Cr-B2, a Gram-negative hexavalent chromium [Cr(VI)] reducing bacteria, was isolated from the aerator water of an activated sludge process in the wastewater treatment facility of a dye and pigment based chemical industry. Cr-B2 exhibited a resistance for 1,100 mg/l Cr(VI) and, similarly, resistance against other heavy metal ions such as $Ni^{2+}$ (800 mg/l), $Cu^{2+}$ (600 mg/l), $Pb^{2+}$ (1,100 mg/l), $Cd^{2+}$ (350 mg/l), $ZN^{2+}$ (700 mg/l), and $Fe^{3+}$ (1,000 mg/l), and against selected antibiotics. Cr-B2 was observed to efficiently reduce 200 mg/l Cr(VI) completely in both nutrient and LB media, and could convert Cr(VI) to Cr(III) aerobically. Cr(VI) reduction kinetics followed allosteric enzyme kinetics. The $K_m$ values were found to be 43.11 mg/l for nutrient media and 38.05 mg/l for LB media. $V_{max}$ values of 13.17 mg/l/h and 12.53 mg/l/h were obtained for nutrient media and LB media, respectively, and the cooperativity coefficients (n) were found to be 8.47 and 3.49, respectively, indicating positive cooperativity in both cases. SEM analysis showed the formation of wrinkles and depressions in the cells when exposed to 800 mg/l Cr(VI) concentration. The organism was seen to exhibit pleomorphic behavior. Cr-B2 was identified on the basis of morphological, biochemical, and partial 16S rRNA gene sequencing chracterizations and found to be Acinetobacter sp.
Esterase produced by Acinetobacter sp. B1 (strain B1) was optimized by means of one-variable-at-a-time and response surface methodologies. Results of the one-variable-at-a-time experiment showed that Tween 80 significantly increased esterase production of strain B1. The addition of Tween 80 to the culture medium increased the biomass and esterase activity of strain B1, stimulated content of total extracellular protein, and enhanced the oleic acid (C18:1) composition in the cell membrane of strain B1. The influence of eight culture variables on esterase production was evaluated by Plackett-Burman design. Results showed that Tween 80, pH, and $K_2HPO_4$ significantly affected the esterase production of strain B1. Tween 80, pH, and $K_2HPO_4$ were further optimized by central composite design. Under the optimized conditions (w/v, soluble starch 2.5%, tryptone 1.5%, Tween 80 0.8%, $K_2HPO_4$ 0.5%, NaCl 0.5%, pH 8.0, inoculum size 1%, and inoculum age 24 h), the maximum esterase activity of strain B1 was 152.13 U/ml, which was 10-fold higher than that of non-optimization after 36 h cultivation.
Kim Hak-Kyeong;Kim Dong-Kyu;Jeong Nam-Soo;Lee Myung-Suk;Kim Sang-Bong
Fisheries and Aquatic Sciences
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제4권1호
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pp.10-17
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2001
One serious problem among the troubles to identify objects in an optical microscopic image is contour background due to non-uniform light source and various transparency of samples. To solve this problem, this paper proposed an elimination method of the contour background and compensation technique as follows. First, Otsu's optimal thresholding method extracts pixels representing background. Second, bilinear interpolation finds non-deterministic background pixels among the sampled pixels. Third, the 2D cubic fitting method composes surface function from pivoted background pixels. Fourth, reconstruction procedure makes a contour image from the surface function. Finally, elimination procedure subtracts the approximated background from the original image. To prove the effectiveness of the proposed algorithm, this algorithm is applied to the yeast Zygosaccharomyces rouxii and ammonia-oxidizing bacteria Acinetobacter sp. Labeling by this proposed method can remove some noise and is more exact than labeling by only Otsu's method. Futhermore, we show that it is more effective for the reduction of noise.
This paper is to propose image segmentation method based on chamfer algorithm. First, we get original image from CCD camera and transform it into gray image. Second, we extract maximum gray value of background and reconstruct and eliminate the background using surface fitting method and bilinear interpolation. Third, we subtract the reconstructed background from gray image to remove noises in gray image. Fourth, we transform the subtracted image into binary image using Otsu's optimal thresholding method. Fifth, we use morphological filters such as areaopen, opening, filling filter etc. to remove noises and isolated points. Sixth, we use chamfer distance or Euclidean distance to this filtered image. Finally, we use watershed algorithm and count microorganisms in image by labeling. To prove the effectiveness, we apply the proposed algorithm to one of Ammonia-oxidizing bacteria, Acinetobacter sp. It is shown that both Euclidean algorithm and chamfer algorithm show over-segmentation. But Chamfer algorithm shows less over-segmentation than Euclidean algorithm.
한국 해안으로부터 우수 원유분해능 균주를 분리동정하여 그 특성을 관찰하였다. 이들 분리균주 중 우수 균주로는 Acinetobacter twoffii G1, Klebsiella pneumoniae L25, Pseudomonas maltophilia N246이 동정되었다. 이들 균주의 생장은 0.15%의 원유 농도와 3.5% sodium chloride에서 최대의 생장을 보여주었다. 이들 균주 중 X. campestris M12와 Xanthomonas sp. M28은 특별히 hexadecane과 octane을 그리고 P. maltophilia N246은 octane 을 탄소원으로 0.2-0.3%의 농도에서 최대로 분해하였다. K. pneumoniae L25에 의한 crude oil의 경Al적인 분해과정을 gas-liquid chromatography로 분석하였으며, 그 결과 긴 사슬의 alkane 보다 C14 이하의 짧은 사슬의 alkane을 보다 쉽게 이용하였으며 $30^{\circ}C$에서 8일간 배양시에 거의 모두 이용되었다.
디젤유로 오염된 토양으로부터 분리한 디젤 분해 우수 균주를 HS 균주로 명명하고, 각 균주의 디젤유 분해능과 특성을 조사하였다. 분리된 HS균주의 동정결과 HSI 균주는 Acinetobacter sp. HS2, HS3 균주는Pseudomonas sp.로 동정되었다. 최소배지에서 디젤유2%, pH 7.0,$25^{\circ}C$, 교반속도 200 rpm의 조건으로 5일간 배양한 결과 HSI 균주는 88% 이상의 높은 분해효율을 나타내었다. 소수성과 유화능의 측정 결과 HSI 균주가 가장 높은 소수성을 나타내었고, 유화능은 HS3 균주가 가장 높게 나타났다. 위의 결과를 토대로 액체 배양시 분해효율이 가장 높은 HSI 균주를 선택하여 토양배양을 실시한 결과 30일이 경과된 후 80%이상의 디젤유 분해효율을 나타내었고, 디젤유 분해효율은 미생물 활성과 비례하는 것으로 확인되었다. 따라서 신규 분리된 디젤유 분해균주는 높은 디젤유 분해능과 토양 생존능으로 실제 유류오염 환경에 적용이 가능할 것으로 사료된다.
T. japonius의 배양에 유효한 먹이 미생물을 탐색하기 위하여, T. japonicus가 서식하는 tide pool 면장 해수 및 해조류에서 264균주를 분리, 각 균주에 대한 먹이효과 실험을 하였던 결과, 각 생장단계별로 세균종이 달랐다. 즉 nauplius기, copepodite기 및 성체의 각기에 가장 유효한 먹이 세균은 Acinetobacter sp. AG-3뿐이고, Moraxella spp., Flavobacterium spp.는 copepodite기 이후에, Pseudomonas spp.는 성체기의 먹이 효과가 있었다. 이것은 tide pool속의 많은 세균중 극히 일부에 속하며, 먹이 세균의 최적 농도는 $10^6/ml$로 tide pool 평균 생균수 농도에 거의 일치하였다.
대전 근교의 유류로 오염된 토양으로부터 유류를 분해하는332개의 세균 콜로니를 분리한 후 이 중 lipase 활성이 우수한 한 균주를 최종 선별하여 생리생화학적 조사와 16S rRNA 염기서열분석 등을 통하여 동정한 결과 Acinetobactor sp. B2로 확인되었다. 최종 선별된 Acinetobactor sp. B2는 trehalose, mannitol을 제외한 다양한 당을 이용하였고, kanamycin, streptomycin, tetracycline, spectinomycin의 항생제에 대해서 약한 내성을, 그리고 Ba, Li, Mn, Al, Cr, Pb 등의 중금속에 대해서는 mg/ml 단위까지 강한 내성을 나타냈고 생장 최적 온도는 $30^{\circ}C$로 확인되었다. Acinetobactor sp. B2에서 정제된 lipase의 분자량은60 kDa이었고, 이 효소의 최적 온도와 PH는 각각 $40^{\circ}C$와 pH 10이었다. 그리고p-nitrophenyl palmitate (pNPP)를 가수분해하는데 필요한 활성에너지는 $4-37{\circ}C$의 범위에서 2.7 kcal/mol 이었고, $60^{\circ}C$ 이상의 온도에서는 불안정한 효소임이 확인되었다. 또 pNPP에 대한 이 효소의 Michaelis constant (Km)와 최대속도상수 $(V_{max})$값은 각각 21.8 ${\mu}M$과 $270.3\;{\mu}M\;min^{-1}mg^{-1}$ 이었고, 이 효소는 $Cd^{2+},\;Co^{2+},\;Fe^{2+},\;Hg^{2+},$ EDTA, 2-mercaptoethanol에 의해 강하게 억제되었다.
포도당을 이용하여 성장하고 있는 호기성 일산화탄소 산화 세균인 Acinetobacter sp. Strain JC1 DSM 3808애 존재하는 catalase의 활성은 지수성장기 중반에서 높게 나타났으나, 지수성장기 후반 및 정체기 초기에서 낮아졌다가 정체기 중기에서 급격히 증가한 후 다시 감소하였다. 이 세균에는 세종류(Cat1, Cat2, Cat3)의 catalase가 존재하였는데, Cat1과 Cat3의 활성은 성장시기에 따라 큰 차이를 보이지 않았으나 Cat2의 활성은 성장시기에 따라 큰 변화를 나타내었다. Cat3는 이 세균이 포도당을 이용하여 성장할 때만 생성되었고, 일산화탄소나 메탄올을 이용하여 성장할 때는 생성되지 않았다. 세포추출액을 ethanol과 chloroform으로 처리한 후 활성염색을 하였을 때 Cat1과 Cat3의 활성은 안정하였으나 Cat2는 활성을 상실하였다. 세포추출액을 20mM $H_2O_2$와 3-amino-1,2,4-triazole(AT)을 처리하였을 때 Cat1과 Cat3의 활성이 반감되었고, Cat2는 $H_2O_2$에 의해서는 불활성되었으나 AT의 영향은 받지 않았다. Cat1은 80$^{\circ}C$ 1분간 열처리후에도 활성을 나타내었으나, Cat2와 Cat3는 60$^{\circ}C$와 70$^{\circ}C$에서 1분간의 열처리 후 각각 활성을 상실하였다. Cat2는 catalase 활성외에 peroxidase의 활성도 나타내었다. 일곱단계의 과정을 거쳐 포도당에서 성장시에만 생성되는 Cat3를 정제하였다. 정제된 Cat3의 크기는 150,000이었고, 63,000의 크기를 가진 두개의 동일한 소단위로 구성되어 있었으며, $H_2O_2$에 대한 K_m값은 39mM과 58mM로 나타났다. 정제된 효소의 활성을 위한 최적 pH는 7.0이었으나 전반적으로 pH 6~9에서 비슷하게 높은 활성을 나타내었다. 정제된 효소의 최적온도는 40$^{\circ}C$이었으며 20~50$^{\circ}C$에서 비슷한 활성을 나타내었고, 30$^{\circ}C$에서는 60분동안 효소활성이 거의 상실되지 않았다. 정제된 효소는 ethanol과 chloroform 처리에는 안정하였으나 12mM AT 와 0.1mM $NaN_3$ 및 1mM KCN에 의해 90% 이상의 활성이 억제되었다.
The bacterial strain which utilizes phenol and degrade TCE was isolated from an industrial waste site. The bacterial strain was named as T5-7 and identified as an Acinetobacter species. After phenol-induction, the strain T5-7 removed TCE efficiently without cell growth. So, it seems that TCE degradation was not related to cell growth. TCE degradation increased when initial cell concentrations of phenol-grown T5-7 were high. In the presence of phenol, initial degradation of TCE was delayed but total amount of degradation was not affected at final stage. The strain cultured in 0.1% yeast extract did not degrade TCE, which indicates that phenol induction was essential to the TCE degradation.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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