• Journal of Life Science
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• 제11권1호
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• pp.34-38
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• 2001

The cDNA encoding ribosomal protein S4(RPS 4) from an ovary cDNA library of the Japanese monkey (Macaca fuscata) was cloned and sequenced. The RPS4X gene from monkey X chromosome encodes a deduced protein of 263 amino acids and share 99.1% cDNA sequence similarity and 100% amino acid sequence identify with the human RPS4X. Rate of synonymous substitution was higher in RPS4Y than in RPS4X in comparison to the monkey and human. The ratio of synonymous and nonsynonymous substitutions per site indicated that directional selection has nor occurred in RPS4 genes. Phylogenetic analysis using the neighbor-joining method revealed that X and Y-linked RPS4 genes have evolved independently.

• Tuberculosis and Respiratory Diseases
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• 제56권4호
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• pp.393-404
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• 2004

연구배경 : 유전자 재결합 반응에 있어서 다른 종류의 RNA의 첨가에도 불구하고 유전자 반응에 영향이 없어야 여타 실험의 정량적 분석에 이용이 가능하다. 이에 저자들은 쥐를 대상으로 filter hybridization방법과 SP-A mRNA을 이용하여 비특이성 RNA 즉, 쥐의 비장 RNA의 첨가가 surfactant protein A (SP-A)의 유전자 재결합반응의 linearity, 상관계수 및 특이성에 미치는 영향을 알아보기 위하여 이 연구를 시행하였다. 방 법 : SP-A transcript mRNA의 정량, 즉 0, 0.1, 0.5, 1 및 2.5 ng에 비특성 RNA 즉 비장 RNA를 각각 0,1, 5 및 $10{\mu}g$을 첨가하여 filter hybridization 방법을 이용하여 SP-A mRNA양과 cpm과의 연관성을 비교정량측정하여 각각의 linearity, 상관계수 및 특이성의 분자생물학적 정도관리에 대한 비교 관찰을 하기 위하여 이 연구를 시행하였다. 결 과 : 1. 쥐의 spleen RNA 0, 1, 5, 10 및 $20{\mu}g$에 대한 cpm과의 표준곡선 및 상관계수는 Y=0.13X-19.35(X=cpm, Y=spleen RNA input)이고, 상관계수는 0.98이었다. 2. SP-A sense 전사체 0, 0.1, 0.5, 1.0, 2.5 및 5 ng에 대한 cpm과의 표준곡선 및 상관계수는 Y=0.00066X-0.046 (X=cpm, Y=SP-A mRNA 전사체)이고, 상관계수는 0.99이었다. 3. 쥐의 비장 RNA $1{\mu}g$을 첨가 후 SP-A sense 전사체 0, 0.1, 0.5, 1.0, 2.5 및 5 ng에 대한 cpm과의 표준곡선 및 상관계수는 Y=0.00056X-0.051(X=cpm, Y=SP-A mRNA 전사체)이고, 상관계수는 0.99이였다. 쥐의 비장 RNA $5{\mu}g$을 첨가 후 표준곡선은 Y=0.00065X-0.088 (X=cpm, Y=SP-AmRNA 전사체)이고, 상관계수는 0.99이였다. 쥐의비장 RNA $10{\mu}g$을 첨가 후 표준곡선은 Y=0.00051X-0.10 (X=cpm, Y=SP-A mRNA 전사체)이고, 상관계수는 0.99이었다. 결 론 : 이상의 결과는 비특이성 RNA인 비장 RNA의 첨가 후 SP-A sense mRNA양과 cpm과의 상관관계는 sense 유전자와 anti-sense 유전자의 유전자 재결합 반응에 있어서 다양한 양의 비특이성 RNA의 첨가나 오염에도 불구하고 linearity, 상관계수 및 그 특이성이 잘 유지됨을 입증해 준 결과라 생각된다.

• Bulletin of the Korean Chemical Society
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• 제28권7호
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• pp.1141-1150
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• 2007

Molecular modeling study has been performed to assist in the design of PTP1B inhibitors using FlexX. FlexX dockings with 19 test ligands, whose structures have been determined by X-ray crystallography, were successful in reproducing the experimental conformations within the protein. An increase in biological activity is observed as hydrophobic character of formylchromone derivatives increases. Most ligands bind to the activesite regions of the protein successfully in two different score runs. The Drug score run gave better results than the FlexX score run based on the score, rank, binding modes and bond distance of docked structures. Consensus values from the CScore scoring function are between 3 and 5, suggesting that the scoring scheme is reliable. All formylchromone inhibitors considered in this work show unidirectional binding modes in the active site pocket, which is contrary to the bidirectional X-ray results by Malamas et al. and amino acid residues responsible for such orientation are identified to help further development of the inhibitors.

• 미생물학회지
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• 제47권1호
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• pp.7-13
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• 2011

일반적으로 대장균을 숙주로 이용하여 고등생물 유래 막단백질을 발현시킬 경우 발현된 막단백질은 숙주 세포에 치명적인 독성을 보인다. 우리가 발현을 시도한 15개의 인간 막단백질 중에서 특히 퓨린수용체 $P2X_4$ 발현은 대장균에 강한 독성을 보였다. 이러한 독성의 원인을 알아보기 위해 hydroxylamine을 사용하여 하여 인간 $P2X_4$ 유전자를 돌연변이 시키고 독성이 약해진 돌연변이체를 선별하였다. 돌연변이체 단백질을 면역블랏으로 분석한 결과 야생형에 비해 모두 단백질의 크기가 작았다. 크기가 제법 큰 돌연변이 두 개를 골라 DNA 서열분석을 해보니 130번째, 또는 194번째 Trp 코돈이 종결코돈으로 바뀜으로써 두 번째 막통과 도메인이 사라진 truncated protein이라는 사실을 알았다. 이들 돌연변이체의 세포내 위치를 추적해보니 둘 다 세포막에 삽입되어 있지는 않았다. 이런 결과를 종합해 볼 때 $P2X_4$의 발현이 대장균에 독성을 보이기 위해서는 전체 단백질의 올바른 세포막 삽입이 중요함을 시사한다.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제6권6호
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• pp.369-374
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• 1996

The ${\beta}$-lactamase inhibitory protein (BLIP) produced by Streptomyces exfoliatus SMF19 was purified(33 kDa) and the N-terminal amino acid sequence was determined as NH2-ATSVVAWGGNND. Genomic DNA library of S. exfoliatus SMF19 was constructed in pWE15 and recombinants harbouring the corresponding gene were selected by colony hybridization to the mixture of 36-mer oligonucleotide designed from the N-terminal amino acid sequence. The corresponding gene (bliX) was isolated on a 4-kb ApaI fragment of S. exfoliatus SMF19 chromosomal DNA and then sequenced. The bliX consisting of 1, 119bp encoded a mature protein with a deduced amino acid sequence of 342 residues and also encoded a 40-amino-acid signal sequence. No significant sequence similarity to bliX was found by pairwise comparison using various protein and nucleotide sequences.

• 한국수산과학회지
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• 제7권4호
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• pp.209-214
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• 1974

Casein을 단백원으로 하고 조단백질과 지질의 함량을 조사한 사료로서 치무지개송어를 19일간 사육하여 다음과 같은 결과를 얻었다. 1) 무지개송어의 체중은 사료중의 단백질 함량이 많을수록 증가하며 단백질의 함량 $40\%$ 부근에서 최대치에 달하고 그 이상 단백질이 증가하여도 체중은 증가하지 않았다. 체단백질의 증가도 사료중의 단백질 함량이 $40\%$ 부근에서 최대치에 가까워지며 그 이상 단백질이 증가하여 도 변화는 적었다. 2) 단백질의 이용치는 사료중의 단백질 함양이 많을 수록 증가하였으나 체단백질의 축적률은 단백질의 함량 $40\%$ 부근에서 최대치에 달했다. 3) 이상의 결과에서 Casein을 단백원으로 하는 경우 치무지개송어의 단백질 요구량은 사료중 $40\%$라고 생각했다. 4) 사료의 단백효율(y)은 단백질의 함양(x)이 많을 수록 감소하고 그 관계는 y=4.91-0.034x의 방정식으로 표시 할 수 있었다. 5) 사료의 단백질 함량과 사료효율 및 사료계수와의 관계를 검토하였다. 끝으로 시종 실험을 지도하여 주신 동경수산대학에 야진길 교수에게 사의를 표한다.

• Childhood Kidney Diseases
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• 제4권1호
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• pp.1-5
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• 2000

목 적 : 24시간 소변내 단백량을 예측하는데 있어 spot urine의 단백은 소변량에 따른 보정이 필요하여 spot urine의 protein/creatinine(P/Cr)비를 이용하여왔다. 하지만 크레아티닌 측정에 많은 시간과 비용이 소모되는 단점이 있고, 비중(specific gravity; SG)을 이용하여 creatinine(estimated creatinine; Cr-est)을 산출할 수 있다는 보고가 있어, 24시간 소변내 단백량을 예측하는데 P/Cr-est비의 유용성을 알아보고자 본 연구를 시행하였다. 방 법 : 1998년 3월부터 6월까지 고려대학교 의료원 구로병원 소아과에 내원한 환아 147명을 대상으로 spot urine에서 단백, creatinine과 비중을 측정하여 creatinine과 비중의 상관관계 및 그 관계식을 구하고 24시간 소변내 단백량과 비교하였다. 결 과 : 1) spot urine의 creatinine과 비중은 통계적으로 의의 있는 상관관계를 보였다(R=0.407, P<0.001, Cr=SG. x 4485.82-4482.87). 2) 24시간 소변내 단백량은 P/Cr비와 통계적으로 의의 있는 상관관계를 보였다(R=0.771, P<0.001, 24시간뇨중 단백=0.338 x (P/Cr) +667.885). 3) 24시간 소변내 단백 량은 P/Cr-est 비와 통계적으로 의의 있는 상관관계를 보였다. (R=0.723, P<0.001, 24시간뇨중 단백=0.354 x (P/Cr-est) +726.044) 결 론 : 소아단백뇨를 예측하는데 있어 spot urine의 비중으로 산출한 creatinine치를 이용하여 얻어진 P/Cr-est비가 선별검사로서 유용하게 사용될 수 있으리라 생각된다.

• Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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• 제5권2호
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• pp.285-294
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• 1992

Biochemical polymorphisms of sow's milk proteins, $\beta$-casein ($\beta$-CN), $\beta$-lactoglobulin ($\beta$-LG), post-lactoglobulin (post-LG), $\alpha$-lactalbumin ($\alpha$-LA) and X-protein, as genetic markers for major pig breeds (Landrace, Yorkshire, Duroc, Hampshire and cross bred) in Korea were determined by starch gel electrophoresis. Phenotype and gene frequencies at all marker loci were estimated and genetic differences among breed populations were analyzed. Three $\beta$-CN phenotypes (AA, AB and BB) controlled by two codominant alleles (${\beta}-CN^A$ and ${\beta}-CN^B$), four $\beta$-LG phenotypes (AA, AC, $AC^{\pm}$ and CC) controlled by two codominant alleles (${\beta}-LG^A$ and ${\beta}-LG^C$) and ten X-protein phenotypes (AA, BB, CC, DD, AB, AC, AD, BC, BD and CD) controlled by four codominant alleles ($X^A,\;X^B,\;X^C\;and\;X^D$) were identified. In addition, a genetically controlled polymorphism of post-LG was found for the first time in sow's milk protein. Three different phenotypes (AA, AB and BB) were designated $post-LG^A$ and $post-LG^B$. Of the five marker loci examined, $\alpha$-LA locus was observed to lack any individual variation in all breeds studied. All populations were in Hardy-Weinberg equilibrium for all loci. There were marked breed differences for phenotype and gene frequencies in the post-LG and X-protein marker loci. However, there were little differences between breeds in the gene frequencies at the $\beta$-CN and $\beta$-LG marker loci.

• Biomolecules & Therapeutics
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• 제25권3호
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• pp.231-238
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• 2017

Myelin is a specialized structure of the nervous system that both enhances electrical conductance and insulates neurons from external risk factors. In the central nervous system, polarized oligodendrocytes form myelin by wrapping processes in a spiral pattern around neuronal axons through myelin-related gene regulation. Since these events occur at a distance from the cell body, post-transcriptional control of gene expression has strategic advantage to fine-tune the overall regulation of protein contents in situ. Therefore, many research interests have been focused to identify RNA binding proteins and their regulatory mechanism in myelinating compartments. Fragile X mental retardation protein (FMRP) is one such RNA binding protein, regulating its target expression by translational control. Although the majority of works on FMRP have been performed in neurons, it is also found in the developing or mature glial cells including oligodendrocytes, where its function is not well understood. Here, we will review evidences suggesting abnormal translational regulation of myelin proteins with accompanying white matter problem and neurological deficits in fragile X syndrome, which can have wider mechanistic and pathological implication in many other neurological and psychiatric disorders.

• Journal of Applied Biological Chemistry
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• 제59권1호
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• pp.25-29
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• 2016

B형 간염 바이러스는 간경변증과 간세포암의 원인이 되는 간섬유화를 유발한다. 하지만 현재까지 그와 관련한 자세한 메커니즘은 밝혀지지 않았기에 본 연구에서 이를 알아보고자 하였다. 실험 결과, B형 간염 바이러스에서 발현되는 HBx 단백질에 의해 vimentin, fibronectin, slug, snail, NOX4가 증가되는 것을 확인하였다. NOX4에 의한 활성산소가 snail, slug 발현을 유도하고 섬유화 과정을 촉진할 수 있기 때문에 NOX4의 발현을 유도하는 HBx가 간섬유화를 조절, 유도하는 것을 확인하였다.