• Title/Summary/Keyword: Xylose

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The Enzymatic Pattern of Bifdobacterium sp. Int-57 Isolated from Korean Feces (한국인 분변으로부터 분리한 Bifidobacterium sp. Int-57의 효소 Pattern)

  • 박헌국;강동현;이계호;윤석환;이세경;지근억
    • Microbiology and Biotechnology Letters
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    • v.20 no.6
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    • pp.647-654
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    • 1992
  • In order to study the physiological properties of the intestinal bacteria, we isolated the intestinal bacteria of Koreans and tested the enzymatic patterns. Isolated Bifidobacterium sp. Int-57 had the higher activity of $\alpha$-glucosidase, $\beta$-glucosidase, $\alpha$-galactosidase, $\beta$-galactosidase. $\beta$-xylosidase and $\alpha$-arabinofuranosidase than other intestinal microorganisms. The effect of the carbon sources on the production of each enzymes of Bijidobacterium sp. Int-57 was investigated. The most suitable carbon source for the production of $\beta$-glucosidase was maltose, for a-glucosidase cellobiose, for $\alpha$-galactosidase raffinose, for $\beta$-galactosidase lactose, and for $\beta$-xylosidase and $\alpha$-arabinofuranosidase xylose, respectively. In addition, we investigated the optimal conditions and pH stability of each crude enzymes. The optimal condition of a-glucosidase was pH 6.0 and $40^{\circ}C$. that of Jj-glucosidase pH 7.0 and 50oe, that of $\beta$-galactosidase pH 7.0 and $50^{\circ}C$, that of $\beta$-xylosidase pH 6.0 and $40^{\circ}C$ , and that of $\alpha$-arabinofuranosidase pH 5.0 and $50^{\circ}C$. respectively. a-Glucosidase was stable at pH 4.0-9.0. Jj-glucosidase at pH 4.0-7.0. $\beta$-galactosidase at pH 4.0-9.0, $\beta$-xylosidase at pH 4.0-6.0, and /3-arabinofuranosidase at pH 7.0-9.0, respectively.

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Utilization of cyclohexanol and characterization of Acinetobacter calcoaceticus C-15 (Acinetobacter calcoaceticus C-15에 의한 Cyclohexanol의 이용 및 그 특성)

  • Kim, Kyung Ae;Park, Jong Sung;Rhee, In Koo
    • Microbiology and Biotechnology Letters
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    • v.13 no.1
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    • pp.71-77
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    • 1985
  • A bacterium which grows on cyclohexanol as sole carbon and energy source was isolated from sludge of industrial areas in Taegu and identified as Acinetobacter calcoaceticus C-15. The growth medium for the optimal culture condition was composed of 0.2% cyclohexanol, 0.11% $NH_4Cl$, 0.05% $KH_2PO_4$, 0.2% $K_2HPO_4$, 0.02% $MgSO_4{\cdot}7H_2O$, and 0.05% yeast extracts. The optimal pH value and temperature for the growth were 7.2 and $33^{\circ}C$, respectively. Specific growth rate of A. calcoaceticus C-15 at $33^{\circ}C$ on the cyclohexanol and cyclohexanone was $0.27hr^{-1}$ and $0.15hr^{-1}$, respectively. Growth yield for cyclohexanol was 1.0. The bacteria utilized ethanol, 1-butanol, 1-pentanol, and cyclohexanol as a carbon source but not methanol, 1-hexanol, m-cresol, glycerol, and cyclohexane. The bacteria grew on benzoate, adipate, acetate, and citrate, but did not on salicylate, phthalate, p-hydroxybenzoate, and gluconate. A calcoaceticus C-15 did not utilize all kind of sugars other than xylose. Cell-free extracts contained $NAD^+$-linked cyclohexanol dehydrogenase which catalized the oxidation of cyclohexanol to cyclohexanone.

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RNAi-Mediated Gene Silencing of Trcot1 Induces a Hyperbranching Phenotype in Trichoderma reesei

  • Gao, Fei;Li, Mengzhu;Liu, Weiquan;Bai, Yingguo;Tao, Tu;Wang, Yuan;Zhang, Jie;Luo, Huiying;Yao, Bin;Huang, Huoqing;Su, Xiaoyun
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • v.30 no.2
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    • pp.206-215
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    • 2020
  • Trichoderma reesei is the major filamentous fungus used to produce cellulase and there is huge interest in promoting its ability to produce higher titers of cellulase. Among the many factors affecting cellulase production in T. reesei, the mycelial phenotype is important but seldom studied. Herein, a close homolog of the Neurospora crassa COT1 kinase was discovered in T. reesei and designated TrCOT1, which is of 83.3% amino acid sequence identity. Functional disruption of Trcot1 in T. reesei by RNAi-mediated gene silencing resulted in retarded sporulation on potato dextrose agar and dwarfed colonies on minimal medium agar plates containing glucose, xylan, lactose, xylose, or glycerol as the sole carbon source. The representative mutant strain, SUS2/Trcot1i, also displayed reduced mycelia accumulation but hyperbranching in the MM glucose liquid medium, with hyphal growth unit length values decreased to 73.0 ㎛/tip compared to 239.8 ㎛/tip for the parent strain SUS2. The hyperbranching phenotype led to slightly but significantly increased cellulase secretion from 24 to 72 h in a batch culture. However, the cellulase production per unit of mycelial biomass was much more profoundly improved from 24 to 96 h.

Polysaccharide isolated from fermented barley extract activates macrophages via the MAPK and NF-κB pathways (보리발효추출물로부터 분리한 다당의 대식세포 활성화 및 신호 전달)

  • Kim, Han Wool;Jee, Hee Sook;Shin, Kwang-Soon
    • Korean Journal of Food Science and Technology
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    • v.50 no.5
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    • pp.555-563
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    • 2018
  • Barley has nutritional benefits due to its high dietary fiber content; therefore, the intake of whole barley grains is recommended. However, barley is often consumed in the fermented form because of the improved texture and digestibility. The present study was designed to elucidate the intracellular signaling pathway for macrophage activation by the polysaccharide BF-CP from fermented barley. BF-CP is a neutral polysaccharide, composed of neutral sugars, including glucose (70.7%), xylose (11.4%), and arabinose (9.0%). BF-CP exhibited macrophage-stimulatory activity by inducing the production of interleukin (IL)-6, tumor necrosis factor $(TNF)-{\alpha}$, and nitric oxide in RAW 264.7 macrophages. Further, BF-CP treatment strongly increased the IL-6 and $TNF-{\alpha}$ gene expression in a concentration-dependent manner. Signal transduction experiments using immunoblotting showed that BF-CP phosphorylated mitogen-activated protein kinases (MAPKs), such as c-Jun N-terminal kinase, extracellular signal-regulated kinase, and p38, and nuclear factor $(NF)-{\kappa}B$, in RAW 264.7 cells in a concentration-dependent manner. These results suggest that BF-CP activates the macrophages via MAPK and $NF-{\kappa}B$ pathways, and also induces an increase in the production of cytokines.

Semantic Inference System Using Backward Chaining (후방향 추론기법을 이용한 시멘틱 추론 시스템)

  • 함영경;박영택
    • Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
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    • 2003.10a
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    • pp.97-99
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    • 2003
  • 대부분의 웹 문서들은 HTML이나 XML로 표현된 웹의 정보들은 Syntactic 구조를 기반으로 표현되기 때문에, 소프트웨어가 정보를 처리하는데 한계가 있다. HTML은 문서의 display안을 위한 tag기반의 문서 표현 방식이고, XML은 문서의 구조를 사람이 이해하기 쉽도록 제안된 표현 방식이기 때문이다. 따라서, HTML 및 XML로 표현된 정보들을 가지고 서비스를 제공하는 웹 에이전트들은 사용자들에게 의미있는 서비스를 제공하기 위해 오프라인 상에서 많은 수작업을 수행해야만 했다. 이와 같은 문제점을 극복하기 위해서 미국과 유럽에서는 시멘틱 웹에 대한 연구를 활발히 진행하고 있다. 시멘틱 웹은 기존의 웹과는 달리 소프트웨어가 이해하고 처리 할 수 있는 형태(machine processable)로 정보를 표현하기 때문에 오프라인 상에서 수행되던 많은 작업들을 에이전트가 이해하고 처리할 수 있게 되었다. 그러나. 온톨로지를 구축하는 과정에서도 필연적으로 정보의 31(Incorrect, incomplete, Inconsistence)가 나타나고, 서비스의 결과 또한 온톨로지에 의해 좌우된다는 단점이 있다. 본 논문에서 제안하는 후방향 추론기법을 이용한 추론엔진은 다음과 같은 시스템을 제안한다. 첫째. 시멘틱 웹을 이용함으로써 소프트웨어 에이전트의 자동화 시스템을 제안한다. 둘째 은톨로지 정보의 한계성을 극복하기 위해 규칙기반의 후방향 추론 기법을 사용하는 시멘틱 추론엔진을 제안한다. 본 논문에서 제안하는 후방향 추론기법을 이용한 시멘틱 추론시스템은 사용자의 질의를 입력받아. 온톨로지와 시멘틱 웹 문서의 정보를 이용하여 후방향 추론을 수행함으로써 웹 정보의 불완전성을 완화하고, 온톨로지의 영향력를 감소시킴으로써 웹 서비스의 질을 향상시키는데 목적이 있다.RED에 비해 향상된 성능을 보여주었다.웍스 네트워크상의 다양한 디바이스들간의 네트워크 다양화와 분산화 기능을 얻을 수 있었고, 기존의 고가의 해외 솔루션인 Echelon사의 LonMaker 소프트웨어를 사용하지 않고도 국내의 순수 솔루션인 리눅스 기반의 LonWare 3.0 다중 바인딩 기능을 통해 저 비용으로 홈 네트워크 구성 관리 서버 시스템 개발에 대한 비용을 줄일 수 있다. 기대된다.e 함량이 대체로 높게 나타났다. 점미가 수가용성분에서 goucose대비 용출함량이 고르게 나타나는 경향을 보였고 흑미는 알칼리가용분에서 glucose가 상당량(0.68%) 포함되고 있음을 보여주었고 arabinose(0.68%), xylose(0.05%)도 다른 종류에 비해서 다량 함유한 것으로 나타났다. 흑미는 총식이섬유 함량이 높고 pectic substances, hemicellulose, uronic acid 함량이 높아서 콜레스테롤 저하 등의 효과가 기대되며 고섬유식품으로서 조리 특성 연구가 필요한 것으로 사료된다.리하였다. 얻어진 소견(所見)은 다음과 같았다. 1. 모년령(母年齡), 임신회수(姙娠回數), 임신기간(姙娠其間), 출산시체중등(出産時體重等)의 제요인(諸要因)은 주산기사망(周産基死亡)에 대(對)하여 통계적(統計的)으로 유의(有意)한 영향을 미치고 있어 $25{\sim}29$세(歲)의 연령군에서, 2번째 임신과 2번째의 출산에서 그리고 만삭의 임신 기간에, 출산시체중(出産時體重) $3.50{\sim}3.99kg$사이의 아이에서 그 주산기사망률(周産基死亡率)이 각각 가장 낮았다. 2. 사산(死産)과 초생아사망(初生兒死亡)을 구분(區分)하여 고려해 볼때 사산(死産)은 모성(母性)의 임신력(姙娠歷)과 매우 밀접한 관련이 있는 것으

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Purification and Structural Analysis of Antitumor Polysaccharides Obtained from Ganoderma lucidum IY 009 (Ganoderma lucidum IY 009로 부터 분리된 항암성 다당류의 정제 및 구조분석)

  • Lee, Kweon-Haeng;Jeong, Hoon;Lee, June-Woo;Han, Man-Deuk;Choi, Kyoung-Sook;Oh, Doo-Hwan
    • Microbiology and Biotechnology Letters
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    • v.22 no.2
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    • pp.190-196
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    • 1994
  • Alkali soluble(AS) fraction, revealed the highest antitumor activity of the alkali extracted fractions of G. lucidum IY 009, was loaded on DEAE cellulose(OH$^{-}$ form) column. AS-1, AS-2, AS-3, AS-4 and AS-5 were obtained by stepwise elution with H$_{2}$O, 0.1 M NaHCO$_{3}$, 0.3 M NaHCO$_{3}$, 0.5 M NaHCO$_{3}$ and 0.5 N NaOH respectively, and their antitumor activities(I.R. %) against the sarcoma 180 were 97.5%, 68.0%, 73.0%, 81.0% and 66.0% respectively. AS-1 observed highest antitumor activity was appeared as single peak on the Sepharose CL-4B column chromatography, and their molecular weight was about 580,000 dalton. The carbohydrate content of AS-1 was 98.9%, their monosaccharide consisted of 67.5% of mannose, 22.5% of xylose, 5.8% of glucose, 1.8% of galactose and 2.0% of ribose. AS-1 was assumed $\alpha $linkaged xylomannan having infrared absorption at 864.3 cm$^{-1}$. The main alditol acetates of AS-1 were identified as 1,5-Di-O-acetyl1-2,3,4-Tri-O-methylxylitol, 1,4,5-Tro-O-acety1-2,3,6-Tri-O-methylmannitol and 1,3,4,5-Tetra-O-acety1-2,6-Di-O-methylmannitol by methylation analysis, and their molar ratio was 1 : 2 : 1. The core portion of AS-1 might be $\alpha $-(1$\longrightarrow $ 4)mannopyranosyl unit branched with side chain, C1 of xylopyranosyl residue linked to C3 of every 3 mannopyranosyl units, and the degree of polymerization of structural unit in AS-1 was about 835.

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Cloning, Expression, and Characterization of a New Xylanase from Alkalophilic Paenibacillus sp. 12-11

  • Zhao, Yanyu;Meng, Kun;Luo, Huiying;Yang, Peilong;Shi, Pengjun;Huang, Huoqing;Bai, Yingguo;Yao, Bin
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • v.21 no.8
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    • pp.861-868
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    • 2011
  • A xylanase gene, xyn7c, was cloned from Paenibacillus sp. 12-11, an alkalophilic strain isolated from the alkaline wastewater sludge of a paper mill, and expressed in Escherichia coli. The full-length gene consists of 1,296 bp and encodes a mature protein of 400 residues (excluding the putative signal peptide) that belongs to the glycoside hydrolase family 10. The optimal pH of the purified recombinant XYN7C was found to be 8.0, and the enzyme had good pH adaptability at 6.5-8.5 and stability over a broad pH range of 5.0-11.0. XYN7C exhibited maximum activity at $55^{\circ}C$ and was thermostable at $50^{\circ}C$ and below. Using wheat arabinoxylan as the substrate, XYN7C had a high specific activity of 1,886 U/mg, and the apparent $K_m$ and $V_{max}$ values were 1.18 mg/ml and 1,961 ${\mu}mol$/mg/min, respectively. XYN7C also had substrate specificity towards various xylans, and was highly resistant to neutral proteases. The main hydrolysis products of xylans were xylose and xylobiose. These properties make XYN7C a promising candidate to be used in biobleaching, baking, and cotton scouring processes.

On Supporting Internet Integrated Servies over Token Ring and Ethernet (토큰링과 이더넷에서의 인터넷 통합서비스지원)

  • Kim, So-Yeon;Lee, Mi-Jeong
    • Journal of KIISE:Computer Systems and Theory
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    • v.26 no.6
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    • pp.644-661
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    • 1999
  • 인터넷에서 통합서비스를 제공하기 위해서는 종단간 다양한 QoS를 지원해야 하는데 이를 위해서는 인터넷뿐 아니라 종단 사용자와 인터넷을 연결하는 랜에서의 QoS 지원이 필요하다. 이에, IETF는 특정 링크 계층으로 구성되는 서브넷에서 QoS 지원을 위한 기본 골격을 제안하였다. 그런데 , 매체 접근방식에 따라 서브넷이 제공할 수 있는 서비스의 정도가 크게 달라지기 때문에 실제로 IS802 모델을 특정서브넷에 구현하기 위해서는 이에 대한 고려가 필요하다. 본 논문에서는 통합서비스를 지원하기 위한 기반이 되는 서브넷 차원에서의 우선순위 지원을 목표로 IS802 모델을 전통적인 이더넷과 토큰링에 적용하여 보았다. 먼저, IS802 모델의 대역폭관리자를 적용한 이더넷 IS모델과 토큰링_IS 모델의 구현을 제안하고 특별히, 이더넷의 경우 매체 접근 방식의 특성상 IS802 모델의 적용만으로는 서브넷차원에서의 우선순위에 따른 전송을 지원할 수 없기 때문에 이를 보완하기 위한 페이즈 모델을 추가로 제안하였다. 시뮬레이션을 통해 기존의 전통적인 이더넷과 토큰링 및 새롭게 표준화된 IS802 모델을 적용한 이더넷 _IS와 토큰링 _IS, 그리고 페이즈 모델간의 성능을 비교하였다. 시뮬레이션결과 토큰링의 경우 단순한 입장 제어에 의해서도 QoS 지원 정도가 크게 향상될수 있음을 볼 수 있었다. 또한 , 페이즈 모델의 경우 이더넷의 매체 접근 방식을 상당히 보완함으로써 QoS 지원 정도가 크게 향상될 수 있음을 볼 수 있었다. 또한, 페이즈 모델의 경우 이더넷의 매체 접근 방식을 상당히 보완함으로써 QoS 지원을 요구하는 플로우에대해서는 전통적인 이더넷이나 이더넷_IS 비해 훨씬 안정적인 서브넷 차원의 우선순위지원 서비스를 제공할 수 있음을 확인할 수 있었다.제공하는 멀티미디어 동기화 편집기와 변환기 및 상영기를 ScriptX를 이용하여 Windows95 상에 구현하였다.기 위한 간단한 例를 들어 봄으로써 이 글을 쓰는 동기으 일면을 대신하고자 한다.置함으로 이것을 Multi-Drop(points) system으로 swiching System을 利用 Mini-Network을 構成할 수도 있다.크 구성 관리 서버 시스템 개발에 대한 비용을 줄일 수 있다. 기대된다.e 함량이 대체로 높게 나타났다. 점미가 수가용성분에서 goucose대비 용출함량이 고르게 나타나는 경향을 보였고 흑미는 알칼리가용분에서 glucose가 상당량(0.68%) 포함되고 있음을 보여주었고 arabinose(0.68%), xylose(0.05%)도 다른 종류에 비해서 다량 함유한 것으로 나타났다. 흑미는 총식이섬유 함량이 높고 pectic substances, hemicellulose, uronic acid 함량이 높아서 콜레스테롤 저하 등의 효과가 기대되며 고섬유식품으로서 조리 특성 연구가 필요한 것으로 사료된다.리하였다. 얻어진 소견(所見)은 다음과 같았다. 1. 모년령(母年齡), 임신회수(姙娠回數), 임신기간(姙娠其間), 출산시체중등(出産時體重等)의 제요인(諸要因)은 주산기사망(周産基死亡)에 대(對)하여 통계적(統計的)으로 유의(有意)한 영향을 미치고 있어 $25{\sim}29$세(歲)의 연령군에서, 2번째 임신과 2번째의 출산에서 그리고 만삭의 임신 기간에, 출산시체중(出産時體重) $3.50{\sim}3.99kg$사이의 아이에서 그 주산기사망률(周産基死亡率)이 각각 가장 낮았다. 2. 사산(死産)과 초생아사망(初生兒死亡)을 구분(區分)하여 고려해 볼때 사산(死産)은 모성(母性)의 임신력(姙娠歷)

Material and Heat Balances of Bioethanol Production Process by Concentrated Acid Saccharification Process from Lignocellulosic Biomass (목질계 Biomass로부터 강산 당화 공정에 의한 Bioethanol 생산 공정의 물질 및 열수지)

  • Kim, Hee-Young;Lee, Eui-Soo;Kim, Won-Seok;Suh, Dong-Jin;Ahn, Byoung-Sung
    • Clean Technology
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    • v.17 no.2
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    • pp.156-165
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    • 2011
  • The process for bioethanol production from lignocellulosic biomass was studied through process simulation using PRO/II. Process integration was conducted with concentrated acid pretreatment, hydrolysis process, SMB (simulated moving bed chromatography) process and pervaporation process. Energy consumption could be minimized by the heat recovery process. In addition, material and energy balance were calculated based on the results from the simulation and literature data. A net production yield of 4.07 kg-biomass and energy consumption value of 3,572 kcal per 1 kg ethanol were calculated, which is indicating that 26% yield increase and 30% energy saving compared to the bioethanol production process with dilute-acid hydrolysis (SRI report). In order to make it possible, sugar conversion yield of cellulose and hemi-cellulose is to be reached up to 90% and fermentation of xylose needs to be developed. In order to reduce the energy consumption up to 30%, the concentration of acid solution after being separated by 5MB should exceed 20%. If acid/sugar separation by SMB process is to be practical, the bioethanol process designed in this study can be commercially feasible.

Comparison of Selective Media for Isolation and Detection of Shigella spp. from Foods (식품으로부터 쉬겔라 검출을 위한 분리배지 비교)

  • In, Ye-Won;Ha, Su-Jeong;Oh, Se-Wook
    • Journal of the Korean Society of Food Science and Nutrition
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    • v.40 no.7
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    • pp.1025-1031
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    • 2011
  • The objective of this study was to compare the performances of conventional microbiological media used in isolation of Shigella spp. from foods. Total of six selective media, including MacConkey agar (MAC), Salmonella Shigella agar (SSA), desoxycholate citrate agar (DCA), xylose lysine desoxycholate agar (XLD), hektoen enteric agar (HEA), and CHROMagar, were tested. MAC showed almost the same colony numbers as compared to tryptic soy agar (TSA) while DCA showed significantly lower colony numbers when cultivated Shigella spp. was counted in each medium. In a food recovery test with beef, pork and shrimp, S. sonnei recovered well on CHROMagar (p<0.05). With lettuce and cabbage, S. sonnei displayed significantly significant recovery (p<0.05) on SSA in comparison with other selective media. Heat-injured cells recovered well on MAC and SSA. In a specificity test using Enterobacteriaceae strains, HEA was identified as having the highest specificity among the tested media. However, Morganella spp. could not be differentiated from Shigella spp. on any of the tested selective media. Shigella spp. precluded the possibility of isolation from foods by a single 'best' selective medium. Consequently, a combination of complementary selective media or selection of appropriate media according to cell conditions must be considered for comprehensive isolation.