생체친화성 다당류 코팅은 금속류의 생체재료 자체 염증 반응으로 의한 합병증(예: 스텐트 재협착 등) 문제를 해결하는 데 활용될 수 있지만, 자체적인 친수성으로 인해 체내의 습윤 환경에서 코팅층이 오랫동안 유지되기 어렵다. 본 논문에서는 히알루론산 상에 접착성 카테콜 작용기를 도입하여 습윤 환경에서도 강한 부착력을 유지하는 다당류 기반의 바이오코팅 소재를 합성하고, 폴리젖산으로 구성된 스텐트 상에서의 수중 안정성 테스트를 통해 그 기능성을 확인하고자 하였다. 연구 결과, 1.26%의 낮은 카테콜 작용기 도입만으로도 수중 안정성이 크게 증대되었음을 모세관 실험 및 분광학적 분석 방법을 통해 확인할 수 있었다. 본 연구 결과는 바이오 코팅 재료의 생채 내 안정성 증대를 위해 카테콜 작용기 도입이 유용할 수 있다는 점을 시사한다.
Pseudomonas sp. NGK1, isolated by naphthalene enrichment culture technique, is capable of degrading anthracene as a sole source of carbon and energy. The organism degraded anthracene through the intermediate formation of 1,2-dihydroxyanthracene, 2-hydroxy-3-naphthoic acid, salicylate, and catechol. The intermediates were isolated and characterized by TLC, spectrophotometry, and HPLC analysis. The cell free extract of anthracene-grown cells showed activities of anthracene dioxygenase, 2-hydroxy-3-naphthylaldehyde dehydrogenae, 2-hydroxy-3-naphthoate hydroxylase, salicylate hydroxylase and catechol 2,3-dioxygenase. The formed catechol as a metabolite is degraded through meta-cleavage with the formation of ${\alpha}$-hydroxymuconic semi-aldehyde.
Park, Dong-Woo;Lee, Jun-Hun;Lee, Dong-Hun;Lee, Kyoung;Kim, Chi-Kyung
Journal of Microbiology and Biotechnology
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제13권5호
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pp.700-705
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2003
Pseudomonas sp. S-47 is capable of degrading benzoate and 4-chlorobenzoate as well as catechol and 4-chlorocatechol via the meta-cleavage pathway. The three enzymes of 2-oxopenta-4-enoate hydratase (OEH), acetaldehyde dehydrogenase (acylating) (ADA), and 2-oxo-4-hydroxypentonate aldolase (HOA) encoded by xylJQK genes are responsible for the three steps after the meta-cleavage of catechol. The nucleotide sequence of the xylJQK genes located in the chromosomal DNA was cloned and analyzed. GC content of xylJ, xylQ, and xylK was 65% and consisted of 786, 924, and 1,041 nucleotides, respectively. The deduced amino acid sequences of xylJ, xylQ, and xylK genes from Pseudomonas sp. S-47 showed 93%, 99%, and 99% identity, compared with those of nahT, nahH, and nahI in Pseudomonas stutzeri An10. However, there were only about 53% to 85% identity with xylJQK of Pseudomonas putida mt-2, dmpEFG of P. putida CF600, aphEFG of Comamonas testosteroni TA441, and ipbEGF of P. putida RE204. On the other hand, the xylLTEGF genes located upstream of xylJQK in the strain S-47 showed high homology with those of TOL plasmid from Pseudomonas putida mt-2. These findings suggested that the xylLTEGFIJQK of Pseudomonas sp. S-47 responsible for complete degradation of benzoate and then catechol via the meta-pathway were phylogenetically recombinated from the genes of Pseudomonas putida mt-2 and Pseudomonas stutzeri An10.
Park, Dong-Woo;Chae, Jong-Chan;Kim, Young-Soo;Iida, Toshiya;Kudo, Toshiaki;Kim, Chi-Kyung
BMB Reports
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제35권4호
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pp.432-436
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2002
Pseudomonas sp. S-47 is capable of degrading catechol and 4-chlorocatechol via the meta-cleavage pathway. XyITE products catalyze the dioxygenation of the aromatics. The sylT of the strain S-47 is located just upstream of the xylE gene. XylT of the strain S-47 is located just upstream of the xylE gene. XyIT is typical chloroplast-type ferredoxin, which is characterized by 4 cystein residues that are located at positions 41, 46, 49, and 81. The chloroplast-type ferredoxin of Pseudomonas sp. S-47 exhibited a 98% identity with that of P. putida mt-2(TOL plasmid) in the amino acid sequence, but only about a 40 to 60% identity with the corresponding enzymes from other organisms. We constructed two recombinant plasmids (pRES1 containing xylTE and pRES101 containing xylE without xylT) in order to examine the function of XyIT for the reactivation of the catechol 2,3-dioxygenase (XyIE) that is oxidized with hydrogen peroxide was recovered in the catechol 2,3-dioxygenase (C23O) activity about 4 mimutes after incubation, but the pRES101 showed no recovery. That means that the typical chloroplast-type ferredoxin (XyIT) of Pseudomonas sp. S-47 is involved in the reactivation of the oxidized C23O in the dioxygenolytic cleavage of aromatic compounds.
본 연구는 방향족 화합물질 중 페놀폐수에 대한 생물학적 처리를 위해 본 실험실에서 분리한 페놀분해능이 우수한 Rhodococrus sp. EL-GT를 이용하여 catechol 분해 catechol 1,2-dioxygenase 분해활성을 측정하였고, 이것이 ortho-pathway임을 확인할 수 있었다. 또한 다른 연구에서 보고된 Rhodococcus rhodochrous NCIMB 13259 균주의 catechol 1,2 dioxygenase를 기초로한 primer를 이용하여 PCR을 수행하였으며 이 분해 유전자의 cloning실험을 수행 중이다. 이들 실험을 통하여 Rhodococcus sp.의 페놀분해균의 유전적 구조 및 특성을 검토하고 밝혀지는 단백질 정보를 이용하여 방향족 화합물의 분해능이 보다 우수한 균주의 개발을 시도하고자 한다.
Changes in polamine titers during shoot differentiation in Cymbidium sp. (Jungfrau) protocorms were studied in order to investigate the mechanism of shoot differentiation by using auxin-inhibitors(PCIB, TIBA), hormones(GA3, ABA, BA), and phenolic compounds (2,4-dichlorophenol, catechol). The shoot differentiation and propagation of protocorms were promoted by PCIB or 2,4-dichlorophenol, and the growth of differentiated shoot were promoted by TIBA or catechol. In BA-treated protocorms, white or brown protocorms were observed. Putrescine was the most abundant polyamine during the propagation and differentiation processes. As compared with putrescine, spermidine did not show significant changes and spermine was not detected at all. Putrescine titers decreased after a temporary increase, and then again increased in the presence of GA3, ABA, 2,4-dichlorophenol, and then again increased in the presence of GA3, ABA, 2,4-dichlorophenol, catechol, or PCIB. But, in BA-treated protocorms, putrescine level was much lower than spermidine.
Polyphenol oxidase(PPO) isolated from the crude extract of ascidian, Halocynthia roretzi, showed higher affinity for catechol than tyrosine or DL-DOPA. Successful enzyme assay could be performed at $25^{\circ}C$, 10min. by mixing 0.2ml of crude enzyme extract with 2.8ml of 0.13M catechol in 0.1M sodium phosphate buffer(pH 6.4). The specific activity of PPO which had been purified with a combination of ammonium sulfate treatment, ion exchange chromatography on DEAE-cellulose, and gel filtration on Sepharose 6B was 13-fold disc gel electrophoresis. The activity of PPO was stable from pH 5.0 to 8.0 and showed the peak activity at pH 6.4 .The optimum reaction temperature for PPO oxidation on catechol was 35$^{\circ}C$ and those enzyme were heat stable up to 4$0^{\circ}C$. Molecular weigth of the enzyme was estimated about 170kDa. One molecule was found to be composed of gour subunits. Two of them had molecular weigh of 55kDa and the others 30kDa. The {TEX}$K_{m}${/TEX} values, {TEX}$V_{max}${/TEX} and catalytic efficiency({TEX}$V_{max}${/TEX}/{TEX}$K_{m}${/TEX}) for catechol were 0.12mM, 2.5mM/liter/min. and {TEX}$0.18min^{-1}${/TEX} respectively. The substrate affinity and electrophorectic pattern suggested that the enzyme of ascidian was considered to be not tyosine but catechol oxidase.
본 연구에서는 단일 탄소원과 질소원으로 aniline을 이용하는 것으로 보고된 바 있는 Bukholderia sp. HY1과 Deiftia sp. HY99로부터 aniline의 첫 번째 분해 단계에 관련된 aniline dioxygenas의 위치를 확인하고 그 유전자를 클로닝하여 아미노산 서열을 결정하고 비교하였다. 한 개 이상의 플라스미드 DNA를 포함하고 있을 것으로 조사된 B.a sp. HY1에서 유래된 플라스미드의 curing 실험을 통해, B. sp. HY1의 aniline oxygenase는 플라스미드가 아닌 염색체 DNA에 존재하는 것으로 확인되었다. B. sp. HY1과 D. sp. HY99에서 유래된 aniline dioxygenase small subunit는 146개 아미노산을 기준으로 약 79%의 상동성을 보였다. 특히, B. sp. HY1으로부터 얻어진 ado2는 aniline dioxygenase small subunit의 terminal dioxygenase에 속하는 것으로 Frateuria sp. ANA-18의 tdnA2와 99%, 그리고 Delftia sp. HY99의 ado2는 Delftia sp. AN3의 danA2와 99% 이상의 아미노산 상동성을 나타내었다. 또한 본 연구에서 두 균주에서 얻어진 catechol oxygenase의 아미노산 서열분석을 통해 B. sp. HY1은 catechol 1,2-dioxygenase에 의해 ortho pathway를 D. sp. HY99는 catechol 2,3-dioxygenase에 의해 meta pathway를 운영할 것이라는 이전 보고를 강력하게 뒷받침해 주었다.
The authors isolated four olefinic catechols, commonly referred to as urushiol, from the sap of Korean lacquer tree(Rhus vernicifera STOKES) with stronger antioxidative activities than $\alpha-tocopherol$. The hexane extract with a free radical scavenging activity was purified by silica and ODS gel column chromatography. The active compounds were identified by MS and $^1H-NMR$ as 3-[8'(Z),11'(Z),14'-pentadecatrienyl]catechol, 3-[8'(Z),11'(Z)-pentadecadienyl]catechol, 3-[8'(Z)-pentadecenyl] catechol, and 3-pentadecylcatechol. All of these compounds showed strong free radical scavenging activities on 1,1-diphenyl-2-picrylhydrazyl(DPPH) radical, in which 3-pentadecylacatechol exhibited the highest activity ($IC_{50}$: $1.2{\mu}g/ml$). They also showed a significant inhibitory activity on lipid peroxidation ($IC_{50}$: 2.1 - 3.5 ${\mu}g/ml$). The antioxidative activity of 3-pentadecylcatechol on DPPH radical and lipid peroxidation is approximately two times greater than that of $\alpha$-tocopherol. The results suggest that the urushiol derivatices may contribute to the preservative characteristics effective against oxidative stress and could be a good source for industrial applications including a coating material.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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