations. AMOVA showed higher variation among populations (62%) than within them (38%). The Bayesian model determined 5 clusters, or genetic groups. The posteriori distribution of the Theta II estimator detected full model identifying high inbreeding, intensified by low gene flow (Nm = 0.3954). Mantel test confined population 6 as distinct cluster corresponding to geographic remoteness (R = 0.5137, $p{\leq}0.005$). Results were used as the bases for developing conserve measures to restore populations.

부추속(부추과) 미기록 식물 1종: 갯부추 (An unrecorded species of Allium (Alliaceae) in Korea: A. pseudojaponicum Makino)

  • 최혁재;김윤영;고은미;장창기;오병운
    • 식물분류학회지
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    • 제36권1호
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    • pp.53-59
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    • 2006
  • 전라남도 여수시 거문도에서 발견된 부추속(부추과) 1분류군을 국내 미기록종으로 보고한다. 이 분류군은 지금까지 일본의 남부지방에만 분포하는 것으로 알려졌던 Allium pseudojaponicum Makino로서, 근연종인 산부추(Allium thunbergii G. Don)에 비해 윤이 나는 상록성의 잎, 화경에 측생하는 인경 및 2n=32의 염색체수 등의 특징으로 쉽게 구분된다. 국명은 생육지의 특성을 고려하여 '갯부추'로 신칭하였다. 이 분류군에 대한 형태적 특징을 기재하였고, 도해 및 생태 사진을 제시하였다.

형태와 DNA 바코드에 근거한 한국 미기록 외래식물의 보고, 미국잔디갈고리(콩과) (New record of an alien plant, Desmodium paniculatum (Fabaceae), in Korea based on a morphological examination and DNA barcoding)

  • 진동필;김중현;심선희;서화정;김진석
    • 식물분류학회지
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    • 제51권2호
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    • pp.133-140
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    • 2021
  • 북아메리카 원산이며, 일본에서는 외래식물로 알려진 미국잔디갈고리(Desmodium paniculatum)가 국내의 화성시와 대전시에서 발견되었다. 본종은 다년생 초본이며, 협과는 4-5개의 소절과로 연결되고, 소절과 사이의 배축면이 완만하게 좁아지는 점에서 국내의 근연분류군들과 구분된다. 미국잔디갈고리는 강변과 도로변에서 자라고 있어, 하천정비나 도로 공사를 통해 유입된 것으로 추측된다. Internal transcribed spacer 계통수상에서 한국산 미국잔디갈고리는 일본산 개체와 단계통을 형성하였다. 본 연구는 미국잔디갈고리의 형태적 특징에 대한 기재와 사진, 도해, 분포 위치에 대해 보고하였다.

동영상 시맨틱 이해를 위한 시각 동사 도출 및 액션넷 데이터베이스 구축 (Visual Verb and ActionNet Database for Semantic Visual Understanding)

  • 배창석;김보경
    • 한국차세대컴퓨팅학회논문지
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    • 제14권5호
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    • pp.19-30
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    • 2018
  • 영상 데이터에 대한 시맨틱 정보를 정확하게 이해하는 것은 인공지능 및 기계학습 분야에서 가장 어려운 도전과제의 하나로 알려져 있다. 본 논문에서는 동영상 시맨틱 이해를 위한 시각 동사 도출과 이를 바탕으로 하는 동영상 데이터베이스인 액션넷 데이터베이스 구축에 관해 제안하고 있다. 오늘날 인공지능 기술의 눈부신 발달에는 인공지능 알고리즘의 발전이 크게 기여하였지만 알고리즘의 학습과 성능 평가를 위한 방대한 데이터베이스의 제공도 기여한 바가 매우 크다고 할 수 있다. 인공지능이 도전하기 어려운 분야였던 시각 정보 처리에 있어서도 정지 영상 내의 객체인식에 있어서는 인간의 수준을 능가하기 시작하면서 점차 동영상에서의 내용에 대한 시맨틱 이해 기술 개발로 발전하고 있다. 본 논문에서는 이러한 동영상 이해를 위한 학습 및 테스트 데이터베이스로서 액션넷 구축에 요구되는 시각 동사의 후보를 도출한다. 이를 위해 언어학 기반의 동사 분류체계를 살펴보고, 영상에서의 시각 정보를 명세한 데이터 및 언어학에서의 시각 동사 빈도 등으로부터 시각 동사의 후보를 도출한다. 시각 동사 분류체계와 시각 동사후보를 바탕으로 액션넷 데이터베이스 스키마를 정의하고 구축한다. 본 논문에서 제안하는 시각 동사 및 스키마와 이를 바탕으로 하는 액션넷 데이터베이스를 개방형 환경에서 확장하고 활용성을 제고함으로써 동영상 이해 기술 발전에 기여할 수 있을 것으로 기대한다.

저탄소 녹색도시 조성을 위한 친환경 요소의 비중도 분석: 수도권 신도시내 친환경 인증 아파트단지 사례 (Analysis on Weight Proportion of Eco-friendly Elements for the Development of Low-Carbon Green City : Case of Eco-Environment Certified Apartment Housing Complexes in the Metropolitan Newtown)

  • 정성훈;김정인
    • 환경정책연구
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    • 제10권3호
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    • pp.21-48
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    • 2011
  • 저탄소 녹색도시 조성에 있어서 쾌적한 주거환경의 필수조건인 친환경 요소에 대한 정성적(qualitative) 계획요소 분류체계를 발전적으로 확장하여 정량적(quantitative) 계량분석이 가능한 비중도 개념으로 구체화하였다. 이 비중도 개념을 저탄소 녹색도시 조성에 있어서의 다양한 친환경 요소의 발굴과 그에 따른 객관적 평가지표의 새로운 대안으로서 제시하였다. 실증분석을 위하여 첫째, 설문조사는 국내 수도권 신도시내 현지거주자(50명) 및 외부전문가(50명)등 총 100명을 대상으로 실시하였으며, 둘째 사례조사는 수도권 신도시내 74개소의 친환경 인증 아파트단지를 대상으로 실시하였다. 친환경 요소의 항목별, 유형별 합산 비중도를 분석한 결과에서 항목별로는 실내환경 및 생태환경, 유형별로는 탄소저감형 및 탄소흡수형이 큰 비중도로 나타났다. 이런 결과에 따라 최근 수도권 신도시에서는 생태주거 및 신 재생에너지 등의 미래지향적이고 지속가능성을 위주로 한 다양한 친환경 요소에 대한 인식도 및 선호도가 상당히 보편화 단계에 이르렀다는 긍정적인 의미를 확인하였다. 또한, 장기적 투자 효과를 유발하는 탄소저감형 및 탄소 흡수형 위주의 친환경 요소의 도입이 초기 투자비용의 부담에도 불구하고 점차 새로운 주거 트렌드로 정착되어 가고 있음을 확인할 수 있었다.

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버섯 학술 용어 해설 (Explanation of mushroom academic terminology)

  • 이재성;성재모;김양섭;채정기;유영복;유승헌;차재순;이현숙;이재동;이종수;박원철;구창덕;석순자;김용갑;차병진;장현유
    • 한국버섯학회지
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    • 제4권4호
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    • pp.144-213
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    • 2006
  • The mushroom production reached to 1000 billion won in monetary value in Korea. We, however, do not have systematic terminology dictionary published yet. Recently new varieties of medicinal mushrooms in addition to culinary mushrooms are being introduced steadily through out the world. This makes the necessity of coordinated and consistent arrangement of terms involved in culture, cultivation and physiological aspects of mushrooms. Various components in relation to the medicinal and physiological functionality also poses ambiguity in terminology along with the terms used in breeding and genetic researches. Moreover, some of the scientific terms are being used erroneously. In order to help mushroom cultivators, students, and mushroom business personnel in understanding the terms on mushroom science and technology we intended to collect and organize all the terms related to mushroom morphology and cultivation, poison and medicinal functionality, processing and utilization, and so on. Thirteen professionals from each field participated in this project. The fields included here are : 1) Genetics and breeding of mushrooms, 2) Cultivation and physiology of mushrooms, 3) Taxonomy and ecology of mushrooms, 4) Processing and functional components, 5) Blight and insects of mushrooms.

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웹기반 전복류 (Haliotis) SNP 데이터베이스 구축 (Construction of web-based Database for Haliotis SNP)

  • 정지은;이재봉;강세원;백문기;한연수;최태진;강정하;이용석
    • 한국패류학회지
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    • 제26권2호
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    • pp.185-188
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    • 2010
  • - 본 웹 데이터베이스 서버의 구축을 통해 Haliotis 속간의 염기서열과 일치하는 서열을 자체 BLAST 를 통해 매우 빠른 속도로 추출 할 수 있었다. - Repeat elements, E. coli, vector 등의 서열들과 동시에 BLAST를 시행할 수 있어 cDNA 또는 genomic DNA 라이브러리를 구축할 때 라이브러리의 오염, 삽입체의 길이 등의 상태를 쉽게 확인 할 수 있었다. - Clustering Res. 인터페이스를 통해 SNPs 발굴이 용이하게 되었으며 자체 구축된 primer3 를 통해 실험용 시발체를 제작할 수 있게 되었다 (Evans et al. 2001). - 이러한 SNP 데이터베이스 구축은 SNP 발굴 작업을 극대화 시킬 수 있어 차후 수행될 Haliotis 관련 분자육종 관련연구에 많은 도움이 될 것으로 기대된다.