• 한국가금학회:학술대회논문집
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• 한국가금학회 2005년도 제22차 정기총회 및 학술발표회
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• pp.62-63
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• 2005

오골계는 중요한 유전자원으로 보존할 가치가 있어 천연기념물로 보호를 받고 있다. 이 품종의 유전적인 조성을 살펴보기 위하여 mitochondrial DNA (mtDNA) 염기서열을 이용하여 계통분석을 실시하였다. 본 연구에 이용된 30마리의 오골계는 4개의 haplotype으로 분리가 되었으며 가장 많은 haplotype에는 11개의 개체가 속해 있었다. 계통 유전학적 분석 결과를 볼 때, 닭은 3개의 그룹으로 나누어지며 오골계는 3개의 그룹 모두에서 관찰됨을 알 수 있었다. 이 결과는 오골계의 보존 및 육종계획을 수립하는데 중요하게 이용될 것으로 사료된다.

• Journal of Animal Science and Technology
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• 제64권5호
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• pp.830-841
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• 2022

Genetic analysis has great potential as a tool to differentiate between different species and breeds of livestock. In this study, the optimal combinations of single nucleotide polymorphism (SNP) markers for discriminating the Yeonsan Ogye chicken (Gallus gallus domesticus) breed were identified using high-density 600K SNP array data. In 3,904 individuals from 198 chicken breeds, SNP markers specific to the target population were discovered through a case-control genome-wide association study (GWAS) and filtered out based on the linkage disequilibrium blocks. Significant SNP markers were selected by feature selection applying two machine learning algorithms: Random Forest (RF) and AdaBoost (AB). Using a machine learning approach, the 38 (RF) and 43 (AB) optimal SNP marker combinations for the Yeonsan Ogye chicken population demonstrated 100% accuracy. Hence, the GWAS and machine learning models used in this study can be efficiently utilized to identify the optimal combination of markers for discriminating target populations using multiple SNP markers.

• 한국가금학회지
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• 제42권4호
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• pp.275-283
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• 2015

닭고기 구매 의사결정력이 높은 503명의 일반 주부를 대상으로 토종닭의 생산에서 소비까지 관련된 품질 속성들을 선발하여 중요도-만족도 분석을 실시하였다. 중요도와 만족도 모두 높은 유지강화 대상으로는 원산지(origin), 유통기한(shelf life), 신선도(freshness), 위생/안전성(hygiene/safety) 등이 해당되었으며, 높은 중요도를 지님에도 만족도가 낮아 중점개선 대상으로는 토종닭 인증(certification), 냉동 여부(freeze or not) 등이 해당되었다. 건강에 대한 관심도 증가에 따라 정육량(lean meat) 또는 단백질(protein) 함량에 관심을 보였고, 관능적 특성으로 토종닭 특유의 쫄깃한 식감에 대한 중요도와 만족도가 높았다. 향후 새롭게 개발될 토종닭 품종에 대해서는 현재보다는 더 연하면서도 풍미가 강하고 쫄깃한 식감이 강한 것을 선호하였다. 이 결과를 통해 토종닭 구입 시 주요 속성과 앞으로 개선해야 할 품질적 특성 방향을 제시함으로써 신품종 토종닭의 육종 방향을 제시하고 있다.

• 대한수의학회지
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• 제27권1호
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• pp.1-7
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• 1987

The present studies were designed to investigate the morphology and stainability of the chicken spermatozoa. Semen samples were collected by abdominal massage from 10 cocks of Arbor, Acres strain (egg breed) and 10 cocks of white Cornish strain (meat breed). The semen samples were diluted with Sarker's solution and were washed. Some of the semen smear slides were stained with seven differential stain methods and was compared with one another by light microscope. In addition to the staining already compared, the length of heads, middle pieces and tails of 400 spermatozoa of two chicken breed was measured with micrometer. The results obtained from these, studies were as follows: 1. Eosin stain appeared to give good results than hematoxylin, pre-treated protease and eosin or hematoxylin stain, pre-treated protease and hematoxylin-eosin stain, carbol-fuchsin, stain and Giemsa 9 technique in differential staining of spermatozoal three portions and pre-treated protease and eosin stain appeared as good staining methods for middle piece of spermatozoa. 2. The average length of chicken spermatozoa was $90.4{\pm}4.0{\mu}m$, and the average length of the head, middle piece and tail of spermatozoa was $13.0{\pm}0.5{\mu}m$, $3.8{\pm}0.2{\mu}m$ and $73.6{\pm}3.8{\mu}m$ lesoectively. 3. The average length of spermatozoa of Arbor Acres strain was $89.2{\pm}5.0{\mu}m$ and the average length of the head, middle piece and tail of spermatozoa was $12.9{\pm}0.5{\mu}m$, $3.8{\pm}0.2{\mu}m$ and $72.5{\pm}4.7{\mu}m$ respectively. The average length of spermatozoa of with Cornish was $91.6{\pm}3.0{\mu}m$ and the average length of the head, middle piece and tail of spermatozoa was $13.1{\pm}0.5{\mu}m$, $3.8{\pm}0.2{\mu}m$ and $74.7{\pm}2.8{\mu}m$ respectively.

• 한국가금학회:학술대회논문집
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• 한국가금학회 2005년도 제22차 정기총회 및 학술발표회
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• pp.68-69
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• 2005

Dominant white와 Extended black 은 닭의 깃털 색깔에 관여하는 유전자위로서 각각 PMEL l7과 MC1R 유전자를 암호화하며 이들의 염기서열 다형은 닭의 깃털 색깔 양상과 매우 밀접하게 연관되어있다. 본 실험은 이러한 점에 착안하여 PMEL17과 MC1R 유전자의 염기서열에서 Barred Plymouth rock, Korean Ogol Chicken and White Leghorn의 품종 특이적인 염기서열 다형을 확인하였다. PMEL17 유전자에서 8개, MC1R 유전자에서 4개씩 모두 12개의 다형이 확인되었다. White Leghorn은 모든 염기서열 다형 위치에서 다른 두 종의 닭들과 다른 염기를 가지고 있었다. 그러나 Barred Plymouth Rock과 Korean Ogol Chicken은 모든 염기서열 다형 위치에서 같은 염기를 가지고 있었다.

• 한국가금학회지
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• 제35권4호
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• pp.361-366
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• 2009

본 연구는 한국재래닭의 유전적 특성과 차별성을 검증하기 위하여 microsatellite(MS) marker를 이용한 타품종들과의 유전적 유연 관계를 분석하였다. 분석을 위해 7개 계통의 닭 317수(백색레그혼: 79, 로드아일랜드레드: 40, 코니쉬: 37, 적갈재래닭: 44, 황갈재래닭: 39, 흑색재래닭: 39, 오골계: 39)를 대상으로 7개의 MS marker들을 이용해 대립 유전자 및 유전자형을 분석하였다. 7개의 집단간의 유전적 유연 관계를 알아보기 위해 각 MS marker별 대립 유전자의 빈도를 산출하여 이를 근거로 집단간의 유전적 거리에 대한 추정 결과 KY와 KL간의 유전적 거리는 0.074로 가장 가까운 것으로 나타났으며, KR과 KY(0.101), KR과 KL(0.173) 역시 가까운 유전적 거리를 나타내고 있음을 확인하였다. 로드아일랜드의 경우, 한국재래닭 3계통과의 유전적 거리가 평균 0.233으로 타품종에 비해 비교적 가까운 것으로 나타났다. 레그혼은 다른 모든 품종들과의 거리가 가장 먼 것으로 확인되었다. 또한, 산란종인 백색레그혼과 육용종인 코니쉬 간의 유전적 거리는 가장 먼 것으로 확인되었다. 분석된 집단간의 유전적 구조에 따라 각 개체들이 어떻게 분포되어 있는가를 확인하기 위하여 각 개체들간의 유전적 거리를 분석하였다. 분석 결과, 백색레그혼의 경우 하나의 큰 그룹으로 분포하고 있음을 확인하였다. 또한, 로드아일랜드레드, 코니쉬 및 오골계 역시 각각 그룹을 형성하여 분포하고 있음을 확인하였다. 한국 재래닭 3계통은 각각 그룹을 이루지 못하였으며, 3계통이 합쳐져 넓게 분포하고 있음을 확인하였다. 재래닭의 경우 넓게 분포되어 있기는 하지만 다른 품종들과의 분포의 차이가 있음을 확인할 수 있었다.

• Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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• 제29권11호
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• pp.1547-1554
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• 2016

To assess genetic diversity and maternal origin of Turkish and Iranian native chicken breeds, we analyzed the mtDNA D-loop sequences of 222 chickens from 2 Turkish (Denizli and Gerze) and 7 Iranian (White Marandi, Black Marandi, Naked Neck, Common Breed, Lari, West Azarbaijan, and New Hampshire) native chicken breeds, together with the available reference sequences of G. gallus gallus in GenBank. The haplotype diversity was estimated as $0.24{\pm}0.01$ and $0.36{\pm}0.02$ for Turkish and Iranian populations, respectively. In total, 19 haplotypes were observed from 24 polymorphic sites in Turkish and Iranian native chicken populations. Two different clades or haplogroups (A and E) were found in Turkish and Iranian chickens. Clade A haplotypes were found only in White Marandi, Common Breed and New Hampshire populations. Clade E haplotypes, which are quite common, were observed in Turkish and Iranian populations with 18 different haplotypes, of which Turkish and Iranian chickens, Clade E, haplotype 1 (TRIRE1) was a major haplotype with the frequency of 81.5% (181/222) across all breeds. Compared to red jungle fowl, Turkish and Iranian chicken breeds are closely related to each other. These results suggest that Turkish and Iranian chickens originated from the same region, the Indian subcontinent. Our results will provide reliable basic information for mtDNA haplotypes of Turkish and Iranian chickens and for studying the origin of domestic chickens.

• Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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• 제18권6호
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• pp.755-761
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• 2005

Blood samples were collected from eight native Japanese breeds of chickens (Miyadi-dori, Ohiki, Onaga-dori, Shoukoku, Tosa-Jidori, Tosa-Kukin, Toutenkou and Uzurao) and two foreign breeds of chickens (White Leghorn and Rhode Island Red) to examine the genetic variability and relationships among the breeds by using a microsatellite DNA technique. Except for the Shoukoku breed, the other Japanese chicken breeds all originate from Kochi Prefecture. Ohiki, Onaga-dori, Tosa-Jidori, Toutenkou and Uzurao are fancy fowl, and Miyadi-dori and Tosa-Kukin are utility fowl. Among the fancy fowl, Ohiki, Onaga-dori, and Toutenkou males have thick and long feathers in the saddle and tail. Genetic variabilities of the 20 microsatellites examined, varied depending on the breed: the mean number of alleles per locus ranged from 2.05 (Miyadi-dori) to 3.90 (Rhode Island Red); proportion of polymorphic loci ranged from 0.75 (Miyadi-dori) to 1.00 (Rhode Island Red, Shoukoku and Uzurao); and mean expected heterozygosity ranged from 0.330 (Miyadi-dori) to 0.607 (Rhode Island Red). Unique microsatellite alleles were detected in each breed. Using the neighbour-joining method, phylogenetic trees were constructed based on the genetic distances of D$_{A}$ and D$_{ST}$. Among the breeds originating from Kochi Prefecture, fancy and utility breeds belonged to different clusters. Among the fancy breeds, those having thick and long feathers in the tail and saddle showed a close genetic relationship to the Shoukoku breed, which also has thick and long feathers in the tail and saddle.

• 한국동물위생학회지
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• 제38권3호
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• pp.167-171
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• 2015

Pathogenic microorganisms were monitored on the chicken carcasses in slaughterhouse of Jeonbuk area. It was conducted to evaluate the microbiological quality on 204 chicken carcasses. Staphylococcus (S.) aureus was isolated in largest number and its ration was 41.2%, Salmonella spp. 6.4%, Campylobacter (C.)jejuni 7.4%, C. coli 7.4%. Serotype of Salmonella (S.) spp. was identified as S. Infantis 46.1%, S. Enteritidis 23.1%, S. Typhimurium 7.7%, S. Montevideo 7.7%. In breed chickens, Salmonella spp. was detected broiler 4.1%, white semi-broiler 8.0% Korean native chicken 12.0%. C. jejuni was isolated broiler 7.4%, white semi-broiler 12.0%, Korean native chicken 0%, C. coli, broiler 7.4%, white semi-broiler 0%, Korean native chicken 18.1% and S. aureus, broiler 38.8%, white semi-broiler 40.0%, Korean native chicken 51.5%.

• 한국가금학회지
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• 제41권4호
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• pp.305-311
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• 2014

복제수변이(Copy number variation, CNV)는 DNA 다양한 구조적 변화의 한 형태이다. 복제수변이는 인간의 질병 및 농업의 생산성에 영향을 미치는 것으로 알려져 있다. 이전 우리나라의 닭의 품종은 유럽에서 유입되어진 품종을 기반으로 구축되어져 있었다. 따라서 농촌진흥청 국립축산과학원에서는 20년 동안 재래품종을 복원하려고 노력하였고, 5품종 12계통으로 복원하였다. 최근 염기서열분석 기술의 발달로, 해상도가 좋은 게놈 전체의 복제수변이를 발굴할 수 있게 되었다. 그러나 한국 재래닭 품종에 대해서는 체계적인 연구가 이루어지지 않고 있다. 본 연구에서는 한국 재래 닭(계통 L)에 대해서 게놈 전체의 염기서열을 분석하고 닭의 참고서열과 비교하여 재래닭에서 확인된 복제수 변이를 보고하였다. 닭의 28개 염색체에서 총 501개의 복제수 변이를 확인하였고, 이를 Gain과 Loss로 나누어서 표시하였다. 또한 우리는 501개의 복제수 변이를 포함하고 있는 유전자의 기능을 분류하였다. 그 결과, 전사 및 유전자 조절에 관련된 유전자들이 많이 분류되었다. 본 연구의 결과는 복제수 변이와 한국 재래닭의 경제형질 간의 연관성을 설명할 수 있는 기초자료로 활용될 것으로 사료된다.