• 제목/요약/키워드: community similarity

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Variations in Kiwifruit Microbiota across Cultivars and Tissues during Developmental Stages

  • Su-Hyeon Kim;Da-Ran Kim;Youn-Sig Kwak
    • The Plant Pathology Journal
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    • 제39권3호
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    • pp.245-254
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    • 2023
  • The plant microbiota plays a crucial role in promoting plant health by facilitating the nutrient acquisition, abiotic stress tolerance, biotic stress resilience, and host immune regulation. Despite decades of research efforts, the precise relationship and function between plants and microorganisms remain unclear. Kiwifruit (Actinidia spp.) is a widely cultivated horticultural crop known for its high vitamin C, potassium, and phytochemical content. In this study, we investigated the microbial communities of kiwifruit across different cultivars (cvs. Deliwoong and Sweetgold) and tissues at various developmental stages. Our results showed that the microbiota community similarity was confirmed between the cultivars using principal coordinates analysis. Network analysis using both degree and eigenvector centrality indicated similar network forms between the cultivars. Furthermore, Streptomycetaceae was identified in the endosphere of cv. Deliwoong by analyzing amplicon sequence variants corresponding to tissues with an eigenvector centrality value of 0.6 or higher. Our findings provide a foundation for maintaining kiwifruit health through the analysis of its microbial community.

초례산의 산화지와 비산화지의 식물군집구조 및 토양성분의 동태 (Dynamics of the Plant Community Structure and Soil Properties in the Burned and Unburned Areas of the Mt. Ch’olye-san)

  • Sim, Hak-Bo;Woen Kim
    • The Korean Journal of Ecology
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    • 제19권5호
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    • pp.417-430
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    • 1996
  • This study was conducted to investigate the developmental process of plant community during the secondary succession and the dynamics of soil properties in the burned and unburned areas of Mt. Ch’oly-san. Owing to the forest fire occurred on April, 1989, the red pine(Pinus densiflora) forest and its floor vegetation were burned down. The floristic composition of burned and unburned areas were composed of 53 and 49 species of vascular plants, respectively. The dominant species based on SDR4 of the burned sites were lespedeza cyrtobotrya (89.62), Miscanthus sinensis var. purpurascens (62.50), and Carex humilis (58.73), Quercus serrata (43.33). In contrast, Pinus densiflora (83.56), Lespedeza cyrtobotrya (55.57), Miscanthus sinensis var. purpurascens (51.88) and Carex humilis (50.41) were dominant in the unburned area. The biological spectra showed the $H-D_1-R_5-e$ type in both the burned and unburned areas. The indices of similarity ($CC_S$) between the two areas were 0.74. Degree of succession (DS) was 604 in the burned area and 802 in the unburned area. From these facts, it is assumed that the succession is rapidly progressing because of the recovery of vegetation. The species diversity ($\={H}$) and evenness index(C) in the burned and unburned areas were 0.15 and 0.18, respectively. Red pine tree did not resprout after scorch by the forest fire, but Lespedeza, Quercus, Rhododendron, Albizzia, and Zanthoxylum resprouted from the roots and trunks after the forest fire. It seems that these species are the fire-resistant species. Soil properties such as soil pH, content of organic matter, available phosphous, total nitrogen, tatal carbon, exchangeable potssium, sodium, calcium, and magnesium increased due to forest fire. These results suggest the intensity of forest fire in the study area was relatively weak. Monthly changes of soil properties were of little significance except for some cases.

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서해 군산 연안에서 새우조망으로 어획된 저서생물의 종조성 및 군집구조 (Species Composition and Community Structure of Demersal Organisms Caught by Shrimp Beam Trawl in the Coastal Waters of Gunsan of West Sea)

  • 한인성;엄기혁;권정노;박경동
    • 수산해양교육연구
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    • 제28권1호
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    • pp.211-220
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    • 2016
  • Species composition of aquatic organism in the marine ranching area of Gunsan, Korea were investigated using shrimp beam trawl from May to December in 2010. A total of 91 species, $98,127ind./km^2$ and $877.6kg/km^2$ of aquatic organism were collected. Among them, species were included 60 species in Pisces, 21 in Crustacea and 10 in Mollusca. The individual dominant species, occupying over 10% of total individuals, were Latreutes anoplonyx($47,327ind/km^2$, 48.23%), Crangon hakodatei($11,578ind./km^2$, 11.80%) and Trachysalambria curvirostris($10,237ind./km^2$, 10.40%). And the biomass dominant species, occupying over 9% of total biomass, were Paralichthys olivaceus($135kg/km^2$, 15.4%), Okamejei kenojei($98.2kg/km^2$, 11.2%) and Portunus tribuberculatus($84.8kg/km^2$, 9.6%). From the cluster and MDS analysis based on Bray-Curtis similarity matrix of fourth root transformed data of number of species and individuals per unit area collected more than two times during this survey by each month and station was divided into three different groups. Group A showed seasonal similarity of characteristic of distribution in August and November, Group B in December and Group C in May.

금정산성 등산로 주변 식생의 생태적 특성 평가 (Assessment on Ecological Characteristics of Vegetation in the Trail of Area Adjacent to GeumJeong Mountain Fortress)

  • 남정칠;서정범;조국희;김석규
    • 환경영향평가
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    • 제19권6호
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    • pp.527-537
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    • 2010
  • This study are Geumjung mountain fortress of the Busan Metropolitan City in the north gate of the East gate around the trail to identify the vegetation structure importance value, dominance, species diversity, similarity index analysis. Results of the study, plot on the western slopes elevation 423-636m, slopes of $15{\sim}20^{\circ}$ slope areas, Pinus densiflora, Pinus thunbergii, Quercus acutissima, Pinus thunbergii, Pinus rigida, Carpinus coreana, Quercus mongolica are fulfilling a community. Trees layer a height 8~12m, coverage 40~70%, sub-trees layer the height 3~7m, coverage 10~80%, shrubs layer the height 0.8~1.5m, coverage 20-30%, herb layer the height 0.1~0.5m, coverage 5-10% were in the range of plot in the east slope elevation 452-647m, slopes in the slope of $5-30^{\circ}$ and Pinus rigida, Pinus thunbergii, Pinus densiflora, Quercus mongolica, Quercus dentata, Carpinus coreana is fulfilling a community. The trees layer height 8~13m, coverage 0~70%, sub-trees layer the height 2~6m, coverage 0~80%, shrubs layer the height 0.8~1.5m, coverage 20-40%, herb layer the height 0.1-0.5m, coverage 5-40% were in the range. The survey showed to be in relatively good vegetation, but in some areas of Pinus rigida, Quercus acutissima, as was predicted in succession, the shrub layer in the plot of some dominated vine plants and vegetation management will be needed for this purpose respectively.

논과 밭 토양의 황산염 환원세균 군집 구조 비교 (Comparison of community structure of sulfate reducing bacteria in rice paddy and dry farming soils)

  • 이중배;박경량
    • 미생물학회지
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    • 제51권1호
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    • pp.21-30
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    • 2015
  • 본 연구는 논과 밭 토양의 황산염 환원세균의 군집구조와 T-RFLP 패턴을 조사한 논문으로, 유기 농법 토양과 관행 농법 토양 그리고 밭 토양 총 3종류의 토양을 8월과 11월에 채집하여 실험하였다. 토양 성분 분석 결과 총 질소, 총 탄소, 총 인의 값은 모든 토양이 비슷하게 나타났고 계절별로는 수분의 함량은 8월에, 총 탄소는 11월에 가장 높게 나타났다. 황산염 환원세균은 초산보다 젖산을 기질로 이용하는 황산염 환원세균이 더 많이 분포하고, 유기 농법 토양에 황산염 환원세균이 가장 많이 분포하는 것으로 나타났다. 각 토양에서 얻은 총 181개 클론으로 계통학적 분석을 한 결과, 대부분의 클론들은 배양 가능한 황산염 환원세균과는 매우 낮은 상동성을 보였으나, 자연계에서 확인되는 클론들과는 90% 이상의 높은 상동성을 나타내었다. T-RFLP 분석 결과 91, 357, 395, 474 bp의 분포가 가장 높았고, 계절에 따라 황산염 환원세균의 군집 구조가 달라지는 것을 확인하였다.

Residential college에서 효과적인 인성 교육을 위한 룸메이트 배정 문제 (Roommate assignment for effective character education within a Residential College system)

  • 최혜봉;남지혜;김우성
    • 한국융합학회논문지
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    • 제8권9호
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    • pp.319-330
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    • 2017
  • 최근, 다양한 국내 대학들에서 residential college를 통하여 인성교육을 위한 공동체 프로그램들을 진행하고 있다. 그렇지만 대부분의 프로그램들이 학생들 간의 관계에 기반을 두고 있기 때문에 공동체 생활환경에서 발생하게 되는 다른 갈등 상황이 발생할 수 있으며 이는 인성 교육 목표 달성을 저해할 수 있다. 본 논문에서는 효과적으로 인성 교육 목표를 성취하기 위하여 갈등 상황을 낮추기 위한 룸메이트 배정 알고리즘을 제시한다. 본 연구에서 사용하는 방법론은 심리학의 유사성 이론에 기반을 둔 클러스터링 알고리즘이며, 알고리즘을 통하여 배정된 결과, 룸메이트간의 유사도(유클리디안 거리)는 임의대로 배정한 것보다 현저히 높음을 볼 수 있었다. 본 연구에서 개발된 알고리즘은 H대학교의 국제관에서 생활하는 학생들의 데이터에 적용되었으며, 이러한 알고리즘을 통하여 대학과 같은 교육기관이 학생들의 갈등상황을 효과적으로 관리할 수 있기를 기대할 수 있다.

Cluster 분석에 의한 백두대간 남부권역 천연림의 산림 분류 (The Classification of Forest by Cluster Analysis in the Natural Forest of the Southern Region of Baekdudaegan Mountains)

  • 이정민;황광모;김지홍
    • 한국산림과학회지
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    • 제103권1호
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    • pp.12-22
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    • 2014
  • 본 연구는 백두대간 남부권역의 황악산, 박석산, 덕유산, 지리산 등 네 지역을 대상으로 복잡 다양한 천연림 군집을 분류하고 산림피복유형을 집약하였다. 점표본법을 이용하여 851개의 표본점에서 식생자료를 수집하였다. 조사된 식생자료를 대상으로 Cluster 분석을 실시하여 총 18개 군집으로 분류하였으며, 분류된 군집의 상층 수종 구성의 유사성을 바탕으로 중생혼합림형, 기타활엽수림형, 굴참나무-졸참나무림형, 신갈나무림형, 소나무림형, 서어나무림형, 구상나무림형 등 총 7개의 산림피복유형으로 집약하였다. 연구 대상지에서 신갈나무림형이 가장 넓게 분포하였고, 위도가 낮아질수록 신갈나무림형이 분포하는 평균해발고는 높아졌다. 중생혼합림형과 기타활엽수림형은 계곡에 많이 분포하였고, 신갈나무림형과 소나무림형은 능선 부위에 많이 분포하는 경향이 있었다.

인천 및 경기도 도서지역 소사나무림 군집구조분석 연구 - 석모도, 영종도, 영흥도 및 대부도를 대상으로 - (A Study on the Plant Community Structure of Carpinus turczaninowii in Islands of Incheon and Gyeonggi-do - Case Study of Seokmo, Yeongjong, Yeongheung and Daebu Island -)

  • 김용훈;권오정;반수홍;오충현
    • 한국환경생태학회지
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    • 제35권1호
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    • pp.68-80
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    • 2021
  • 본 연구는 도서식물자원인 소사나무의 식물군집구조 분석을 통해 소사나무림의 서식지 외 보전 및 서식환경 등의 기초자료를 제공하고자 수행하였다. 군집구조 분석을 위하여 소사나무가 출현하는 석모도, 영종도, 영흥도 및 대부도를 대상으로 총 29개의 방형구(각 100㎡)를 설치 및 조사하였다. 군집분류는 TWINSPAN에 의한 classification 분석을 하였다. 군집분류 결과 소사나무-졸참나무 군락(I), 소사나무-소나무 군락(II), 소사나무-신갈나무 군락(III), 소사나무-팥배나무 군락(IV), 소사나무 전형군락(V), 소사나무-굴참나무 군락(VI) 등 총 6개의 군락으로 분류되었다. 종다양도는 0.90008~1.12868, 우점도는 0.17536~0.25665이며, 유사도지수는 17.1429~38.2979%이었다. 군락별 7개 환경인자를 RDA ordination로 상관관계 분석한 결과 제 1축은 울폐도 및 낙엽층 깊이가 양의 상관관계를 보였으며, 암석노출도, 토양경도 및 해발고도는 음의 상관관계를 보였다. 제 2축은 암석노출도와 울폐도가 양의 상관관계를 보였으며, 경사도는 음의 상관관계를 보였다. 군락 I(소사나무-졸참나무 군락)은 주로 울폐도 및 낙엽층 깊이가 식생분포에 영향을 미치는 환경인자로 나타났다. 군락 II(소사나무-소나무 군락)와 군락 III(소사나무-신갈나무 군락)은 경사도가 식생분포에 영향을 미치는 환경인자로 나타났으며, 군락 IV(소사나무-팥배나무 군락), 군락 V(소사나무 전형군락)와 군락 VI(소사나무-굴참나무 군락)은 암석노출도, 해발고도, 토양경도 등이 식생분포에 영향을 미치는 환경인자로 나타났다.

PCR-T- RFLP Analyses of Bacterial Communities in Activatced Sludges in the Aeration Tanks of Domestic and Industrial Wastewater Treatment Plants

  • RHO SANG CHUL;AN NAN HEE;AHN DAE HEE;LEE KYU HO;LEE DONG HUN;JAHNG DEOK JIN
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제15권2호
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    • pp.287-295
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    • 2005
  • In order to compare bacteria] community structure and diversity in activated sludges, terminal restriction fragment length polymorphism (T-RFLP) of PCR-amplified 16s rDNAs was analyzed for 31 domestic and industrial wastewater treatment plants (WTPs). Regardless of the characteristics of the wastewaters, the bacteria] community structures of activated sludges appeared diverse and complex. In particular, activated sludges in domestic WTPs contained higher bacterial diversity than those in industrial WTPs. It was also found that terminal restriction fragment (T-RF) profiles derived from domestic WTPs were very similar with each other, although activated sludges were collected from different plants at different locations. Interestingly, activated sludges of a WTP where restaurant and toilet sewages of a company were managed showed a bacterial community structure similar to that of domestic WTPs. Activated sludges in leather industria] WTPs also showed a high similarity. However, other wastewaters possessed different bacterial communities, so that overall similarity was as low as about $30\%$. Since activated sludges from WTPs for domestic wastewaters and a company sewage appeared to hold similar bacterial communities, it was necessary to confirm if similar wastewaters induce a similar bacterial community. To answer this question, analysis of T-RFs for activated sludges, taken from another 12 domestic WTPs, was conducted by using a 6­FAM$^{TM}$-Iabeled primer and an automated DNA sequencer for higher sensitivity. Among 12 samples, it was again found that T-RF profiles of activated sludges from Yongin, Sungnam, Suwon, and Tancheon domestic WTPs in Kyonggi-do were very similar with each other. On the other hand, T-RF profiles of activated sludges from Shihwa and Ansan WTPs were quite different from each other. It was thought that this deviation was caused by wastewaters, since Ansan and Shihwa WTPs receive both domestic and industrial wastewaters. From these results, it was tentatively concluded that similar bacterial communities might be developed in activated sludges, if WTPs treat similar wastewaters.

광양만 및 섬진강 하구에서 채집된 어류의 공간적 군집 특성 (Spatial Characteristics of Fish Assemblage in Seomjin River Estuary and Gwangyang Bay)

  • 김용준;유태식;지창우;곽인실
    • 한국어류학회지
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    • 제35권4호
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    • pp.285-293
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    • 2023
  • 섬진강 하구와 광양만은 국내에서 유일하게 대규모 둑이 없는 자연상태를 유지하고 있어 생태학 및 경제학적으로 굉장히 중요한 위치에 있다. 또한, 다양한 어류의 주요 서식처로 알려져 있는 해역이다. 어류 군집에 대한 정보는 환경상태를 평가할 수 있는 적합한 지표군이기 때문에 지속적인 모니터링이 필요하다. 본 연구에서는 2020년~2021년 5월과 9월에 총 8지점 섬진강 하구 (ES1~ES3)와 광양만 (ES4~ES8)에 출현하는 어종을 파악하고 어류 군집구조의 시공간적 변화를 파악하기 위해 조사를 진행하였다. 채집된 어류는 총 2강 14목 42과 68속 78종, 5,111개체가 채집되었다. 조사기간 내 채집된 우점종으로는 보구치가 2,370개체가 채집되었으며, 상대 풍부도 (Relative abundance)는 46.4%로 나타났다. 아우점종은 주둥치가 1,643개체가 채집되어 상대 풍부도 32.1%가 나타났다. 어류 군집은 Bray-Curtis 유사도에 따라 총 3개의 그룹으로 나타났으며, 각각 기수역, 연안의 내측과 외측으로 나누어졌다. 1그룹은 주로 담수역 지점과 기수역에서 서식하는 어류가 주로 채집되었으며, 3그룹에서는 연안에 서식하는 어류들만 채집되었다. ANOSIM (Analysis of similarity) 분석을 진행한 결과, Group 2와 Group 3 사이에서 가장 큰 유의한 차이 (ANOSIM R=0.783, p=0.001)가 나타났고, 두 그룹에 기여하는 종은 보구치와 갯장어였다. 본 연구는 섬진강 하구부터 연안 외측까지 공간에 따른 어류 군집 변화를 나타내었다. 이러한 결과는 공간에 따라 변화하는 주요종에 대한 장기적인 모니터링을 제시하며, 경제성이 높은 어종의 보호와 관리를 위한 중요한 기초 자료로 활용될 것으로 사료된다.