Um, Si-Hyeon;Kim, Jin-Sik;Song, Saemee;Kim, Nam Ah;Jeong, Seong Hoon;Ha, Nam-Chul
Molecules and Cells
/
v.38
no.8
/
pp.715-722
/
2015
In Gram-negative bacteria in the periplasmic space, the dimeric thioredoxin-fold protein DsbC isomerizes and reduces incorrect disulfide bonds of unfolded proteins, while the monomeric thioredoxin-fold protein DsbA introduces disulfide bonds in folding proteins. In the Gram-negative bacteria Salmonella enterica serovar Typhimurium, the reduced form of CueP scavenges the production of hydroxyl radicals in the copper-mediated Fenton reaction, and DsbC is responsible for keeping CueP in the reduced, active form. Some DsbA proteins fulfill the functions of DsbCs, which are not present in Gram-positive bacteria. In this study, we identified a DsbA homologous protein (CdDsbA) in the Corynebacterium diphtheriae genome and determined its crystal structure in the reduced condition at $1.5{\AA}$ resolution. CdDsbA consists of a monomeric thioredoxin-like fold with an inserted helical domain and unique N-terminal extended region. We confirmed that CdDsbA has disulfide bond somerase/reductase activity, and we present evidence that the N-terminal extended region is not required for this activity and folding of the core DsbA-like domain. Furthermore, we found that CdDsbA could reduce CueP from C. diphtheriae.
For the rapid detection of objective pathogenic bacteria from colon biopsy specimens, multiplex PCR (polymerase chain reaction) method was developed. The major objective bacteria in this study were Shiga-like toxin producing E. coli O157:H7, Staphylococcus aureus, Vibrio parahaemolyticus, Listeria monocytogenes, Shigella spp. Salmonella spp. and Yersinia spp.. To detect simultaneously 7 kinds of pathogenic bacteria in single reaction tube, multiplex PCR system was executed using 6 sets of primers used in single PCR system for the respective bacteria. The results in this research might be applied for the detection of pathogenic bacteria form colon biopsy samples.
NC strain mice were inoculated intraperitoneally with Dermatophoilus-like microorganism strain W254 isolated from the sulfur granules of the swine tonsils. The development of the resulting abscesses in NC strain mice was investigated at regular time intervals by means of histological, histochemical and electron microscopical methods. The results obtained were as follows ; 1. The inoculated bacteria have settled in the subserous site of the peritoneal organ and provoked cellular response to form neutrophil, macrophage and connective tissue layers at the time of one week after inoculation, and thereafter were found to have formed typical actinomycotic abscess two weeks after inoculation. 2. The persistant abscesses were appeared to reveal close interaction between higher activity of organism and tissue reaction and contained hyaloid bodies within or outside bacterial clumps. 3. The hyaline materials were appeared to be composed of protein rich in hydroxyphenyl group by histochemical examination. The materials were presumed to be produced by the interaction between bacterial activity and host cell reaction. 4. The bacteria in the abscesses showed the various developmental stages of coccoid body, mulberry-like body tuber-shaped body and filamentous body, and it was confirmed that the mesosomal development was related to septation of the bacterial cells.
Aerobic floc-like sludge was formed in a batch reactor and the effect of cations on the formation of aerobic floc-like sludge was studied. In order to enhance the formation (rate) of aerobic floc-like sludge, cations such as $K^+$, $Na^+$, $Ca^{2+}$, and $Mg^{2+}$ were added to the seed sludge. It was found that $Ca^{2+}$ had positive effect on the formation of floc-like sludge, as measured by sludge volume index (SVI) for settle ability. The formation of floc-like sludge was confirmed by the microscopic observation after DAPI staining. The scattered forms of sludge samples at the initial stage became aggregated to form floes after $Ca^{2+}$ addition. To ensure the functions of sludge floes in a treatment plant, the gradient of ionic species around the surfaces of floc-like sludge was monitored by ion selective microelectrodes for ${NH_4}^+,\;{NO_3}^-$, and pH. The effective concentration of $Ca^{2+}$ ion to form floc-like sludge was determined to be 750 mg/L (0.15 mg $Ca^{2+}/mg$ MLSS). Under the effective $Ca^{2+}$ condition, the SVI value was the lowest and large distribution of nitrifying bacteria at the outer surface was observed in the aerobic floc-like sludge. From the results, it was found that the calcium ion functioned as an agent for the formation of aerobic floc-like sludge, resulting in the enhanced nitrification.
The Osaeg hotspring (long. $128^{\circ}$ 56'E, tat. $37^{\circ}$ 06'N) located in the northester part of Kangwon-do, Korea. The pH value of the hot spring water is 8.31, and the EC, $SO_4$, F and Na are 196 ${\mu}\textrm{s}$/cm, 10.88 mg/L, 8.19 mg/L, and 37.07 mg/L, respectively. The ocherous precipitates are precipitated on the stream bottom of Osaeg hot spring drainage. X-ray diffraction analysis (XRD), scanning electron microscopy (SEM) and stereo-microscope were used to analyze the precipitates. X-ray diffraction analysis shows that the precipitates consist mainly of poorly crystalline materials and messelite. Many spherical and rod-shaped bacteria-like forms were observed in the precipitates.
Image contrast of whole bacteria was compared in Staphylococcus aureus and Escherichia coli depending on pre-stain suspension liquids by energy-filtering transmission electron microscopy. The two bacterial strains were suspended in three most commonly used liquids for negative staining (triple distilled water [DW], phosphate-buffered saline [PBS], and nutrient broth [NB]) and directly observed without staining or stained with neutralized potassium phosphotungstate (PTA), respectively. Even though in low contrast, unstained bacteria were observed owing to their inherent electron density and cell shape in zero-loss (elastic scattering) images. After being suspended in PBS, unstained bacteria appeared to have higher contrast and more refined periphery than DW-suspended ones, and extracellular appendage structures such as fimbriae and flagella could be discerned. The unstained bacteria appeared to be invariably surrounded with electron-lucent precipitates, possibly from PBS. As far as delineation of the structures, the combination of DW or PBS suspension with subsequent staining provided the most satisfactory results, as evidenced by the high contrast of bacterial morphology and appendage structures. However, after being suspended in NB and stained with PTA, bacteria often had too high contrast or poor staining, with electron-dense aggregates around the bacteria. These results suggest that suspension with concentrated organic aliquots including broth media before PTA staining could deteriorate image contrast, and should be used only in dilute form for visualizing bacterial morphology and appendage structures. Moreover the contrast enhancement of unstained bacteria by salt granules would be advantageous in demonstrating bacterial sorption of environmental particles like heavy metals, maintaining minimal contrast for cell imaging.
A filamentous form of mollicute-like bacterium was detected during a routine health survey of wild adult kuruma shrimp Penaeus japonicus. The kuruma shrimp were native to Japan and were imported to Korea. The histology showed no pathological changes. Transmission electron microscopy revealed extensive infections of hepatopancreatic epithelial cell by a pleomorphic, filamentous intracellular bacterium. The filamentous bacterium was of about 60 nm in diameter and 300 nm to more than $1{\mu}m$ in length. Teh morphology of bacteria were filamentous and branched with terminal blebs, or knobs, on the branches. They lacked the cell wall, and were bounded by the plasma membrane. They contained typical prokaryotic ribosomes and fibrillar DNA-like strands. No additional internal structure has been observed. They are considered to be mollicutes, based upon the morphological appearance and upon the cellular location.
Synthetic zinc chlorins possessing a hydrophylic polyoxyethylene chain at the 17 -position were prepared. An amphiphilic zinc chlorin possessing a single chIorin moiety showed absorption maxima at 675 nm in an aqueous medium, indicating that the zinc chIorin did not form large aggregates but a dimeric structure. In contrast, amphiphilic zinc chlorin dyads in which two zinc chlorin moieties were connected with a hydrophilic polyoxyethylene linkage showed red-shifted absorption band around 720-740 nm in an aqueous medium. The result indicated that the amphiphilic zinc chlorin dyad self-aggregated to form chlorosome-like oligomer.
The rapid development of the poultry industry has led to the production of large amounts of manure, which produce substances like hydrogen sulfide ($H_2S$) that contribute to odor pollution. $H_2S$ is a highly undesirable gas component and its removal from the environment is therefore necessary. Sulfur-oxidizing bacteria (SOB) are widely known to remove contaminating $H_2S$ due to their ability to oxidize reduced sulfur compounds. In this study, three potential SOB (designated AH18, AH25, and AH28) that were previously isolated from a hot spring in Malaysia were identified by 16S rRNA gene analysis. Laboratory-scale biological deodorization experiments were conducted to test the performance of the three isolates-in the form of pure or mixed cultures, with the cells immobilized onto alginate as a carrier-in reducing the $H_2S$ from chicken manure. On the basis of 16S rRNA phylogenetic analysis, isolate AH18 was identified as Pseudomonas sp., whereas isolates AH25 and AH28 were identified as Achromobacter sp. The most active deodorizing isolate was AH18, with an $H_2S$ reduction rate of 74.7% (p < 0.05). Meanwhile, the reduction rates for isolates AH25 and AH28 were 54.2% and 60.8% (p > 0.05), respectively. However, the $H_2S$ removal performance was enhanced in the mixed culture, with a reduction rate of 81.9% (p < 0.05). In conclusion, the three potential SOB isolates were capable of reducing the $H_2S$ from chicken manure in the form of a pure culture immobilized on alginate, and the reduction performance was enhanced in the mixed culture.
Flavobacterium columnare (F. columnare), the dermotropic Gram negative yellow pigmented bacteria was isolated from different sites of skin ulcerations in the Nile tilapia (Oreochromis niloticus) and Nile catfish (Clarias gariepinus) collected from an earthen pond located at an aquaculture station in Sharkiya Province, Lower Egypt during an acute episode of mass kills during the early summer of 2009. An acute infection with F. columnare was behind the emergent event of mass mortalities among both populations. Many of the Nile tilapias exhibited typical signs of hole - in- the head like lesions from which F. columnare together with the myxosporean spore, Myxobolus tilapiae (M. tilapiae) were retrieved. Most of the cohabitating infected Nile catfishes exhibited severe form of saddle back like ulcer. The identities of the retrieved isolates were confirmed using morphological, biochemical and molecular tools. The research lead us to conclude that the two diverse etiological agents (F. columnare and M. tilapiae) under the triggering effect of the abrupt change in the water quality measures (abrupt rise in the water temperature, ammonia, pH, sharp decrease in dissolved oxygen) have synergized together to induce the above mentioned pathology with the consequent reemergence of fish mass mortalities.
본 웹사이트에 게시된 이메일 주소가 전자우편 수집 프로그램이나
그 밖의 기술적 장치를 이용하여 무단으로 수집되는 것을 거부하며,
이를 위반시 정보통신망법에 의해 형사 처벌됨을 유념하시기 바랍니다.
[게시일 2004년 10월 1일]
이용약관
제 1 장 총칙
제 1 조 (목적)
이 이용약관은 KoreaScience 홈페이지(이하 “당 사이트”)에서 제공하는 인터넷 서비스(이하 '서비스')의 가입조건 및 이용에 관한 제반 사항과 기타 필요한 사항을 구체적으로 규정함을 목적으로 합니다.
제 2 조 (용어의 정의)
① "이용자"라 함은 당 사이트에 접속하여 이 약관에 따라 당 사이트가 제공하는 서비스를 받는 회원 및 비회원을
말합니다.
② "회원"이라 함은 서비스를 이용하기 위하여 당 사이트에 개인정보를 제공하여 아이디(ID)와 비밀번호를 부여
받은 자를 말합니다.
③ "회원 아이디(ID)"라 함은 회원의 식별 및 서비스 이용을 위하여 자신이 선정한 문자 및 숫자의 조합을
말합니다.
④ "비밀번호(패스워드)"라 함은 회원이 자신의 비밀보호를 위하여 선정한 문자 및 숫자의 조합을 말합니다.
제 3 조 (이용약관의 효력 및 변경)
① 이 약관은 당 사이트에 게시하거나 기타의 방법으로 회원에게 공지함으로써 효력이 발생합니다.
② 당 사이트는 이 약관을 개정할 경우에 적용일자 및 개정사유를 명시하여 현행 약관과 함께 당 사이트의
초기화면에 그 적용일자 7일 이전부터 적용일자 전일까지 공지합니다. 다만, 회원에게 불리하게 약관내용을
변경하는 경우에는 최소한 30일 이상의 사전 유예기간을 두고 공지합니다. 이 경우 당 사이트는 개정 전
내용과 개정 후 내용을 명확하게 비교하여 이용자가 알기 쉽도록 표시합니다.
제 4 조(약관 외 준칙)
① 이 약관은 당 사이트가 제공하는 서비스에 관한 이용안내와 함께 적용됩니다.
② 이 약관에 명시되지 아니한 사항은 관계법령의 규정이 적용됩니다.
제 2 장 이용계약의 체결
제 5 조 (이용계약의 성립 등)
① 이용계약은 이용고객이 당 사이트가 정한 약관에 「동의합니다」를 선택하고, 당 사이트가 정한
온라인신청양식을 작성하여 서비스 이용을 신청한 후, 당 사이트가 이를 승낙함으로써 성립합니다.
② 제1항의 승낙은 당 사이트가 제공하는 과학기술정보검색, 맞춤정보, 서지정보 등 다른 서비스의 이용승낙을
포함합니다.
제 6 조 (회원가입)
서비스를 이용하고자 하는 고객은 당 사이트에서 정한 회원가입양식에 개인정보를 기재하여 가입을 하여야 합니다.
제 7 조 (개인정보의 보호 및 사용)
당 사이트는 관계법령이 정하는 바에 따라 회원 등록정보를 포함한 회원의 개인정보를 보호하기 위해 노력합니다. 회원 개인정보의 보호 및 사용에 대해서는 관련법령 및 당 사이트의 개인정보 보호정책이 적용됩니다.
제 8 조 (이용 신청의 승낙과 제한)
① 당 사이트는 제6조의 규정에 의한 이용신청고객에 대하여 서비스 이용을 승낙합니다.
② 당 사이트는 아래사항에 해당하는 경우에 대해서 승낙하지 아니 합니다.
- 이용계약 신청서의 내용을 허위로 기재한 경우
- 기타 규정한 제반사항을 위반하며 신청하는 경우
제 9 조 (회원 ID 부여 및 변경 등)
① 당 사이트는 이용고객에 대하여 약관에 정하는 바에 따라 자신이 선정한 회원 ID를 부여합니다.
② 회원 ID는 원칙적으로 변경이 불가하며 부득이한 사유로 인하여 변경 하고자 하는 경우에는 해당 ID를
해지하고 재가입해야 합니다.
③ 기타 회원 개인정보 관리 및 변경 등에 관한 사항은 서비스별 안내에 정하는 바에 의합니다.
제 3 장 계약 당사자의 의무
제 10 조 (KISTI의 의무)
① 당 사이트는 이용고객이 희망한 서비스 제공 개시일에 특별한 사정이 없는 한 서비스를 이용할 수 있도록
하여야 합니다.
② 당 사이트는 개인정보 보호를 위해 보안시스템을 구축하며 개인정보 보호정책을 공시하고 준수합니다.
③ 당 사이트는 회원으로부터 제기되는 의견이나 불만이 정당하다고 객관적으로 인정될 경우에는 적절한 절차를
거쳐 즉시 처리하여야 합니다. 다만, 즉시 처리가 곤란한 경우는 회원에게 그 사유와 처리일정을 통보하여야
합니다.
제 11 조 (회원의 의무)
① 이용자는 회원가입 신청 또는 회원정보 변경 시 실명으로 모든 사항을 사실에 근거하여 작성하여야 하며,
허위 또는 타인의 정보를 등록할 경우 일체의 권리를 주장할 수 없습니다.
② 당 사이트가 관계법령 및 개인정보 보호정책에 의거하여 그 책임을 지는 경우를 제외하고 회원에게 부여된
ID의 비밀번호 관리소홀, 부정사용에 의하여 발생하는 모든 결과에 대한 책임은 회원에게 있습니다.
③ 회원은 당 사이트 및 제 3자의 지적 재산권을 침해해서는 안 됩니다.
제 4 장 서비스의 이용
제 12 조 (서비스 이용 시간)
① 서비스 이용은 당 사이트의 업무상 또는 기술상 특별한 지장이 없는 한 연중무휴, 1일 24시간 운영을
원칙으로 합니다. 단, 당 사이트는 시스템 정기점검, 증설 및 교체를 위해 당 사이트가 정한 날이나 시간에
서비스를 일시 중단할 수 있으며, 예정되어 있는 작업으로 인한 서비스 일시중단은 당 사이트 홈페이지를
통해 사전에 공지합니다.
② 당 사이트는 서비스를 특정범위로 분할하여 각 범위별로 이용가능시간을 별도로 지정할 수 있습니다. 다만
이 경우 그 내용을 공지합니다.
제 13 조 (홈페이지 저작권)
① NDSL에서 제공하는 모든 저작물의 저작권은 원저작자에게 있으며, KISTI는 복제/배포/전송권을 확보하고
있습니다.
② NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 상업적 및 기타 영리목적으로 복제/배포/전송할 경우 사전에 KISTI의 허락을
받아야 합니다.
③ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 보도, 비평, 교육, 연구 등을 위하여 정당한 범위 안에서 공정한 관행에
합치되게 인용할 수 있습니다.
④ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 무단 복제, 전송, 배포 기타 저작권법에 위반되는 방법으로 이용할 경우
저작권법 제136조에 따라 5년 이하의 징역 또는 5천만 원 이하의 벌금에 처해질 수 있습니다.
제 14 조 (유료서비스)
① 당 사이트 및 협력기관이 정한 유료서비스(원문복사 등)는 별도로 정해진 바에 따르며, 변경사항은 시행 전에
당 사이트 홈페이지를 통하여 회원에게 공지합니다.
② 유료서비스를 이용하려는 회원은 정해진 요금체계에 따라 요금을 납부해야 합니다.
제 5 장 계약 해지 및 이용 제한
제 15 조 (계약 해지)
회원이 이용계약을 해지하고자 하는 때에는 [가입해지] 메뉴를 이용해 직접 해지해야 합니다.
제 16 조 (서비스 이용제한)
① 당 사이트는 회원이 서비스 이용내용에 있어서 본 약관 제 11조 내용을 위반하거나, 다음 각 호에 해당하는
경우 서비스 이용을 제한할 수 있습니다.
- 2년 이상 서비스를 이용한 적이 없는 경우
- 기타 정상적인 서비스 운영에 방해가 될 경우
② 상기 이용제한 규정에 따라 서비스를 이용하는 회원에게 서비스 이용에 대하여 별도 공지 없이 서비스 이용의
일시정지, 이용계약 해지 할 수 있습니다.
제 17 조 (전자우편주소 수집 금지)
회원은 전자우편주소 추출기 등을 이용하여 전자우편주소를 수집 또는 제3자에게 제공할 수 없습니다.
제 6 장 손해배상 및 기타사항
제 18 조 (손해배상)
당 사이트는 무료로 제공되는 서비스와 관련하여 회원에게 어떠한 손해가 발생하더라도 당 사이트가 고의 또는 과실로 인한 손해발생을 제외하고는 이에 대하여 책임을 부담하지 아니합니다.
제 19 조 (관할 법원)
서비스 이용으로 발생한 분쟁에 대해 소송이 제기되는 경우 민사 소송법상의 관할 법원에 제기합니다.
[부 칙]
1. (시행일) 이 약관은 2016년 9월 5일부터 적용되며, 종전 약관은 본 약관으로 대체되며, 개정된 약관의 적용일 이전 가입자도 개정된 약관의 적용을 받습니다.