• 제목/요약/키워드: base pair stability

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Poly$[d(A-T)_2]$, Poly$[d(G-C)_2]$와 스퍼민의 결합 형태에 관한 연구 (Binding Site of Spermine at Poly$[d(A-T)_2]$ and Poly$[d(G-C)_2]$)

  • 윤병화;전선희;송영대;조태섭;김석규
    • 대한화학회지
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    • 제42권5호
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    • pp.506-511
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    • 1998
  • 생체 내에서 양이온을 가지는 폴리아민류인 스퍼민이 DNA에 결합할 경우 안정화도를 증가시킴과 동시에 구조적인 변환(B형태→Z형태 변환)을 유발하는 것으로 알려져 있다. 그러나, 스퍼민의 분광학적 비활성 때문에 DNA에 대한 정확한 결합 위치를 분광학적으로 결정하는 것은 불가능했으므로 그 결합메커니즘에 관한 구체적인 보고는 없다. 본 실험에서는 스퍼민에 대한 탐침 작용을 할 수 있는 물질로 분광 활성이 있으며 결합 자리를 잘 알고 있는 DAPI를 사용하였다. 합성 DNA에서 스퍼민의 결합 자리와 염기 선택성을 연구한 결과, 스퍼민의 농도가 커질수록 아데닌-티민 염기쌍이 교대로 나선을 이루는 $poly[d(A-T)_{2}]$ 에서는 스퍼민이 DNA의 작은 홈 주위의 인산기 뼈대에 걸쳐지면 DAPI의 소수성 환경을 증가시켜 형광스펙트럼의 세기를 급격히 증가시킨다. 구아닌-시토신 염기쌍이 교대로 반복되며 만들어진 $poly[d(G-C)_{2}]$에서는 스퍼민이 DNA의 큰 홈 속에 결합하면서 큰 홈에 걸쳐 있으면서 부분적으로 염기쌍사이에 삽입된 DAPI를 밀어내는 것으로 생각할 수 있다. 이 두 가지의 경우에 스퍼민이 염기쌍에 대해 특별한 선택성을 보이지 않았다.

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효과적인 siRNA의 디자인 (Designing An Effective siRNA)

  • 구남진;조광휘
    • Bioinformatics and Biosystems
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    • 제2권1호
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    • pp.17-23
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    • 2007
  • Short interfering RNA(siRNA)는 특별한 gene의 발현을 막는데 사용될 수 있고 그 gene의 기능과 치료의 적용에 많은 가능성을 가지고 있지만, 효과적인 siRNA를 디자인하는 방법은 아직까지 명확하지 않다. 효과적인 siRNA는 서열적인 경향을 가지고 있는데 낮은 G/C content, Sense strand의 3' 끝에 적은 안정성과 1번 위치에는 G/C, 19번 위치에는 A/U의 존재 여부를 들 수 있다. 이러한 특성 말고도 최근에는 mRNA의 2차구조가 RNAi 작용에 중요한 역할을 하게 되는데 복잡한 구조(hairpin, multi loop)를 가지고 수소결합을 많이 하여 안정한 상태에 있는 부분은 siRNA의 기능을 크게 줄어들게 한다. 또한, siRNA가 특정한 mRNA에 작동하도록 BLAST 검색을 하여 부작용의 가능성을 배제한다.

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라미네이팅 필름의 코로나 처리 효과와 주사 전자현미경을 이용한 해석 (The Effect of Corona Treated on Laminating Film and Its Analytical Study by SEM)

  • 김종규;김양평
    • 한국인쇄학회지
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    • 제26권2호
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    • pp.15-30
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    • 2008
  • Studies were carried out the phenomenal observation on the effect of corona treated hotmelt laminating film in process of manufacture by 2 kinds of experiments. These are as follow: 1) In order to verify the treatment reducing value of dynes and dynes durability with the lapse of time, it was checked dynes of a pair of 4 bar discharge electrode with 9 one for 144 hr., and it show results that 9 bar discharge electrode has higher initial dynes as well as keep up 48 dynes durability long than 4 one. 2) Drawn an inference from 3 actions -Chemical-Physical-Mechanical, on laminating film in terms of SEM's observation that are the adhesive status in boundary of corona treated base film, extrusion coating hotmelt layer, and configuration of hotmelt surface after corona treated. In tandem system, EVA layers adhesion keep its stability without corona discharge treatment.

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병렬구조 신 압연기의 최적설계 : 조작성 및 제어성능의 최대화 (Optimal Design of a New Rolling Mill Based upon Stewart Platform Manipulator : Maximization of Kinematic Manipulability)

  • 홍금식;이승환;최진태
    • 제어로봇시스템학회논문지
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    • 제8권9호
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    • pp.764-775
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    • 2002
  • A kinematic and dynamic optimal design of a new parallel-type rolling mill based upon Stewart platform manipulator is investigated. To provide sufficient degrees-of-freedom in the rolling process and the structural stability of each stand, a parallel manipulator with six legs is considered. The objective of this new parallel-type rolling mill is to permit an integrated control of the strip thickness, strip shape, pair crossing angle, uniform wear of the rolls, and tension of the strip. By splitting the weighted Jacobian matrices Into two parts, the linear velocity, angular velocity, force, and moment transmissivities are analyzed. A manipulability measure, the ratio of the manipulability ellipsoid volume and the condition number of a split Jacobian matrix, is defined. Two kinematic parameters, the radius of the base and the angle between two neighboring Joints, are optimally designed by maximizing the global manipulability measure in the entire workspace. The maximum force needed in the hydraulic actuator is also calculated using the structure determined through the kinematic analysis and the Plucker coordinates. Simulation results are provided.

유통 중인 고추 품종에 대한 Microsatellite 마커 Data Base 구축 (Construction of a Microsatellite Marker Database of Commercial Pepper Cultivars)

  • 권용삼;홍지화;최근진
    • 원예과학기술지
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    • 제31권5호
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    • pp.580-589
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    • 2013
  • 국내에서 최근에 유통되고 있는 고추 170품종을 대상으로 microsatellite 마커를 이용하여 DNA 프로파일 데이터베이스를 구축하기 위하여 품종식별력이 높은 분자표지의 선정 및 이를 활용한 품종 식별력 및 유전적 유사도 검정 등에 대한 연구를 수행하였다. 고추 형태적 특성이 다른 11품종을 302개의 microsatellite 마커로 검정하여 24개의 다형성이 높은 마커를 선정한 다음 170품종에 대한 DNA 프로파일 데이터베이스를 구축하였다. 고추 170품종을 24개의 microsatellite 마커로 분석하였을 때 마커당 평균 대립유전자수는 6.83개로 나타났고, 최소 2개부터 15개까지 다양한 분포를 나타내었다. PIC 값의 경우 0.324-0.873 범위에 속하였으며 평균값은 0.673으로 높게 나타났다. Microsatellite 마커의 대립유전자를 이용하여 고추 170품종에 대한 계통도를 작성하였을 때 과실의 형태에 따라 3개의 그룹으로 크게 나누어졌으며 모든 품종이 microsatellite 마커의 유전자형에 의해 식별이 되는 것으로 나타났다. 이 연구결과에 의해 개발된 고추 품종별 DNA 프로파일 데이터베이스는 품종보호출원 품종의 선 DNA 검정을 통한 대조품종 선정, 구별성, 균일성, 안정성의 재확인에 매우 유용하게 이용되어질 수 있어 향후, 품종보호권 강화 등에 크게 기여할 수 있을 것으로 사료된다.