• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제32권7호
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• pp.911-917
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• 2022

As valuable antibiotics, microbial natural products have been in use for decades in various fields. Among them are polyene compounds including nystatin, amphotericin, and nystatin-like Pseudonocardia polyenes (NPPs). Polyene macrolides are known to possess various biological effects, such as antifungal and antiviral activities. NPP A1, which is produced by Pseudonocardia autotrophica, contains a unique disaccharide moiety in the tetraene macrolide backbone. NPP B1, with a heptane structure and improved antifungal activity, was then developed via genetic manipulation of the NPP A1 biosynthetic gene cluster (BGC). Here, we generated a Streptomyces artificial chromosomal DNA library to isolate a large-sized NPP B1 BGC. The NPP B1 BGC was successfully isolated from P. autotrophica chromosome through the construction and screening of a bacterial artificial chromosome (BAC) library, even though the isolated 140-kb BAC clone (named pNPPB1s) lacked approximately 8 kb of the right-end portion of the NPP B1 BGC. The additional introduction of the pNPPB1s as well as co-expression of the 32-kb portion including the missing 8 kb led to a 7.3-fold increase in the production level of NPP B1 in P. autotrophica. The qRT-PCR confirmed that the transcription level of NPP B1 BGC was significantly increased in the P. autotrophica strain containing two copies of the NPP B1 BGCs. Interestingly, the NPP B1 exhibited a previously unidentified SARS-CoV-2 RNA-dependent RNA polymerase (RdRp) inhibition activity in vitro. These results suggest that the Streptomyces BAC cloning of a large-sized, natural product BGC is a valuable approach for titer improvement and biological activity screening of natural products in actinomycetes.

• The Plant Pathology Journal
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• 제40권4호
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• pp.346-357
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• 2024

This study was carried out to screen the antifungal activity against Colletotrichum acutatum, Colletotrichum dematium, and Colletotrichum coccodes. Bacterial isolate GP-P8 from pepper soil was found to be effective against the tested pathogens with an average inhibition rate of 70.7% in in vitro dual culture assays. 16S rRNA gene sequencing analysis result showed that the effective bacterial isolate as Bacillus siamensis. Biochemical characterization of GP-P8 was also performed. According to the results, protease and cellulose, siderophore production, phosphate solubilization, starch hydrolysis, and indole-3-acetic acid production were shown by the GP-P8. Using specific primers, genes involved in the production of antibiotics, such as iturin, fengycin, difficidin, bacilysin, bacillibactin, surfactin, macrolactin, and bacillaene were also detected in B. siamensis GP-P8. Identification and analysis of volatile organic compounds through solid phase microextraction/gas chromatography-mass spectrometry (SPME/GC-MS) revealed that acetoin and 2,3-butanediol were produced by isolate GP-P8. In vivo tests showed that GP-P8 significantly reduced the anthracnose disease caused by C. acutatum, and enhanced the growth of pepper plant. Reverse transcription polymerase chain reaction analysis of pepper fruits revealed that GP-P8 treated pepper plants showed increased expression of immune genes such as CaPR1, CaPR4, CaNPR1, CaMAPK4, CaJA2, and CaERF53. These results strongly suggest that GP-P8 could be a promising biocontrol agent against pepper anthracnose disease and possibly a pepper plant growth-promoting agent.

• 한국균학회지
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• 제23권1호통권72호
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• pp.37-45
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• 1995

석유에테르, 80% 에탄올 및 물로 추출하여 얻은 204개의 추출물 각각에 대해서 8종류의 곰팡이에 대한 항균활성을 검색하였다. 그 결과 Abortiporus DGU-L6 버섯의 석유에테르 추출물은 Microsporum gypseum균에 대하여 항균활성을 나타내었고, Cortinarius DGU-L51 버섯의 알콜추출물에서는 A. niger, Marasminus DGU-L67 버섯의 알콜 추출물 및 물 추출물에서는 A. niger(KCTC 2118)과 A. versicolor(KCTC 2120) 균에 대해서 항균활성을 나타내었다. 그리고 Hetero DGU-L25 버섯의 석유에테르 추출물은 8종류의 곰팡이에 대해서 모두 항균활성을 나타내었고, 이중 특히 모창을 유발하는 균에 대해서는 40 mg/ml의 아주 낮은 최소억제농도 값을 나타내었다.

• Pediatric Infection and Vaccine
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• 제13권2호
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• pp.155-162
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• 2006

목 적 : 감염병 치료를 위해서 항생제의 적절한 선택은 필수적이며 잘못된 사용은 내성균주의 출현과 확산, 치료의 실패, 약물 부작용, 의료비 상승 등의 다양한 문제점을 초래한다. 저자들은 임상에서 특정 항생제의 사용을 제한하는 전산 프로그램의 운용이 항생제의 부적절한 사용을 억제하고 약제 사용량 감소에 도움이 되는지 알아보고자 본 연구를 시행하였다. 방 법 : 항생제관리위원회의 의결로 내성의 우려가 있는 고가의 항생제와 과거에 부적절한 사용 경향을 보였던 약제 등 총 7계열의 16개 품목을 제한 항생제로 선정하였다. 입원환자를 대상으로 제한 항생제 관리용 전산 프로그램 운용 후인 2004년과 2005년 5~7월(연구군) 및 운용 전인 2002년과 2003년 동일기간(대조군)에 처방된 항생제의 사용 내역을 후향적으로 조사하였다. 항생제 사용량 비교를 위한 지표는 1일당 재원환자 100명당 항생제 사용자수(명)로 하였으며 일별 항생제 사용 환자수를 조사한 후 재원환자 100명당 사용자수를 산정하였으며, 계열별로 양군간 비교를 시도하였다. 결 과 : 1일 재원 환자수는 대조군($823.5{\pm}37.1$명)이 연구군($809.2{\pm}39.3$명)보다 많았으며(P<0.001), 1일 퇴원 환자수(연구군 : $81.2{\pm}16.0$명 vs. 대조군 : $81.5{\pm}16.9$명)와 재원일수(연구군 : $9.9{\pm}1.6$ vs. 대조군 : $10.0{\pm}2.1$)는 양군간 비슷하였다. 1일당 재원환자 100명당 항생제 사용자수(연구군 vs. 대조군)는 항진균제($0.6{\pm}0.3$명 vs. $0.7{\pm}0.4$명)와 glycopeptides ($4.1{\pm}0.7$명 vs. $4.2{\pm}0.6$명)는 양군간 비슷하였고, carbapenems($1.9{\pm}0.5$명 vs. $0.9{\pm}0.3$명)과 piperacillin-tazobactam($0.7{\pm}0.3$명 vs. $0.3{\pm}0.2$명), quinolones ($2.2{\pm}0.6$명 vs. $1.6{\pm}0.5$명)은 연구군에서 더 많았으며(P<0.001), 고가의 광범위 cephalosporins($1.3{\pm}0.4$명 vs. $1.6{\pm}0.3$명)와 부적절한 사용 경향을 보였던 약제($1.1{\pm}0.5$명 vs. $6.0{\pm}1.4$명)는 연구군에서 유의하게 감소하였다(P<0.001). 결 론 : 항생제 사용을 제한하는 전산 프로그램의 운용은 임상자료 분석에서 부적절한 사용 경향을 가진 항생제의 사용을 줄이는데 효과적이나 내성균 치료제나 고가 약제의 사용량 감소를 위해서는 미흡한 조치이며 이에 대한 추가적인 대책이 필요하다.

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제49권3호
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• pp.403-412
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• 2021

본 연구에서는 토양 및 근권에 존재하는 Bacillus 속의 식물 생장 촉진 활성, 식물 병원성 곰팡이의 생장 억제활성, 미네랄 가용화능 및 세포 외 효소활성을 확인해 보고자 하였다. 식물 병원성 곰팡이에 대한 항진균 활성에서 DDP257은 10종의 병원성 곰팡이에서 항진균 활성이 모두 나타났다. 식물 생장 촉진 인자인 indole-3-acetic acid 생성능에서는 ANG20이 70.97 ㎍/ml로 가장 높게 나타났다. 추가적으로 1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase 생성능 조사에서는 총 10종에서 생성능을 확인하였고, 질소 고정능과 siderophore 생성능 조사에서는 대부분의 분리균주에서 활성을 확인하였다. 이후 분리된 균주에 대하여 phosphate, calcite, zinc과 같은 미네랄 가용화능을 확인하였으며 세포외 효소활성에서도 대부분의 효소에서 활성이 나타났다. 특히 alkaline phosphatase, esterase (C4), acid phosphatase, naphtol-AS-BI-phosphohydrolase에서 선별된 균주 모두 유사한 활성을 보였다. 이는 Bacillus 속이 다양한 유기물과 항생물질 및 세포 외 효소를 분비함으로써 이러한 결과가 나타난 것으로 판단된다. 따라서, 본 연구 결과를 통해 토양의 환경 개선에 기여하는 균주를 활용하여 미생물 제제로써의 가능성을 제시한다.

• Clinical and Experimental Pediatrics
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• 제49권6호
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• pp.623-629
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• 2006

목 적 : 신생아 의료의 발전으로 신생아 사망률은 감소하였으나 여러 가지 침습적 시술의 증가로 신생아 패혈증의 발생은 줄어들지 않고 있으며, 아직도 신생아 이환과 사망의 상당한 비중을 차지하고 있다. 전남대학교병원 신생아중환자실에서 신생아 패혈증의 발생시기에 따른 흔한 원인균 및 항생제 감수성 결과를 분석하여 가장 적절한 항생제 선택의 지침을 정하고자 하였다. 방 법 : 2000년 1월 1일부터 2004년 12월 31일까지 전남대학교병원 신생아중환자실에 입원한 환아 중 혈액배양 검사에서 1회(피부 상재균인 경우 2회) 이상 동정된 경우는 89명이었다. 이 중 74명은 패혈증에서 회복된 후 재발하지 않았으며(74례), 12명은 임상증상 재출현과 함께 혈액배양 검사상 균이 1회 더 동정되었고(24례), 3명은 2회 더 동정되어(9례) 총 107례에 대한 입원기록지를 후향적으로 조사하였다. 재태연령, 출생체중, 성별, 주산기 위험인자와 임상증상, 원인균 및 항생제 감수성, 사망률 등을 조사하였다. 결 과 : 신생아 패혈증의 발생빈도는 1.7%였으며, 30주 미만, 출생체중 1,500 g 미만에서 빈발하였다(P<0.05). 조발형의 거의 대부분(92.9%) gram-양성균이 원인이었으나, 지발형에서는 약 2/3(67.4%)가 gram-양성균이고 나머지 1/3은 gram-음성균(20.0%)과 칸디다(12.6%)가 차지하였다. Gram-음성균과 칸디다 감염은 중심정맥 카테테르가 있는 경우에서 많았다. 항생제 감수성 검사상 gram-양성균은 vancomycin, teicoplanin, chloramphenicol 순이었고, gram-음성균은 ciprofloxacin, imipenem, cefotaxime, ceftazidime 순이었다. 결 론 : 신생아 패혈증은 저출생체중 미숙아에서 흔하고, coagulase-negative staphylococci, Candida, S. aureus가 가장 흔한 원인균이었다. 항생제 감수성 검사상 1차 항생제 선택에 조발형은 3세대 cephalosporin 계열과 clindamycin, 지발형은 3세대 cephalosporin 계열과 glycopeptide 계열의 병용이 추천되며, 지발형에서 충분한 항생제 치료에도 반응이 없다면 칸디다 패혈증을 의심하고 예방적 항진균제 사용이 필요할 것으로 사료되었다.

• 한국식물병리학회:학술대회논문집
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• 한국식물병리학회 2003년도 정기총회 및 추계학술발표회
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• pp.102.1-102
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• 2003

A bacterial strain YC4963 with antifungal activity against Colletotrichum orbiculare, a causal organism of cucumber anthracnose was isolated from the rhizosphere soil of Siegesbeckia pubescens (Siegesbeckia pubescens Makino；Family：Compositae) in Korea. Based on physiological and biochemical characteristics and 16S ribosomal DNA sequence analysis, the bacterial strain was identified as Pseudomonu aureofaciens. The bacteria also inhibited mycelial growth of several plant fungal pathogens such as Botrytis cinerea, Fusarium oxysporum and Rhizoctonia solani on PDA and 0.1 TSA media. The antibiotic activity was found from the culture filtrate of TSB(tryptic soy broth) and its active compounds were quantitatively bound to XAD adsorber resin. The antibiotic spectrum was broad and growth of C. orbiculare and F. oxysporum, B. cinerea were inhibited at very low concentration. The chemical data from various chromatographic procedures showed that active fraction consisted of at least two phenazine derivatives. However, the metabolites had no inhibitory effect on Pythium ultimum which was reported to be sensitive to phenazine antibiotics. The compounds responsible for the activity are now under investigation.

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제10권1호
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• pp.39-43
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• 1982

항진균성 항생물질 생산균으로 분리된 Streptomyces균 No. 297 균의 배양액으로부터 항균물질을 분리·정제하여 침상결정을 얻었다. 이 물질은 UV. IR. spectra, NMR, Mass-spectra 및 여러 화학반응시험을 통하여 t-cin-namamide로 동정되었다. 항균 spectra를 조사해본 결과 Pellicularia sasakii, Pyricularia oryzae 기타 및 병원성 진균류에 강한 항균성을 나타내며 세균류에는 항균력이 극히 약한 것이 특징이다.

• 대한관절경학회지
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• 제16권2호
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• pp.180-184
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• 2012

진균에 의한 감염성 관절염은 면역 억제 치료자, 약물 남용자, 장기간의 항생제 투여자 등에서 발생하는 드문 질환으로 특히 건강한 성인에서의 감염은 매우 드물다. 진균에 의한 슬관절의 감염성 관절염은 국내에서 2예의 보고가 있으나, 건강한 성인에서 발생한 진균성 슬관절염은 아직 보고된 바가 없는 실정이다. 이에 저자들은 건강한 성인에서 반복적인 관절 내 스테로이드 주사 후 발생한 진균성 관절염 및 이와 동반한 슬와낭종의 관절경적 치료를 경험하여 문헌 고찰과 함께 보고하는 바이다. 진균성 슬관절염은 특징적인 임상상이 없는 드문 질환으로, 진단에 있어 어려움이 있으므로 면밀한 관찰과 주의를 요한다.

• 대한미생물학회지
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• 제21권2호
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• pp.191-204
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• 1986

Leptospira isolated from the patients with so called epidemic pulmonary hemorrhagic fever were comparatively studied with standard strains obtained from ATCC. The specific aim of this study was to clarify the morphologic heterogeneity of the isolates, i. e., coexistence of spiral forms in both handness, right and left, rod and spherical forms in their population by comparing them with those of the ATCC strains. No differences between our strains and ATCC strains were noticed in their growth characteristics, responses to the culture media, temperature, antibiotics and antifungal agents. Furthermore, the morphologic heterogeneity had been repeatedly observed even in cultures of standard ATCC strains, which had been noticed in the cultures of bacteria isolated in this laboratory. The serologic analysis of our isolates demonstrated that the bacteria reacted with L. icterohaemorrhagiae and L. australis regardless their differences in time of isolation(1984, 1985). Thus, it was concluded that the spiral bacteria isolated in this laboratory are Leptospira of a new serovar which still remained to be determined. And the previous reports on the morphology of the Leptospira, which described that the Leprospira population has only spiral forms with right. handed coils might be reconsidered.