이모작재배에 적합한 극조숙 양질 다수성 소맥품종육성을 위하여 등수기간에 관여하는 유전자 작용에 대한 연구는 매우 중요하다. 추파성품종 Yam-hill과 Hyslop, 춘파성품종 Red Bobs와 Siete Cellos를 사용하여 4 $\times$ 4 complete diallel crosses F$_1$, F$_2$, BC$_1$ 및 BC$_2$를 작성, Jinks-Hay-man model를 이용하여 등숙기간에 관여하는 유전자 작용을 분석하였다. 본 시험은 오레곤 주립대학교에서 실시되었다. 그 결과의 개요는 다음과 같다. 전등숙기간인 출수에서 생리적 성숙기까지의 기간과 출수에서 개화까지의 기간에서 maternal effect 가 인정되지 않았으며 비대립유전자간 상호작용도 발현되지 않았다. 개화에서 생리적 성숙기까지의 기간에서는 비대립유전자간에 상호작용이 인정되었다. 춘파성 품종인 Red Bobs와 Siete Cellos는 전등숙기간과 출수에서 개화까지의 기간을 지배하는 우성유전자들을 가지고 있었으며 짧은 쪽에 비하여 긴쪽이 우성으로 발현되고 있었다. 대조적으로 추파성 품종인 Yamhill 과 Hyslop은 개화에서 생리적 성숙기까지의 기간을 지배하는 우성유전자들을 가지고 있었으며 긴쪽이 우성으로 작용하고 있었다. 그리고 이 유전자들은 문배친들간에 독립적으로 분포되어 있었다.
Genetic polymorphisms of the renin-angiotensin system (RAS) have been associated with hypertension in various ethnic groups, but no relation between these polymorphisms and hypertension has yet been systematically evaluated. To assess the relationship between allelic variation of RAS genes and hypertension, we performed the case-control studies using genetic markers in Korean normotensives and hypertensives. The allele and genotype frequencies of RAS genes in Korean population were not significantly different between normotensives and hypertensives. To investigate the distribution of allele frequencies among various populations, the data obtained in this study were compared to those in other ethnic groups studied previously. Except for T174M polymorphism of angiotensinogen (AGT) gene, allele frequencies of RAS genes were different among racial groups. The reason for these differences may be due to the difference in various genetic or environmental background or due to the effects by various sample size studied. In addition, it can be emphasized that carefully designed studies are required to minimize the ethnic heterogeneity of the case and control populations.
본 연구에서는 제주 재래흑돈의 모색에 관여하는 MC1R 유전자를 이용하여, 모색유전자 빈도를 조사함으로써, 제주 재래흑돈군 확보를 위한 선발계획 수립에 기초자료를 제공하고자 수행하였다. 공시동물은 랜드레이스, 대요크셔, 듀록 각 품종별 20두와 제주흑돈 93두 등 총 153두를 공시하여 수행하였다. 품종별 MC1R 유전자형을 설정하기 위하여 genbank에 등록되어 있는 돼지 MC1R 유전자(AF181964)를 참고로 하여 두 쌍의 primer (MERL1-EPIG2, EPIG1-EPIG3)를 제작 PCR 증폭을 수행하였다. 먼저 primer MERL1-EPIG2를 이용하여 428bp의 PCR 산물을 얻었으며, primer EPIG1-EPIG3를 이용하여 405bp의 PCR산물을 얻었다. 이들 증폭된 PCR 산물은 서로 다른 2개의 제한효소를 이용하여 PCR-RFLP를 실시하였다. 먼저 primer MERL1-EPIG2를 이용하여 증폭한 428bp의 PCR산물은 제한효소 BspHⅠ(TCATG|A)을 이용하여 절단하였으며, primer EPIG1-EPIG3으로 증폭한 405bp의 PCR산물은 제한효소 AccⅡ(CGC|G)를 이용하여 절단하였다. 이들 절단된 DNA 단편은 TBE buffer에서 전기영동 후 EtBr로 염색하거나 Silver stain 염색을 하여 다형현상을 관찰하였으며, 본 연구의 결과를 요약하면 다음과 같다. 1. 제한효소 BspHⅠ을 이용하여 PCR-RFLP을 수행한 결과 백색의 랜드레이스와 대요크셔는 전 개체 모두가 2개의 밴드(256bp, 172bp)가 확인되었으며, 듀록은 절단되지 않은 하나의 밴드(428bp)가 확인 되었다. 그러나 제주 흑돈에서는 3개의 서로 다른 형태의 밴드가 발견되었는데, 전체 93두중 밴드가 하나인 개체는(428bp)는 29두(31.2%), 밴드가 두 개인 개체는(256bp, 172bp)는 19두(20.4%), 밴드가 3개인(428bp, 256bp, 172bp) 개체는 전체의 절반 정도인 45두(48.4%)이었다. 2. AccⅡ를 이용하여 PCR-RFLP를 실시한 결과 랜드레이스와 대요크셔 종에서는 2개의 밴드(222bp, 183)가 확인 되었으며, 듀록은 한 개의 밴드(405bp)만이 관찰되었다. 그러나 제주흑돈에서는 3개의 서로 다른 형태의 밴드가 확인되었으며, 분포빈도는 BspHⅠ을 이용한 PCR- RFLP 결과와 동일하였다. 3. 이상의 결과를 MC1R 유전자형으로 분류하면 백색품종인 랜드레이스와 대요크셔 품종은 MC1R*3 allele이었으며, 적색의 듀록은 MC1R*4 allele로서 도입종의 모색유전자는 한가지 형태로 고정되어 있었다. 그러나 제주 재래흑돈에 있어서 MC1R*2 allele과 MC1R*3 allele 모두 다 나타났으며, 대부분은 이들의 헤테로 형태였다. 따라서 제주 재래흑돈의 모색고정을 위하여 종모돈 선정시 MC1R 유전자를 이용하면, 짧은 기간 내에 모색이 고정될 것으로 추정되며, 명확한 유전양상 구명을 위해서는 agouti 유전자의 추가 연구가 필요할 것으로 사료된다.
Purpose: The aim of this study was to investigate the frequency of loss of heterozygosity and the microsatellite instability at multiple tumor suppressor gene loci in gastric adenocarcinomas. Materials and Methods: Loss of heterozygosity and the microsatellite instability at several tumor suppressor gene loci were analyzed in 29 primary gastric carcinomas by using microdissection and the polymerase chain reaction. Results: Twenty-three ($79\%$) of the 29 cases demonstrated loss of heterozygosity at one or more loci. The frequency of loss of heterozygosity at the p53 locus was the highest ($63\%$) and those at the VHL, APC, p16, Rb, MEN1, BRCA1, DPC4, 3p21, and 16p13 region were $41\%,\;36\%,\;19\%,\;29\%,\;33\%,\;26\%,\;21\%,\;32\%,\;and\;11\%$, respectively. Compared with histological type, loss of heterozygosity was more common in diffuse-type gastric cancer (P<0.01). Interestingly, 9 of 10 tumors with allelic deletion at the p53 locus showed loss of heterozygosity at other tumor suppressor gene loci. The microsatellite instability was also detected in 6 ($20\%$) of the 29 cases at one or more loci. Conclusion: These data suggest that frequent loss of heterozygosity and the microsatellite instability at multiple tumor suppressor genes might be required for the development and the progression of gastric carcinomas and that p53 allelic loss may be the most frequent event in the development of gastric carcinomas.
Hepatocellular carcinoma (HCC) is major health problem with high mortality rates, especially in patients with hepatitis B virus (HBV) infection. Telomerase function is one of common mechanisms affecting genome stability and cancer development. Recent studies demonstrated that genetic polymorphisms of telomerase associated genes such as telomerase associated protein 1 (TEP1) rs1713449 and PIN2/TERF1-interacting telomerase inhibitor 1 (PINX1) rs1469557 may be associated with risk of HCC and other cancers. In this study, 325 patients with HCC and 539 non-HCC groups [193 healthy controls, 80 patients with HBV-related liver cirrhosis (LC) and 266 patients with HBV-related chronic hepatitis (CH)] were enrolled to explore genetic polymorphisms of both SNPs using the allelic discrimination method based on MGB probe TaqMan real time PCR. We demonstrated that all genotypes of both genes were in Hardy-Wienberg equilibrium (P>0.05). Moreover, there was no significant association between rs1713449 genotypes and HCC risk, HCC progression and overall survival (P>0.05). Interestingly, we observed positive association of rs1469557 with risk of HCC when compared with the LC group under dominant (CC versus CT+TT, OR=1.89, 95% CI= 1.06-3.40, P=0.031) and allelic (C versus T alleles, OR=1.75, 95% CI=1.04-2.94, P=0.033) models, respectively. Moreover, overall survival of HCC patients with CC genotype of rs1469557 was significantly higher than non-CC genotype (Log-rank P=0.015). These findings suggest that PINX1 rs1469557 but not TEP1 rs1469557 might play a role in HCC progression in Thai patients with LC and be used as the prognosis marker to predict overall survival in HCC patients.
이 연구는 MAOA CA 반복 유전자다형성에 따라 알코올의존 환자에서 행동 및 성격특성 그리고 임상양상의 차이를 알아봄으로써 유전자형과 표현형과의 관계를 알아보기 위해 수행되었다. 이 연구 결과 임상양상에서 S군에 비해 L군의 임상양상이 보다 부정적인 양상을 보이고 있었다. 이는 MAOA CA 반복 유전자다형성이 음주양상을 변화시키는 역할을 할 가능성을 시사하고 있다. 그렇지만 이러한 영향이 유전자의 직접적인 인과관계로 설명하기는 어렵고 간접적이고 이차적인 영향에 따른 결과로 생각해 볼 수 있겠다. 또한, 행동특성에서 L군이 S군에 비해 전체적으로 공격성이 많았고 자기주장적 태도가 강했다. 그리고 MAOA CA 반복 유전자다형성의 대립유전자 길이가 자기주장적 태도와 상관관계가 있었으며 이러한 자기주장적 태도를 MAOA CA 반복 유전자다형성의 대립유전자 길이가 부분적으로 설명하고 있었고, 자기주장적 태도가 강한 환자의 경우 길이가 긴 대립유전자를 가질 가능성이 많았다. 공격성도 그 자체가 여러 가지 측면을 가지고 있는 복합적인 행동특성이기 때문에 전체 공격성을 어느 하나의 유전자만으로 설명할 수 있을 것으로 기대하는 것은 비현실적이다. 그렇지만 이 연구에서 자기주장적 태도는 분화된 공격성의 한 측면이어서 MAOA CA 반복 유전자다형성이 일부분이지만 설명을 할 수 있다는 것을 시사하고 있어, 연구자들은 이 연구가 향후 유전자형이 공격성 같은 표현형을 설명하는 연구들에 있어 기초자료가 될 수 있을 것으로 생각된다. 아직까지 MAOA CA 반복 유전자다형성과 MAOA 활성도와의 관계가 명확하지 않고 대사산물과의 관계도 설명이 어려운 실정이어서 향후 이에 대한 연구들이 필요하겠다.
CSRP3, APOBEC2, CAV1, CAV2 및 CAV3 유전자들은 포유동물에서 도체와 육질 형질에 중요한 역할을 하는 것으로 보고되고 있다. 따라서, 이 유전자들의 단일염기다형(Single nucleotide poly- morphism; SNP)을 8개의 다른 소의 품종에서 확인한 결과 coding region에서 caveolin family 유전자에서 9개의 SNP, CSRP3유전자에서 1개의 SNP 및 APOBEC2 유전자에서 3개의 SNP가 존재함을 확인하였다. 이 coding region의 SNP들은 PCR-RFLP 방법에 의해 재확인하였으며 이들 유전자의 intronic region에서도 9개의 SNP가 존재함을 확인할 수 있었다. 8개의 다른 품종 소에 각 유전자들의 SNP들을 이용하여 유전자 빈도를 확인한 결과 CAV2, CAV3, CSRP3 및 APOBEC2 유전자의 SNP 중에서 5개가 품종간에서 유의적으로 차이가 있음을 확인할 수 있었다. 이 SNP들은 차후 검증작업을 통하여 육질관련 형질 마커로 이용될 수 있을 것으로 사료된다.
PSS hetero 돼지를 이용하여 PSS와 관련된 유전자를 cloning 하여 유전자 구조를 분석하고 세포내의 유전자의 존재를 확인하여 PSS 돼지의 유전양식을 밝히고자 실시되었고, 그 결과를 요약하면 다음과 같다. 615번 amino acid가 N과 n에서 각각 arginine과 cysteine으로 존재함을 확인할 수 있었다. 그리고 6번 염색체(PSS 관련유전자)로부터 우성유전자 N과 열성유전자 n이 각각 유전자 좌위(locus)에 대립 유전자(alleles)로 존재함을 확인할 수 있었으며, 이러한 alleles로 존재함으로써 각각의 유전자가 나뉘어져 유전됨을 알 수 있었다.
The study was conducted to investigate the phenotypes of blood proteins, hemoglobin and albumin, of 104 German shepherds in Dag-gu, Yae-chum Kim-hae and Kwang-ju area by the starch gel electrophoresis. The results obtained were summarized as follows: 1. The hemoglobin phenotypes were observed three(HbBB, HbBb and Hbbb). Fast migrating bands were same and slow migrating bands were divided by heavy(HbBB), light(HbBb) and non-stained(Hbbb). The frequencies of appearance in HbBB, HbBb and Hbbb were 17.31%, 51.92% and 30.77%, respectively. 2. The hemoglobin phenotypes were controlled by two allelic genes, $Hb^b$ and $Hb^B$. The gene frequencies were calculated at 0.567 in $Hb^B$ and 0.433 in $Hb^A$. 3. The albumin phenotypes were observed three(AlbFF, AlbSS and and AlbFS), which were divided by fast migrating band(AlbFF), slow migrating band(AlbSS) and mixed migrating band(AlbFS). The frequencies of appearance in AlbFF, AlbFS and AlbSS were 5.77%, 28.85% and 65.38%, respectively. 4. The albumin phenotypes were controlled by two alleic genes, $Alb^F$ and $Alb^S$. The gene frequencies were calculated at 0.202 in $Alb^F$ and 0.798 in $Alb^S$.
Regions of allelic loss on chromosomes in many tumors of human and some experimental animals are generally considered to harbor tumor-suppressor genes involved in tumorigenesis. Allelotype analyses have greatly improved our under-standing of the molecular mechanism of radiation lymphomagenesis. Previously, we and others found frequent loss of heterozygosity (LOH) on chromosomes 4, 11, 12, 16 and 19 in radiation-induced lymphomas from several $F_1$, hybrid mice. To examine possible contributions of individual tumor-suppressor genes to tumorigenesis in p53 heterozygous deficiency, we investigated the genome-wide distribution and status of LOH in radiation-induced lymphomas from $F_1$ mice with different p53 status. In this study, we found frequent LOH (more than 20%) on chromosomes 4 and 12 and on chromosomes 11, 12, 16 and 19 in radiation-induced lymphomas from $(STS/A{\times}MSM/Ms)F_1$ mice and $(STS/A{\times}MSM/Ms)F_1-p53^{KO/+}$ mice, respectively. Low incidences of LOH (10-20%) were also observed on chromosomes 11 in mice with wild-type p53, and chromosomes 1, 2, 9, 17 and X in p53 heterozygous-deficient mice. The frequency of LOH on chromosomes 9 and 11 increased in the $(STS/A{\times}MSM/Ms)F_1-p53^{KO/+}$ mice. Preferential losses of the STS-derived allele on chromosome 9 and wild-type p53 allele on chromosome 11 were also found in the p53 heterozygous-deficient mice. Thus, the putative tumor-suppressor gene regions responsible for lymphomagenesis might considerably differ due to the p53 status.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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