• Mycobiology
• /
• 제51권1호
• /
• pp.16-25
• /
• 2023

Lecanora is one of the largest genera of lichens worldwide. These lichens can be easily seen, and are commonly found on trees and rocks. Most Korean Lecanora species belong to the Lecanora subfusca group, which has well-defined superficial thallus, red-brown apothecia, and soredia. The new species of L. neobarkmaniana grows on rocks, farinose soredia coalescing, usually covering the whole thallus, and containing atranorin and zeorin. We used internal transcribed spacer (ITS) and mitochondrial small subunit (mtSSU) sequence data to identify the phylogenetic relationship across Lecanora sequence data and found the species to form different clades. In this study, we reported some interesting findings and described the genetic relationship with other sorediate Lecanora species and the characteristics of the new species. An identification key for the Korean sorediate Lecanora species is given.

• 한국균학회지
• /
• 제51권2호
• /
• pp.91-100
• /
• 2023

During an investigation of micro-fungi in soil, two fungal isolates belonging to the phylum Ascomycota, namely KNUF-20-NI011 and KNUF-20-NI006, were collected from Gyeongbuk Province and Dokdo Island in Korea and identified as Clonostachys divergens and Chrysosporium merdarium, respectively. The fungal isolates were confirmed through molecular phylogenetic analyses of the internal transcribed spacer regions, 28S rDNA large subunit, and β-tubulin sequences. Cultural and morphological characteristics were observed and determined using different media. These species were identified based on phylogenetic relationships along with their cultural and morphological characteristics. To our knowledge, this is the first report on Clonostachys divergens and Chrysosporium merdarium in Korea.

• 한국균학회지
• /
• 제50권1호
• /
• pp.1-29
• /
• 2022

Hypocreales is one of the largest orders within the class Sordariomycetes in Ascomycota. Several species of this order are cosmopolitan and have a broad range of habitats. Here, we isolated several fungal strains from environmental samples, including freshwater sediment and plant litter. The strains were identified via molecular and phylogenetic analyses of rDNA and other DNA markers, such as TUB, RPB2, and EF1. The morphological characteristics of the fungi were investigated using microscopy, and culture characteristics were assessed from their growth on several media. We identified 17 species previously unrecorded in Korea: Dactylonectria hordeicola, Flavocillium bifurcatum, Fusarium luffae, Ilyonectria ilicicola, Ilyonectria qitaiheensis, Ilyonectria robusta, Lecanicillium aphanocladii, Nectria ulmicola, Neonectria lugdunensis, Ovicillium oosporum, Pseudonectria foliicola, Sarocladium spinificis, Scolecofusarium ciliatum, Trichoderma appalachiense, Trichoderma subviride, Trichoderma taiwanense, and Trichoderma tsugarense.

• Mycobiology
• /
• 제51권5호
• /
• pp.320-332
• /
• 2023

Talaromyces is a genus within the phylum Ascomycota (class Eurotiomycetes, order Eurotiales, family Trichocomaceae). Many species in this genus are known to produce diverse secondary metabolites with great potential for agricultural, medical, and pharmaceutical applications. During a survey on fungal diversity in the genus Talaromyces in Korea, six strains were isolated from soil, indoor air, and freshwater environments. Based on morphological, physiological, and multi-locus (ITS, BenA, CaM, and RPB2) phylogenetic analyses, we identified five previously unrecorded species in Korea (T. brevis, T. fusiformis, T. muroii, T. ruber, and T. soli) and a new species (T. echinulatus sp. nov.) belonging to section Talaromyces. Herein, detailed descriptions, illustrations, and phylogenetic tree are provided.

• 한국균학회지
• /
• 제51권4호
• /
• pp.335-347
• /
• 2023

Sordariomycetes is the second largest class of Ascomycota, distributed throughout various habitat including terrestrial and aquatic environments and also existing as endophytes. We isolated endophytic fungal strains in Korea, identifying them based on their morphological characteristics and molecular analyses, using eight specific DNA regions for accurate genus identification. We identified five previously unrecorded endophytic fungal species in Korea: Chaetomium subaffine, Colletotrichum jiangxiense, Colletotrichum sydowii, Diaporthe vacuae and Neurospora tetraspora. In this study, we describe the morphological characteristics and present our phylogenetic analyses of these five fungal species.

• 한국미생물·생명공학회지
• /
• 제40권4호
• /
• pp.287-295
• /
• 2012

부안갯벌에서 채집된 염생식물 칠면초와 해홍나물의 뿌리로부터 84종의 내생진균을 분리 및 동정하였다. 염생식물 샘플은 칠면초와 해홍나물이 부안갯벌로부터 분리되었다. 모든 내생진균류들은 ITS1, 5.8s와 ITS2를 포함하는 ITS영역의 서열에 의해 분석되었다. 내생진균류들은 Pleosporales (45%), Eurotiales (27%), Incertae sedis (11%), Dothideales (6%), Capnodiales (5%), Hypocreales (5%), 및 Agaricales (1%)에 해당하는 것을 확인하였다. 내생진균류는 자낭균문과 담자균문의 Alternaria속, Ascomycota속, Aspergillus속, Aureobasidium속, Cladosporium속, Eupenicillium속, Fusarium속, Gibberella속, Hocrea속, Lewia속, Macrophoma속, Penicillium속, Peyronellaea속, Phoma속, Pleospora속, Pleosporales속, Pseudeurotium속, Schizophyllum속, 그리고 Talaromyces속이 포함되는 것을 확인하였다. 그리고 alternaria (21%)와 Penicillium (13%)이 우점종인 것을 확인하였다. 본 연구에서는 칠면초와 해홍나물로부터 내생진균을 분리한 결과 Pleosporales 목과 Eurotiales 목의 Alternaria (21%)와 Penicillium (13%)이 가장 많이 분포하는 것으로 나타났다.

• 한국작물학회:학술대회논문집
• /
• 한국작물학회 2017년도 9th Asian Crop Science Association conference
• /
• pp.364-364
• /
• 2017

Saemangeum reclaimed land is a part of Saemangeum Development Project. Most of the persistent problems of Saemangeum reclaimed land remain to be related to soil salinity. Soil salinity is a major abiotic factor related to microbial community structure and also fungi have been reported to be more sensitive to salinity stress than bacteria. The aim of this study was conducted to investigate the effect of soil salinity levels on the microbial communities in Saemangeum reclaimed land using 454 pyrosequencing analysis. Soil samples was collected from 12 sites of in Saemangeum reclaimed land. For pyrosequencing, 27F/518R (bacteria) and ITS3/ITS4 (fungi) primers were used containing the Roche 454 pyrosequencing adaptor-key-linker (underlined) and unique barcodes (X). Pyrosequencing was performed by Chun's Lab (Seoul, Korea) using the standard shotgun sequencing reagents and a 454 GS FLX Titanium sequencing System (Roche, Inc.). In the soil samples, Proteobacteria (bacteria) and Ascomycota (fungi) shows the highest relative abundance in all the soil sample sites. Proteobacteria, Bacteroidetes, Plantomycetes, Gemmatimonadetes and Parcubacteria were shown to have significantly higher abundance in high salinity level soils than low salinity level soils, while Acidobacteria and Nitrospirae has significantly higher relative abundance in low salinity level soils. The abundance of fungal, Ascomycota has the highest relative abundance in soil samples, followed by Basidiomycota, Chlorophyta, Zygomycota and Chytridiomycota. Basidiomycota, Zygomycota, Glomeromycota and Cerozoa were show significantly higher relative abundance in low salinity level soils. The principal coordinate analysis (PCoA) and correlation analysis shown to salinity-related soil parameters such as ECe, Na+, SAR and EPS were affected to bacterial and fungal community structure. Proteobacteria, Bacteroidetes, Plantomycetes exhibited significantly positive correlation with soil salinity, while Acidobacteria exhibited significantly negative correlation. In the case of fungal community, Basidiomycota and Zygomycota were seen show significantly negative correlation with salinity related soil parameters. These results suggest that provide understanding effect of soil salinity on microbial community structure and correlation of microbial community with soil parameters in Saemangeum reclaimed land.

• 한국균학회지
• /
• 제43권4호
• /
• pp.281-285
• /
• 2015

석회유황합제의 배나무 동계방제 수단으로써 효과를 과학적으로 증명하기 위해 배 과수원에서 1차 전염원의 역할을 하는 낙엽에 석회유황합제를 처리한 후 낙엽에 존재하는 진균의 다양성 변화를 확인하였다. 물이 처리된 대조구와 석회유황합제 처리구의 낙엽에서 진균 genomic DNA를 추출한 다음 rDNA internal transcribed spacer (ITS) 영역의 염기서열 분석을 통해 진균들을 동정한 결과, 대조구와 석회유황합제 처리구에서 자낭균문(Ascomycota)과 담자균문(Basidiomycota)에 속하는 다양한 종류의 진균들이 동정되었으나 동정되는 진균의 수와 비율은 서로 다르게 나타났다. 특히 배 과피얼룩병을 일으키는 Alternaria속과 Cladosporium속의 진균은 대조구에 비해 석회유황합제 처리구에서 동정되는 비율이 대폭 감소되었으며, Phomopsis속의 진균은 대조구에서는 동정되었으나 석회유황합제 처리구에서는 동정되지 않았다. 이러한 결과는 석회유황합제 처리가 배 낙엽에 존재하는 진균 다양성의 변화에 영향을 미쳤으며 동계방제로서 역할을 수행할 수 있음을 시사한다.

• 한국균학회지
• /
• 제38권2호
• /
• pp.95-98
• /
• 2010

본 연구는 제주도 물찾오름과 사려니숲의 말뚝버섯(Phallus impudicus) 알에서 기생하는 미기록 종인 자낭버섯에 대하여 종 특징기술을 하고 미세구조를 도해하였다. 본 종은 분류학적으로 자낭균문 맥각균목 점버섯과 점버섯속에 속하며, Doi(1978)의 의견을 따라 말뚝사슴뿔버섯(Podostroma solmsi f. octospora)으로 동정하고 한국명을 신칭하였다. 본 종의 포자는 방추형 또는 타원형의 단포자형이며, 포자표면에 미세한 사마귀상 돌기가 밀포되어 있다. 자낭의 양끝은 뭉툭하고 포자는 자낭 내에 일렬로 배열되는 특징이 있다. 일부 균학자들은 종의 특성으로 보아 점버섯과(family Hypocreaceae)의 Hypomyces에서 유래되었다고 주장하며, 사슴뿔버섯속(genus Podostroma)과는 분류학적 특징이 많이 다르므로 새로운 속(genus)으로의 분리가 필요하다고 주장하였다. 앞으로 본 종에 대해서는 표준종 및 근연종과의 유전자를 비교하여 새로운 분류군으로서 세밀한 조사가 더 필요할 것으로 생각된다. 본 연구에 사용된 표본은 국립농업과 학원 식물균류표본보존센타(HCCN)에 보존되어 있다.

• 생명과학회지
• /
• 제31권4호
• /
• pp.377-384
• /
• 2021

진달래(Rhododendron mucronulatum)는 우리나라에서 어렵지 않게 볼 수 있는 개화식물로 꽃이 아름다워 관상목으로 이용되고 있고 생태학적, 약리적으로 잠재력이 있는 중요한 산림자원이다. 우리나라의 대표적 진달래나무군락지인 비슬산군립공원에서 진달래나무 아래의 토양을 채집하여 그 진균 군집의 특성을 조사하였다. 위치와 계절에 따른 진균 군집의 차이를 확인하기 위하여 토양 샘플은 총 3개의 위치에서 2월과 8월에 각각 한번씩 채집하였다. Pyrosequencing을 통해 총 454,157개의 서열을 얻을 수 있었다. 첫번째 채집포인트에서 얻은 샘플의 진균 군집이 6개 샘플 중 가장 종 풍부도가 높았고 가장 다양한 진균들로 구성되어 있음을 확인하였다. 분류 단위 별 분석으로는, Basidiomycota, Ascomycota, Mortierellomycota가 대표적인 문(phylum)으로 나타났으며, Agaricales_f, Mortierellaceae, Clavariaceae가 주요한 과(family)인 것으로 분석되었다. Mortierella 속(genus)은 모든 샘플중에서 가장 우점한 속이었다. 또한 총 진달래와 관련이 있는 것으로 추정되는 19개의 속이 확인되었다. 8월에 채집한 샘플에서 위치에 따라 각각 109개, 111개, 112개의 특이적인 속이 발견되었고, 2월의 샘플과 비교했을 때 2월의 샘플에는 존재하지 않는 28개의 공통된 속이 발견되었다. 이 연구는 추후 진달래나무에 특이적인 진균의 새로운 종을 규명하거나 토양 진균류와 식물의 상호작용을 규명하는 기초자료로 활용될 수 있다.