Yu, Ji-Gang;Lim, Jeong-A;Song, Yu-Rim;Heu, Sunggi;Kim, Gyoung Hee;Koh, Young Jin;Oh, Chang-Sik
Journal of Microbiology and Biotechnology
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제26권2호
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pp.385-393
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2016
Pseudomonas syringae pv. actinidiae causes bacterial canker disease in kiwifruit. Owing to the prohibition of agricultural antibiotic use in major kiwifruit-cultivating countries, alternative methods need to be developed to manage this disease. Bacteriophages are viruses that specifically infect target bacteria and have recently been reconsidered as potential biological control agents for bacterial pathogens owing to their specificity in terms of host range. In this study, we isolated bacteriophages against P. syringae pv. actinidiae from soils collected from kiwifruit orchards in Korea and selected seven bacteriophages for further characterization based on restriction enzyme digestion patterns of genomic DNA. Among the studied bacteriophages, two belong to the Myoviridae family and three belong to the Podoviridae family, based on morphology observed by transmission electron microscopy. The host range of the selected bacteriophages was confirmed using 18 strains of P. syringae pv. actinidiae, including the Psa2 and Psa3 groups, and some were also effective against other P. syringae pathovars. Lytic activity of the selected bacteriophages was sustained in vitro until 80 h, and their activity remained stable up to 50℃, at pH 11, and under UV-B light. These results indicate that the isolated bacteriophages are specific to P. syringae species and are resistant to various environmental factors, implying their potential use in control of bacterial canker disease in kiwifruits.
Chemical control of bacterial canker of kiwifruit caused by Pseudomonas syringae pv. actinidiae was attempted by spraying of streptomycin sulfate ·oxytetracycline WP streptomycin WP streptomycin ·copper hydroxide WP kasugamycin SL kasugamycin·copper oxychloride WP and copper hydroxide WP. The control efficacies of the bactericides were variable depending upon the spraying schedule,. Application of streptomycin WP and streptomycin sulfate·oxytetracycline WP from middle April to early May was found to be the most effective in controlling the bacterial canker. For copper hydroxide WP the spraying from middle January to early February showed the highest control efficacy. Kasugamycin SL was the most effective in controlling the disease by spraying from middle April to early May but it was still relatibvely effective during other spray periods. Foliar application of copper hydroxide WP and copper-antibiotic formulaions after middle April caused severe phytotoxicity. Kasgamycil SL streptomycin WP streptomycin·copper hydroxide WP and copper hydroxide WP were potential bactericides which could substitute streptomycin sulfate·oxytetracycline WP. Selective applications of the bactericides according to their optimum spray time can enhance the control efficacies against bacterial canker of kiwifruit and retard the emergency of resistant strains of P. syringae pv. actinidiae to the bactericides. The optimum spray number of streptomycin sulfate·oxytetracycline WP was 3 times with 15-day-intervals or 4 times with 10-day-intervals. The result suggested that the potential bactericides to bacterial canker of kiwifruit should be also used according to their optimum spray schedules in order to get their highest control efficacies.
Lee, Young Sun;Kim, Gyoung Hee;Koh, Young Jin;Zhuang, Qiguo;Jung, Jae Sung
The Plant Pathology Journal
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제32권2호
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pp.162-167
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2016
Pseudomonas syringae pv. actinidiae, the causal agent of canker in kiwifruit, can be divided into three biovars (biovars 1, 2, and 3). Strains belonging to biovar 1 produce phaseolotoxin and were isolated in Japan and Italy before 2008. Strains of biovar 2 produce coronatine instead of phaseolotoxin and have been isolated only in Korea. Strains belonging to biovar 3 produce neither phaseolotoxin nor coronatine and are responsible for the global outbreak of bacterial canker of kiwifruit in recent years. The biovar 3-specific primer set was developed in a previous work. In this study, two sets of PCR primers specific to strains of biovars 1 and 2, respectively, were developed based on random amplified polymorphic DNA analyses. Primers PsaJ-F and PsaJ-R produced a 481-bp region with genomic DNA of biovar 1 strains, whereas primers PsaK-F and PsaK-R amplified a 413-bp region present only in the genome of biovar 2 strains.
Pseudomonas syringae pv. actinidiae (Psa) causes bacterial canker disease in kiwifruit. Antibacterial activity of plant essential oils (PEOs) originating from 49 plant species were tested against Psa by a vapor diffusion and a liquid culture assays. The five PEOs from Pimenta racemosa, P. dioica, Melaleuca linariifolia, M. cajuputii, and Cinnamomum cassia efficiently inhibited Psa growth by either assays. Among their major components, estragole, eugenol, and methyl eugenol showed significant antibacterial activity by only the liquid culture assay, while cinnamaldehyde exhibited antibacterial activity by both assays. The minimum inhibitory concentrations (MICs) of estragole and cinnamaldehyde by the liquid culture assay were 1,250 and 2,500 ppm, respectively. The MIC of cinnamaldehyde by the vapor diffusion assay was 5,000 ppm. Based on the formation of clear zones or the decrease of optical density caused by these compounds, they might kill the bacterial cells and this feature might be useful for managing the bacterial canker disease in kiwifruit.
키위 세균성 궤양병의 원인균인 Pseudomonas syringae pv. actinidiae는 유전적으로 구별되는 다섯 개의 biovar (1, 2, 3, 5, 6)로 나뉘어 진다. 그 중 biovar 3에 속하는 균주가 2008년 이래 전세계적으로 대유행을 일으키고 있다. 본 연구의 목표는 우리나라에서 분리된 biovar 3균주들의 집단 구조를 밝히고 그들의 기원을 추적하는데 있다. 13개의 우리나라 대표 균주와 2개의 중국 균주를 포함하는 15개 biovar 3 균주의 유전적 다양성을 RAPD-PCR로 평가하였다. RAPD 결과 연구에 사용된 균주들은 8개로 나누어져 이들을 subgroup I - VIII로 명명하였다. Subgroups II와 III은 중국 균주로 우리나라에서 발견되지 않았다. 따라서 우리나라 biovar 3 균주는 유전적으로 구별되는 6개의 subgroup (I, IV, V, VI, VII, VIII)으로 구성되어 있음을 알 수 있었다. New Zealand와 Europe균주에 특이적인 각각의 프라이머를 사용하여 PCR을 수행했을 때 subgroups V와 VI에 속하는 균주가 예상했던 DNA 절편을 증폭시켜 이들이 각각 두 지역에서 유입된 균주임을 시사하였다. 우리나라에서 처음 발견된 biovar 3 균주인 subgroup VIII에 특이적인 프라이머를 개발하여 조사한 결과 이 subgroup 균주는 처음 출현한 이후 더 이상 발견되지 않았다.
2013년부터 2016년까지 P. syringae pv. actinidiae에 의한 궤양병에 감염된 것으로 확인된 과수원수는 202개였는데, Psa2가 73개 과수원에서 검출되었고 Psa3는 129개 과수원에서 검출되었다. 2015년에 비해 2016년 Psa2에 감염된 과수원은 거의 증가하지 않았지만 Psa3에 감염된 과수원은 두 배 가량 증가했다. 우리나라에서 재배하고 있는 키위 품종들 중에서 일부 토종다래를 제외한 모든 키위 품종들에서 Psa3가 검출되어 아직까지 Psa3에 저항성인 품종은 없다는 것이 확인되었다. 조사된 품종들 중에서 골드키위 품종인 Hort16A와 제시골드와 레드키위 품종인 홍양이 Psa3에 가장 감수성이었다. 경남지역에서 역학조사와 RAPD 분석 결과 2014년 홍양 과수원에서 최초 Psa3에 의한 궤양병은 중국에서 수입한 Psa3에 오염된 꽃가루에 의해 발생했고, 2016년 경남 사천과 고성 지역의 과수원들에서 궤양병의 대발생은 홍양 과수원으로부터 근처 제시골드와 헤이워드 과수원으로 2차감염에 의한 Psa3의 급속한 확산 때문으로 추정된다.
키위에 세균성 궤양병을 일으키는 Pseudomonas syringae pv. actinidiae는 유전적 특성과 생산하는 독소에 따라 5개의 biovar (1, 2, 3, 5, 6)로 나누어진다. 그중 최근 전 세계적으로 유행하고 있는 biovar 3는 2011년부터 국내에서 분리되고 있다. RAPD 분석을 바탕으로 국내에서 분리된 biovar 3 균주는 6개의 subgroup (I, IV, V, VI, VII, VIII)으로 나누어진 바 있다. 본 연구에서는 차등되는 RAPD 밴드의 염기서열로부터 6개 subgroup 각각에 특이적인 SCAR primers를 개발하였다. 각 subgroup에 특이적인 이들 primers를 사용하여 2011-2017에 국내에서 분리한 biovar 3 균주들의 subgroup 분포를 조사하였다. 조사된 54개 균주 중 35개(64.8%)가 subgroup V에, 9개(16.7%) 균주가 subgroup IV, 4개(7.4%)가 subgroup VI, 3개(5.6%) 균주가 subgroup VII, 2개(3.7%)가 subgroup VIII, 그리고 1개(1.9%) 균주가 subgroup I에 속하였다. Subgroups IV, V 및 VI에 속하는 균주들은 각각 중국, 뉴질랜드, 칠레 균주와 연관이 있었다. 이 연구에 따르면 우리나라의 biovar 3 균주들은 유전적으로 다양하며 꽃가루를 통해 외국으로부터 유입된 것으로 추정된다.
Pseudomonas syringae pv. actinidiae (Psa)는 키위에 세균성 궤양병을 일으키는 병원균이다. Psa 균주는 유전적 및 생화학적 특징에 따라 5개의 biovar로 나누어진다. 그중 biovar 2와 3이 국내에서 발견되어 광범위한 피해를 주고 있다. Psa를 방제하는 효율적인 방법 중 한가지는 streptomycin과 같은 항생제를 사용하는 것이다. 그러나, 이 항생제에 저항성을 갖는 균주가 국내에서 분리되었고, 선행 연구에서 biovar 2 균주의 저항성이 strA-strB 유전자에 의한 것으로 밝혀졌다. 본 연구에서는 Psa biovar 3 균주에서 streptomycin 저항성의 분자적 기작을 밝히고자 하였다. 실험실에서 선발된 streptomycin 저항성 균주의 리보솜 단백질 S12를 암호화하는 유전자인 rpsL의 염기서열을 결정한 결과, 43번째 또는 88번째 코돈에서 자연발생적 점 돌연변이가 일어난 것을 확인하였다. 한편, 두 곳의 키위 과수원에서 분리된 4개의 streptomycin 저항성 biovar 3 균주에서는 민감성 균주에서 AAA인 rpsL의 코돈 43이 AGA로 단일 염기 치환이 일어났고, 이는 아미노산을 lysine에서 arginine으로 변화시키게 된다. 국내에서 발견된 biovar 3 균주 모두의 저항성 기작은 rpsL 유전자의 돌연변이에 기인하였다.
경기도와 강원도에 위치한 화악산, 명지산 그리고 설악산에서 침엽수를 채집하여 균 분리를 수행하였다. 특히, 눈측백과 분비나무의 내생균에 대한 연구가 최초로 수행되었으며, 본 연구를 통해 이들로부터 분리한 균에 대한 형태적, 유전적 동정을 수행하였다. 그 결과 Cryptosporiopsis actinidiae, Pestalotiopsis mangiferae, Pyrenochaeta cava가 확인되었으며, 이에 대해 최초로 국내에서 눈측백과 분비나무에 분포함을 보고하였다.
참다래 궤양병의 간단하고 효율적인 병원성 검정법을 개발하고자 수행하였다. 이 검정법은 과민성반응(hypersensitive reaction) 검정법을 변형한 것으로 병원균을 50 mM 인산 완충액(pH 7.5)에 현탁하여 5년생 참다래 상위엽에 주사기를 이용하여 엽육세포에 주입하였다. 병징은 접종 2일 후부터 보이기 시작하여 4일후에 판정이 가능하였으며 검정한계 농도는 $10^4$cfu/ml이었다. 주사접종법을 이용하여 25종에 대한 기주범위를 검정하였을 때 병원균과 기주에 따라 여러 가지 병징을 보였다. 이 검정법은 습도와 관계없이 빠르게 병징을 나타내는 효과적인 방법이었다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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