• 한국어류학회지
• /
• 제18권4호
• /
• pp.293-299
• /
• 2006

두툽상어 (Scyliorhinus torazame)부터 분리된 항산화 효소 Cu,Zn-superoxide dismutase (Cu,Zn-SOD 또는 SOD1)의 핵산 염기서열 및 추정 아미노산 서열을 대상으로 분자 계통학적 분석을 실시하였다. 종래 알려져 있는 척추동물의 Cu,Zn-SOD 서열들을 포함하여 neighbor-joining (NJ), maximum parsimony (MP), maximum likelihood (ML) 및 Bayesian 분석 등을 포함한 다양한 계통 분석을 수행하였으며, 이를 통해 연골어류인 본 어종의 척추동물 분류군 내에서의 계통적 위치를 추정하고자 하였다. 다양한 분자 계통수로부터 얻어진 대부분의 consensus tree들에서 분석에 사용한 분류군들은 종래 알려진 분류학적 위치와 비교적 잘 일치하였고, 이중 두툽상어는 같은 연골어류종인 blue shark와 높은 유연관계를 나타내면서 보다 진화한 경골어류들과는 확연히 구분되는 분지를 형성하였다. 특히 핵산 염기서열을 바탕으로 한 neighbor-joining 분석에서 두툽상어는 경골어류와 양막동물에 비해 보다 원시형태의 척추동물 Cu,Zn-SOD 유전자의 한 형태를 보유하고 있는 것으로 나타났다.

• 대한방사성의약품학회지
• /
• 제6권1호
• /
• pp.39-45
• /
• 2020

Recently, single-domain antibodies (sdAb) are bioengineered for molecular imaging applications. Single-domain antibody, obtained from naturally occurring antibodies in camelid species and cartilaginous fish is the smallest fully functional antigen-binding antibody fragments of heavy-chain. Since their discovery, they have been investigated extensively in clinical therapeutics, monitoring and diagnostics. Their small size is important advantage for high solubility, high stability, fast blood clearance and rapid targeting. This review article summarizes the recent status of this new antibody to visualize, diagnose or inhibit specific targets of cancer.

• 한국어병학회지
• /
• 제14권2호
• /
• pp.59-64
• /
• 2001

두툽상어의 간조직 cDNA library의 EST를 통해 중금속의 세포내 농도 조절과 환경으로부터 흡수한 유해 중금속의 해독작용 등의 기능을 수행하는 MT 유전자를 cloning하였다. 염기서열 분석 결과 두툽상어의 MT 유전자는 204bp의 coding 영역과 182bp의 3'UTR 영역으로 구성되어 있었으며, 종결코돈 이후 162bp의 polyadenylatin 신호서열과 이로부터 15bp 이후의 poly(A)서열 등이 확인되었다. 염기서열로부터 유추한 68개의 아미노산 서열에는 다른 척추동물에서와 같이 Cys 잔기가 전체의 29.4%(20/68)로 풍부하였으며, 아미노산 서열수준에서 포유류와는 43~54%, 어류들과는 41~45%의 상동성을 나타냈었다. 특히 20개의 Cys은 어류와 18개가 다른 척추동물과는 19개가 잘 보존되어 있었다. 두툽상어 MT는 특이하게 모든 척추동물에서 잘 보존된 $\beta$-domain 끝 쪽의 9번째 Cys앞에 5개의 아미노산을 더 갖고 있었으며, 경골어류 MT의 특징인 4번째 위치의 gap이 없고, 18번째 Cys의 위치가 어류와 달리 다른 척추동물들과 같았다. 또한 C 말단의 아미노산 잔기가 다른 생물체와는 모두 다른 Ser을 갖는 특징을 나타내었다. 이와 같은 두툽상어 MT유전자의 특징들은 연골어류의 분자적 진화과정을 알 수 있는 분자 표지유전자로 이용할 수 있을 것이다.

• 한국어병학회지
• /
• 제24권3호
• /
• pp.205-211
• /
• 2011

충북 청원군 병천천에서 채집된 시료 중 붕어 5마리에서 모두 거머리가 관찰되었고, 잉어는 10마리 중 5마리에서 거머리의 기생이 확인되었다. 잉어에서의 거머리 기생은 국내에서 처음으로 확인되었다. 붕어 아가미는 거머리의 흡혈로 인하여 새엽 상피세포의 증가, 새판에 존재하는 모세혈관의 확장, 새판 일부분과 새엽이 소실, 새판 상피세포들은 수종변성(hydrophic degeneration), 울혈, 새판 및 새엽 상피세포의 증식 등이 관찰되었다. SEM으로 관찰한 결과 새판이 인접하는 새판과 점진적으로 융합되어, 결국은 새엽 하나가 원통모양으로 변형되었다. 또한, 붕어 아가미 새엽의 자유면에 존재하는 미세융기의 부분적인 파괴가 관찰되었다. 새엽 상피층이 파괴된 부분에는 연골기질이 외부로 노출되었고, 그 주변에는 다수의 혈구들이 산재하고 있었다. L. sinensis의 18S rRNA 분석은 형태학적 분류와 일치하지 않았다.

• 한국어류학회지
• /
• 제8권2호
• /
• pp.57-67
• /
• 1996

인도네시아 아라푸라해의 어류를 조사하기 위하여 1994년 6월과 1996년 3월 두차례에 걸쳐 이 해역에서 조업하고 있는 한국 트롤선에 승선하여 어획된 어획물을 분류한 결과, 총 137종의 어류가 동정되었다. 이 중 '94년과 '96년에 동시에 출현한 어종은 모두 40종이었다. 전체 출현종 가운데 연골어류에서는 흉상어목에서 흉상어과 6종, 홍어목에서 색가오리과 3종이 출현하였으며, 경골어류에서는 농어목의 전갱이과 17종, 민어과 6종, 청어목의 멸치과 4종, 복어목의 참복과 3종의 순으로 종수가 많았다. 아라푸라해에서 처음으로 기록되는 종은 Sardinella longiceps, Setipinna melanochir, Cypselurus hiraii, Podothecus sachi, Nemipterus aurora, Johnius grypotus, Moolgarda perusii의 모두 7종이었다.

• Animal cells and systems
• /
• 제9권1호
• /
• pp.1-7
• /
• 2005

Class I and class II MHC genes have been identified in most of the jawed vertebrate taxa. In all investigated bony fish species, unlike mammals, the classical class I and class II MHC genes are not linked and even are found on different chromosomes. Linking and clustering of the class I and class II MHC genes is not the only phenomenon clearly detected in the evolution of immune system from cartilaginous to mammals. In all non-mammalian classes the LMP/TAP genes are highly conserved within class I genes region, while these genes are conserved within class II genes region only in mammals. Today we know that LMP/TAP genes in mammals have a crucial role in peptide processing for presentation within class I molecules, as well as in anti-tumor immunity. For these reasons, differences in clustering of LMP/TAP/MHC genes can be responsible for the differences in mechanisms and efficacy of anti-tumor immunity in non-mammalian vertebrates compared to same mechanisms in mammals. Also, the differences in cytokine network and anti-tumor antigens presentation within classes of vertebrates can be explained by toe peculiarity of LMP/TAP/MHC gene clustering.

• 생명과학회지
• /
• 제28권1호
• /
• pp.105-109
• /
• 2018

생물다양성은 생존하는 유기체들의 변이성으로 정의하며 지구상의 생물의 다양성과 생태계를 구성하는 복잡한 상호작용을 일컫는다. 본 연구는 합천군 덕진천에 서식하는 동물의 종조성과 다양성을 공간적 시간적 양상으로 실시하였다. 2016년 시즌에 동정된 포유류, 연골어류, 경골어류, 조류, 양서류, 파충류, 어류 종의 수는 55분류군이었다. 포유류의 Berger-Parker's index (BPI)는 0.233(지점 A)에서 0.333(지점 D)로 나타났다. 포유류와 조류에 대한 Shannon-Weaver index (H')와 두 다른 다양성 척도(N1과 N2)는 상류지역이 하류 지역보다 높았다. 동물 분류군에 대한 ${\beta}$-다양성은 어류 0.229에서 무척추동물 0.339까지 나타났다. 동물종에 대한 풍부도 지수는 지점과 시기에 따라 변화가 있었다. 지점 A는 포유류, 조류, 양서/파충류에서 높은 풍부도를 나타내었다. 비록 다섯 동물 강에 대한 풍부도 지수(R1, R2)가 시즌 별로 다르지만 유의성을 나타내지는 않았다. 균등도 지수(E1-E5) 역시 시즌 별로 다르지만 유의성을 나타내지는 않았다.

• 생명과학회지
• /
• 제8권3호
• /
• pp.235-240
• /
• 1998

Matrix metalloproteinases(MMP)는 배발생 및 재조직화 등의 정상적인 생체형성과 관절염, 암전이, 치근막염, 골조송증 등의 질병과정에서 collagen이나 proteoglycan과 같은 세포외기질의 구성성분을 분해하는 아연(zinc)효소군이다. 지금까지 다양한 종에서 mmp의 유전자가 클로닝되고 그 기능이 연구되어 왔지만 아직 어류에서는 연구결과가 보고된 바가 없다. 본 연구에서는 한국의 부산연안에 많은 연골어유 투툽상어(Scylliorhinus toraxzame)로부터 RT-PCR(reverse transcriptase dependent polymerase chain reaction)의방법으로 mmp cDNA의 일부를 클로닝하였다. 이것은 염기서열에서 인간, 쥐 및 닭의 membrane type matrix matalloproteinase-3(mt3-mmps)의 염기서열과 74% 동일성을 보이며, 아미노산서열에서는 90%이상의 동일성을 갖고 있다. 또한 MMP에 나타나는 cysteine switch domain, zinc binding domain(HExGH motif), propeptide cleavage site, and RRKR motif등을 가지고 있다. 이러한 결과로부터 본 연구에서 클로닝된 RT-PCR단편은 두툽상어의 mt3-mmp 또는 이와 유사한 유전자의 cDNA이라 믿어진다.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
• /
• 제30권8호
• /
• pp.1195-1206
• /
• 2020

Beringraja pulchra, Cham-hong-eo in Korean, is a mottled skate which is belonging to the cartilaginous fish. Although this species is economically valuable in South Korea as an alkaline-fermented food, there are few microbial studies on such fermentation. Here, we analyzed microbial changes and pH before, during, and after fermentation and examined the effect of inoculation by a skin microbiota mixture on the skate fermentation (control vs. treatment). To analyze microbial community, the V4 regions of bacterial 16S rRNA genes from the skates were amplified, sequenced and analyzed. During the skate fermentation, pH and total number of marine bacteria increased in both groups, while microbial diversity decreased after fermentation. Pseudomonas, which was predominant in the initial skate, declined by fermentation (Day 0: 11.39 ± 5.52%; Day 20: 0.61 ± 0.9%), while the abundance of Pseudoalteromonas increased dramatically (Day 0: 1.42 ± 0.41%; Day 20: 64.92 ± 24.15%). From our co-occurrence analysis, the Pseudoalteromonas was positively correlated with Aerococcaceae (r = 0.638) and Moraxella (r = 0.474), which also increased with fermentation, and negatively correlated with Pseudomonas (r = -0.847) during fermentation. There are no critically significant differences between control and treatment. These results revealed that the alkaline fermentation of skates dramatically changed the microbiota, but the initial inoculation by a skin microbiota mixture didn't show critical changes in the final microbial community. Our results extended understanding of microbial interactions and provided the new insights of microbial changes during alkaline fermentation.

• 한국어류학회지
• /
• 제17권1호
• /
• pp.19-28
• /
• 2005

줄납자루, Acheilognathus yamatsutae (Cyprinidae)의 골격형성과 연골의 골화 과정에 대하여 연구한 결과는 다음과 같다. 전장 $6.82{\pm}0.08mm$ 에 부설골 (parasphenoid), 치골 (dentary), 익상골 (pterygoid), 각설골 (ceratohyal), 새궁(branchial arch) 등과 미골 (caudal skeleton)의 일부 등이 생성되었다. $7.76{\pm}0.09mm$에는 전두골 (frontal)과 두정골 (parietal)의 발달이 현저하였고, 주상악골 (maxillary)이 나타났으며, 흉대 (pectoral girdle)의 방사기골(proximal), 견갑골 (scapula), 오훼골 (coracoid)이 형성되었다. 또한 신경극 (neural spine)과 혈관극 (hemal spine)이 미추(caudal vertebrae)에 생성되기 시작하였다. $9.68{\pm}0.14mm$에 내장골 (vesceral skeleton)의 주새개골(opercle)과 새조골 (branchiostegals)이 나타났으며, 12.94 mm에는 흉대의 후측두골 (post temporal)이 생성되었다. 골격의 골화는 $9.68{\pm}0.14mm$를 전후하여 일어났으며, 부설골, 인두골 (pharyngeal bone), 치골, 전상악골(premaxillary), 주상악골, 주새개골 등과 늑골 (pleural rib), 신경극, 혈관극이 골화되었으며, 흉대의 의쇄골(cleithrum)과 상의쇄골 (supracleithrum) 그리고 미골의 미부봉상골 (urostyle)과 꼬리지느러미 (caudal fin)가 골화되었다. $11.52{\pm}0.13mm$에는 척추골이 생성되면서 골화되었고, $15.30{\pm}0.68mm$에 두부의 전두골, 전새개골(preopercle), 하새개골 (subopercle), 설악골 (hyomandibular)등이 경골화되었다. 본 종의 골격 형성과 골화는 다른 어종에 비하여 비교적 늦게 발달하였다.